El snRNA ( ácido ribonucleico nuclear pequeño) de U11 es un ARN no codificante importante en el complejo proteico del espliceosoma menor , que activa el mecanismo de corte y empalme alternativo . El espliceosoma menor está asociado con componentes proteicos similares a los del espliceosoma principal . Utiliza el snRNA de U11 para reconocer el sitio de empalme 5 ' (funcionalmente equivalente al snRNA de U1 ) mientras que el snRNA de U12 se une al punto de ramificación para reconocer el sitio de empalme 3' (funcionalmente equivalente al snRNA de U2 ). [1]
ARN espliceosomal U11 | |
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![]() Estructura secundaria del ARN espliceosomal U11 humano | |
Identificadores | |
Símbolo | U11 |
Rfam | RF00548 |
Otros datos | |
Tipo de ARN | Gene ; snRNA ; empalme |
Dominio (s) | Eucariota |
IR | IR: 0000369 IR: 0030627 IR: 0005692 |
ENTONCES | Entonces: 0000398 |
Estructuras PDB | PDBe |
Estructura secundaria
El snRNA U11 tiene una estructura de tallo-bucle con un extremo 5 'como secuencia del sitio de empalme (5' ss) [2] y contiene cuatro estructuras de tallo-bucle (I-IV). Una comparación estructural del ARNnn de U11 entre plantas, vertebrados e insectos muestra que está plegado en una estructura con una unión de cuatro vías en el sitio 5 'y en una estructura de bucle de tallo en el sitio 3'. [3]
Sitio de unión durante la ruta de ensamblaje
La región del sitio de corte y empalme 5 'posee una secuencia complementaria con el sitio de corte y empalme 5' de los intrones de pre-ARNm de tipo U12 eucariotas . Tanto el sitio de corte y empalme 5 'como el sitio de unión de Sm están altamente conservados en todas las especies. [3] Además, el tallo loop III es un posible sitio de unión a proteínas o una región de apareamiento de bases, ya que tiene una secuencia de nucleótidos altamente conservada 'AUCAAGA'. [3]
Papel durante el empalme alternativo
![](http://wikiimg.tojsiabtv.com/wikipedia/commons/thumb/3/3f/Minor_Spliceosome_mechanism.png/220px-Minor_Spliceosome_mechanism.png)
Los snRNP de U11 y U12 (ruta espliceosomal menor) son análogos funcionales de los snRNP de U1 y U2 (ruta espliceosomal principal) mientras que los snRNP de U4 atac / U6 atac son similares a U4 / U6 . A diferencia de la vía de corte y empalme principal, los snRNP de U11 y U12 se unen al ARNm como un complejo di-snRNP de U11 / U12 preformado y estable. Esto se hace mediante el uso de siete proteínas (65K, 59K, 48K, 35K, 31K, 25K y 20K). Cuatro de ellos (59K, 48K, 35K y 25K) están asociados con ARNnn U11. [4]
Durante la formación del espliceosoma, el extremo 5 'de los snRNA de U11 y U12 interactúan con el sitio de corte y empalme 5' y la secuencia del punto de ramificación del mRNA, respectivamente, a través del emparejamiento de bases. [4] [5] U11 snRNP se une a una repetición en tándem conocida como U11 snRNP-binding splicing Enhancer (USSE) e inicia el proceso de empalme. [6] Dado que los snRNA de U11 y U12 se unen como un bicomplejo, forman un puente molecular entre dos extremos de los intrones en el complejo preespliceosomal. [4] Las proteínas U11-48K y U11 / U12-65K reconocen el sitio de empalme del intrón de tipo U12 y estabilizan el bicomplejo U11 / U12. [6] Después de activar el complejo espliceosomal, U11 snRNA abandona el ensamblaje.
Este tipo de reconocimiento del sitio de empalme 5 'y puente de intrones a través de interacciones proteína-proteína , proteína-ARN y ARN-ARN es único en el complejo splicesomal menor, a diferencia del principal espliceosomal. [4] Dado que el empalme alternativo es la clave para la variación de las proteínas que codifican la expresión génica (ARNm), U11 es crucial para este proceso regulador y responsable de la formación de un grupo proteómico . Por lo tanto, el ARNnn U11 es importante en términos de aspectos evolutivos. [7]
Referencias
- ^ Elliot, David; Ladomery, Michael (2011). Biología molecular del ARN . Prensa de la Universidad de Oxford. pag. 124.
- ^ Russell AG, Charette JM, Spencer DF, Gray MW (octubre de 2006). "Un origen evolutivo temprano para el espliceosoma menor". Naturaleza . 443 (7113): 863–6. Código Bibliográfico : 2006Natur.443..863R . doi : 10.1038 / nature05228 . PMID 17051219 . S2CID 4419061 .
- ^ a b c Schneider C, Will CL, Brosius J, Frilander MJ, Lührmann R (junio de 2004). "Identificación de una partícula de ribonucleoproteína nuclear pequeña U11 evolutivamente divergente en Drosophila" (PDF) . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 101 (26): 9584–9. Código Bibliográfico : 2004PNAS..101.9584S . doi : 10.1073 / pnas.0403400101 . PMC 470718 . PMID 15210936 .
- ^ a b c d Will CL, Schneider C, Hossbach M, Urlaub H, Rauhut R, Elbashir S, Tuschl T, Lührmann R (junio de 2004). "El snRNP 18S U11 / U12 humano contiene un conjunto de proteínas novedosas que no se encuentran en el espliceosoma dependiente de U2" . ARN . 10 (6): 929–41. doi : 10.1261 / rna.7320604 . PMC 1370585 . PMID 15146077 .
- ^ Kolossova I, Padgett RA (marzo de 1997). "U11 snRNA interactúa in vivo con el sitio de empalme 5 'de intrones de pre-mRNA dependientes de U12 (AU-AC)" . ARN . 3 (3): 227–33. PMC 1369475 . PMID 9056760 .
- ^ a b Verbeeren J, Niemelä EH, Turunen JJ, Will CL, Ravantti JJ, Lührmann R, Frilander MJ (marzo de 2010). "Un mecanismo antiguo para el control de empalme: U11 snRNP como activador de empalme alternativo". Célula molecular . 37 (6): 821–33. doi : 10.1016 / j.molcel.2010.02.014 . hdl : 11858 / 00-001M-0000-0012-D5F2-D . PMID 20347424 .
- ^ Kashyap, Luv; Tripathi Parul. "Empalme alternativo: cómo un gen puede producir muchas proteínas" (PDF) . Biociencia explicada .
enlaces externos
- Página de ARN espliceosomal U11 en Rfam