La subunidad 8 del complejo de transcripción CCR4-NOT es una proteína que en humanos está codificada por el gen CNOT8 . [5] [6] [7] Es una subunidad del complejo CCR4-Not deadenilasa .
CNOT8 | |||||||||||||||||||||||||
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Identificadores | |||||||||||||||||||||||||
Alias | Subunidad 8 del complejo de transcripción CNOT8 , CAF1, CALIF, Caf1b, POP2, hCAF1, CCR4-NOT | ||||||||||||||||||||||||
Identificaciones externas | OMIM : 603731 MGI : 1916375 HomoloGene : 48304 GeneCards : CNOT8 | ||||||||||||||||||||||||
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Ortólogos | |||||||||||||||||||||||||
Especies | Humano | Ratón | |||||||||||||||||||||||
Entrez |
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Ensembl |
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UniProt |
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RefSeq (ARNm) |
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RefSeq (proteína) |
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Ubicación (UCSC) | Crónicas 5: 154,86 - 154,88 Mb | Crónicas 11: 58,1 - 58,12 Mb | |||||||||||||||||||||||
Búsqueda en PubMed | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Wikidata | |||||||||||||||||||||||||
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Interacciones
Se ha demostrado que CNOT8 interactúa con BTG2 , [8] BTG1 , [8] [9] CNOT1 [6] [10] y CNOT3 . [6]
Referencias
- ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000155508 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000020515 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ Fidler C, Wainscoat JS, Boultwood J (mayo de 1999). "El gen POP2 humano: identificación, secuenciación y mapeo de la región crítica del síndrome 5q-". Genómica . 56 (1): 134–6. doi : 10.1006 / geno.1998.5687 . PMID 10036195 .
- ^ a b c Albert TK, Lemaire M, van Berkum NL, Gentz R, Collart MA, Timmers HT (marzo de 2000). "Aislamiento y caracterización de ortólogos humanos de subunidades del complejo CCR4-NOT de levadura" . Ácidos nucleicos Res . 28 (3): 809-17. doi : 10.1093 / nar / 28.3.809 . PMC 102560 . PMID 10637334 .
- ^ "Entrez Gene: complejo de transcripción CNOT8 CCR4-NOT, subunidad 8" .
- ^ a b Prévôt D, Morel AP, Voeltzel T, Rostan MC, Rimokh R, Magaud JP, Corbo L (marzo de 2001). "Relaciones de las proteínas antiproliferativas BTG1 y BTG2 con CAF1, el homólogo humano de un componente del complejo transcripcional CCR4 de levadura: participación en la vía de señalización alfa del receptor de estrógeno" . J. Biol. Chem . 276 (13): 9640–8. doi : 10.1074 / jbc.M008201200 . PMID 11136725 .
- ^ Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (octubre de 2005). "Hacia un mapa a escala de proteoma de la red de interacción proteína-proteína humana". Naturaleza . 437 (7062): 1173–8. Código Bibliográfico : 2005Natur.437.1173R . doi : 10.1038 / nature04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .
- ^ Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). "Mapeo a gran escala de interacciones proteína-proteína humana por espectrometría de masas" . Mol. Syst. Biol . 3 (1): 89. doi : 10.1038 / msb4100134 . PMC 1847948 . PMID 17353931 .
Otras lecturas
- Bogdan JA, Adams-Burton C, Pedicord DL, Sukovich DA, Benfield PA, Corjay MH, Stoltenborg JK, Dicker IB (1998). "Proteína represora del catabolito de carbono humano (CCR4) -factor asociativo 1: clonación, expresión y caracterización de su interacción con la proteína de translocación de células B BTG1" . Biochem. J . 336 (Parte 2): 471–81. doi : 10.1042 / bj3360471 . PMC 1219893 . PMID 9820826 .
- Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2000). "Clonación de ADN mediante recombinación específica de sitio in vitro" . Genome Res . 10 (11): 1788–95. doi : 10.1101 / gr.143000 . PMC 310948 . PMID 11076863 .
- Prévôt D, Morel AP, Voeltzel T, Rostan MC, Rimokh R, Magaud JP, Corbo L (2001). "Relaciones de las proteínas antiproliferativas BTG1 y BTG2 con CAF1, el homólogo humano de un componente del complejo transcripcional CCR4 de levadura: participación en la vía de señalización alfa del receptor de estrógeno" . J. Biol. Chem . 276 (13): 9640–8. doi : 10.1074 / jbc.M008201200 . PMID 11136725 .
- Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (2001). "Hacia un catálogo de genes y proteínas humanos: secuenciación y análisis de 500 nuevas proteínas completas que codifican ADNc humanos" . Genome Res . 11 (3): 422–35. doi : 10.1101 / gr.GR1547R . PMC 311072 . PMID 11230166 .
- Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (2000). "Localización subcelular sistemática de nuevas proteínas identificadas por secuenciación de cDNA a gran escala" . Rep . EMBO 1 (3): 287–92. doi : 10.1093 / embo-reports / kvd058 . PMC 1083732 . PMID 11256614 .
- Morel AP, Sentis S, Bianchin C, Le Romancer M, Jonard L, Rostan MC, Rimokh R, Corbo L (2003). "La proteína antiproliferativa BTG2 interactúa con el complejo CCR4 humano existente in vivo en tres formas reguladas por el ciclo celular" . J. Cell Sci . 116 (Pt 14): 2929–36. doi : 10.1242 / jcs.00480 . PMID 12771185 .
- Wiemann S, Arlt D, Huber W, Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, Bechtel S, Sauermann M, Korf U, Pepperkok R, Sültmann H, Poustka A (2004). "De ORFeome a la biología: una tubería de genómica funcional" . Genome Res . 14 (10B): 2136–44. doi : 10.1101 / gr.2576704 . PMC 528930 . PMID 15489336 .
- Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, del Val C, Arlt D, Hahne F, Bechtel S, Simpson J, Hofmann O, Hide W, Glatting KH, Huber W, Pepperkok R, Poustka A, Wiemann S (2006). "La base de datos LIFEdb en 2006" . Ácidos nucleicos Res . 34 (Problema de la base de datos): D415-8. doi : 10.1093 / nar / gkj139 . PMC 1347501 . PMID 16381901 .
- Dorfleutner A, Bryan NB, Talbott SJ, Funya KN, Rellick SL, Reed JC, Shi X, Rojanasakul Y, Flynn DC, Stehlik C (2007). "La proteína 2 del dominio de pirina celular es un regulador candidato de la activación del inflamasoma" . Infectar. Immun . 75 (3): 1484–92. doi : 10.1128 / IAI.01315-06 . PMC 1828547 . PMID 17178784 .
enlaces externos
- Ubicación del genoma humano CNOT8 y página de detalles del gen CNOT8 en UCSC Genome Browser .