La subunidad 6 del factor de especificidad de escisión y poliadenilación es una proteína que en humanos está codificada por el gen CPSF6 . [5] [6] [7]
CPSF6 | |||||||||||||||||||||||||
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Identificadores | |||||||||||||||||||||||||
Alias | CPSF6 , CFIM, CFIM68, HPBRII-4, HPBRII-7, factor 6 específico de escisión y poliadenilación, CFIM72 | ||||||||||||||||||||||||
Identificaciones externas | OMIM : 604979 MGI : 1913948 HomoloGene : 134126 GeneCards : CPSF6 | ||||||||||||||||||||||||
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Ortólogos | |||||||||||||||||||||||||
Especies | Humano | Ratón | |||||||||||||||||||||||
Entrez |
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Ensembl |
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UniProt |
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RefSeq (ARNm) |
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RefSeq (proteína) |
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Ubicación (UCSC) | Crónicas 12: 69,24 - 69,27 Mb | Crónicas 10: 117,34 - 117,38 Mb | |||||||||||||||||||||||
Búsqueda en PubMed | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Wikidata | |||||||||||||||||||||||||
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Función
La proteína codificada por este gen es una subunidad de un factor de escisión requerido para la escisión del ARN 3 'y el procesamiento de poliadenilación. La interacción de la proteína con el ARN es uno de los primeros pasos en el ensamblaje del complejo de procesamiento del extremo 3 'y facilita el reclutamiento de otros factores de procesamiento. El complejo del factor de escisión está compuesto por cuatro polipéptidos. Este gen codifica la subunidad de 68 kD. Tiene una organización de dominio que recuerda a las proteínas espliceosomales. [7]
Interacciones
Se ha demostrado que CPSF6 interactúa con WWP1 [8] y PLSCR1 . [8]
Referencias
- ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000111605 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000055531 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ Rüegsegger U, Blank D, Keller W (enero de 1998). "El factor Im de escisión de pre-ARNm humano está relacionado con proteínas SR espliceosomales y puede reconstituirse in vitro a partir de subunidades recombinantes". Célula molecular . 1 (2): 243–53. doi : 10.1016 / S1097-2765 (00) 80025-8 . PMID 9659921 .
- ^ Cardinale S, Cisterna B, Bonetti P, Aringhieri C, Biggiogera M, Barabino SM (abril de 2007). "Localización subnuclear y dinámica de la subunidad de 68 kDa del factor de escisión de mamíferos del factor de procesamiento del extremo 3 'de Pre-mRNA" . Biología molecular de la célula . 18 (4): 1282–92. doi : 10.1091 / mbc.E06-09-0846 . PMC 1838998 . PMID 17267687 .
- ^ a b "Entrez Gene: CPSF6 escisión y factor específico de poliadenilación 6, 68 kDa" .
- ^ a b Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, et al. (Octubre de 2005). "Hacia un mapa a escala de proteoma de la red de interacción proteína-proteína humana". Naturaleza . 437 (7062): 1173–8. doi : 10.1038 / nature04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .
enlaces externos
- Ubicación del genoma humano CPSF6 y página de detalles del gen CPSF6 en UCSC Genome Browser .
Otras lecturas
- Maruyama K, Sugano S (enero de 1994). "Oligo-taponamiento: un método simple para reemplazar la estructura de la tapa de ARNm eucariotas con oligoribonucleótidos". Gene . 138 (1–2): 171–4. doi : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90802-8 . PMID 8125298 .
- Rüegsegger U, Beyer K, Keller W (marzo de 1996). "Purificación y caracterización del factor de escisión humano Im implicado en el procesamiento del extremo 3 'de los precursores del ARN mensajero" . La revista de química biológica . 271 (11): 6107–13. doi : 10.1074 / jbc.271.11.6107 . PMID 8626397 .
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (octubre de 1997). "Construcción y caracterización de una biblioteca de ADNc enriquecida en longitud completa y enriquecida en el extremo 5 '". Gene . 200 (1–2): 149–56. doi : 10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3 . PMID 9373149 .
- de Vries H, Rüegsegger U, Hübner W, Friedlein A, Langen H, Keller W (noviembre de 2000). "El factor II (m) de escisión del pre-ARNm humano contiene homólogos de proteínas de levadura y une otros dos factores de escisión" . El diario EMBO . 19 (21): 5895–904. doi : 10.1093 / emboj / 19.21.5895 . PMC 305781 . PMID 11060040 .
- Awasthi S, Alwine JC (noviembre de 2003). "Asociación de factor de escisión de poliadenilación I con U1 snRNP" . ARN . 9 (11): 1400-9. doi : 10.1261 / rna.5104603 . PMC 1287061 . PMID 14561889 .
- Brown KM, Gilmartin GM (diciembre de 2003). "Un mecanismo para la regulación del procesamiento de pre-ARNm 3 'por el factor de escisión humano Im". Célula molecular . 12 (6): 1467–76. doi : 10.1016 / S1097-2765 (03) 00453-2 . PMID 14690600 .
- Dettwiler S, Aringhieri C, Cardinale S, Keller W, Barabino SM (agosto de 2004). "Motivos de secuencia distinta dentro de la subunidad de 68 kDa del factor de escisión Im median la unión del ARN, las interacciones proteína-proteína y la localización subcelular" (PDF) . La revista de química biológica . 279 (34): 35788–97. doi : 10.1074 / jbc.M403927200 . PMID 15169763 . S2CID 39752996 .
- Venkataraman K, Brown KM, Gilmartin GM (junio de 2005). "El análisis de un sitio poli (A) no canónico revela un mecanismo tripartito para el reconocimiento del sitio poli (A) de vertebrados" . Genes y desarrollo . 19 (11): 1315–27. doi : 10.1101 / gad.1298605 . PMC 1142555 . PMID 15937220 .
- Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (octubre de 2005). "Hacia un mapa a escala de proteoma de la red de interacción proteína-proteína humana". Naturaleza . 437 (7062): 1173–8. doi : 10.1038 / nature04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .
- Millevoi S, Loulergue C, Dettwiler S, Karaa SZ, Keller W, Antoniou M, Vagner S (octubre de 2006). "Una interacción entre U2AF 65 y CF I (m) vincula las maquinarias de procesamiento de empalmes y extremos 3 '" . El diario EMBO . 25 (20): 4854–64. doi : 10.1038 / sj.emboj.7601331 . PMC 1618107 . PMID 17024186 .
- Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). "Mapeo a gran escala de interacciones proteína-proteína humana por espectrometría de masas" . Biología de sistemas moleculares . 3 (1): 89. doi : 10.1038 / msb4100134 . PMC 1847948 . PMID 17353931 .