El factor de complementación APOBEC1 es una proteína que en humanos está codificada por el gen A1CF . [5] [6] [7]
A1CF | |||||||||||||||||||||||||
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Identificadores | |||||||||||||||||||||||||
Alias | Factor de complementación A1CF , ACF, ACF64, ACF65, APOBEC1CF, ASP, APOBEC1 | ||||||||||||||||||||||||
Identificaciones externas | OMIM : 618199 MGI : 1917115 HomoloGene : 16363 GeneCards : A1CF | ||||||||||||||||||||||||
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Ortólogos | |||||||||||||||||||||||||
Especies | Humano | Ratón | |||||||||||||||||||||||
Entrez |
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Ensembl |
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UniProt |
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RefSeq (ARNm) |
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RefSeq (proteína) |
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Ubicación (UCSC) | 10: 50,8 - 50,89 Mb | 19 de Cr: 31,87 - 31,95 Mb | |||||||||||||||||||||||
Búsqueda en PubMed | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Wikidata | |||||||||||||||||||||||||
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Gene
Se produce un corte y empalme alternativo en este locus y se han descrito tres variantes de transcripción de longitud completa, que codifican tres isoformas distintas. Se ha observado un empalme adicional, pero no se ha determinado la naturaleza completa de estas variantes. [7]
Función
El ARNm de la apolipoproteína B de mamíferos se somete a desaminación de C a U específica de sitio , que está mediada por un complejo enzimático de múltiples componentes que contiene un núcleo mínimo compuesto por APOBEC1 y un factor de complementación codificado por este gen. [8] El producto génico tiene tres motivos de reconocimiento de ARN no idénticos y pertenece a la familia hnRNP R de proteínas de unión a ARN. Se ha propuesto que este factor de complementación funciona como una subunidad de unión de ARN y acopla APOBEC1 para desaminar la citidina aguas arriba . Los estudios sugieren que la proteína también puede estar involucrada en otros eventos de edición o procesamiento de ARN. [7]
Su eliminación resulta en letalidad en ratones. [9]
Interacciones
Se ha demostrado que A1CF interactúa con APOBEC1 , [10] [11] CUGBP2 , [12] y SYNCRIP . [13] [10]
Referencias
- ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000148584 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000052595 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
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- ^ a b c "Entrez Gene: factor de complementación A1CF APOBEC1" .
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- ^ Blanc V, Henderson JO, Newberry EP, Kennedy S, Luo J, Davidson NO (agosto de 2005). "La deleción dirigida del gen del factor de complementación de apobec-1 murino (acf) resulta en letalidad embrionaria" . Mol. Célula. Biol . 25 (16): 7260–9. doi : 10.1128 / MCB.25.16.7260-7269.2005 . PMC 1190267 . PMID 16055734 .
- ^ a b Blanc V, Navaratnam N, Henderson JO, Anant S, Kennedy S, Jarmuz A, Scott J, Davidson NO (marzo de 2001). "Identificación de GRY-RBP como una proteína de unión a ARN de apolipoproteína B que interactúa con el factor de complementación de apobec-1 y apobec-1 para modular la edición de C a U" . J. Biol. Chem . 276 (13): 10272–83. doi : 10.1074 / jbc.M006435200 . PMID 11134005 .
- ^ Mehta A, Kinter MT, Sherman NE, Driscoll DM (marzo de 2000). "Clonación molecular del factor de complementación apobec-1, una nueva proteína de unión a ARN involucrada en la edición de ARNm de apolipoproteína B" . Mol. Célula. Biol . 20 (5): 1846–54. doi : 10.1128 / MCB.20.5.1846-1854.2000 . PMC 85365 . PMID 10669759 .
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enlaces externos
- Ubicación del genoma humano A1CF y página de detalles del gen A1CF en UCSC Genome Browser .
Otras lecturas
- Mehta A, Kinter MT, Sherman NE, Driscoll DM (2000). "Clonación molecular del factor de complementación apobec-1, una nueva proteína de unión a ARN involucrada en la edición de ARNm de apolipoproteína B" . Mol. Célula. Biol . 20 (5): 1846–54. doi : 10.1128 / MCB.20.5.1846-1854.2000 . PMC 85365 . PMID 10669759 .
- Lellek H, Kirsten R, Diehl I, Apostel F, Buck F, Greeve J (2000). "Purificación y clonación molecular de un nuevo componente esencial del complejo enzimático de edición de ARNm de apolipoproteína B" . J. Biol. Chem . 275 (26): 19848–56. doi : 10.1074 / jbc.M001786200 . PMID 10781591 .
- Yang Y, diputado de Sowden, Smith HC (2000). "Inducción de citidina a la edición de uridina en ARNm de apolipoproteína B citoplasmática por sobreexpresión de APOBEC-1" . J. Biol. Chem . 275 (30): 22663–9. doi : 10.1074 / jbc.M910406199 . PMID 10833526 .
- Blanc V, Navaratnam N, Henderson JO, Anant S, Kennedy S, Jarmuz A, Scott J, Davidson NO (2001). "Identificación de GRY-RBP como una proteína de unión a ARN de apolipoproteína B que interactúa con el factor de complementación de apobec-1 y apobec-1 para modular la edición de C a U" . J. Biol. Chem . 276 (13): 10272–83. doi : 10.1074 / jbc.M006435200 . PMID 11134005 .
- Harrington JJ, Sherf B, Rundlett S, Jackson PD, Perry R, Cain S, Leventhal C, Thornton M, Ramachandran R, Whittington J, Lerner L, Costanzo D, McElligott K, Boozer S, Mays R, Smith E, Veloso N , Klika A, Hess J, Cothren K, Lo K, Offenbacher J, Danzig J, Ducar M (2001). "Creación de bibliotecas de expresión de proteínas en todo el genoma mediante la activación aleatoria de la expresión génica". Nat. Biotechnol . 19 (5): 440–5. doi : 10.1038 / 88107 . PMID 11329013 . S2CID 25064683 .
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- Chester A, Somasekaram A, Tzimina M, Jarmuz A, Gisbourne J, O'Keefe R, Scott J, Navaratnam N (2003). "El complejo de edición de ARNm de apolipoproteína B realiza un ciclo multifuncional y suprime la descomposición mediada por tonterías" . EMBO J . 22 (15): 3971–82. doi : 10.1093 / emboj / cdg369 . PMC 169042 . PMID 12881431 .
- Blanc V, Kennedy S, Davidson NO (2003). "Una nueva señal de localización nuclear en el dominio auxiliar del factor de complementación apobec-1 regula la importación y el transporte nucleocitoplasmático" . J. Biol. Chem . 278 (42): 41198–204. doi : 10.1074 / jbc.M302951200 . PMID 12896982 .
- Xie K, Sowden MP, Dance GS, Torelli AT, Smith HC, Wedekind JE (2004). "La estructura de una desaminasa de edición de ARN de levadura proporciona información sobre el pliegue y la función de la desaminasa inducida por activación y APOBEC-1" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 101 (21): 8114–9. Código Bibliográfico : 2004PNAS..101.8114X . doi : 10.1073 / pnas.0400493101 . PMC 419566 . PMID 15148397 .