La vimentina es una proteína estructural que en humanos está codificada por el gen VIM . Su nombre proviene del latín vimentum que se refiere a una serie de varillas flexibles. [4]
EMPUJE |
---|
|
Estructuras disponibles |
---|
PDB | Búsqueda de ortólogos: PDBe RCSB |
---|
Lista de códigos de identificación de PDB |
---|
1GK4 , 1GK6 , 1GK7 , 3G1E , 3KLT , 3S4R , 3SSU , 3SWK , 3TRT , 3UF1 , 4MCY , 4MCZ , 4MD0 , 4MD5 , 4MDJ , 4YPC , 4YV3 |
|
|
Identificadores |
---|
Alias | VIM , CTRCT30, HEL113, vimentina |
---|
Identificaciones externas | OMIM : 193060 MGI : 98932 HomoloGene : 2538 GeneCards : VIM |
---|
Ubicación de genes ( humanos ) |
---|
| Chr. | Cromosoma 10 (humano) [1] |
---|
| Banda | 10p13 | Comienzo | 17.228.241 pb [1] |
---|
Final | 17.237.593 pb [1] |
---|
|
|
Ontología de genes |
---|
Función molecular | • unión a proteínas andamio • actividad molécula estructural • constituyente estructural del citoesqueleto • proteína de unión C-terminal • GO: proteína 0001948 unión • constituyente estructural de la lente de ojo • proteína de unión idénticos • RNA de doble hebra de unión • queratina filamento de unión • unión específica de proteínas de dominio
|
---|
Componente celular | • citoplasma • citosol • proyección celular • adhesión focal • membrana plasmática • peroxisoma • borde anterior de la célula • proyección neuronal • exosoma extracelular • citoesqueleto • filamento intermedio • GO: 0005578 matriz extracelular • núcleo • polisoma • matriz nuclear • vesícula fagocítica • complejo ribonucleoproteico
|
---|
Proceso biológico | • organización del filamento intermedio • movimiento de la célula o componente subcelular • regulación negativa del desarrollo de la proyección neuronal • transducción de la señal de la proteína SMAD • desarrollo de astrocitos • proceso basado en el filamento intermedio • regulación positiva de la expresión génica • deslizamiento del filamento muscular • diferenciación de las células gliales de Bergmann • GO: 0022415 proceso viral • desarrollo de células de fibra del cristalino • vía de señalización mediada por citocinas • regulación positiva del proceso biosintético del colágeno • regulación de la estabilidad del ARNm • regulación positiva de la traducción • respuesta celular al lipopolisacárido • respuesta celular al dipéptido muramil • respuesta celular al interferón-gamma
|
---|
Fuentes: Amigo / QuickGO |
|
Ortólogos |
---|
Especies | Humano | Ratón |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (ARNm) | | |
---|
RefSeq (proteína) | | |
---|
Ubicación (UCSC) | Crónicas 10: 17.23 - 17.24 Mb | n / A |
---|
Búsqueda en PubMed | [2] | [3] |
---|
Wikidata |
Ver / editar humano | Ver / Editar mouse |
|
Patrón de tinción de inmunofluorescencia de anticuerpos de vimentina. Producido incubando anticuerpos primarios de vimentina y anticuerpos secundarios marcados con FITC con células HEp-20-10.
Tinción de inmunofluorescencia de células HeLa con anticuerpo para revelar vimentina que contiene filamentos intermedios en verde y anticuerpo contra LAMP1 para revelar lisosomas en rojo. El ADN nuclear se ve en azul. Los anticuerpos y cortesía de imagen Encor Biotecnología Inc .
La vimentina es una proteína de filamento intermedio (IF) de tipo III que se expresa en las células mesenquimales . Las proteínas IF se encuentran en todas las células animales [5] , así como en las bacterias . [6] Los filamentos intermedios, junto con los microtúbulos a base de tubulina y los microfilamentos a base de actina , componen el citoesqueleto . Todas las proteínas IF se expresan de una manera altamente regulada por el desarrollo; la vimentina es el principal componente citoesquelético de las células mesenquimales . Debido a esto, la vimentina se usa a menudo como un marcador de células derivadas de mesenquimales o células que experimentan una transición epitelial a mesenquimatosa (EMT) durante el desarrollo normal y la progresión metastásica .
Un monómero de vimentina, como todos los demás filamentos intermedios, tiene un dominio central α-helicoidal , coronado en cada extremo por dominios amino no helicoidales (cabeza) y carboxilo (cola). [7] Es probable que dos monómeros se expresen co-traduccionalmente de una manera que facilite la formación de un dímero en espiral, que es la subunidad básica del ensamblaje de vimentina. [8]
Las secuencias α-helicoidales contienen un patrón de aminoácidos hidrofóbicos que contribuyen a formar un "sello hidrofóbico" en la superficie de la hélice. [7] Además, existe una distribución periódica de aminoácidos ácidos y básicos que parece jugar un papel importante en la estabilización de los dímeros en espiral . [7] El espaciamiento de los residuos cargados es óptimo para los puentes de sal iónica , lo que permite la estabilización de la estructura de la hélice α. Si bien este tipo de estabilización es intuitivo para las interacciones intracadena, en lugar de las interacciones entre cadenas, los científicos han propuesto que quizás el cambio de los puentes salinos intracadena formados por residuos ácidos y básicos a las asociaciones iónicas entre cadenas contribuye al ensamblaje del filamento. [7]
La vimentina juega un papel importante en el apoyo y el anclaje de la posición de los orgánulos en el citosol . La vimentina está adherida al núcleo , al retículo endoplásmico y a las mitocondrias , ya sea lateral o terminalmente. [9]
La naturaleza dinámica de la vimentina es importante a la hora de ofrecer flexibilidad a la célula. Los científicos descubrieron que la vimentina proporcionaba a las células una resistencia ausente en las redes de microtúbulos o filamentos de actina, cuando estaban bajo estrés mecánico in vivo . Por tanto, en general, se acepta que la vimentina es el componente citoesquelético responsable de mantener la integridad celular. (Se encontró que las células sin vimentina son extremadamente delicadas cuando se las perturba con una micropunción). [10] Los ratones transgénicos que carecen de vimentina parecían normales y no mostraban diferencias funcionales. [11] Es posible que la red de microtúbulos haya compensado la ausencia de la red intermedia. Este resultado apoya una íntima interacción entre los microtúbulos y la vimentina. Además, cuando estaban presentes los despolimerizadores de microtúbulos, se produjo la reorganización de la vimentina, lo que nuevamente implica una relación entre los dos sistemas. [10] Por otro lado, los ratones heridos que carecen del gen vimentina se curan más lentamente que sus contrapartes de tipo salvaje. [12]
En esencia, la vimentina es responsable de mantener la forma celular, la integridad del citoplasma y estabilizar las interacciones citoesqueléticas. Se ha demostrado que la vimentina elimina proteínas tóxicas en los cuerpos de inclusión JUNQ e IPOD en la división asimétrica de líneas celulares de mamíferos . [13]
Además, se encuentra que la vimentina controla el transporte de colesterol derivado de lipoproteínas de baja densidad , LDL, desde un lisosoma hasta el sitio de esterificación. [14] Con el bloqueo del transporte de colesterol derivado de LDL dentro de la célula, se encontró que las células almacenan un porcentaje mucho menor de la lipoproteína que las células normales con vimentina. Esta dependencia parece ser el primer proceso de una función bioquímica en cualquier célula que depende de una red celular de filamentos intermedios. Este tipo de dependencia tiene ramificaciones en las células suprarrenales, que dependen de los ésteres de colesterilo derivados de las LDL. [14]
La vimentina juega un papel en la formación de agresores , donde forma una jaula que rodea un núcleo de proteína agregada. [15]
Se ha utilizado como marcador tumoral de sarcoma para identificar el mesénquima . [16] [17] Jerad Gardner ha cuestionado su especificidad como biomarcador. [18]
La metilación del gen de la vimentina se ha establecido como un biomarcador del cáncer de colon y se está utilizando en el desarrollo de pruebas fecales para el cáncer de colon. También se han observado niveles estadísticamente significativos de metilación del gen de vimentina en ciertas patologías gastrointestinales superiores como esófago de Barrett , adenocarcinoma de esófago y cáncer gástrico de tipo intestinal. [19] Los altos niveles de metilación del ADN en la región promotora también se han asociado con una supervivencia notablemente menor en los cánceres de mama con hormonas positivas. [20] Se identificó la regulación a la baja de vimentina en la variante quística del carcinoma papilar de tiroides utilizando un enfoque proteómico. [21] Véase también Anticuerpo anti-proteína citrulinado para su uso en el diagnóstico de artritis reumatoide .
Se ha demostrado que la vimentina interactúa con:
- DSP [22]
- HOMBRES1 [23]
- MYST2 [24] [25]
- PKN1 [26]
- PRKCI [27] [28]
- PLEC [29] [30]
- SPTAN1 [30]
- UPP1 [31]
- YWHAZ [32]
Se ha descubierto que la 3 'UTR del ARNm de vimentina se une a una proteína de 46 kDa. [33]