La aprataxina es una proteína que en humanos está codificada por el gen APTX . [5] [6] [7]
APTX | |||||||||||||||||||||||||
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Identificadores | |||||||||||||||||||||||||
Alias | APTX , AOA, AOA1, AXA1, EAOH, EOAHA, FHA-HIT, aprataxina | ||||||||||||||||||||||||
Identificaciones externas | OMIM : 606350 MGI : 1913658 HomoloGene : 41634 GeneCards : APTX | ||||||||||||||||||||||||
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Ortólogos | |||||||||||||||||||||||||
Especies | Humano | Ratón | |||||||||||||||||||||||
Entrez |
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Ensembl |
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UniProt |
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RefSeq (ARNm) |
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Ubicación (UCSC) | Crónicas 9: 32,97 - 33,03 Mb | Crónicas 4: 40,68 - 40,7 Mb | |||||||||||||||||||||||
Búsqueda en PubMed | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Wikidata | |||||||||||||||||||||||||
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Este gen codifica un miembro de la superfamilia de la tríada de histidina (HIT), algunos de los cuales tienen actividades de unión a nucleótidos y diadenosina polifosfato hidrolasa. La proteína codificada puede desempeñar un papel en la reparación del ADN monocatenario . Las mutaciones en este gen se han asociado con ataxia-apraxia ocular . Se han identificado múltiples variantes de transcripción que codifican distintas isoformas para este gen, sin embargo, no se ha determinado la naturaleza de longitud completa de algunas variantes. [7]
Función
La aprataxina elimina el AMP de los extremos del ADN después de intentos de ligación abortados por la ADN ligasa IV durante la unión de extremos no homólogos , lo que permite intentos posteriores de ligación. [8] [9]
Roturas de hebras de ADN
La apraxia-1 oculomotora de la ataxia es un trastorno neurológico causado por mutaciones en el gen APTX que codifica la aprataxina. [10] El trastorno neurológico parece ser causado por la acumulación gradual de roturas de cadenas de ADN no reparadas como resultado de eventos abortivos de ligadura de ADN. [10]
Envejecimiento prematuro
Se han generado ratones mutantes Aptx - / - , pero carecen de un fenotipo obvio. [10] Se generó otro modelo de ratón en el que se expresa una mutación de superóxido dismutasa I (SOD1) en un ratón Aptx - / - . [11] La mutación SOD1 provoca una reducción en la recuperación de la transcripción después del estrés oxidativo . Estos ratones mostraron una senescencia celular acelerada . Este estudio también demostró un papel protector de Aptx in vivo y sugirió que la pérdida de la función de Aptx da como resultado una acumulación progresiva de roturas del ADN en el sistema nervioso, lo que desencadena las características del envejecimiento prematuro sistémico [11] (ver teoría del envejecimiento del daño del ADN ).
Interacciones
Se ha demostrado que la aprataxina interactúa con:
- PARP1 , [12] [13]
- P53 , [13]
- XRCC1 , [12] [13] y
- XRCC4 . [14]
Referencias
- ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000137074 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000028411 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ Fecha H, Onodera O, Tanaka H, Iwabuchi K, Uekawa K, Igarashi S, Koike R, Hiroi T, Yuasa T, Awaya Y, Sakai T, Takahashi T, Nagatomo H, Sekijima Y, Kawachi I, Takiyama Y, Nishizawa M , Fukuhara N, Saito K, Sugano S, Tsuji S (octubre de 2001). "La ataxia de inicio temprano con apraxia motora ocular e hipoalbuminemia es causada por mutaciones en un nuevo gen de la superfamilia HIT". Nat Genet . 29 (2): 184–8. doi : 10.1038 / ng1001-184 . PMID 11586299 . S2CID 25665707 .
- ^ Moreira MC, Barbot C, Tachi N, Kozuka N, Uchida E, Gibson T, Mendonca P, Costa M, Barros J, Yanagisawa T, Watanabe M, Ikeda Y, Aoki M, Nagata T, Coutinho P, Sequeiros J, Koenig M (Octubre de 2001). "El gen mutado en ataxia-apraxia ocular 1 codifica la nueva aprataxina de proteína HIT / Zn-finger". Nat Genet . 29 (2): 189–93. doi : 10.1038 / ng1001-189 . PMID 11586300 . S2CID 23001321 .
- ^ a b "Entrez Gene: APTX aprataxin" .
- ^ Rass U, Ahel I, West SC (diciembre de 2008). "Mecanismo molecular de la desadenilación del ADN por la aprataxina de la proteína de la enfermedad neurológica" . J. Biol. Chem . 283 (49): 33994–4001. doi : 10.1074 / jbc.M807124200 . PMC 2662222 . PMID 18836178 .
- ^ Reynolds JJ, El-Khamisy SF, Katyal S, Clements P, McKinnon PJ, Caldecott KW (marzo de 2009). "Ligadura de ADN defectuoso durante la reparación de rotura de una sola hebra de parche corto en ataxia apraxia oculomotora 1" . Mol. Célula. Biol . 29 (5): 1354–62. doi : 10.1128 / MCB.01471-08 . PMC 2643831 . PMID 19103743 .
- ^ a b c Ahel I, Rass U, El-Khamisy SF, Katyal S, Clements PM, McKinnon PJ, Caldecott KW, West SC (2006). "La aprataxina de la proteína de la enfermedad neurodegenerativa resuelve intermedios abortivos de ligadura de ADN". Naturaleza . 443 (7112): 713–6. doi : 10.1038 / nature05164 . PMID 16964241 . S2CID 4431045 .
- ^ a b Carroll J, Page TK, Chiang SC, Kalmar B, Bode D, Greensmith L, Mckinnon PJ, Thorpe JR, Hafezparast M, El-Khamisy SF (2015). "La expresión de una mutación patógena de SOD1 sensibiliza a las células y ratones deficientes en aprataxina al estrés oxidativo y desencadena las características del envejecimiento prematuro" . Tararear. Mol. Genet . 24 (3): 828–40. doi : 10.1093 / hmg / ddu500 . PMC 4291253 . PMID 25274775 .
- ^ a b Date H, Igarashi S, Sano Y, Takahashi T, Takahashi T, Takano H, Tsuji S, Nishizawa M, Onodera O (diciembre de 2004). "El dominio FHA de la aprataxina interactúa con la región C-terminal de XRCC1". Biochem. Biophys. Res. Comun . 325 (4): 1279–85. doi : 10.1016 / j.bbrc.2004.10.162 . PMID 15555565 .
- ^ a b c Gueven N, Becherel OJ, Kijas AW, Chen P, Howe O, Rudolph JH, Gatti R, Date H, Onodera O, Taucher-Scholz G, Lavin MF (mayo de 2004). "Aprataxina, una proteína novedosa que protege contra el estrés genotóxico" . Tararear. Mol. Genet . 13 (10): 1081–93. doi : 10.1093 / hmg / ddh122 . PMID 15044383 .
- ^ Clements PM, Breslin C, Deeks ED, Byrd PJ, Ju L, Bieganowski P, Brenner C, Moreira MC, Taylor AM, Caldecott KW (noviembre de 2004). "El producto del gen ataxia-apraxia oculomotora 1 tiene un papel distinto del ATM e interactúa con las proteínas de reparación de rotura de la cadena de ADN XRCC1 y XRCC4". Reparación de ADN (Amst.) . 3 (11): 1493–502. doi : 10.1016 / j.dnarep.2004.06.017 . PMID 15380105 .
Otras lecturas
- Aicardi J, Barbosa C, Andermann E, et al. (1989). "Ataxia-apraxia motora ocular: un síndrome que imita la ataxia-telangiectasia". Ana. Neurol . 24 (4): 497–502. doi : 10.1002 / ana.410240404 . PMID 3239952 . S2CID 45836910 .
- Gascon GG, Abdo N, Sigut D y col. (1995). "Síndrome de ataxia-apraxia oculomotora". J. Child Neurol . 10 (2): 118–22. doi : 10.1177 / 088307389501000210 . PMID 7782601 . S2CID 26080242 .
- Hannan MA, Sigut D, Waghray M, Gascon GG (1995). "Síndrome de ataxia-apraxia motora ocular: una investigación de la radiosensibilidad celular de los pacientes y sus familias" . J. Med. Genet . 31 (12): 953–6. doi : 10.1136 / jmg.31.12.953 . PMC 1016697 . PMID 7891378 .
- Moreira MC, Barbot C, Tachi N, et al. (2001). "Mapeo de homocigosidad de formas portuguesas y japonesas de apraxia ataxia-oculomotora a 9p13 y evidencia de heterogeneidad genética" . Soy. J. Hum. Genet . 68 (2): 501–8. doi : 10.1086 / 318191 . PMC 1235299 . PMID 11170899 .
- Brenner C (2002). "Sugerencia, Fhit y GalT: función, estructura, evolución y mecanismo de tres ramas de la superfamilia de la tríada de histidina de nucleótidos hidrolasas y transferasas" . Bioquímica . 41 (29): 9003-14. doi : 10.1021 / bi025942q . PMC 2571077 . PMID 12119013 .
- Shimazaki H, Takiyama Y, Sakoe K y col. (2002). "Ataxia de inicio temprano con apraxia motora ocular e hipoalbuminemia: las mutaciones del gen aprataxina". Neurología . 59 (4): 590-5. doi : 10.1212 / wnl.59.4.590 . PMID 12196655 . S2CID 19576330 .
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH y col. (2003). "Generación y análisis inicial de más de 15.000 secuencias de ADNc humano y de ratón de longitud completa" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. doi : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
- Tranchant C, Fleury M, Moreira MC, et al. (2004). "Variabilidad fenotípica de mutaciones del gen aprataxina". Neurología . 60 (5): 868–70. doi : 10.1212 / 01.wnl.0000048562.88536.a4 . PMID 12629250 . S2CID 29358633 .
- Le Ber I, Moreira MC, Rivaud-Péchoux S, et al. (2003). "Ataxia cerebelosa con apraxia oculomotora tipo 1: estudios clínicos y genéticos" . Cerebro . 126 (Pt 12): 2761–72. doi : 10.1093 / cerebro / awg283 . PMID 14506070 .
- Sekijima Y, Hashimoto T, Onodera O, et al. (2004). "Distonía severa generalizada como presentación de un paciente con mutación del gen aprataxina". Mov. Desorden . 18 (10): 1198–200. doi : 10.1002 / mds.10526 . PMID 14534929 . S2CID 28225863 .
- Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). "Secuenciación completa y caracterización de 21.243 ADNc humanos de longitud completa" . Nat. Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038 / ng1285 . PMID 14702039 .
- Sano Y, Date H, Igarashi S, et al. (2004). "La aprataxina, la proteína causante de la EAOH es una proteína nuclear con un papel potencial como proteína reparadora del ADN". Ana. Neurol . 55 (2): 241–9. doi : 10.1002 / ana.10808 . PMID 14755728 . S2CID 25338143 .
- Gueven N, Becherel OJ, Kijas AW, et al. (2004). "Aprataxina, una proteína novedosa que protege contra el estrés genotóxico" . Tararear. Mol. Genet . 13 (10): 1081–93. doi : 10.1093 / hmg / ddh122 . PMID 15044383 .
- Humphray SJ, Oliver K, Hunt AR, et al. (2004). "Secuencia de ADN y análisis del cromosoma 9 humano" . Naturaleza . 429 (6990): 369–74. doi : 10.1038 / nature02465 . PMC 2734081 . PMID 15164053 .
- Habeck M, Zühlke C, Bentele KH y col. (2004). "Las mutaciones de aprataxina son una causa rara de ataxia de inicio temprano en Alemania". J. Neurol . 251 (5): 591–4. doi : 10.1007 / s00415-004-0374-7 . PMID 15164193 . S2CID 20280677 .
- Hirano M, Nishiwaki T, Kariya S, et al. (2004). "Las nuevas variantes de empalme aumentan la diversidad molecular de la aprataxina, el gen responsable de la ataxia de inicio temprano con apraxia motora ocular e hipoalbuminemia". Neurosci. Lett . 366 (2): 120–5. doi : 10.1016 / j.neulet.2004.05.034 . PMID 15276230 . S2CID 37647769 .
- Amouri R, Moreira MC, Zouari M, et al. (2005). "Mutaciones del gen de la aprataxina en familias tunecinas". Neurología . 63 (5): 928–9. doi : 10.1212 / 01.wnl.0000137044.06573.46 . PMID 15365154 . S2CID 41637052 .
- Clements PM, Breslin C, Deeks ED, et al. (2005). "El producto del gen ataxia-apraxia oculomotora 1 tiene un papel distinto del ATM e interactúa con las proteínas de reparación de rotura de la cadena de ADN XRCC1 y XRCC4". Reparación de ADN (Amst.) . 3 (11): 1493–502. doi : 10.1016 / j.dnarep.2004.06.017 . PMID 15380105 .
enlaces externos
- Entrada de GeneReviews / NCBI / NIH / UW sobre ataxia con apraxia oculomotora tipo 1
- Entradas OMIM sobre ataxia con apraxia oculomotora tipo 1
- Ubicación del genoma humano APTX y página de detalles del gen APTX en UCSC Genome Browser .