homología de secuencia
La homología de secuencia es la homología biológica entre secuencias de ADN , ARN o proteínas , definida en términos de ascendencia compartida en la historia evolutiva de la vida . Dos segmentos de ADN pueden tener ascendencia compartida debido a tres fenómenos: ya sea un evento de especiación (ortólogos), o un evento de duplicación (parálogos), o bien un evento de transferencia de genes horizontal (o lateral) (xenólogos). [1]
La homología entre el ADN, el ARN o las proteínas se infiere típicamente a partir de su similitud de secuencia de nucleótidos o aminoácidos . La similitud significativa es una fuerte evidencia de que dos secuencias están relacionadas por cambios evolutivos a partir de una secuencia ancestral común. Se utilizan alineaciones de secuencias múltiples para indicar qué regiones de cada secuencia son homólogas.
El término "porcentaje de homología" se usa a menudo para referirse a "similitud de secuencia", es decir, el porcentaje de residuos idénticos ( porcentaje de identidad ), o el porcentaje de residuos conservados con propiedades fisicoquímicas similares ( porcentaje de similitud ), por ejemplo, leucina e isoleucina , por lo general. se utiliza para "cuantificar la homología". Según la definición de homología especificada anteriormente, esta terminología es incorrecta ya que la similitud de secuencia es la observación, la homología es la conclusión. [3] Las secuencias son homólogas o no. [3] Esto implica que el término "porcentaje de homología" es un nombre inapropiado. [4]
Al igual que con las estructuras morfológicas y anatómicas, la similitud de secuencias puede deberse a una evolución convergente o, como con secuencias más cortas, por casualidad, lo que significa que no son homólogas. Las regiones de secuencias homólogas también se denominan conservadas . Esto no debe confundirse con la conservación en secuencias de aminoácidos , donde el aminoácido en una posición específica ha sido sustituido por otro diferente que tiene propiedades fisicoquímicas funcionalmente equivalentes.
La homología parcial puede ocurrir cuando un segmento de las secuencias comparadas tiene un origen compartido, mientras que el resto no. Tal homología parcial puede resultar de un evento de fusión de genes .
Las secuencias homólogas son ortólogas si se infiere que descienden de la misma secuencia ancestral separada por un evento de especiación : cuando una especie diverge en dos especies separadas, se dice que las copias de un solo gen en las dos especies resultantes son ortólogas. Los ortólogos, o genes ortólogos, son genes en diferentes especies que se originaron por descendencia vertical de un solo gen del último ancestro común . El término "ortólogo" fue acuñado en 1970 por el evolucionista molecular Walter Fitch . [5]
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