La subunidad de 90 kDa del factor de transcripción IIIB es una proteína que en humanos está codificada por el gen BRF1 . [5] [6] [7]
BRF1 | |||||||||||||||||||||||||
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Identificadores | |||||||||||||||||||||||||
Alias | BRF1 , BRF, BRF-1, GTF3B, HEL-S-76p, TAF3B2, TAF3C, TAFIII90, TF3B90, TFIIIB90, hBRF, CFDS, RNA polimerasa III factor de iniciación de la transcripción subunidad de 90 kDa, RNA polimerasa III subunidad del factor de iniciación de la transcripción, BRF1 RNA subunidad del factor de iniciación de la transcripción de la polimerasa III | ||||||||||||||||||||||||
Identificaciones externas | OMIM : 604902 MGI : 1919558 HomoloGene : 1161 GeneCards : BRF1 | ||||||||||||||||||||||||
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Ortólogos | |||||||||||||||||||||||||
Especies | Humano | Ratón | |||||||||||||||||||||||
Entrez |
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Ensembl |
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UniProt |
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RefSeq (ARNm) |
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RefSeq (proteína) |
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Ubicación (UCSC) | Crónicas 14: 105,21 - 105,32 Mb | Crónicas 12: 112,96 - 113 Mb | |||||||||||||||||||||||
Búsqueda en PubMed | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Wikidata | |||||||||||||||||||||||||
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Función
Este gen codifica una de las tres subunidades del complejo del factor de transcripción ARN polimerasa III . Este complejo juega un papel central en el inicio de la transcripción por la ARN polimerasa III en genes que codifican ARNt, ARNr 5S y otros ARN estructurales pequeños. El producto génico pertenece a la familia TF2B. Se han identificado tres variantes empalmadas alternativamente que codifican tres isoformas diferentes, que funcionan en diferentes promotores transcritos por la ARN polimerasa III. Una transcripción que codifica una cuarta isoforma aún no se ha caracterizado por completo. [7]
Interacciones
Se ha demostrado que BRF1 (gen) interactúa con:
- RB1 , [8] [9]
- RBL1 , [8]
- RBL2 , [8] y
- TBP [5] [10]
Referencias
- ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000185024 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000011158 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ a b Wang Z, Roeder RG (agosto de 1995). "Estructura y función de una subunidad del factor de transcripción humano TFIIIB que se conserva evolutivamente y contiene dominios relacionados con la proteína 2 del grupo de alta movilidad y TFIIB" . Proc Natl Acad Sci USA . 92 (15): 7026-30. doi : 10.1073 / pnas.92.15.7026 . PMC 41464 . PMID 7624363 .
- ^ Mital R, Kobayashi R, Hernandez N (enero de 1997). "La transcripción de la ARN polimerasa III de los promotores VAI de adenovirus tipo 2 y U6 humano tiene diferentes requisitos para el BRF humano, una subunidad del TFIIIB humano" . Mol Cell Biol . 16 (12): 7031–42. doi : 10.1128 / MCB.16.12.7031 . PMC 231706 . PMID 8943358 .
- ^ a b "Entrez Gen: homólogo de BRF1 BRF1, subunidad del factor de iniciación de la transcripción de la ARN polimerasa III IIIB (S. cerevisiae)" .
- ^ a b c Sutcliffe JE, Cairns CA, McLees A, Allison SJ, Tosh K, White RJ (junio de 1999). "El factor de transcripción de ARN polimerasa III IIIB es un objetivo para la represión por las proteínas de bolsillo p107 y p130" . Mol. Célula. Biol . 19 (6): 4255–61. doi : 10.1128 / mcb.19.6.4255 . PMC 104385 . PMID 10330166 .
- ^ Johnston IM, Allison SJ, Morton JP, Schramm L, Scott PH, White RJ (junio de 2002). "CK2 forma un complejo estable con TFIIIB y activa la transcripción de la ARN polimerasa III en células humanas" . Mol. Célula. Biol . 22 (11): 3757–68. doi : 10.1128 / mcb.22.11.3757-3768.2002 . PMC 133823 . PMID 11997511 .
- ^ McCulloch V, Hardin P, Peng W, Ruppert JM, Lobo-Ruppert SM (agosto de 2000). "Las variantes de hBRF empalmadas alternativamente funcionan en diferentes promotores de ARN polimerasa III" . EMBO J . 19 (15): 4134–43. doi : 10.1093 / emboj / 19.15.4134 . PMC 306597 . PMID 10921893 .
Otras lecturas
- Chesnokov I, Chu WM, Botchan MR, Schmid CW (1997). "p53 inhibe la transcripción dirigida por ARN polimerasa III de una manera dependiente del promotor" . Mol. Célula. Biol . 16 (12): 7084–8. doi : 10.1128 / MCB.16.12.7084 . PMC 231711 . PMID 8943363 .
- Chu WM, Wang Z, Roeder RG, Schmid CW (1997). "Transcripción de la ARN polimerasa III reprimida por Rb a través de sus interacciones con TFIIIB y TFIIIC2" . J. Biol. Chem . 272 (23): 14755–61. doi : 10.1074 / jbc.272.23.14755 . PMID 9169441 .
- Wang Z, Roeder RG (1997). "Tres subunidades específicas de la ARN polimerasa III humana forman un subcomplejo con una función selectiva en el inicio de la transcripción específico" . Genes Dev . 11 (10): 1315-26. doi : 10.1101 / gad.11.10.1315 . PMID 9171375 .
- Sutcliffe JE, Cairns CA, McLees A, Allison SJ, Tosh K, White RJ (junio de 1999). "El factor de transcripción de ARN polimerasa III IIIB es un objetivo para la represión por las proteínas de bolsillo p107 y p130" . Mol. Célula. Biol . 19 (6): 4255–61. doi : 10.1128 / mcb.19.6.4255 . PMC 104385 . PMID 10330166 .
- Hsieh YJ, Wang Z, Kovelman R, Roeder RG (1999). "Clonación y caracterización de dos subunidades conservadas evolutivamente (TFIIIC102 y TFIIIC63) de TFIIIC humano y su participación en interacciones funcionales con TFIIIB y ARN polimerasa III" . Mol. Célula. Biol . 19 (7): 4944–52. doi : 10.1128 / MCB.19.7.4944 . PMC 84305 . PMID 10373544 .
- Hsieh YJ, Kundu TK, Wang Z, Kovelman R, Roeder RG (noviembre de 1999). "La subunidad TFIIIC90 de TFIIIC interactúa con múltiples componentes de la maquinaria de la ARN polimerasa III y contiene una actividad acetiltransferasa específica de histona" . Mol. Célula. Biol . 19 (11): 7697–704. doi : 10.1128 / mcb.19.11.7697 . PMC 84812 . PMID 10523658 .
- McCulloch V, Hardin P, Peng W, Ruppert JM, Lobo-Ruppert SM (agosto de 2000). "Las variantes de hBRF empalmadas alternativamente funcionan en diferentes promotores de ARN polimerasa III" . EMBO J . 19 (15): 4134–43. doi : 10.1093 / emboj / 19.15.4134 . PMC 306597 . PMID 10921893 .
- Johnston IM, Allison SJ, Morton JP, Schramm L, Scott PH, White RJ (junio de 2002). "CK2 forma un complejo estable con TFIIIB y activa la transcripción de la ARN polimerasa III en células humanas" . Mol. Célula. Biol . 22 (11): 3757–68. doi : 10.1128 / MCB.22.11.3757-3768.2002 . PMC 133823 . PMID 11997511 .
- Cabart P, Murphy S (2002). "Ensamblaje del factor de transcripción específico del gen de ARN nuclear pequeño humano IIIB complejo de novo con y sin promotor" . J. Biol. Chem . 277 (30): 26831–8. doi : 10.1074 / jbc.M203119200 . PMID 12016223 .
- Willis IM (2002). "Una nomenclatura universal para las subunidades del factor de iniciación de la transcripción de la ARN polimerasa III TFIIIB" . Genes Dev . 16 (11): 1337–8. doi : 10.1101 / gad.998102 . PMID 12066800 .
- Stoecklin G, Colombi M, Raineri I, Leuenberger S, Mallaun M, Schmidlin M, Gross B, Lu M, Kitamura T, Moroni C (septiembre de 2002). "Clonación funcional de BRF1, un regulador de la renovación de ARNm dependiente de ARE" . EMBO J . 21 (17): 4709-18. doi : 10.1093 / emboj / cdf444 . PMC 126184 . PMID 12198173 .
- Weser S, Riemann J, Seifart KH, Meissner W (2003). "Ensamblaje y aislamiento de pasos intermedios de complejos de transcripción formados en el gen de ARNr 5S humano" . Ácidos nucleicos Res . 31 (9): 2408–16. doi : 10.1093 / nar / gkg345 . PMC 154231 . PMID 12711686 .
- Schmidlin M, Lu M, Leuenberger SA, Stoecklin G, Mallaun M, Gross B, Gherzi R, Hess D, Hemmings BA, Moroni C (diciembre de 2004). "La actividad desestabilizadora de ARNm dependiente de ARE de BRF1 está regulada por la proteína quinasa B" . EMBO J . 23 (24): 4760–9. doi : 10.1038 / sj.emboj.7600477 . PMC 535089 . PMID 15538381 .
enlaces externos
- FactorBook BRF1
- Ubicación del genoma humano BRF1 y página de detalles del gen BRF1 en UCSC Genome Browser .