Los Xanthomonadales son un orden bacteriano dentro de las Gammaproteobacteria . Son uno de los grupos más grandes de fitopatógenos bacterianos , albergando especies como Xanthomonas citri , Xanthomonas euvesicatoria , Xanthomonas oryzae y Xylella fastidiosa . [1] [2] [3] [4] [5] Estas bacterias afectan a plantas de importancia agrícola, como tomates, plátanos, cítricos, arroz y café. Muchas especies dentro del orden también son patógenos humanos. Las especies del género Stenotrophomonas son oportunistas resistentes a múltiples fármacos patógenos responsables de infecciones nosocomiales en pacientes inmunodeficientes . [6] [7]
Xantomonadales | |
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Mancha foliar en la planta de hiedra inglesa , causada por Xanthomonas hortorum | |
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Caracteristicas
Los xantomonadales son aerobios obligados gramnegativos , catalasa positivos y no formadores de esporas . [8] Los miembros pertenecientes a la orden son varillas rectas sin prótesis . Mientras que algunos miembros son inmóviles, otras especies dentro del orden son móviles por medio de flagelos . Stenotrophomonas es el único género capaz de reducir los nitratos dentro de los Xanthomonadales.
Taxonomía
Los Xanthomonadales constan de 28 géneros con nombres válidos entre dos familias: Xanthomonadaceae y Rhodanobacteraceae . [9] [10] [11] La Xanthomonadaceae consta de 13 géneros, mientras que la Rhodanobacteraceae consta de 14 géneros. Las familias se pueden distinguir unas de otras sobre la base de indeles de firma conservados que se encuentran entre una variedad de proteínas, específicas para cada familia. [10] Estos indeles están en paralelo con el análisis filogenómico que revela dos clados distintos que parecen ser evolutivamente divergentes. Lysobacterales y Lysobacteraceae son sinónimos anteriores de Xanthomonadales y Xanthomonadaceae , respectivamente. [10] [12]
Posición filogenética
Los Xanthomonadales son los primeros divergentes de bacterias dentro de las Gammaproteobacteria y, a menudo, se utilizan para enraizar árboles filogenéticos creados para la clase. [13] Hasta hace poco, el orden Xanthomonodales incluía a las familias Xanthomonadaceae , Algiphilaceae , Solimonadaceae , Nevskiaceae y Sinobacteraceae . Sin embargo, no se encontraron firmas moleculares que incluyan a todas las familias. [10] Los organismos se reorganizaron taxonómicamente de modo que Xanthomonadales incluía Xanthomonadaceae , que luego se dividió en dos familias. La división estaba de acuerdo con los CSI que se encontraron específicamente para todos los miembros de la orden Xanthomonadales enmendada, proporcionando soporte para la taxonomía actualmente aceptada. Todas las demás especies se transfirieron a Nevskiales , que no compartía CSI con Xanthomonadales, pero siguen siendo parientes cercanos dentro de Gammaproteobacteria . [10] Cardiobacteriales , Chromatiales , Methylococcales , Legionellales y Thiotrichales son también órdenes de ramificación profunda que son vecinos filogenéticos de miembros Xanthomonadales y Nevskiales . [10] [13] El orden Nevskiales alberga una sola familia ( Salinisphaeraceae ) y seis géneros: Alkanibacter , Fontimonas , Hydrocarboniphaga , Nevskia , Solimonas y Steroidobacter . [10] Las larvas de Wohlfahrtiimonas chitiniclastica e Ignatzschineria son dos especies que históricamente han sido aceptadas como miembros de la familia Xanthomonadaceae . Sin embargo, no comparten firmas conservadas con la familia, ni con la orden Xanthomonodales. [10] Estas especies forman ramificaciones profundas dentro de las vecinas Gammaproteobacteria , y son monofiléticas con miembros Cardiobacteriales . Por tanto, estas especies están actualmente etiquetadas como incertae sedis .
Filogenia
La taxonomía actualmente aceptada se basa en el Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI). [9]
- Rhodanobacteraceae
- " Gynumella "
- Aquimonas
- Chiayiivigra
- Megamonas
- Dokdonella
- Dyella
- Frateuria
- Fulvimonas
- Luteibacter
- Metallibacterium
- Mizugakiibacter
- Oleiagrimonas
- Pseudofulvimonas
- Rhodanobacter
- Rudea
- Tahibacter
- Xanthomonadaceae
- Arenimonas
- Denitratimonas
- Kaistibacter
- Luteimonas
- Lisobacter
- Pseudoxanthomonas
- Rehaibacterium
- Silanimonas
- Stenotrophomonas
- Thermomonas
- Vulcaniibacterium
- Xanthomonas
- Xylella
Referencias
- ↑ da Silva AC, Ferro JA, Reinach FC, et al. (2002). "Comparación de los genomas de dos patógenos Xanthomonas con diferentes especificidades del huésped". Naturaleza . 417 (6887): 459–463. doi : 10.1038 / 417459a . PMID 12024217 .
- ^ Van Sluys MA, de Oliveira MC, Monteiro-Vitorello CB, et al. (2003). "Análisis comparativos de las secuencias del genoma completo de la enfermedad de Pierce y cepas de clorosis variegada de cítricos de Xylella fastidiosa" . J Bacteriol . 185 (3): 1018–26. doi : 10.1128 / JB.185.3.1018-1026.2003 . PMC 142809 . PMID 12533478 .
- ^ Lee BM, Park YJ, Park DS y col. (2005). "La secuencia del genoma de Xanthomonas oryzae patovar oryzae KACC10331, el patógeno del tizón bacteriano del arroz" . Ácidos nucleicos Res . 33 (2): 577–586. doi : 10.1093 / nar / gki206 . PMC 548351 . PMID 15673718 .
- ^ Ryan RP, Vorholter F, Potnis N y col. (2005). "Patogenómica de Xanthomonas: comprensión de las interacciones planta-bacteria". Nat Rev Microbiol . 9 (5): 344–355. doi : 10.1038 / nrmicro2558 . PMID 21478901 .
- ^ Chen J, Xie G, Han S, Chertkov O, Sims D, Civerolo EL (2010). "Secuencias del genoma completo de dos cepas de Xylella fastidiosa (M12 y M23) que causan la enfermedad de quemadura de hoja de almendro en California" . J Bacteriol . 192 (17): 4534. doi : 10.1128 / JB.00651-10 . PMC 2937377 . PMID 20601474 .
- ^ Crossman LC, Gould VC, Dow JM y col. (2008). "El genoma completo, análisis comparativo y funcional de Stenotrophomonas maltophilia revela un organismo fuertemente protegido por determinantes de resistencia a los medicamentos" . Genome Biol . 9 (4): R74. doi : 10.1186 / gb-2008-9-4-r74 . PMC 2643945 . PMID 18419807 .
- ^ Looney WJ, Narita M, Mühlemann K (2009). "Stenotrophomonas maltophilia: un patógeno humano oportunista emergente". Lancet Infect Dis . 9 (5): 312–323. doi : 10.1016 / S1473-3099 (09) 70083-0 . PMID 19393961 .
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- ^ a b c d e f g h Naushad S, Adeolu M, Wong S, Sohail M, Schellhorn HE, Gupta RS (2015). "Un marco taxonómico basado en marcadores filogenómicos y moleculares para el orden Xanthomonadales: propuesta para transferir las familias Algiphilaceae y Solimonadaceae al orden Nevskiales ord. Nov. Y para crear una nueva familia dentro del orden Xanthomonadales, la familia Rhodanobacteraceae fam. Nov., Que contiene el género Rhodanobacter y sus parientes más cercanos ". Antonie van Leeuwenhoek . 107 (2): 467–485. doi : 10.1007 / s10482-014-0344-8 . PMID 25481407 .
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