Dedo de zinc y proteína que contiene el dominio BTB 16

ZBTB16
Estructuras disponibles PDB Búsqueda de ortólogos: PDBe RCSB Lista de códigos de identificación de PDB 1BUO , 1CS3
Identificadores
Alias	ZBTB16 , PLZF, ZNF145, dedo de zinc y dominio BTB que contiene 16
Identificaciones externas	OMIM : 176797 MGI : 103222 HomoloGene : 21214 GeneCards : ZBTB16
Ubicación de genes ( humanos ) Chr. Cromosoma 11 (humano) [1] Banda 11q23.2 Comienzo 114,059,711 pb [1] Fin 114,256,765 pb [1]
Ubicación de genes ( ratón ) Chr. Cromosoma 9 (ratón) [2] Banda 9 A5.3 | 9 26.47 cm Comienzo 48.654.297 pb [2] Fin 48,836,222 pb [2]
Patrón de expresión de ARN Más datos de expresión de referencia
Ontología de genes Función molecular • GO: 0000980 ARN polimerasa II reguladora en cis de unión a ADN de la región secuencia-específica • la unión al ADN • actividad homodimerización proteína • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 DNA-binding factor de transcripción actividad • de unión de iones metálicos • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 Actividad represora de la transcripción de unión al ADN, específica de la ARN polimerasa II • GO: unión a proteínas 0001948 • unión a proteínas idéntica • unión a ácidos nucleicos • unión a ADN bicatenario • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Actividad del factor de transcripción de unión al ADN, específico de la ARN polimerasa II • Unión de la proteína C-terminal • Unión específica de dominio de proteína • Unión de ADN específica de secuencia Componente celular • cuerpo PML • mota nuclear • cuerpo nuclear • celda de membrana • transcripcional represor complejo • célula núcleo • citosol • macromolecular compleja • nucleoplasma Proceso biológico • Morfogénesis embrionaria de las extremidades posteriores • Morfogénesis de las extremidades anteriores • Desarrollo del sistema esquelético • Diferenciación de células mieloides • Regulación de la transcripción, plantilla de ADN • Especificación del patrón embrionario • Morfogénesis de los dedos embrionarios • Regulación positiva de la osificación • Regulación negativa de la transcripción del promotor de la ARN polimerasa II • Morfogénesis de las extremidades posteriores • transcripción, plantilla de ADN • desarrollo de mesonefros • regulación positiva de la transcripción, plantilla de ADN • desarrollo del sistema nervioso central • desarrollo del cartílago • división asimétrica de células madre de la línea germinal masculina • regulación positiva del desarrollo del cartílago • ubiquitinación de proteínas • regulación positiva de la diferenciación de condrocitos • regulación positiva del proceso apoptótico • localización de proteínas en el núcleo • regulación positiva de la diferenciación de células T NK • regulación negativa de transcripción, plantilla de ADN • regulación positiva de la diferenciación de las células grasas • regulación negativa de la diferenciación de las células mieloides • especificación del patrón anterior / posterior • regulación negativa de la proliferación celular • proceso apoptótico • modificación postraduccional • hematopoyesis • regulación positiva de la transcripción del promotor de la ARN polimerasa II Fuentes: Amigo / QuickGO
Ortólogos
Especies	Humano	Ratón
Entrez	7704	235320
Ensembl	ENSG00000109906	ENSMUSG00000066687
UniProt	Q05516	Q3UQ17
RefSeq (ARNm)	NM_001018011 NM_006006 NM_001354750 NM_001354751 NM_001354752	NM_001033324 NM_001364543
RefSeq (proteína)	NP_001018011 NP_005997 NP_001341679 NP_001341680 NP_001341681	NP_001028496 NP_001351472
Ubicación (UCSC)	Crónicas 11: 114,06 - 114,26 Mb	Crónicas 9: 48,65 - 48,84 Mb
Búsqueda en PubMed	[3]	[4]
Wikidata
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La proteína 16 que contiene el dedo de zinc y el dominio BTB es una proteína que en humanos está codificada por el gen ZBTB16 .

Función

Este gen es miembro de la familia de proteínas de dedos de zinc de tipo Krueppel C2H2 y codifica un factor de transcripción de dedos de zinc que contiene nueve dominios de dedos de zinc de tipo Kruppel en el extremo carboxilo. Esta proteína se encuentra en el núcleo, participa en la progresión del ciclo celular e interactúa con una histona desacetilasa . Se han asociado casos específicos de reordenamiento génico aberrante en este locus con la leucemia promielocítica aguda (APL) ^[5] y se han identificado funciones fisiológicas en las células T Natural Killer de ratón ^{[6] [7]} y en las células T gamma-delta . ^[8]Se han caracterizado variantes de corte y empalme transcripcionales alternativas en humanos. ^{[9] [10]}

Interacciones

Se ha demostrado que el dedo de zinc y la proteína 16 que contiene el dominio BTB interactúan con:

• Receptor de angiotensina II tipo 1 , ^[11]
• BCL6 , ^[12]
• IMC1 , ^[13]
• Receptor de calcitriol , ^{[14] [15]}
• FHL2 , ^[16]
• GATA1 , ^[17]
• GATA2 , ^[18]
• HDAC1 , ^{[19] [20] [21]}
• HDAC4 , ^{[19] [22]}
• HDAC5 , ^{[19] [22]}
• HDAC6 , ^[19]
• Factor de crecimiento similar al EGF que se une a la heparina , ^{[23] [24]}
• Correpresor del receptor nuclear 2 , ^{[21] [25] [26]}
• Proteína de leucemia promielocítica ^[27]
• RUNX1T1 , ^{[28] [29]}
• Receptor alfa del ácido retinoico , ^[30]
• SIN3A , ^{[14] [20] [21]}
• SIN3B , ^[20] y
• ZBTB32 . ^[31]

Ver también

• Zbtb7

Referencias

1. GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000109906 - Ensembl , mayo de 2017
2. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000066687 - Ensembl , mayo de 2017
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6. Kovalovsky D, Uche OU, Eladad S, Hobbs RM, Yi W, Alonzo E, Chua K, Eidson M, et al. (2008). "El regulador transcripcional BTB-zinc dedo, PLZF, controla el desarrollo de funciones efectoras de células iNKT" . Inmunología de la naturaleza . 9 (9): 1055–64. doi : 10.1038 / ni.1641 . PMC 2662733 . PMID 18660811 .  
7. AK salvaje, Constantinides MG, Han J, Picard D, Martin E, Li B, Lantz O, Bendelac A (2008). "El factor de transcripción PLZF (Zbtb16) dirige el programa efector del linaje de células NKT" . La inmunidad . 29 (3): 391–403. doi : 10.1016 / j.immuni.2008.07.011 . PMC 2613001 . PMID 18703361 .  
8. Kreslavsky T, Savage AK, Hobbs R, Gounari F, Bronson R, Pereira P, Pandolfi PP, Bendelac A, von Boehmer H (2009). "Factor de transcripción PLZF inducible por TCR requerido para el fenotipo innato de un subconjunto de células T γδ con diversidad de TCR restringida" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 106 (30): 12453–8. Código Bibliográfico : 2009PNAS..10612453K . doi : 10.1073 / pnas.0903895106 . PMC 2718370 . PMID 19617548 .  
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Lectura adicional

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Enlaces externos

• ZBTB16 + proteína, + humano en los encabezados de temas médicos (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .

Este artículo incorpora texto de la Biblioteca Nacional de Medicina de los Estados Unidos , que es de dominio público .