La proteína que interactúa con mTOR que contiene el dominio DEP ( DEPTOR ), también conocida como proteína 6 que contiene el dominio DEP ( DEPDC6 ), es una proteína que en los seres humanos está codificada por el gen DEPTOR . [5]
DEPTOR | |||||||||||||||||||||||||
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Identificadores | |||||||||||||||||||||||||
Alias | DEPTOR , DEP.6, DEPDC6, dominio DEP que contiene proteína que interactúa con MTOR, dominio DEP que contiene proteína que interactúa con MTOR | ||||||||||||||||||||||||
Identificaciones externas | OMIM : 612974 MGI : 2146322 HomoloGene : 32551 GeneCards : DEPTOR | ||||||||||||||||||||||||
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Ortólogos | |||||||||||||||||||||||||
Especies | Humano | Ratón | |||||||||||||||||||||||
Entrez | |||||||||||||||||||||||||
Ensembl |
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UniProt |
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RefSeq (ARNm) |
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RefSeq (proteína) |
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Ubicación (UCSC) | Crónicas 8: 119,87 - 120,05 Mb | Crónicas 15: 55,11 - 55,26 Mb | |||||||||||||||||||||||
Búsqueda en PubMed | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Wikidata | |||||||||||||||||||||||||
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Estructura
El gen DEPTOR se puede encontrar solo en vertebrados. En humanos, el gen DEPTOR se localiza en el cromosoma 8, 8q24.12 con un tamaño de proteína 409 aa [6]. El DEPTOR humano contiene dos dominios DEP N-terminales y un dominio PDZ C-terminal . [7]
Función
DEPTOR participa en la vía de señalización de mTOR como regulador endógeno. Se ha demostrado una interacción directa entre DEPTOR y mTOR. [7] La sobreexpresión de DEPTOR regula a la baja la actividad de mTORC1 y mTORC2 in vitro . Tanto mTORC1 como mTORC2 pueden inhibir DEPTOR a través de la fosforilación . [7]
Metabolismo
La célula DEPTOR regula de forma autónoma la adipogénesis . [8] En el músculo, Baf60c promueve un cambio de tipo miofibra oxidativa a glucolítica a través de la activación de Akt / PKB mediada por DEPTOR . [9] Dentro del cerebro, DEPTOR se expresa en gran medida en el hipocampo , el hipotálamo medio-basal y los órganos circunventriculares . [10] La sobreexpresión de DEPTOR en el hipotálamo medio-basal protege a los ratones contra la obesidad inducida por una dieta alta en grasas al modular la señalización de Akt / PKB . [11]
Cáncer clínico
Aunque en la mayoría de los cánceres, la vía mTOR se activa de forma constitutiva y la expresión de DEPTOR es baja, un estudio ha encontrado que DEPTOR se sobreexpresa en las células de mieloma múltiple y es necesario para su supervivencia. [7]
Referencias
- ^ a b c GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000155792 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000022419 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ "Entrez Gene: dominio DEP DEPDC6 que contiene 6" . CS1 maint: parámetro desalentado ( enlace )
- ^ "Homo sapiens - familias de proteínas Ensembl - Gene: DEPTOR (ENSG00000155792)" . Navegador del genoma Ensembl 78 .
- ^ a b c d Peterson TR, Laplante M, Thoreen CC, Sancak Y, Kang SA, Kuehl WM, Gray NS, Sabatini DM (mayo de 2009). "DEPTOR es un inhibidor de mTOR frecuentemente sobreexpresado en células de mieloma múltiple y necesario para su supervivencia" . Celular . 137 (5): 873–86. doi : 10.1016 / j.cell.2009.03.046 . PMC 2758791 . PMID 19446321 .
- ^ Laplante M, Horvat S, Festuccia WT, Birsoy K, Prevorsek Z, Efeyan A, Sabatini DM (agosto de 2012). "La célula DEPTOR promueve de forma autónoma la adipogénesis, y su expresión está asociada a la obesidad" . Metabolismo celular . 16 (2): 202–12. doi : 10.1016 / j.cmet.2012.07.008 . PMC 3463374 . PMID 22883231 .
- ^ Meng ZX, Li S, Wang L, Ko HJ, Lee Y, Jung DY, Okutsu M, Yan Z, Kim JK, Lin JD (mayo de 2013). "Baf60c impulsa el metabolismo glucolítico en el músculo y mejora la homeostasis de la glucosa sistémica a través de la activación de Akt mediada por Deptor" . Medicina de la naturaleza . 19 (5): 640–5. doi : 10.1038 / nm.3144 . PMC 3650110 . PMID 23563706 .
- ^ Caron A, Baraboi ED, Laplante M, Richard D (enero de 2015). "Proteína que interactúa con mTOR que contiene el dominio DEP en el cerebro de rata: distribución de la expresión y posible implicación". La Revista de Neurología Comparada . 523 (1): 93-107. doi : 10.1002 / cne.23668 . PMID 25159114 . S2CID 205683672 .
- ^ Caron, Alexandre; Labbé, Sébastien M .; Lanfray, Damien; Blanchard, Pierre-Gilles; Villot, Romain; Roy, Christian; Sabatini, David M .; Richard, Denis; Laplante, Mathieu (2016). "Sobreexpresión hipotalámica mediobasal de Deptor protege contra la obesidad inducida por una dieta alta en grasas" . Metabolismo molecular . 5 (2): 102-112. doi : 10.1016 / j.molmet.2015.11.005 . PMC 4735664 . PMID 26909318 .
Otras lecturas
- Maruyama K, Sugano S (enero de 1994). "Oligo-taponamiento: un método simple para reemplazar la estructura de la tapa de ARNm eucariotas con oligoribonucleótidos". Gene . 138 (1–2): 171–4. doi : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90802-8 . PMID 8125298 .
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (octubre de 1997). "Construcción y caracterización de una biblioteca de ADNc enriquecida en longitud completa y enriquecida en el extremo 5 '". Gene . 200 (1–2): 149–56. doi : 10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3 . PMID 9373149 .
- Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (noviembre de 2000). "Clonación de ADN mediante recombinación específica de sitio in vitro" . Investigación del genoma . 10 (11): 1788–95. doi : 10.1101 / gr.143000 . PMC 310948 . PMID 11076863 .
- Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (marzo de 2001). "Hacia un catálogo de genes y proteínas humanos: secuenciación y análisis de 500 nuevas proteínas completas que codifican ADNc humanos" . Investigación del genoma . 11 (3): 422–35. doi : 10.1101 / gr.GR1547R . PMC 311072 . PMID 11230166 .
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