La uroporfirinógeno descarboxilasa ( uroporfirinógeno descarboxilasa o UROD ) es una enzima ( EC 4.1.1.37 ) que en los seres humanos está codificada por el gen UROD . [5]
UROD | |||||||||||||||||||||||||
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Identificadores | |||||||||||||||||||||||||
Alias | UROD , PCT, UPD, uroporfirinógeno descarboxilasa | ||||||||||||||||||||||||
Identificaciones externas | OMIM : 613521 MGI : 98916 HomoloGene : 320 GeneCards : UROD | ||||||||||||||||||||||||
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Ortólogos | |||||||||||||||||||||||||
Especies | Humano | Ratón | |||||||||||||||||||||||
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Ubicación (UCSC) | Crónicas 1: 45,01 - 45,02 Mb | Crónicas 4: 116,99 - 116,99 Mb | |||||||||||||||||||||||
Búsqueda en PubMed | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Wikidata | |||||||||||||||||||||||||
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Función
La uroporfirinógeno III descarboxilasa es una enzima homodimérica ( PDB : 1URO ) que cataliza el quinto paso en la biosíntesis del hemo , que corresponde a la eliminación de los grupos carboxilo de las cuatro cadenas laterales de acetato del uroporfirinógeno III para producir el coproporfirinógeno III :
- uroporfirinógeno IIIcoproporfirinógeno III + 4 CO 2
Significación clínica
Se sabe que las mutaciones y la deficiencia de esta enzima causan porfiria cutánea tardía familiar y porfiria hepatoeritropoyética . [5]
Mecanismo
A concentraciones bajas de sustrato, se cree que la reacción sigue una ruta ordenada, con la eliminación secuencial de CO 2 de los anillos D, A, B y C, mientras que a niveles más altos de sustrato / enzima parece ser operativa una ruta aleatoria. La enzima funciona como un dímero en solución, y tanto las enzimas humanas como las del tabaco se han cristalizado y resuelto con buenas resoluciones.
UroD se considera una descarboxilasa poco común, ya que realiza descarboxilaciones sin la intervención de ningún cofactor, a diferencia de la gran mayoría de descarboxilasas. Recientemente se ha propuesto que su mecanismo proceda a través de la protonación del sustrato por un residuo de arginina . [6] Un demostrado que la tasa de no catalizada la reacción de UROD es de 10 informe 2008 -19 s -1 , así que a pH 10 la tasa de aceleración de UROD con relación a la tasa de no catalizada, es decir, el dominio catalítico, es la mayor para cualquier enzima conocida, 6 x 10 24 M −1 . [7]
Referencias
- ^ a b c GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000126088 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000028684 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ a b "Gen Entrez: descarboxilasa de uroporfirinógeno UROD" .
- ^ Silva PJ, Ramos MJ (2005). "Estudio de densidad funcional de los mecanismos para la descarboxilación libre de cofactores realizada por la descarboxilasa de uroporfirinógeno III". J Phys Chem B . 109 (38): 18195–200. doi : 10.1021 / jp051792s . PMID 16853337 .
- ^ Lewis CA, Wolfenden R (noviembre de 2008). "Descarboxilación de uroporfirinógeno como punto de referencia para la competencia catalítica de enzimas" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 105 (45): 17328–33. Código Bibliográfico : 2008PNAS..10517328L . doi : 10.1073 / pnas.0809838105 . PMC 2582308 . PMID 18988736 .
Otras lecturas
- Élder GH, Lee GB, Tovey JA (1978). "Disminución de la actividad de la descarboxilasa de uroporfirinógeno hepática en la porfiria cutánea tardía esporádica". N. Engl. J. Med . 299 (6): 274–8. doi : 10.1056 / NEJM197808102990603 . PMID 661926 .
- de Verneuil H, Bourgeois F, de Rooij F, et al. (1992). "Caracterización de una nueva mutación (R292G) y una deleción en el locus de descarboxilasa de uroporfirinógeno humano en dos pacientes con porfiria hepatoeritropoyética" . Tararear. Genet . 89 (5): 548–52. doi : 10.1007 / bf00219182 . hdl : 1765/58484 . PMID 1634232 . S2CID 31811381 .
- Romana M, Grandchamp B, Dubart A y col. (1991). "Identificación de una nueva mutación responsable de la porfiria hepatoeritropoyética". EUR. J. Clin. Invertir . 21 (2): 225–9. doi : 10.1111 / j.1365-2362.1991.tb01814.x . PMID 1905636 . S2CID 22358220 .
- Garey JR, Harrison LM, Franklin KF y col. (1990). "Uroporfirinógeno descarboxilasa: una mutación del sitio de empalme provoca la deleción del exón 6 en varias familias con porfiria cutánea tarda" . J. Clin. Invertir . 86 (5): 1416–22. doi : 10.1172 / JCI114856 . PMC 296884 . PMID 2243121 .
- Garey JR, Hansen JL, Harrison LM y col. (1989). "Una mutación puntual en la región codificante de uroporfirinógeno descarboxilasa asociada con la porfiria cutánea tarda familiar" . Sangre . 73 (4): 892–5. doi : 10.1182 / sangre.V73.4.892.892 . PMID 2920211 .
- Roméo PH, Raich N, Dubart A, et al. (1986). "Clonación molecular y secuencia de nucleótidos de un ADNc de descarboxilasa de uroporfirinógeno humano completo" . J. Biol. Chem . 261 (21): 9825–31. doi : 10.1016 / S0021-9258 (18) 67589-1 . PMID 3015909 .
- Dubart A, Mattei MG, Raich N y col. (1986). "Asignación de descarboxilasa de uroporfirinógeno humano (URO-D) a la banda p34 del cromosoma 1". Tararear. Genet . 73 (3): 277–9. doi : 10.1007 / BF00401245 . PMID 3460962 . S2CID 34478515 .
- Romana M, Dubart A, Beaupain D y col. (1987). "Estructura del gen de la descarboxilasa de uroporfirinógeno humana" . Ácidos nucleicos Res . 15 (18): 7343–56. doi : 10.1093 / nar / 15.18.7343 . PMC 306252 . PMID 3658695 .
- de Verneuil H, Grandchamp B, Beaumont C, et al. (1986). "Mutante estructural de uroporfirinógeno descarboxilasa (Gly281 ---- Glu) en un caso de porfiria". Ciencia . 234 (4777): 732–4. Código Bibliográfico : 1986Sci ... 234..732D . doi : 10.1126 / science.3775362 . PMID 3775362 .
- Roberts AG, Elder GH, De Salamanca RE, et al. (1995). "Una mutación (G281E) del gen de la uroporfirinógeno descarboxilasa humana provoca tanto porfiria hepatoeritropoyética como porfiria cutánea tardía familiar manifiesta: estudios bioquímicos y genéticos en pacientes españoles" . J. Invest. Dermatol . 104 (4): 500–2. doi : 10.1111 / 1523-1747.ep12605953 . PMID 7706766 .
- Maruyama K, Sugano S (1994). "Oligo-taponamiento: un método simple para reemplazar la estructura de la tapa de ARNm eucariotas con oligoribonucleótidos". Gene . 138 (1–2): 171–4. doi : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90802-8 . PMID 8125298 .
- Meguro K, Fujita H, Ishida N y col. (1994). "Defectos moleculares de la descarboxilasa de uroporfirinógeno en un paciente con porfiria hepatoeritropoyética leve". J. Invest. Dermatol . 102 (5): 681–5. doi : 10.1111 / 1523-1747.ep12374134 . PMID 8176248 .
- Moran-Jimenez MJ, Ged C, Romana M, et al. (1996). "Uroporfirinógeno descarboxilasa: secuencia completa de genes humanos y estudio molecular de tres familias con porfiria hepatoeritropoyética" . Soy. J. Hum. Genet . 58 (4): 712-21. PMC 1914669 . PMID 8644733 .
- McManus JF, Begley CG, Sassa S, Ratnaike S (1996). "Cinco nuevas mutaciones en el gen uroporfirinógeno descarboxilasa identificadas en familias con porfiria cutánea" . Sangre . 88 (9): 3589–600. doi : 10.1182 / blood.V88.9.3589.bloodjournal8893589 . PMID 8896428 .
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, et al. (1997). "Construcción y caracterización de una biblioteca de ADNc enriquecida en longitud completa y enriquecida en el extremo 5 '". Gene . 200 (1–2): 149–56. doi : 10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3 . PMID 9373149 .
- Whitby FG, Phillips JD, Kushner JP, Hill CP (1998). "Estructura cristalina de la descarboxilasa de uroporfirinógeno humana" . EMBO J . 17 (9): 2463–71. doi : 10.1093 / emboj / 17.9.2463 . PMC 1170588 . PMID 9564029 .
- Mendez M, Sorkin L, Rossetti MV, et al. (1998). "Porfiria cutánea tarda familiar: caracterización de siete mutaciones novedosas de uroporfirinógeno descarboxilasa y frecuencia de alelos comunes de hemocromatosis" . Soy. J. Hum. Genet . 63 (5): 1363–75. doi : 10.1086 / 302119 . PMC 1377546 . PMID 9792863 .
- Wang H, Long Q, Marty SD y col. (1998). "Un modelo de pez cebra para la porfiria hepatoeritropoyética". Nat. Genet . 20 (3): 239–43. doi : 10.1038 / 3041 . PMID 9806541 . S2CID 28379777 .
- McManus JF, Begley CG, Sassa S, Ratnaike S (1999). "Tres nuevas mutaciones en el gen uroporfirinógeno descarboxilasa en la porfiria cutánea tarda familiar. Mutación en breve nº 237. En línea" . Tararear. Mutat . 13 (5): 412–413. doi : 10.1002 / (SICI) 1098-1004 (1999) 13: 5 <412 :: AID-HUMU13> 3.0.CO; 2-N . PMID 10338097 .
- Christiansen L, Ged C, Hombrados I y col. (1999). "Detección de mutaciones en el gen de la descarboxilasa de uroporfirinógeno mediante electroforesis en gel de gradiente desnaturalizante. Identificación y caracterización de seis mutaciones novedosas asociadas con la PCT familiar". Tararear. Mutat . 14 (3): 222–32. doi : 10.1002 / (SICI) 1098-1004 (1999) 14: 3 <222 :: AID-HUMU5> 3.0.CO; 2-V . PMID 10477430 .
enlaces externos
- Resumen de toda la información estructural disponible en el PDB para UniProt : P06132 (Uroporfirinógeno descarboxilasa) en el PDBe-KB .