U5 snRNA es un pequeño ARN nuclear (snRNA) que participa en el empalme del ARN como componente del espliceosoma . Forma la U5 snRNP ( ribonucleoproteína nuclear pequeña ) al asociarse con varias proteínas, incluida la Prp8 , la proteína más grande y más conservada del espliceosoma, Brr2, una helicasa necesaria para la activación del espliceosoma, Snu114 y las proteínas 7 Sm. [1] U5 snRNA forma una serie de hélices apiladas coaxialmente que se proyectan hacia el sitio activo del espliceosoma. [2] [3] El bucle 1, que remata esta serie de hélices, forma 4-5 pares de bases con el exón 5 'durante las dos reacciones químicas de empalme.[4] [5] Esta interacción parece ser especialmente importante durante el paso dos del empalme, la ligadura del exón. [6]
ARN espliceosomal U5 | |
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![]() Estructura secundaria prevista y conservación de la secuencia de U5 | |
Identificadores | |
Símbolo | U5 |
Rfam | RF00020 |
Otros datos | |
Tipo de ARN | Gene ; snRNA ; empalme |
Dominio (s) | Eucariota |
IR | IR: 0000351 IR: 0000353 IR: 0005682 IR: 0046540 |
ENTONCES | Entonces: 0000395 |
Estructuras PDB | PDBe |
Referencias
- ^ Stevens SW, Barta I, Ge HY, Moore RE, Young MK, Lee TD, Abelson J (noviembre de 2001). "Análisis bioquímicos y genéticos de las pequeñas ribonucleoproteínas nucleares U5, U6 y U4 / U6 x U5 de Saccharomyces cerevisiae" . ARN . 7 (11): 1543–53. PMC 1370197 . PMID 11720284 .
- ^ Nguyen TH, Galej WP, Bai XC, Savva CG, Newman AJ, Scheres SH, Nagai K (julio de 2015). "La arquitectura del espliceosomal U4 / U6.U5 tri-snRNP" . Naturaleza . 523 (7558): 47–52. Bibcode : 2015Natur.523 ... 47N . doi : 10.1038 / nature14548 . PMC 4536768 . PMID 26106855 .
- ^ Yan C, Hang J, Wan R, Huang M, Wong CC, Shi Y (septiembre de 2015). "Estructura de un espliceosoma de levadura a una resolución de 3,6 angstrom". Ciencia . 349 (6253): 1182–91. Código bibliográfico : 2015Sci ... 349.1182Y . doi : 10.1126 / science.aac7629 . PMID 26292707 . S2CID 22194712 .
- ^ Newman AJ, Norman C (febrero de 1992). "U5 snRNA interactúa con las secuencias de exón en los sitios de empalme 5 'y 3'". Celular . 68 (4): 743–54. doi : 10.1016 / 0092-8674 (92) 90149-7 . PMID 1739979 . S2CID 3328508 .
- ^ Sontheimer EJ, Steitz JA (diciembre de 1993). "Los pequeños ARN nucleares U5 y U6 como componentes del sitio activo del espliceosoma". Ciencia . 262 (5142): 1989–96. Código Bibliográfico : 1993Sci ... 262.1989S . doi : 10.1126 / science.8266094 . PMID 8266094 .
- ^ O'Keefe RT, Norman C, Newman AJ (agosto de 1996). "La secuencia invariante del bucle 1 del snRNA de U5 es prescindible para el primer paso catalítico de corte y empalme de pre-mRNA en levadura". Celular . 86 (4): 679–89. doi : 10.1016 / s0092-8674 (00) 80140-3 . PMID 8752221 . S2CID 17484887 .
Otras lecturas
- Zwieb C (enero de 1997). "La base de datos de uRNA" . Investigación de ácidos nucleicos . 25 (1): 102–3. doi : 10.1093 / nar / 25.1.102 . PMC 146409 . PMID 9016512 .
- Thomas J, Lea K, Zucker-Aprison E, Blumenthal T (mayo de 1990). "Los snRNAs espliceosomales de Caenorhabditis elegans" . Investigación de ácidos nucleicos . 18 (9): 2633–42. doi : 10.1093 / nar / 18.9.2633 . PMC 330746 . PMID 2339054 .
enlaces externos
- Página de ARN espliceosomal U5 en Rfam