La ribonucleoproteína nuclear heterogénea D0 (HNRNPD), también conocida como proteína 1 de unión a ARN de elemento rico en AU (AUF1), es una proteína que en los seres humanos está codificada por el gen HNRNPD . [5] [6] El empalme alternativo de este gen da como resultado cuatro variantes de transcripción.
HNRNPD | |||||||||||||||||||||||||
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Identificadores | |||||||||||||||||||||||||
Alias | HNRNPD , AUF1 , AUF1A, HNRPD, P37, hnRNPD0, ribonucleoproteína nuclear heterogénea D | ||||||||||||||||||||||||
Identificaciones externas | OMIM : 601324 MGI : 101947 HomoloGene : 22410 GeneCards : HNRNPD | ||||||||||||||||||||||||
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Ortólogos | |||||||||||||||||||||||||
Especies | Humano | Ratón | |||||||||||||||||||||||
Entrez |
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Ensembl |
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UniProt |
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RefSeq (ARNm) |
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RefSeq (proteína) |
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Ubicación (UCSC) | Crónicas 4: 82,35 - 82,37 Mb | Crónicas 5: 99,96 - 99,98 Mb | |||||||||||||||||||||||
Búsqueda en PubMed | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Wikidata | |||||||||||||||||||||||||
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Función
Este gen pertenece a la subfamilia de ribonucleoproteínas nucleares heterogéneas expresadas de forma ubicua (hnRNP). Los hnRNP son proteínas de unión a ácidos nucleicos y forman complejos con ARN nuclear heterogéneo (hnRNA). Los sitios de interacción en el ARN con frecuencia están sesgados hacia motivos de secuencia particulares. [7] Estas proteínas están asociadas con pre-mRNA en el núcleo y parecen influir en el procesamiento de pre-mRNA y otros aspectos del metabolismo y transporte del mRNA. Si bien todos los hnRNP están presentes en el núcleo, algunos parecen desplazarse entre el núcleo y el citoplasma . Las proteínas hnRNP tienen distintas propiedades de unión a ácidos nucleicos. La proteína codificada por este gen tiene dos repeticiones de dominios cuasi-RRM que se unen a los ARN. Se localiza tanto en el núcleo como en el citoplasma. Esta proteína está implicada en la regulación de la estabilidad del ARNm. [6]
Interacciones
Se ha demostrado que HnRNP D interactúa con SAFB [8] y Hsp27 . [9] También se ha informado que interactúa con ARNm como el ARNm de Mef2c. [10]
Referencias
- ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000138668 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000000568 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
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- ^ Arao Y, Kuriyama R, Kayama F, Kato S (agosto de 2000). "Un factor asociado a la matriz nuclear, SAF-B, interactúa con isoformas específicas de AUF1 / hnRNP D". Arco. Biochem. Biophys . 380 (2): 228–36. doi : 10.1006 / abbi.2000.1938 . PMID 10933876 .
- ^ Sinsimer KS, Gratacós FM, Knapinska AM, Lu J, Krause CD, Wierzbowski AV, Maher LR, Scrudato S, Rivera YM, Gupta S, Turrin DK, De La Cruz MP, Pestka S, Brewer G (septiembre de 2008). "Chaperone Hsp27, una nueva subunidad de complejos de proteínas AUF1, funciona en la desintegración de ARNm mediada por elementos ricos en AU" . Mol. Célula. Biol . 28 (17): 5223–37. doi : 10.1128 / MCB.00431-08 . PMC 2519747 . PMID 18573886 .
- ^ Panda AC, Abdelmohsen K, Yoon JH, Martindale JL, Yang X, Curtis J, Mercken EM, Chenette DM, Zhang Y, Schneider RJ, Becker KG, de Cabo R, Gorospe M (agosto de 2014). "La proteína de unión a ARN AUF1 promueve la miogénesis regulando los niveles de expresión de MEF2C" . Mol Cell Biol . 34 (16): 3106-19. doi : 10.1128 / MCB.00423-14 . PMC 4135590 . PMID 24891619 .
Otras lecturas
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- Lahiri DK, Thomas JO (1986). "Un clon de ADNc de las proteínas hnRNP C y su homología con la proteína de unión a ADN monocatenario UP2" . Ácidos nucleicos Res . 14 (10): 4077–4094. doi : 10.1093 / nar / 14.10.4077 . PMC 339847 . PMID 3754960 .
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enlaces externos
- PDBe-KB proporciona una descripción general de toda la información de estructura disponible en el PDB para la ribonucleoproteína nuclear heterogénea humana D0 (HNRPD)