XPC (gen)

Gen codificador de proteínas en la especie Homo sapiens

XPC
Estructuras disponibles PDB Búsqueda de ortólogos: PDBe RCSB Lista de códigos de identificación de PDB 2A4J , 2GGM , 2OBH , 2RVB
Identificadores
Alias	XPC , RAD4, XP3, XPCC, p125, xeroderma pigmentosum, grupo de complementación C, subunidad del complejo XPC, factor de reparación y reconocimiento de daños en el ADN
Identificaciones externas	OMIM : 613208 MGI : 103557 HomoloGene : 3401 GeneCards : XPC
Ubicación de genes ( ratón ) Chr. Cromosoma 6 (ratón) [1] Banda 6 | 6 D1 Comienzo 91.489.305 pb [1] Fin 91,515,888 pb [1]
Patrón de expresión de ARN Más datos de expresión de referencia
Ontología de genes Función molecular • de unión a ADN • unión bucle de ADN heterodúplex • de unión a ADN de burbujas • de unión a ADN monocatenario • dañado de unión a ADN • GO: proteína de unión 0001948 • GO: 0032403 contiene proteína de complejo de unión Componente celular • citoplasma • celda de membrana • nucleoplasma • XPC complejo • nucleolo • nucleótidos de la escisión del factor de reparación 2 complejo • núcleo • mitocondria • intracelular membrana acotada orgánulo • complejo de reparación de nucleótidos escisión Proceso biológico • nucleótidos de reparación por escisión • regulación de la transición de fase del ciclo celular mitótico • reparación de nucleótidos-escisión, el reconocimiento de daños en el ADN • mitótico ADN señalización daños puesto de control-S intra • respuesta celular al estímulo daño en el ADN • genoma mundial de reparaciones de nucleótidos escisión • respuesta a estímulo auditivo • desajuste de reparación • respuesta a UV-B • UV-daño de reparación por escisión • la reparación del ADN • respuesta a drogas • reparación de nucleótidos-escisión, antes de la incisión complejo montaje • reparación de nucleótidos-escisión, dúplex de ADN desenrollar Fuentes: Amigo / QuickGO
Ortólogos
Especies	Humano	Ratón
Entrez	7508	22591
Ensembl	ENSG00000154767	ENSMUSG00000030094
UniProt	Q01831	P51612
RefSeq (ARNm)	NM_001145769 NM_004628	NM_009531
RefSeq (proteína)	NP_004619 NP_001341655 NP_001341656 NP_001341658 NP_001341659	NP_033557
Ubicación (UCSC)	n / A	Crónicas 6: 91,49 - 91,52 Mb
Búsqueda en PubMed	[2]	[3]
Wikidata
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Xeroderma pigmentosum, grupo de complementación C , también conocido como XPC , es una proteína que en humanos está codificada por el gen XPC . XPC participa en el reconocimiento de aductos de ADN voluminosos en la reparación por escisión de nucleótidos . ^[4] Se encuentra en el cromosoma 3. ^[5]

Función

Este gen codifica un componente de la vía de reparación por escisión de nucleótidos (NER). Existen múltiples componentes implicados en la vía NER, incluyendo xeroderma pigmentosum (XP) AG y V, síndrome de Cockayne (CS) A y B, y tricotiodistrofia (TTD) grupo A, etc. Este componente, XPC, juega un papel importante en la los primeros pasos de la NER del genoma global, especialmente en el reconocimiento de daños, la formación de complejos abiertos y la formación de complejos proteicos de reparación. ^[4]

El complejo de XPC-RAD23B es el factor de reconocimiento de daño inicial en la reparación global por escisión de nucleótidos genómicos (GG-NER). ^[6] XPC-RAD23B reconoce una amplia variedad de lesiones que desestabilizan termodinámicamente los dúplex de ADN, incluidos los fotoproductos inducidos por rayos UV (dímeros de ciclopirimidina y 6-4 fotoproductos), aductos formados por mutágenos ambientales como el benzo [a] pireno o diversas aminas aromáticas, ciertas lesiones oxidativas endógenas como las ciclopurinas y los aductos formados por fármacos quimioterapéuticos contra el cáncer como el cisplatino. Se requiere la presencia de XPC-RAD23B para el ensamblaje de los otros factores NER centrales y la progresión a través de la vía NER tanto in vitro como in vivo. ^[7]Aunque la mayoría de los estudios se han realizado con XPC-RAD23B, es parte de un complejo trimérico con centrina-2, una proteína de unión al calcio de la familia de la calmodulina. ^[7]

Significación clínica

Las mutaciones en este gen o en algunos otros componentes de la NER dan como resultado Xeroderma pigmentosum , un trastorno autosómico recesivo poco común que se caracteriza por una mayor sensibilidad a la luz solar con el desarrollo de carcinomas a una edad temprana. ^[4]

Cáncer

El daño al ADN parece ser la principal causa subyacente del cáncer, ^[8] y las deficiencias en los genes de reparación del ADN probablemente subyacen a muchas formas de cáncer. ^{[9] [10]} Si la reparación del ADN es deficiente, el daño del ADN tiende a acumularse. Tal daño excesivo del ADN puede aumentar las mutaciones debido a la síntesis de translesión propensa a errores . El daño excesivo del ADN también puede aumentar las alteraciones epigenéticas debido a errores durante la reparación del ADN. ^{[11] [12]} Tales mutaciones y alteraciones epigenéticas pueden dar lugar a cáncer .

Las reducciones en la expresión de los genes de reparación del ADN (generalmente causadas por alteraciones epigenéticas como la hipermetilación del promotor) son muy comunes en los cánceres y, por lo general, son mucho más frecuentes que los defectos mutacionales en los genes de reparación del ADN en los cánceres. ^{[ cita requerida ]} La siguiente tabla muestra que la expresión de XPC con frecuencia se redujo epigenéticamente en el cáncer de vejiga y también en el cáncer de pulmón de células no pequeñas, y también muestra que XPC se redujo con mayor frecuencia en las etapas más avanzadas de estos cánceres.

Frecuencia de expresión reducida de XPC en cánceres, con las etapas de los cánceres indicadas por separado

Cáncer	Frecuencia	Árbitro.
Cáncer de vejiga	50%	[13]
Neoplasia urotelial papilar de bajo potencial maligno	35%	[13]
Cáncer de vejiga papilar de bajo grado	42%	[13]
Cáncer de vejiga papilar de alto grado	sesenta y cinco%	[13]
Cáncer de pulmón de células no pequeñas (NSCLC)	70%	[14]
NSCLC estadio I	62%	[14]
NSCLC estadios II-III	77%	[14]

Si bien se demostró que la hipermetilación epigenética de la región promotora del gen XPC está asociada con una baja expresión de XPC, ^[13] también puede ocurrir otro modo de represión epigenética de XPC por sobreexpresión del microARN miR-890. ^[15]

Interacciones

Se ha demostrado que XPC (gen) interactúa con ABCA1 , ^[16] CETN2 ^[17] y XPB . ^[18]

Referencias

1. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000030094 - Ensembl , mayo de 2017
2. "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
3. "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
4. "Entrez Gene: XPC xeroderma pigmentosum, grupo de complementación C" .
5. "Entrada OMIM - # 278720 - XERODERMA PIGMENTOSUM, GRUPO DE COMPLEMENTACIÓN C; XPC" . Consultado el 12 de diciembre de 2014 .
6. Sugasawa K, Ng JM, Masutani C, Iwai S, van der Spek PJ, Eker AP, Hanaoka F, Bootsma D, Hoeijmakers JH (1998). "El complejo proteico del grupo C de Xeroderma pigmentosum es el iniciador de la reparación por escisión de nucleótidos del genoma global" . Mol. Celular . 2 (2): 223–32. doi : 10.1016 / s1097-2765 (00) 80132-x . PMID 9734359 . 
7. Schärer OD (octubre de 2013). "Reparación de escisión de nucleótidos en eucariotas" . Perspectivas de Cold Spring Harbor en biología . 5 (10): a012609. doi : 10.1101 / cshperspect.a012609 . PMC 3783044 . PMID 24086042 .  
8. Kastan MB (2008). "Respuestas al daño del ADN: mecanismos y roles en la enfermedad humana: conferencia de 2007 GHA Clowes Memorial Award" . Mol. Cancer Res . 6 (4): 517–24. doi : 10.1158 / 1541-7786.MCR-08-0020 . PMID 18403632 . 
9. Harper JW, Elledge SJ (2007). "La respuesta al daño del ADN: diez años después" . Mol. Celular . 28 (5): 739–45. doi : 10.1016 / j.molcel.2007.11.015 . PMID 18082599 . 
10. Dietlein F, Reinhardt HC (2014). "Vías moleculares: explotación de defectos moleculares específicos del tumor en las vías de reparación del ADN para la terapia del cáncer de precisión" . Clin. Cancer Res . 20 (23): 5882–7. doi : 10.1158 / 1078-0432.CCR-14-1165 . PMID 25451105 . 
11. O'Hagan HM, Mohammad HP, Baylin SB (2008). "Las roturas de doble hebra pueden iniciar el silenciamiento génico y el inicio de la metilación del ADN dependiente de SIRT1 en una isla CpG del promotor exógeno" . PLOS Genetics . 4 (8): e1000155. doi : 10.1371 / journal.pgen.1000155 . PMC 2491723 . PMID 18704159 .  
12. Cuozzo C, Porcellini A, Angrisano T, Morano A, Lee B, Di Pardo A, Messina S, Iuliano R, Fusco A, Santillo MR, Muller MT, Chiariotti L, Gottesman ME, Avvedimento EV (julio de 2007). "Daño del ADN, reparación dirigida por homología y metilación del ADN" . PLOS Genetics . 3 (7): e110. doi : 10.1371 / journal.pgen.0030110 . PMC 1913100 . PMID 17616978 .  
13. Yang J, Xu Z, Li J, Zhang R, Zhang G, Ji H, Song B, Chen Z (2010). "El silencio epigenético de XPC junto con la alteración de p53 tiene un impacto significativo en el resultado del cáncer de vejiga". J. Urol . 184 (1): 336–43. doi : 10.1016 / j.juro.2010.03.044 . PMID 20488473 . 
14. Yeh KT, Wu YH, Lee MC, Wang L, Li CT, Chen CY, Lee H (2012). "El nivel de ARNm de XPC puede predecir la recaída en los no fumadores con cánceres de pulmón de células no pequeñas". Ana. Surg. Oncol . 19 (3): 734–42. doi : 10.1245 / s10434-011-1992-9 . PMID 21861227 . S2CID 19154489 .  
15. Hatano K, Kumar B, Zhang Y, Coulter JB, Hedayati M, Mears B, Ni X, Kudrolli TA, Chowdhury WH, Rodriguez R, DeWeese TL, Lupold SE (2015). "Una pantalla funcional identifica los miARN que inhiben la reparación del ADN y sensibilizan a las células del cáncer de próstata a la radiación ionizante" . Ácidos nucleicos Res . 43 (8): 4075–86. doi : 10.1093 / nar / gkv273 . PMC 4417178 . PMID 25845598 .  
16. Shimizu Y, Iwai S, Hanaoka F, Sugasawa K (enero de 2003). "La proteína del grupo C de Xeroderma pigmentosum interactúa física y funcionalmente con la ADN glicosilasa de timina" . EMBO J . 22 (1): 164–73. doi : 10.1093 / emboj / cdg016 . PMC 140069 . PMID 12505994 .  
17. Araki M, Masutani C, Takemura M, Uchida A, Sugasawa K, Kondoh J, Ohkuma Y, Hanaoka F (junio de 2001). "La proteína del centrosoma centrina 2 / caltractina 1 es parte del complejo del grupo C de xeroderma pigmentosum que inicia la reparación global por escisión de nucleótidos del genoma" . J. Biol. Chem . 276 (22): 18665–72. doi : 10.1074 / jbc.M100855200 . PMID 11279143 . 
18. Yokoi M, Masutani C, Maekawa T, Sugasawa K, Ohkuma Y, Hanaoka F (marzo de 2000). "El complejo de proteínas del grupo C de xeroderma pigmentoso XPC-HR23B juega un papel importante en el reclutamiento del factor de transcripción IIH al ADN dañado" . J. Biol. Chem . 275 (13): 9870–5. doi : 10.1074 / jbc.275.13.9870 . PMID 10734143 . 

Otras lecturas

• Cleaver JE, Thompson LH, Richardson AS, Estados JC (1999). "Un resumen de mutaciones en los trastornos sensibles a los rayos UV: xeroderma pigmentoso, síndrome de Cockayne y tricotiodistrofia". Tararear. Mutat . 14 (1): 9-22. doi : 10.1002 / (SICI) 1098-1004 (1999) 14: 1 <9 :: AID-HUMU2> 3.0.CO; 2-6 . PMID  10447254 .
• El-Deiry WS (2003). "Transactivación de genes de reparación por BRCA1" . Cancer Biol. Ther . 1 (5): 490–1. doi : 10.4161 / cbt.1.5.162 . PMID  12496474 .
• Sugasawa K (2007). "Ubiquitilación inducida por UV del complejo XPC, el complejo de ligasa UV-DDB-ubiquitina y reparación del ADN". J. Mol. Histol . 37 (5–7): 189–202. doi : 10.1007 / s10735-006-9044-7 . PMID  16858626 . S2CID  817898 .
• Legerski R, Peterson C (1993). "Clonación de expresión de un gen de reparación de ADN humano implicado en el grupo C de xeroderma pigmentoso" . Naturaleza . 360 (6404): 610. doi : 10.1038 / 360610b0 . PMID  1461286 .
• Legerski R, Peterson C (1992). "Clonación de expresión de un gen de reparación de ADN humano implicado en el grupo C de xeroderma pigmentoso". Naturaleza . 359 (6390): 70–3. Código Bibliográfico : 1992Natur.359 ... 70L . doi : 10.1038 / 359070a0 . PMID  1522891 . S2CID  34276965 .
• Legerski RJ, Liu P, Li L, Peterson CA, Zhao Y, Leach RJ, Naylor SL, Siciliano MJ (1994). "Asignación del gen del grupo C (XPC) del xeroderma pigmentoso al cromosoma 3p25". Genómica . 21 (1): 266–9. doi : 10.1006 / geno.1994.1256 . PMID  8088800 .
• Maruyama K, Sugano S (1994). "Oligo-taponamiento: un método simple para reemplazar la estructura de la tapa de ARNm eucariotas con oligoribonucleótidos". Gene . 138 (1–2): 171–4. doi : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90802-8 . PMID  8125298 .
• Masutani C, Sugasawa K, Yanagisawa J, Sonoyama T, Ui M, Enomoto T, Takio K, Tanaka K, van der Spek PJ, Bootsma D (1994). "Purificación y clonación de un complejo de reparación de escisión de nucleótidos que involucra la proteína del grupo C de xeroderma pigmentoso y un homólogo humano de la levadura RAD23" . EMBO J . 13 (8): 1831–43. doi : 10.1002 / j.1460-2075.1994.tb06452.x . PMC  395023 . PMID  8168482 .
• Li L, Bales ES, Peterson CA, Legerski RJ (1994). "Caracterización de defectos moleculares en xeroderma pigmentosum grupo C". Nat. Genet . 5 (4): 413–7. doi : 10.1038 / ng1293-413 . PMID  8298653 . S2CID  24923699 .
• Li L, Peterson C, Legerski R (1996). "Secuencia del ADNc de XPC de ratón y estructura genómica del gen XPC humano" . Ácidos nucleicos Res . 24 (6): 1026–8. doi : 10.1093 / nar / 24.6.1026 . PMC  145764 . PMID  8604333 .
• van der Spek PJ, Eker A, Rademakers S, Visser C, Sugasawa K, Masutani C, Hanaoka F, Bootsma D, Hoeijmakers JH (1996). "XPC y homólogos humanos de RAD23: localización intracelular y relación con otros complejos de reparación de escisión de nucleótidos" . Ácidos nucleicos Res . 24 (13): 2551–9. doi : 10.1093 / nar / 24.13.2551 . PMC  145966 . PMID  8692695 .
• Li L, Lu X, Peterson C, Legerski R (1997). "XPC interactúa con HHR23B y HHR23A in vivo". Mutat. Res . 383 (3): 197–203. doi : 10.1016 / s0921-8777 (97) 00002-5 . PMID  9164480 .
• Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). "Construcción y caracterización de una biblioteca de ADNc enriquecida en longitud completa y enriquecida en el extremo 5 '". Gene . 200 (1–2): 149–56. doi : 10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3 . PMID  9373149 .
• Zeng L, Quilliet X, Chevallier-Lagente O, Eveno E, Sarasin A, Mezzina M (1998). "La transferencia de genes mediada por retrovirus corrige el defecto de reparación del ADN de las células de xeroderma pigmentoso de los grupos de complementación A, B y C" . Gene Ther . 4 (10): 1077–84. doi : 10.1038 / sj.gt.3300495 . PMID  9415314 .
• Khan SG, Levy HL, Legerski R, Quackenbush E, Reardon JT, Emmert S, Sancar A, Li L, Schneider TD, Cleaver JE, Kraemer KH (1998). "Mutación de empalme de Xeroderma pigmentosum grupo C asociada con autismo e hipoglicinemia" . J. Invest. Dermatol . 111 (5): 791–6. doi : 10.1046 / j.1523-1747.1998.00391.x . PMID  9804340 .
• Yokoi M, Masutani C, Maekawa T, Sugasawa K, Ohkuma Y, Hanaoka F (2000). "El complejo de proteínas del grupo C de xeroderma pigmentoso XPC-HR23B juega un papel importante en el reclutamiento del factor de transcripción IIH al ADN dañado" . J. Biol. Chem . 275 (13): 9870–5. doi : 10.1074 / jbc.275.13.9870 . PMID  10734143 .
• Batty D, Rapic'-Otrin V, Levine AS, Wood RD (2000). "La unión estable del complejo XPC humano al ADN irradiado confiere una fuerte discriminación de los sitios dañados". J. Mol. Biol . 300 (2): 275–90. doi : 10.1006 / jmbi.2000.3857 . PMID  10873465 .
• Araújo SJ, Nigg EA, Wood RD (2001). "Interacciones funcionales fuertes de TFIIH con XPC y XPG en la reparación por escisión de nucleótidos de ADN humano, sin un reparosoma preensamblado" . Mol. Celda. Biol . 21 (7): 2281–91. doi : 10.1128 / MCB.21.7.2281-2291.2001 . PMC  86862 . PMID  11259578 .
• Araki M, Masutani C, Takemura M, Uchida A, Sugasawa K, Kondoh J, Ohkuma Y, Hanaoka F (2001). "La proteína del centrosoma centrina 2 / caltractina 1 es parte del complejo del grupo C de xeroderma pigmentosum que inicia la reparación global por escisión de nucleótidos del genoma" . J. Biol. Chem . 276 (22): 18665–72. doi : 10.1074 / jbc.M100855200 . PMID  11279143 .

enlaces externos

• Entrada de GeneReviews / NIH / NCBI / UW sobre Xeroderma Pigmentosum