El factor de intercambio de nucleótidos de guanina Rho 7 es una proteína que en humanos está codificada por el gen ARHGEF7 . [5] [6] [7] [8]
ARHGEF7 |
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Estructuras disponibles |
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PDB | Búsqueda de ortólogos: PDBe RCSB |
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Lista de códigos de identificación de PDB |
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1BY1 , 1ZSG , 2L3G |
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Identificadores |
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Alias | ARHGEF7 , BETA-PIX, COOL-1, COOL1, Nbla10314, P50, P50BP, P85, P85COOL1, P85SPR, PAK3, PIXB, factor de intercambio de nucleótidos de guanina Rho 7 |
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Identificaciones externas | OMIM : 605477 MGI : 1860493 HomoloGene : 2895 GeneCards : ARHGEF7 |
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Ubicación de genes ( humanos ) |
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| Chr. | Cromosoma 13 (humano) [1] |
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| Banda | 13q34 | Comienzo | 111,114,559 pb [1] |
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Final | 111.305.737 pb [1] |
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Ubicación de genes ( ratón ) |
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| Chr. | Cromosoma 8 (ratón) [2] |
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| Banda | 8 | 8 A1.1 | Comienzo | 11,727,721 pb [2] |
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Final | 11,835,219 pb [2] |
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Ontología de genes |
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Función molecular | • GO: 0001948 unión a proteínas • actividad del factor de intercambio de guanil-nucleótidos • unión a proteína quinasa
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Componente celular | • citoplasma • citosol • proyección celular • adhesión focal • la colmena • plasma membrana • Unión Celular • cuerpo celular neuronal • corteza celular • proyección neurona • almacenamiento vacuola • lamellipodium • intracelular anatómica estructura
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Proceso biológico | • regulación de la unión de GTP • GO: 0007243 transducción de señales intracelulares • regulación negativa de la vía de señalización del receptor del factor de crecimiento epidérmico • regulación positiva de la morfogénesis del lamelipodio • organización de Golgi • vía de señalización del receptor de efrina • desarrollo del sistema nervioso • ensamblaje de adhesión focal • regulación positiva de la adhesión del sustrato -propagación celular dependiente • regulación positiva de la secreción de la hormona del crecimiento • diferenciación de las células progenitoras hematopoyéticas • regulación positiva del proceso apoptótico • regulación positiva de la unión a proteínas • regulación de la transducción de señales de la proteína Rho • regulación de la transducción de señales mediada por GTPasa pequeña • regulación positiva de la migración de fibroblastos • transducción de señales • ensamblaje de lamelipodio • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 regulación positiva de la actividad de GTPasa • Vía de señalización del receptor acoplado a proteína G
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Fuentes: Amigo / QuickGO |
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Ortólogos |
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Especies | Humano | Ratón |
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Entrez | | |
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Ensembl | | |
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UniProt | | |
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RefSeq (ARNm) | NM_001113511 NM_001113512 NM_001113513 NM_003899 NM_145735
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NM_001320851 NM_001320852 NM_001320853 NM_001320854 NM_001330597 NM_001330598 NM_001354046 NM_001354047 NM_001354048 NM_001354049 NM_001354050 NM_001354051 NM_001354052 NM_001354053 NM_001354054 NM_001354055 NM_001354056 NM_001354057 NM_001354058 NM_001354059 NM_001354060 NM_001354061 |
| NM_001113517 NM_001113518 NM_017402 NM_001372321 NM_001372322
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NM_001372323 NM_001372324 NM_001372325 NM_001372326 |
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RefSeq (proteína) | NP_001106983 NP_001106984 NP_001106985 NP_001307780 NP_001307781
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NP_001307782 NP_001307783 NP_001317526 NP_001317527 NP_003890 NP_663788 NP_001340975 NP_001340976 NP_001340977 NP_001340978 NP_001340979 NP_001340980 NP_001340981 NP_001340982 NP_001340983 NP_001340984 NP_001340985 NP_001340986 NP_001340987 NP_001340988 NP_001340989 NP_001340990 NP_001106985.1 NP_003890.1 NP_001307780.1 |
| NP_001106989 NP_001106990 NP_059098 NP_001359250 NP_001359251
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NP_001359252 NP_001359253 NP_001359254 NP_001359255 |
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Ubicación (UCSC) | Crónicas 13: 111,11 - 111,31 Mb | Crónicas 8: 11,73 - 11,84 Mb |
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Búsqueda en PubMed | [3] | [4] |
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Wikidata |
Ver / editar humano | Ver / Editar mouse |
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ARHGEF7 se conoce comúnmente como el p 21- una proteína ctivated quinasa e x cambio del factor alfa (beta-PIX o βPIX), ya que se identificó mediante la unión a la quinasa activada por p21 (PAK) y también contiene un factor de intercambio de nucleótidos de guanina de dominio . [6]
βPIX es una proteína multidominio que funciona como una proteína de andamio de señalización y como una enzima . [9] βPIX comparte esta estructura de dominio y función de señalización con la proteína ARHGEF6 / αPIX muy similar .
βPIX se somete a un corte y empalme alternativo extenso para generar múltiples variantes de proteínas que contienen o carecen de dominios proteicos particulares. [9] Todas las formas adultas carecen del dominio CH aminoterminal, y las dos variantes adultas principales tienen una región carboxilo terminal alternativa (denominadas β1 y β2): las formas β1 contienen el dominio de trimerización en espiral y el motivo PDZ-diana para unirse a PDZ proteínas (ver más abajo), mientras que las formas β2 carecen de ambos dominios y sus funciones correspondientes. [9]
βPIX contiene un dominio RhoGEF de DH / PH central que funciona como factor de intercambio de nucleótidos de guanina (GEF) para pequeñas GTPasas de la familia Rho , y específicamente Rac y Cdc42 . [6] Al igual que otros GEF, βPIX puede promover tanto la liberación de GDP de una pequeña proteína de unión a GTP inactiva como la unión de GTP para promover su activación. Los andamios de señalización se unen a socios específicos para promover la transducción de señales eficiente al organizar elementos secuenciales de una vía cerca uno del otro para facilitar la interacción / transferencia de información, y también al mantener estos complejos de proteínas socios en ubicaciones específicas dentro de la célula para promover la señalización local o regional. En el caso de βPIX, su dominio SH3 se une a proteínas asociadas con motivos de poliprolina apropiados y, en particular, a quinasas activadas por p21 (PAK) del grupo I ( PAK1 , PAK2 y PAK3 ). [6] PAK se une al dominio βPIX SH3 en el estado inactivo, y la unión de Rac1 o Cdc42 activada a este PAK estimula su actividad de proteína quinasa que conduce a la fosforilación de la proteína diana aguas abajo ; dado que βPIX puede activar las pequeñas GTPasas Rac1 o Cdc42 “p21” a través de su actividad GEF, este complejo βPIX / PAK / Rac ejemplifica una función de andamiaje.
Estructuralmente, βPIX se ensambla como un trímero a través de un dominio de espiral en espiral carboxilo terminal que está presente en la variante principal de empalme carboxilo terminal β1, y además interactúa con dímeros de GIT1 o GIT2 a través de un dominio de unión a GIT cercano para formar GIT-PIX oligomérico. complejos. [9] A través de este complejo GIT-PIX, la función de andamiaje de βPIX se amplifica al ser capaz también de mantener a los socios GIT cerca de los socios βPIX. Por el contrario, las variantes del terminal carboxilo β2 carecen de esta región en espiral y se prevé que no puedan trimerizarse. La principal variante carboxilo terminal β1 también tiene un motivo diana de unión al dominio PDZ que se une a los dominios PDZ en las proteínas SHANK1 , [10] scribble , [11] y SNX27 [12] . Algunas variantes de corte y empalme de βPIX contienen un dominio de homología de calponina (CH) amino-terminal cuyas funciones permanecen relativamente mal definidas, pero pueden interactuar con proteínas de la familia de parvin / affixina . [13] [9] Las variantes de βPIX con este dominio CH amino terminal extendido se expresan más en las primeras etapas del desarrollo, pero parecen raras después del nacimiento. [9]
Se ha informado que la βPIX interactúa con más de 120 proteínas. [9] [14]
Las principales proteínas que interactúan incluyen:
- En sí mismo, o el ARHGEF6 / αPIX altamente relacionado a través de una interacción de bobina en espiral trimérica.
- Dímeros GIT1 o GIT2 a través del dominio de unión a GIT.
- Quinasas activadas por p21 (PAK) 1, 2 y 3 a través del dominio SH3.
- c-Cbl a través del dominio SH3.
- Miembros de la familia de proteínas de unión a GTP de la familia Rho Rac1 y Cdc42 , activados a través del dominio DHPH RhoGEF .
- Los adaptadores de sinapsis neuronales SHANK1 , SHANK2 y SHANK3 a través de PDZ
- Garabatear a través de PDZ
- SNX27 a través de PDZ