La superfamilia de alfa / beta hidrolasa es una superfamilia de enzimas hidrolíticas de origen filogenético y función catalítica muy diferentes que comparten un pliegue común . [1] El núcleo de cada enzima es una hoja alfa / beta (en lugar de un barril ), que contiene 8 hebras beta conectadas por 6 hélices alfa . [1] [2] Se cree que las enzimas divergieron de un ancestro común, conservando poca similitud de secuencia obvia , pero conservando la disposición de los residuos catalíticos. Todos tienen una tríada catalítica, cuyos elementos se apoyan en bucles, que son las características estructurales mejor conservadas del pliegue.
Identificadores | ||||||||
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Símbolo | Abhidrolasa_1 | |||||||
Pfam | PF00561 | |||||||
InterPro | IPR000073 | |||||||
SCOP2 | 1ede / SCOPe / SUPFAM | |||||||
Superfamilia OPM | 127 | |||||||
Proteína OPM | 1qge | |||||||
CDD | cl21494 | |||||||
Membranome | 300 | |||||||
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El pliegue alfa / beta hidrolasa incluye proteasas , lipasas , peroxidasas , esterasas , epóxido hidrolasas y deshalogenasas . [3]
Base de datos
La base de datos ESTHER proporciona una gran colección de información sobre esta superfamilia de proteínas. [4]
Subfamilias
Proteínas humanas que contienen este dominio
ABHD10 ; ABHD11 ; ABHD12 ; ABHD12B ; ABHD13 ; ABHD2 ; ABHD3 ; ABHD4 ; ABHD5 ; ABHD6 ; ABHD7 ; ABHD8 ; ABHD9 ; BAT5 ; BPHL ; C20orf135 ; EPHX1 ; EPHX2 ; FAM108B1 ; LIPA ; LIPF ; LIPJ ; LIPK ; LIPM ; LIPN ; LYPLAL1 ; MEST ; MGLL ; PPME1 ; SERHL ; SERHL2 ; SPG21 ; CES1 ; CES2 ; C4orf29
Ver también
- Serina hidrolasa : una familia de enzimas que se compone principalmente de proteínas con pliegues alfa-beta hidrolasa.
enlaces externos
- La base de datos ESTHER
Referencias
- ↑ a b Ollis, DL; Cheah, E .; Cygler, M .; Dijkstra, B .; Frolow, F .; Franken, SM; Harel, M .; Remington, SJ; Silman, I .; Schrag, J .; Sussman, JL; Verschueren, KHG y Goldman, A. (1992). "El pliegue alfa / beta hidrolasa" (PDF) . Protein Eng . 5 (3): 197–211. doi : 10.1093 / protein / 5.3.197 . hdl : 11370 / 2d4c057d-1a67-437d-ad10-701f7a60f1e6 . PMID 1409539 .
- ^ Carr PD, Ollis DL (2009). "Pliegue de hidrolasa alfa / beta: una actualización". Péptido de proteína. Lett . 16 (10): 1137–48. doi : 10.2174 / 092986609789071298 . PMID 19508187 .
- ^ Nardini M, Dijkstra BW (diciembre de 1999). "Enzimas de pliegue alfa / beta hidrolasa: la familia sigue creciendo". Curr. Opin. Struct. Biol . 9 (6): 732–7. doi : 10.1016 / S0959-440X (99) 00037-8 . PMID 10607665 .
- ^ Renault L, Nègre V, Hotelero T, Cousin X, Marchot P, Chatonnet A (diciembre de 2005). "Nuevas herramientas amigables para los usuarios de ESTHER, la base de datos de la superfamilia de proteínas del pliegue alfa / beta-hidrolasa". Chem. Biol. Interactuar . 157-158: 339–43. doi : 10.1016 / j.cbi.2005.10.100 . PMID 16297901 .