El ARN espliceosómico menor de U6atac es un ARN no codificante que es un componente esencial del complejo de espliceosoma menor de tipo U12 . El espliceosoma de tipo U12 es necesario para eliminar la clase más rara de intrones eucariotas (AT-AC, tipo U12). [1]
ARN espliceosomal menor de U6atac | |
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Identificadores | |
Símbolo | U6atac |
Rfam | RF00619 |
Otros datos | |
Tipo de ARN | Gene ; snRNA ; empalme |
Dominio (s) | Eucariota |
IR | IR: 0000355 IR: 0000369 IR: 0030622 IR: 0030627 IR: 0005691 |
ENTONCES | Entonces: 0000274 |
Estructuras PDB | PDBe |
Se propone que el ARNnn de U6atac forme un complejo de pares de bases con otro ARN espliceosomal U4atac a través de dos regiones de bucle de tallo . Se ha demostrado que estos bucles de vástago que interactúan son necesarios para el corte y empalme in vivo . [2] U6atac es el análogo funcional del ARN espliceosomal U6 en el principal complejo espliceosomal tipo U2 . [2]
Referencias
- ^ Lorkovic ZJ, Lehner R, Forstner C, Barta A (2005). "Conservación evolutiva del espliceosoma menor de tipo U12 entre plantas y humanos" . ARN . 11 (7): 1095-1107. doi : 10.1261 / rna.2440305 . PMC 1370794 . PMID 15987817 .
- ^ a b Padgett RA, Shukla GC (2002). "Un modelo revisado para el emparejamiento de bases U4atac / U6atac snRNA" . ARN . 8 (2): 125-128. doi : 10.1017 / S1355838202017156 . PMC 1370236 . PMID 11911359 .
- Shukla GC, Padgett RA (1999). "Conservación de características funcionales de snRNAs U6atac y U12 entre vertebrados y plantas superiores" . ARN . 5 (4): 525–538. doi : 10.1017 / S1355838299982213 . PMC 1369779 . PMID 10199569 .
enlaces externos
- Página para el ARN espliceosomal menor de U6atac en Rfam