deCODE genetics ( islandés : Íslensk erfðagreining ) es una empresa biofarmacéutica con sede en Reykjavík , Islandia . La empresa fue fundada en 1996 por Kári Stefánsson [1] con el objetivo de utilizar estudios de genética poblacional para identificar variaciones en el genoma humano asociadas con enfermedades comunes y aplicar estos descubrimientos "para desarrollar métodos novedosos para identificar, tratar y prevenir enfermedades. " [2]
Tipo | Privado |
---|---|
Industria | Genética |
Fundado | 1996 |
Sede | Reykjavík , Islandia |
Gente clave | Kári Stefánsson , director ejecutivo |
Ingresos | USD 77 millones (2015) |
Número de empleados | 190 |
Padre | Amgen (2012-presente) |
Sitio web | www.decode.com |
A partir de 2019, más de dos tercios de la población adulta de Islandia participaba en los esfuerzos de investigación de la compañía, [3] y este "enfoque poblacional" sirve como modelo para la medicina de precisión a gran escala y proyectos nacionales de genoma en todo el mundo. [4] deCODE es probablemente más conocido por sus descubrimientos en genética humana, publicado en las principales revistas científicas y ampliamente divulgado en los medios internacionales. Pero también ha hecho contribuciones pioneras a la realización de la medicina de precisión de manera más amplia, a través del compromiso público en la investigación científica a gran escala; el desarrollo de pruebas de riesgo de enfermedades basadas en el ADN para las personas y en todos los sistemas de salud; y nuevos modelos de participación y asociación del sector privado en ciencia básica y salud pública. [5]
Desde 2012, ha sido una subsidiaria independiente de Amgen y sus capacidades y descubrimientos se han utilizado directamente en el descubrimiento y desarrollo de nuevos fármacos. Este ejemplo ha ayudado a impulsar la inversión en genómica y terapéutica de precisión por parte de otras empresas farmacéuticas y biotecnológicas. [6]
Islandia y el enfoque poblacional
En 1996, cuando Stefansson dejó un puesto permanente en la Facultad de Medicina de Harvard para regresar a Islandia y fundar una empresa de genómica, casi todo en su pensamiento no estaba probado o era controvertido. En ese momento, las causas de algunas enfermedades raras, a menudo variaciones en genes individuales que se pueden encontrar estudiando familias pequeñas, estaban comenzando a descubrirse. [7] Sin embargo, estaba lejos de ser aceptado universalmente que hubiera algún componente genético significativo en enfermedades comunes / complejas como enfermedades cardíacas o diabetes tipo 2 con factores de riesgo conductuales y ambientales bien conocidos; ni, incluso si las hubiera, si se podrían encontrar tales variaciones dada la tecnología rudimentaria para leer el ADN. [8]
Stefansson estaba convencido de que existían y podían identificarse, pero solo trabajando a escala industrial. Una década antes de que el término fuera de uso común, la premisa de deCODE era que se trataba de un problema de big data: encontrar variantes que impactan el riesgo en la interacción dinámica con el estilo de vida y otros factores requeriría estudios no a nivel familiar, sino a escala de salud pública. Como empresa de descubrimiento en territorio inexplorado, la estrategia consistía en reunir y consultar la mayor cantidad de datos posible: ADN aportado por decenas de miles de personas; datos médicos y de salud amplios y profundos; y, fundamentalmente, genealogías integrales que unan a todos estos participantes. [9] En resumen, esto requería una población, con personas dispuestas a participar en la investigación, un sistema de salud moderno con un número significativo de casos de las enfermedades más comunes y muchos datos genealógicos. Islandia, el país natal de Stefansson, con 270.000 habitantes en ese momento, se ajusta a esta descripción mejor que cualquier otra. [10]
En 1996, financiado con $ 12 millones en capital de riesgo estadounidense, deCODE estableció un laboratorio y comenzó a operar. [11] En sus primeros años reclutó y genotipificó a decenas de miles de participantes. Hizo un rápido progreso en la creación de una base de datos nacional de genealogía; desarrolló un novedoso sistema de protección de la privacidad con cifrado de identidad supervisado por el gobierno; firmó una asociación histórica con la empresa farmacéutica suiza Roche; y mapeó genes de enfermedades putativas en un puñado de condiciones. [12]
Al mismo tiempo que comenzaba a demostrar su ciencia, la compañía encendió una gran controversia con la propuesta de crear una base de datos de investigación, la Base de datos del sector de la salud de Islandia (o IHD para abreviar), que contiene copias de registros médicos de todo el país. Servicio de salud. [13] En diciembre de 1998, con el cabildeo de deCODE, el Parlamento islandés aprobó la Ley sobre la base de datos del sector de la salud que permitió la licitación pública del derecho de una empresa a crear esta base de datos de salud y utilizarla para investigaciones comerciales y para apoyar el sistema nacional de salud. . [14] Poco después, el parlamento otorgó a deCODE el derecho a crear esta base de datos después de que la empresa presentara una oferta exitosa para hacerlo. [15] Ampliamente apoyado por el público y el parlamento, los objetivos abiertamente comerciales del IHD y la inclusión propuesta de datos de registros médicos a menos que las personas optaran por no participar, desató una oposición vehemente desarrollada en los medios de comunicación locales e internacionales, encabezada por un grupo de activistas islandeses también como varios bioeticistas extranjeros. [16] Aunque el IHD nunca se construyó, el debate subrayó los desafíos políticos involucrados en involucrar a toda una sociedad en una empresa científica, especialmente una con el objetivo explícito de comercializar sus descubrimientos. [17] También aseguró que deCODE y su enfoque pasaran de ser una curiosidad periférica a una de las empresas de más alto perfil en el esfuerzo mundial por comprender el genoma humano. [18]
Genoma de una nación
Cuando Bill Clinton y Tony Blair anunciaron la finalización del primer borrador de la secuencia del genoma humano en junio de 2000, [19] deCODE estaba intensificando afanosamente su búsqueda de genes en docenas de enfermedades y publicando sus primeros descubrimientos. [20] La compañía utilizó la tecnología de lectura de ADN más escalable de la época, el genotipado de microsatélites , para colocar y medir marcadores altamente variables y, por lo tanto, informativos en cientos de puntos a lo largo del genoma. Analizado en conjunto con las genealogías, esto hizo posible ubicar regiones de cromosomas específicos que las personas con una enfermedad determinada tendían a haber heredado de sus antepasados comunes. [21] Se pensaba que dentro de estas regiones se encontraban genes o variantes de secuencia asociadas con enfermedades que posteriormente se podrían encontrar utilizando métodos y herramientas de definición más precisa. [22]
Pero el significado principal de estas primeras publicaciones fue el enfoque en la analítica y el poder sugestivo del enfoque. Gran parte del campo y la atención pública se centró en la carrera entre el Proyecto Genoma Humano (HGP) financiado con fondos públicos y la empresa privada Celera para generar la secuencia completa de un solo genoma completo para usar como referencia para futuras investigaciones. Este fue un desafío técnico para generar y ensamblar datos sin procesar. Por el contrario, deCODE estaba avanzando en una estrategia para analizar la variación en decenas de miles de genomas a través de la genética, aprovechando la naturaleza del genoma como un medio para replicar y transmitir información. El poder de la genética estaba a la vista en 2002, cuando deCODE publicó un mapa genético del genoma que constaba de 5000 marcadores de microsatélites, que las genealogías permitieron ordenar correctamente en todos los cromosomas. El mapa fue fundamental para corregir y completar la secuencia del genoma de referencia pública en 2003, mejorando la precisión del ensamblaje de HGP del 93% al 99%. [23]
Una clave de este enfoque ha sido la participación masiva. Desde sus inicios, más del 90% de las personas a las que se les pidió participar en la investigación de enfermedades de deCODE han aceptado hacerlo. [24] La participación es voluntaria pero no trivial. Requiere ir a un centro de recolección de datos para que le extraigan sangre, responda cuestionarios y se someta a exámenes clínicos y pruebas relevantes para una enfermedad determinada. [25] En 2003, más de 100.000 personas se habían ofrecido como voluntarias para participar en uno o más de las tres docenas de programas de investigación de enfermedades comunes de deCODE. [26] Este número aumentó a 130.000 en 2007, [27] y más de 160.000 en 2018. Esto representa dos tercios de todos los ciudadanos adultos. Los genomas de unos 60.000 de estos participantes se habían secuenciado directamente en 2019, y miles más se secuenciaron cada mes. [28]
Un segundo y único pilar del trabajo de deCODE son las genealogías. La genetista Mary Claire King , cuya investigación basada en la familia a principios de la década de 1990 condujo al descubrimiento de los genes del cáncer de mama BRCA1 y BRCA2, predijo poco después de la fundación de deCODE que la capacidad de "rastrear la genealogía de una nación entera ... podría convertirse en uno de los tesoros de la medicina moderna ". [29] En 1997, deCODE formó una sociedad con la empresa de software local Fridrik Skulason ehf para acelerar la creación de una base de datos nacional completa e informatizada de genealogía. Se basó en todas las fuentes disponibles, desde los primeros registros y sagas de piel de becerro hasta el censo de 1703 y los registros parroquiales hasta el registro nacional contemporáneo. [30]
A principios de la década de 2000, habían creado lo que todavía hoy es la genealogía más completa de todo un país. Vincula a todos los ciudadanos vivos a través de registros prácticamente completos que se remontan a 1703 ( reconocido por la UNESCO como el primer censo nacional nominal del mundo ) y se remonta a antes de la colonización del país en el siglo IX. En la versión de investigación de la base de datos, las identidades de las personas se cifran a través del mismo sistema de anonimización utilizado para el ADN y los datos médicos, de modo que los datos puedan correlacionarse. [31] Y en 2003, deCODE lanzó una versión en línea de cara al público de la base de datos, llamada Íslendingabók , o el Libro de los islandeses. Cualquiera con un número de seguro social islandés podría solicitar una contraseña y luego investigar su árbol genealógico y ver su conexión familiar más cercana con cualquier otra persona en el país. Durante su primer mes en línea, más de un tercio de la población había solicitado una contraseña. [32] Para 2020, tenía más de 200.000 usuarios registrados y más de 900.000 entradas vinculadas, que comprenden la mayoría de los islandeses que han vivido alguna vez. En un día promedio, casi 6000 personas, o cerca del dos por ciento de todos los ciudadanos, consultan la base de datos. [33]
En un país que es esencialmente una gran familia extensa con un gran interés correspondiente en cómo se relacionan sus miembros, Islendingabok se ha convertido en una constante en la vida nacional y un medio diario y directo de compromiso social con el trabajo de deCODE. Pero en términos científicos, la capacidad de comprender las relaciones genealógicas precisas de todos los participantes en sus proyectos de investigación le ha dado a deCODE una ventaja duradera como empresa de descubrimiento, asegurando que sus conjuntos de datos genómicos y médicos se hayan mantenido entre las colecciones más grandes y mejor potenciadas del mundo. [34]
En cada avance sucesivo en la tecnología para leer el ADN, las genealogías han amplificado tanto la cantidad de datos que se pueden generar a partir de ellas como el poder de extraer información de los datos. [35] En la era de los microsatélites , era posible establecer que los participantes compartían ciertos marcadores y segmentos del genoma no por casualidad sino por descendencia . Con el advenimiento a mediados de la década de 2000 de los chips de genotipado , que podían medir cientos de miles de variaciones de una sola letra ( SNP ) en todo el genoma, los estadísticos de deCODE pudieron dividir en fases con precisión los segmentos del genoma, para comprender la fuente parental de los segmentos. y luego imputar los genotipos medidos en algunas personas de toda la población. [36]
Esto multiplica efectivamente el tamaño y la potencia de cualquier estudio. Cuando Illumina comenzó a vender máquinas que podían secuenciar genomas completos de manera económica, deCODE pudo secuenciar directamente varios miles de islandeses y luego imputar los datos de la secuencia del genoma completo (WGS) para prácticamente toda la población. Esto representa una de las colecciones individuales más grandes de datos de WGS en el mundo, y los primeros resultados de su análisis se publicaron en 2015 en una edición especial de Nature Genetics . [37] La secuenciación directa de decenas de miles de personas más desde entonces ha permitido búsquedas rutinarias de variantes cada vez más raras a una escala sin precedentes. [38]
Descubrimientos y contribuciones científicas
La investigación del genoma en general, y la reputación global de deCODE como una organización de descubrimiento, despegaron con la llegada de los chips de genotipado SNP a mediados de la década de 2000. [39] Estas herramientas desencadenaron un auge mundial en los estudios de asociación de todo el genoma ( GWAS ), en los que se escanea todo el genoma para identificar los SNP de los que las personas con una enfermedad determinada tienden a tener una versión, mientras que los individuos no afectados tienden a tener otro. En las enfermedades comunes, como ocurre con muchos rasgos o fenotipos, como la respuesta a los medicamentos, la diferencia no es de certeza causal sino de probabilidades estadísticas que representan un aumento o disminución del riesgo frente al promedio de la población. Por lo tanto, la capacidad de realizar grandes estudios y analizar los datos resultantes, de miles de pacientes con una enfermedad y muchas veces más sujetos de control, idealmente familiares no afectados, es muy importante. [40]
La vasta colección de ADN, datos médicos y genealógicos de deCODE que podían extraerse juntos, y enriquecerse mediante consultas e imputaciones repetidas, se adaptaba casi perfectamente a este tipo de estudio. Desde 2003, la compañía ha descubierto y publicado cientos de variantes relacionadas con la susceptibilidad a decenas de enfermedades y afecciones, incluidas importantes contribuciones continuas para comprender el riesgo heredado de la enfermedad de Alzheimer, la esquizofrenia y otros trastornos psiquiátricos; una docena de formas comunes de cáncer; enfermedad de las arterias coronarias, ictus fibrilación auricular y las otras enfermedades cardiovasculares más comunes; así como rasgos y fenotipos que van desde la respuesta a los fármacos hasta la cognición y el color del cabello y los ojos. [41] La compañía publica sus descubrimientos en revistas revisadas por pares, y muchas, como las variantes TCF7L2 en la diabetes tipo 2, se utilizan como marcadores de riesgo estándar en modelos de riesgo poligénico y en investigación. [42]
Una revisión de la era GWAS publicada en Nature Communications en 2019 cuantificó la enorme contribución de deCODE al campo: los islandeses representaron el 12% de todos los participantes en todos los estudios publicados de GWAS a nivel mundial entre 2007 y 2017, con cada ciudadano participando en promedio de 19 hallazgos publicados en ese período solo. [43] Stefansson, el jefe de investigación de deCODE, Unnur Thorsteinsdottir, y el estadístico Gudmar Thorleifsson se clasificaron respectivamente como el primer, segundo y sexto autor de GWAS de mayor impacto en el mundo. [44]
La adición de secuenciación del genoma completo (WGS) además de sus datos de genotipado dio una nueva dimensión y poder a las capacidades de descubrimiento de deCODE. Por definición, los SNP comunes en chips de genotipado estándar produjeron marcadores de riesgo confiables pero no un punto de apoyo determinante en la biología de enfermedades complejas. Sin embargo, al ejecutar el creciente número de genomas completos secuenciados directamente a través de los datos de genotipado y las genealogías como un andamio, los estadísticos de la compañía han podido imputar WGS de muy alta definición a toda la población. El resultado ha sido la capacidad de realizar estudios GWAS utilizando de 20 a 50 millones de variantes y de buscar sistemáticamente variantes raras que causan o confieren un riesgo muy alto de versiones extremas de fenotipos comunes y, por lo tanto, apuntan directamente a posibles objetivos farmacológicos. [45]
El valor de este enfoque se conoce mejor a partir del modelo de PCSK9 , en el que el estudio de familias con niveles de colesterol extremadamente altos y enfermedad cardíaca de aparición temprana permitió comprender el papel clave de este gen y el desarrollo de una nueva clase de medicamentos para combatir el colesterol. deCODE ahora busca de forma rutinaria variantes tan raras en muchos fenotipos y los resultados han proporcionado la base de los programas de desarrollo y descubrimiento de fármacos. [46] Por ejemplo, desde 2016, sus contribuciones importantes en la enfermedad cardiovascular incluyen demostrar que es el colesterol no HDL en lugar de simplemente los niveles de LDL lo que refleja con mayor precisión el riesgo de enfermedad cardíaca; [47] encontrar variantes en el gen ASGR1 que protegen contra la enfermedad de las arterias coronarias; [48] y definir el papel de la lipoproteína (a) como un factor de riesgo importante de ataque cardíaco. [49]
Como todos los datos de deCODE se encuentran en sus servidores y se pueden consultar simultáneamente, también se pueden consultar con una velocidad notable. En 2014, un grupo del Broad Institute se detuvo en deCODE en su camino de regreso de Finlandia, donde, a través de un importante esfuerzo de investigación, encontraron una variante que protegía a los portadores contra la diabetes tipo 2. Mientras tomaban un café, el equipo de deCODE confirmó que la variante finlandesa no existía en Islandia, pero sí otra. [50] El grupo Broad lo agregó al periódico que anunciaba el descubrimiento. [51]
Debido a sus singulares recursos poblacionales y las preguntas que sus científicos pueden hacer y responder, muchos de los hallazgos más notables de deCODE han sido en ciencia básica. Un enfoque notable ha sido dilucidar cómo se genera la variación en la secuencia del genoma. Siguiendo su mapa genético del genoma basado en microsatélites en 2002, la compañía creó y puso a disposición de la comunidad científica dos más: uno en 2010 basado en 300.000 SNP, [52] y otro en 2019 basado en datos de WGS. [53] La recombinación, la reorganización de los cromosomas que tiene lugar en la producción de óvulos y espermatozoides, es un mecanismo principal para generar diversidad y construir estos mapas. Durante quince años, deCODE ha publicado una serie de artículos innovadores que detallan en una población humana real cómo varía la tasa de recombinación según el sexo, la edad y otras características, y cómo estas diferencias impactan en la generación de diversidad y variación genómica de muchos tipos. La imagen general que ha surgido es que el genoma está generando diversidad pero dentro de ciertos límites, proporcionando un sustrato dinámico pero generalmente estable para la selección natural y la evolución. [54]
Para comprender la población en la que está trabajando y abordar cuestiones más amplias que pocos pueden de la misma manera, deCODE también ha tenido desde sus inicios su propio grupo de antropología genética. Ha publicado un trabajo pionero sobre la mutación mitocondrial y del cromosoma Y para rastrear la mezcla noruega y celta en la población temprana; ADN antiguo secuenciado del período de asentamiento; comparó los genomas islandeses antiguos y modernos para ver cómo la deriva genética , las epidemias y los desastres naturales han producido una población moderna genéticamente distinta de sus antepasados y poblaciones de origen. [55] y variantes observadas bajo selección natural positiva en una sociedad actual. [56] La compañía también ha catalogado los nocauts humanos (personas a las que les faltan ciertos genes) y ha reconstruido el genoma del primer hombre de ascendencia africana que vivió en Islandia mediante el análisis de las secuencias de cientos de sus descendientes vivos. [57] Estos estudios son seguidos con avidez por los medios de comunicación extranjeros e islandeses por igual, y constituyen otro tipo de retorno que deCODE ofrece a la sociedad en la que estudia y trabaja.
Innovación de producto
El liderazgo científico de deCODE durante más de veinte años le ha permitido en repetidas ocasiones ser pionero en nuevos tipos de asociaciones, productos y aplicaciones para muchos aspectos de la medicina de precisión. Entre 1998 y 2004, la compañía firmó alianzas innovadoras y de alto perfil con las compañías farmacéuticas Roche , Merck , Bayer , Wyeth y otras. Estas alianzas proporcionaron fondos para la investigación para avanzar en el trabajo de deCODE, con el objetivo de encontrar nuevos objetivos farmacológicos validados genéticamente en enfermedades comunes; para desarrollar diagnósticos basados en el ADN, que podrían medir el riesgo de enfermedad o predecir la respuesta al fármaco e identificar a los pacientes con más probabilidades de beneficiarse de un fármaco; y diseñar ensayos clínicos "ricos en información" que inscriban a participantes con variantes genéticas particulares, con el potencial de hacer ensayos más pequeños, más informativos y con mayores posibilidades de éxito. [58]
En 2002, deCODE adquirió una empresa de química médica con sede en Chicago para descubrir compuestos basados en sus descubrimientos genéticos y así comenzar a desarrollar su propia línea de nuevos fármacos. [59] Durante los años siguientes, la compañía inició y completó varios ensayos clínicos en etapa temprana para posibles tratamientos nuevos para el ataque cardíaco, la enfermedad arterial periférica y realizó un trabajo con socios sobre el asma y la AME . [60] Estos fueron ejemplos tempranos de lo que hoy se llamaría programas de ' medicina de precisión ': usar la genética para el descubrimiento de objetivos y seleccionar participantes del ensayo probándolos para determinar su susceptibilidad a la enfermedad a través de la misma vía dirigida por el fármaco. [61]
A mediados de la década de 2000, deCODE lanzó un nuevo tipo de diagnóstico de riesgos centrado principalmente en la prevención y el bienestar. Estas pruebas de diagnóstico basadas en ADN detectaron variantes genéticas identificadas por decodificar y otros que correlaciona con un aumento significativo del riesgo individual de enfermedades comunes, incluyendo ataque al corazón, [62] la fibrilación auricular y el accidente cerebrovascular, la diabetes tipo 2, común (no BRCA) cáncer de mama, de próstata cáncer y glaucoma. [63] La prueba de diabetes tipo 2, por ejemplo, se basó en estudios publicados que mostraron que aproximadamente el 10% de las personas portaban dos copias de la variante de riesgo de mayor impacto de deCODE, lo que las coloca en el doble del riesgo promedio de desarrollar diabetes, independientemente de la obesidad. El propósito médico de la prueba era "identificar a los prediabéticos con un riesgo superior al promedio de progresar a una diabetes en toda regla, y que estas mismas personas pueden contrarrestar eficazmente este riesgo adicional mediante la pérdida de peso y el uso de ciertos medicamentos". [64]
Otra característica novedosa de estas pruebas fue la integración de múltiples factores de riesgo genéticos bien validados. El impacto general de estos diferentes factores de riesgo se combinó y calculó en lo que se denominó una puntuación de riesgo poligénico , colocando al individuo en un espectro de riesgo con respecto al de la población en general, independientemente de y además de otros riesgos de salud o estilo de vida. factores. [65] Con cada nuevo descubrimiento, deCODE podría ampliar los factores de riesgo probados. La idea era hacer que las estrategias y terapias de detección y prevención fueran más específicas y más efectivas para las personas con mayor riesgo y, con suerte, proporcionar un nuevo incentivo para que las personas siguieran adelante con una modificación del estilo de vida bien entendida, como la pérdida de peso, dejar de fumar, etc. [66 ] Esta era la esencia de lo que entonces se llamaba medicina personalizada , pero debido a que estas pruebas eran nuevas, su utilidad médica aún no había sido probada. Como todos, por definición, corren el riesgo de contraer enfermedades comunes, y los médicos generalmente entendieron el riesgo genético solo en lo que se refiere a enfermedades raras, la comunidad médica abordó estas pruebas con escepticismo. [67] En 2018, la promoción del uso de puntajes de riesgo poligénico para identificar a aquellos con un riesgo significativamente mayor de enfermedades comunes, y el uso de datos del genoma completo y nuevos algoritmos para construir sobre muchos marcadores deCODE tempranos, comenzó un resurgimiento. [68]
A juzgar por la intensa cobertura mediática de los descubrimientos de deCODE, la gente corriente estaba muy interesada en estos factores de riesgo genéticos y en cómo podrían ser relevantes para su salud. A finales de 2007, la empresa lanzó efectivamente el campo de la genómica personal con su escaneo directo al consumidor (DTC) deCODEme [69], cuyo objetivo es permitir que las personas comprendan mejor su riesgo de enfermedades comunes y utilicen esta información para mantenerse saludables. deCODEme llegó al mercado un día antes de 23andMe , ahora ampliamente conocido y financiado por Google . [70] El marketing de deCODEme hizo hincapié en su pedigrí, seriedad y rigor científico: "proporcionado por un líder mundial en el descubrimiento de factores de riesgo genéticos para enfermedades ... [para que sus clientes] se beneficien directamente del conocimiento y la experiencia de los científicos que llevan a cabo internacionalmente investigación de renombre "(sus competidores utilizaron las variantes publicadas de deCODE como base para muchos de sus resultados); con el escaneo procesado en los mismos laboratorios que los habían encontrado. En 2012, la exploración completa deCODEme midió un millón de SNP y calculó el riesgo de 47 enfermedades y rasgos comunes, así como información básica sobre la ascendencia materna y paterna, y señaló que la mayoría de las exploraciones de ascendencia del período no tenían muchos datos. [71]
A pesar del énfasis de deCODEme en que sus resultados tenían fines informativos, "una hoja de ruta para mejorar su salud", y la provisión de asesoramiento genético para los usuarios que tenían preguntas sobre sus resultados, los reguladores de EE. UU. Rápidamente tomaron una visión crítica de las evaluaciones de riesgo de enfermedades que se incluyeron directamente en las manos de los consumidores. [72] En junio de 2010, la FDA escribió a deCODE [73] y sus principales competidores para decirles que consideraban que tales exploraciones eran dispositivos médicos que requerían la aprobación de la FDA. [74] Enfrentando vientos en contra regulatorios y luego la reorganización corporativa, deCODE dejó de vender deCODEme a fines de 2012. [75] En 2017, la FDA comenzó a aprobar ciertas evaluaciones de riesgo genético de enfermedad en pruebas de consumidores. [76]
En 2018, deCODE abrió nuevos caminos con una intervención directa en salud pública y el primer programa nacional de cribado genético de este tipo. La compañía lanzó un sitio web que permite a cualquier persona en Islandia solicitar a la compañía, de forma gratuita, que busque todos los datos de la secuencia del genoma para determinar si es probable que sean portadores de un SNP en el gen BRCA2 que confiere un alto riesgo de cáncer de mama y próstata en Islandia. En meses, el diez por ciento de la población había solicitado su estatus BRCA2, y el Hospital Nacional ha desarrollado sus servicios de asesoramiento y otros para ayudar a las personas a hacer un seguimiento de sus resultados preliminares y utilizar la información para proteger su salud. [77]
Negocio
A pesar de su ciencia pionera, o quizás porque a menudo estaba muy por delante del campo, deCODE tenía una historia volátil como negocio independiente. En julio de 2000, completó una oferta pública inicial de $ 200 millones en Nasdaq, grande para el momento y la primera cotización de una empresa islandesa en una bolsa estadounidense. Sus primeras alianzas farmacéuticas, en particular con Roche, ayudaron aún más a financiar la inscripción de la mayoría de los adultos en el país en la primera década de su investigación, y la rápida expansión tanto de sus capacidades de descubrimiento como de sus esfuerzos de desarrollo de productos en medicamentos, diagnósticos. y genómica personal. [78]
Desde una perspectiva científica, como dijo David Altschuler del Broad Institute al MIT Tech Review en 2004, "este es un negocio en el que la masa crítica es importante, y se ha logrado una masa crítica". [79] Pero el negocio también se trataba de dinero. Al ser una empresa de innovación pionera en nuevos mercados, la compañía había gastado más de $ 500 millones en I + D en su primera década y nunca fue rentable. En 2006 estaba pidiendo más préstamos [80] para financiar programas de desarrollo de fármacos basados en premisas completamente novedosas; para llevar adelante las pruebas de diagnóstico en un mercado que incluso los partidarios calificaron de "aún embrionario"; y comercializar la genómica personal, donde estaba siendo eclipsada por el glamour y el efectivo de Silicon Valley de 23andMe. [81]
A finales de 2008, la empresa estaba "entre la espada y la pared", en palabras del propio Stefansson. [82] Bajo la amenaza de ser excluida de Nasdaq por el precio de sus acciones, la empresa necesitaba más capital justo cuando los mercados globales entraban en crisis. [83] Aunque sus científicos siguieron publicando avances a un ritmo notable, a finales de 2009, el holding estadounidense que cotiza en bolsa de la compañía, deCODE genetics, Inc., se declaró en quiebra del Capítulo 11. [84] Sus activos clave, cuyo corazón era la operación genética de Islandia, fueron comprados y mantenidos en funcionamiento por un consorcio de los dos principales patrocinadores originales de la empresa: Arch Venture y Polaris Ventures , junto con Illumina, Inc. , el fabricante dominante. de chips de genotipado y equipos de secuenciación. [85] Abandonó el trabajo en sus programas de desarrollo de fármacos. [86]
Como empresa, deCODE había vuelto en cierto sentido al futuro: era una empresa de 13 años con una reputación global, nuevamente respaldada por sus capitalistas de riesgo originales, que Newsweek calificó como "el fracaso más exitoso del mundo". [87] Durante el período siguiente, Stefansson reflexionó públicamente que deCODE se había fundado entre seis y diez años antes de tiempo. [88] La tecnología para leer con precisión el ADN con suficiente detalle, razonó, no había llegado hasta mediados de la década de 2000, dejando a deCODE endeudado durante años de investigación y desarrollo, pero basado en hallazgos que no proporcionaron una visión suficientemente detallada de la biología de enfermedad para crear rápidamente fármacos de desarrollo y diagnósticos atractivos desde el punto de vista comercial. [89] Lo que podría proporcionar esa información fueron los datos de WGS a escala de población. En 2010, Stefansson estaba describiendo cómo secuenciar algunos miles de individuos y luego usar la imputación, impulsada nuevamente por las genealogías, para asegurarse de que deCODE sería el primero en el mundo en tener algo parecido. [90]
A pesar de sus difíciles circunstancias, con Illumina como uno de sus propietarios, la empresa aún podría recibir las últimas máquinas secuenciadoras y reactivos. En 2011, deCODE e Illumina colaboraron en un artículo que dio una pista temprana sobre el poder de la imputación WGS, convirtiendo 500 secuencias en 40.000 genomas completos de datos. Esto fue suficiente para comenzar a descubrir variantes raras, validadas mediante replicación en varias otras poblaciones. [91] A diferencia de las variantes comunes, las mutaciones que causan enfermedades raras tienden a estar en las regiones de genes que codifican proteínas, lo que proporciona una ventana directa a la biología de la enfermedad y, por lo tanto, una utilidad más directa como objetivos farmacológicos. En diciembre de 2012, la compañía farmacéutica estadounidense Amgen adquirió deCODE por $ 415 millones.
Un motivo clave para la adquisición fue la capacidad única de deCODE de usar datos de WGS para descubrir variantes de codificación raras y causar versiones extremas de enfermedades más comunes. Como Sean Harper, entonces director de I + D de Amgen, dijo a Forbes: "Realmente estaba trabajando en objetivos como PCSK9 [para enfermedades cardíacas] ... lo que realmente llevó a casa el inmenso valor de tener objetivos que hayan sido descubiertos o validados por el tipo de análisis genético humano en el que Decode es un experto mundial ". [92] En términos más generales, estas capacidades también podrían aplicarse para evaluar los programas actuales, y un mes después de la adquisición, deCODE había revisado toda la cartera de proyectos de Amgen. En 2018, Harper estimó que "solo [con] tener un fuerte respaldo genético para la mitad de su cartera, puede mejorar su tasa de retorno de las inversiones en I + D en aproximadamente un 50%". [93] Para 2020, Amgen había introducido dos nuevos fármacos cardiovasculares en ensayos clínicos basados directamente en los descubrimientos de deCODE, que continúan publicándose en las principales revistas científicas. [94]
Como modelo global
La introducción de Stefansson para las organizaciones de la Sociedad Americana de Genética Humana reunión anual de 2017, el Instituto Broad 's de Mark Daly observó que la reunión y el campo fueron dominados por "un paradigma dominante con biobancos reclutó con la participación de la población total, los datos históricos del registro médico , las inversiones en la recopilación de datos genéticos a gran escala y la metodología estadística, y el seguimiento colaborativo a través de las fronteras académicas y de la industria ... [y] deCODE proporcionó la plantilla para este motor de descubrimiento ". [95]
Desde sus inicios, el ejemplo de deCODE dio un nuevo impulso a otros que buscaban genes de enfermedades en comunidades aisladas y pequeñas poblaciones en Cerdeña, Quebec, Terranova, el norte de Suecia, Finlandia y otros lugares. Sin embargo, deCODE no estaba promocionando la "relativa homogeneidad" de la población islandesa para encontrar variantes que causen síndromes raros, sino porque la existencia de mutaciones fundadoras ayudaría a impulsar el descubrimiento de variantes que impactan en enfermedades comunes. [96] En términos de su relevancia para los desafíos médicos globales, Islandia no era una población consanguínea con una alta prevalencia de síndromes raros, sino más bien una sociedad europea en miniatura que podría estudiarse en su conjunto: no la población más pequeña tanto como la el más pequeño y grande.
El primer país grande que siguió el ejemplo de deCODE fue el Reino Unido. [97] La experiencia de Islandia, detrás del valor científico y médico de aplicar el vasto alcance y los recursos del NHS a una de las poblaciones más diversas del mundo, [98] informó la autorización del Biobanco del Reino Unido en 2003 [99] y luego de Genomics England. en 2013. Otros esfuerzos tempranos de biobancos y genómica a gran escala vinculados a los principales sistemas de salud incluyeron el Programa Million Veterans en los EE. UU., lanzado en 2009; [100] el Programa de Investigación sobre Genes, Medio Ambiente y Salud en Kaiser Permanente de California , iniciado en 2007; y el China Kadoorie Biobank en China continental y Hong Kong comenzó a mediados de la década de 2000. [101]
Después de 2014, cuando Illumina anunció que su nuevo sistema X-Ten podía secuenciar genomas completos a escala por $ 1000 cada uno, proliferaron los proyectos nacionales de genomas, [102] desde los EE. UU. ( All of Us , junto con el MVP) y (junto con CKB) hasta Australia. , Canadá , Dubai , Estonia (originalmente iniciado en 2000), Francia , Hong Kong , Japón , Países Bajos , Qatar , Arabia Saudita , Singapur , Corea del Sur , Suecia y Turquía , y más allá. Aunque con diferentes enfoques y enfoques, todos estos programas se inspiraron al menos implícitamente en el ejemplo de deCODE. [103]
Otros grandes proyectos liderados por compañías farmacéuticas han seguido de cerca el modelo de deCODE y su trabajo con Amgen. Estos incluyen Regeneron con el sistema de salud Geisinger en los EE.UU. [104] y la asociación híbrida público / privada / académica de Astra Zeneca con Wellcome Trust en el Reino Unido, Craig Venter's Human Longevity en California y Finngen en Helsinki. [105] Este último, fundado por los líderes del Broad Institute y las universidades finlandesas, el ministerio de salud y los biobancos para impulsar el descubrimiento de fármacos, [106] está notablemente cerca de la visión original de deCODE en Islandia, pero con académicos y organismos gubernamentales como socios de capital en el negocio. . Este modelo de asociación público-privada puede explicar la aprobación de la legislación en Finlandia en 2019 que autoriza el uso casi generalizado de registros médicos anónimos, datos de bienestar social y muestras de biobancos para la investigación biomédica, lo que va mucho más allá de las ambiciones de la legislación del DHI de 1998 que causó tanto mucha controversia en Islandia veinte años antes. [107]
La participación directa y el linaje de deCODE también es evidente en todo el campo. deCODE es miembro fundador y líder de la Sociedad Nórdica de Genética Humana y Medicina de Precisión , que reúne los recursos de todos los países escandinavos e Islandia y Estonia para promover el descubrimiento de genes y la aplicación de la medicina de precisión en toda la región. En 2013, un grupo de ex alumnos de deCODE creó una empresa derivada, NextCODE Health (ahora Genuity Science ), que autorizó y desarrolló aún más las herramientas informáticas y de gestión de datos de secuencia desarrolladas originalmente en Islandia para respaldar el diagnóstico clínico y la genómica de poblaciones en otros países. [108] Sus sistemas y herramientas han sido utilizados por proyectos nacionales de genoma en Inglaterra, [109] Qatar, [110] Singapur; [111] programas pediátricos de enfermedades raras en el Reino Unido, Estados Unidos [112] y China; [113] y en su subsidiaria Genomics Medicine Ireland. En 2019, deCODE y el sistema de salud regional de EE. UU. Intermountain se asociaron para realizar un estudio de medicina de precisión e investigación basado en WGS de 500.000 personas, [114] y deCODE también comenzó a secuenciar a 225.000 participantes en el Biobanco del Reino Unido. [115]
Respuesta a la pandemia de Covid-19
En marzo de 2020, cuando el virus SARS-CoV-2 comenzó a extenderse ampliamente en Islandia, deCODE redirigió temporalmente su investigación clínica, personal de laboratorio y operaciones para realizar pruebas a gran escala para COVID-19 . Este esfuerzo marcó la participación más profunda y directa de la compañía en la salud pública y constituye un componente importante de una de las estrategias de contención más intensivas y exitosas de cualquier país en los primeros meses de la pandemia mundial. [116]
La respuesta de las autoridades sanitarias de Islandia a la pandemia fue notable por ser un ejemplo temprano, transparente y eficaz de las mejores prácticas de control epidemiológico de "prueba, rastreo y aislamiento". A fines de enero de 2020, la Dirección Nacional de Salud comenzó a realizar pruebas a las personas que llegaban a Islandia desde áreas de alto riesgo o que mostraban posibles síntomas de infección y, con el Departamento de Protección Civil y Manejo de Emergencias, activó un sistema para aislar a cualquier persona diagnosticada con el virus. y rastrear y poner en cuarentena a todos sus contactos. [117] El primer caso de Islandia se diagnosticó el 28 de febrero, un mes después de que comenzaran las pruebas específicas, y en cuestión de días, docenas de personas dieron positivo todos los días. Poco más de dos meses después, Islandia estaba prácticamente libre de infecciones activas. [118]
La base de esta respuesta y los datos que la guiaron fueron las pruebas. Sin embargo, si bien el esfuerzo de prueba oficial fue rápido y enérgico, se centró en aquellos que tenían síntomas o estaban en alto riesgo debido a que probablemente habían estado en contacto con personas infectadas. A principios de marzo, la directora ejecutiva de deCODE, Kari Stefansson, se preocupó de que sin evaluar también a la población en general, no había forma de comprender la propagación del virus o su tasa de mortalidad, información crucial para abordar de manera integral la epidemia. [119] En este momento de "manos a la obra", y con los conocimientos, las personas y el equipo para convertir rápidamente el laboratorio de investigación genética de la empresa en una instalación de pruebas de diagnóstico por PCR, [120] se ofreció a poner la empresa capacidades para trabajar en la detección de la población en general bajo los auspicios de la Dirección de Salud. [121] El personal de deCODE trabajó rápidamente para armar los flujos de trabajo para todo, desde la recolección de muestras hasta la ejecución de las pruebas y los informes protegidos por privacidad, y para preparar los hisopos y los reactivos para comenzar las pruebas a gran escala. El jueves 12 de marzo de 2020, la compañía abrió su sitio web para reservar citas para las pruebas y en unas horas se habían inscrito 12.000 personas. Las pruebas comenzaron a la mañana siguiente de forma gratuita. [122]
El esfuerzo de deCODE aumentó rápidamente a una capacidad de más de 1000 muestras por día. Desde el inicio del cribado de la población, menos del 1% de los participantes estaban infectados, lo que indica que la estrategia de contención de las autoridades sanitarias estaba funcionando. [123] [Se necesita fuente no primaria ] Desde mediados de marzo hasta fines de mayo de 2020, la compañía realizó un promedio de 600 pruebas por día, complementando las 250 pruebas por día de las autoridades de salud en el Hospital Nacional Universitario. Aquellos que dieron positivo en la detección de deCODE fueron aislados de manera similar y sus contactos fueron rastreados y se les pidió que se pusieran en cuarentena. En total, a principios de junio se habían realizado más de 60.000 pruebas en Islandia, lo que equivale al 18 por ciento de la población. Impulsado por esta estrategia combinada de pruebas y seguimiento de rastreo y aislamiento, el número de infecciones en Islandia alcanzó su punto máximo en la primera semana de abril y descendió abruptamente a finales de mes. A mediados de mayo, solo había un puñado de infecciones activas en el país, aunque deCODE y las autoridades de salud continuaron realizando hasta 200 pruebas por día a partir de entonces para tratar de detectar cualquier brote nuevo. [124]
Paralelamente a su trabajo de detección, deCODE utilizó sus capacidades genéticas para secuenciar el virus de cientos de individuos infectados y trazar una especie de genealogía de los diferentes clados del virus en el país. Esto mostró cómo durante las primeras semanas de la pandemia el virus había ingresado al país con personas infectadas en diferentes países y luego se había propagado dentro de Islandia. [125] [se necesita fuente no primaria ] En abril de 2020, con colegas de la Dirección de Salud y el hospital nacional, la compañía publicó en el New England Journal of Medicine un artículo que detalla cómo se ve la propagación del COVID-19 en un población, y cómo una política sólida de pruebas, rastreo y aislamiento podría contenerla de manera efectiva. En mayo, la compañía comenzó a trabajar para desarrollar y realizar pruebas de anticuerpos en la población, y los primeros resultados mostraron que alrededor del uno por ciento de la población general que no había sido diagnosticada con la infección portaba anticuerpos contra el virus. Esto significaba, por un lado, que el virus había sido rápido y bien contenido, pero también que casi tres veces se había infectado, como se había diagnosticado oficialmente desde finales de febrero, y también que la población seguía siendo más del 98% ingenua. [126] Eso indicó que las pruebas a gran escala tendrían que continuar para detectar brotes posteriores a medida que el país reabriera sus fronteras para viajar por sus propios ciudadanos y otros que vengan a Islandia. [127] En junio, la compañía dijo que estaba trabajando con la unidad de Amgen en Columbia Británica para usar glóbulos blancos de pacientes recuperados de Covid islandés para comenzar a fabricar anticuerpos para el virus, que podrían usarse profilácticamente o terapéuticamente. [128]
Apariciones en la cultura popular
El trabajo de deCODE es criticado por la novela Jar City de Arnaldur Indriðason de 2000, que fue adaptada a una película de 2006 del mismo nombre . [129]
deCODE y Kári Stefánsson son satirizados como VikingDNA y el profesor Lárus Jóhannsson en Dauðans óvissi tími de Þráinn Bertelsson (Reykjavík: JPV Útgáfu, 2004).
deCODE y específicamente Kári Stefánsson se presenta como el creador de híbridos genéticos monstruosos en la obra satírica de 2007 de Óttar M. Norðfjörð Jón Ásgeir & afmælisveislan (Reykjavík: Sögur, 2007), y la historia de DeCODE aparece tanto directamente como en forma de ficción (bajo la forma de ficción nombre OriGenes) en la novela del mismo autor Lygarinn: Sönn saga (Reykjavík: Sögur, 2011). deCODE es el modelo de la empresa CoDex, en CoDex 1962 de Sjón . [130] [131]
Referencias
- ^ Anuncio del lanzamiento de deCODE y una entrevista con Stefánsson sobre los objetivos de la empresa, en el principal periódico del país, Morgunblaðið , 31 de mayo de 1996. Los cofundadores fueron el pediatra Kristleifur Kristjánsson, quien trabajó en la empresa durante veinte años, y el psiquiatra y poeta Ernir Kristján Snorrason .
- ^ Un buen resumen inicial del enfoque y la misión se encuentra en el primer comunicado de prensa de la compañía , que anuncia el aislamiento de un gen de la enfermedad, 25 de agosto de 1997
- ^ Anna Azvolinsky, "Master Decoder: A Profile of Kári Stefánsson", The Scientist , 1 de marzo de 2019
- ^ Daly, Mark J. "2017 William Allan Award Introducción: Kári Stefansson," American Journal of Human Genetics , vol. 102, número 3 (2018) doi: 10.1016 / j.ajhg.2018.01.010
- ^ Las principales publicaciones de deCODEy sus notas de prensa desde su fundación están disponibles en su sitio web .
- ^ Las principales inversiones en genómica de poblaciones por parte de las compañías farmacéuticas desde 2012 incluyen las de Regeneron , AstraZeneca , AbbVie , Glaxo y otras.
- ^ Véase, por ejemplo, Francesco Cuca et al. , "La distribución de los haplotipos DR4 en Cerdeña sugiere una asociación primaria de diabetes tipo I con los loci DRB1 y DQB1", Human Immunology , Vol. 43, Número 4, págs. 301-308 (agosto de 1995); EM Petty y col. , "Mapeo del gen del hiperparatiroidismo hereditario y prolactinoma (MEN1Burin) al cromosoma 11q: evidencia de un efecto fundador en pacientes de Terranova", American Journal of Human Genetics , Vol 54, Número 6, págs. 1060-1066 (junio de 1994); Melanie M Mahtani y col. , "Mapeo de un gen para la diabetes tipo 2 asociado con un defecto de secreción de insulina mediante un escaneo del genoma en familias finlandesas", Nature Genetics (requiere suscripción), Volumen 14, págs. 90-94, (septiembre de 1996); Steinnun Thorlacius y col. , "Una sola mutación BRCA2 en familias de hombres y mujeres con cáncer de mama de Islandia con diferentes fenotipos de cáncer", Nature Genetics (se requiere suscripción), Vol 13, págs. 117-119 (mayo de 1996)
- ^ Sobre el enfoque y sus escépticos, véase Stephen D. Moore, "La empresa de biotecnología convierte a Islandia en un laboratorio de genética gigante", Wall Street Journal (requiere suscripción), 3 de julio de 1997
- ^ Una descripción temprana del modelo de descubrimiento por Stefansson y su director de laboratorio, Jeffrey Gulcher, en "Genómica de poblaciones: sentar las bases para el modelado y la focalización de enfermedades genéticas", Química clínica y Medicina de laboratorio (requiere suscripción) vol 36, número 8, págs. 523-7 (agosto de 1998)
- ^ Población y otras estadísticas en Estadísticas de Islandia
- ^ Primera entrevista importante con Stefansson sobre la empresa, ahora en funcionamiento, en Morgunblaðið , 24 de noviembre de 1996
- ^ Para obtener una descripción general de las actividades y logros de la empresa en estos primeros años, consulte los años 1997-2003 en la sección de noticias de su sitio web .
- ^ Gulcher y Stefansson citaron encuestas que mostraban un apoyo público al DHI del 75% en "Una saga islandesa sobre una base de datos sanitaria centralizada y toma de decisiones democráticas", Nature Biotechnology (requiere suscripción), volumen 17, p 620, julio de 1999.
- ^ J Gulcher y K Stefansson, "The Icelandic Healthcare Database y el consentimiento informado", New England Journal of Medicine , vol 342, pp 1827-1830 (junio de 2000)
- ^ Chadwick, R. (1999). "La base de datos de Islandia, ¿los tiempos modernos necesitan sagas modernas?". BMJ . 319 (7207): 441–444. doi : 10.1136 / bmj.319.7207.441. PMC 1127047. PMID 10445931.
- ^ Los opositores al IHD crearon una organización llamada Mannvernd para combatirlo y alentar a las personas a ejercer su derecho a optar por no participar. El número de opciones de exclusión proporciona una medida concreta de oposición a la idea y, a la inversa, una medida de cuántas personas estaban a favor de la idea o no tenían una opinión firme. Según una instantánea archivada del sitio web de Mannvernd de septiembre de 2003 , en los cinco años posteriores a la aprobación de la ley que autorizaba el IHD, poco más de 20.000 personas habían optado por no participar, o el 7% de una población de 288.000 en 2003.
- ^ Los libros y los principales artículos de investigación de bioeticistas y otros oponentes de la IHD y la genómica comercial incluyen: Mike Fortun, Genómica prometedora: Islandia y genética deCODE en un mundo de especulación (Berkeley: University of California Press, 2008); David Winickoff, "Genoma y nación: Base de datos del sector de la salud de Islandia y su legado", Innovaciones: Globalización de la gobernanza de la tecnología , vol 1, número 2, págs. 80-105 (febrero de 2006); Henry T. Greely, "Plan de Islandia para la investigación en genómica: hechos e implicaciones", Jurimetrics (requiere suscripción) vol 40, número 2, págs. 153-91 (invierno de 2000); y Jon Merz, "Iceland, Inc ?: Sobre la ética de la genómica de poblaciones comerciales", Social Science & Medicine vol 58, número 6, págs. 1201-9 (abril de 2004). Además del de Mannvernd, otro sitio web alojado en Berkeley, California, se dedicó a las implicaciones antropológicas de deCODE y la investigación genética en Islandia.
- ^ Se escribieron cientos de artículos a favor y en contra del IHD y deCODE y su enfoque. Un vistazo al tenor y al gran número de estos se puede encontrar en una vista archivada de mayo de 1999 del sitio web de Mannvernd, la organización islandesa formada para oponerse al DHI, y en una bibliografía muy detallada creada por el Dr. Skúli Sigurðsson, un miembro destacado. de Mannvernd.
- ^ Ver la versión archivada del anuncio en los archivos de Clinton
- ^ Consulte las publicaciones de deCODE de 1997-2000 en el sitio web de la empresa
- ^ Véase, por ejemplo, un comunicado de prensa de la empresa , "deCODE genetics of Iceland mapea un gen vinculado a la preeclampsia", 19 de septiembre de 1999
- ^ Un buen resumen del enfoque se encuentra en Nicholas Wade, "Una búsqueda del tesoro genómico puede ser oro sorprendente", New York Times , 18 de junio de 2002
- ^ A Kong y col. , "Un mapa de recombinación de alta resolución del genoma humano", Nature Genetics (requiere suscripción), Volumen 31, págs. 241–247, 10 de junio de 2002
- ^ Tasa de participación superior al 90% incluso cuando la controversia sobre el DHI aún estaba fresca, en el informe anual de 2002 de deCODE presentado ante la SEC, p 8; perfil de la empresa en farmacogenómica , 4 de noviembre de 2004
- ^ Una buena descripción inicial de cómo se pide a las personas que participen y cómo se utilizan sus datos en la investigación se encuentra en las páginas 7-9 del informe anual de 2002 de deCODE presentado ante la SEC.
- ^ Helen Pearson, "Perfil: Kari Stefansson", Nature Medicine , volumen 9, página 1099, 1 de septiembre de 2003; tasa de participación en el informe anual de 2002 de deCODE presentado ante la SEC, p. 8
- ^ James Butcher, "Kari Stefansson, general de genética", The Lancet , 27 de enero de 2007
- ^ Anna Azvolinsky, op. cit
- ^ Michael Spectre, "Decoding Iceland", The New Yorker (requiere suscripción), 18 de enero de 1999
- ^ Ver la página de wikipedia en inglés de Islendingabok
- ^ Olga Khazan, "Cómo la obsesión por la genealogía de Islandia conduce a avances científicos", The Atlantic , 7 de octubre de 2014
- ^ Morgunblaðið en el lanzamiento de Islendingabok - con foto
- ^ Islendingabok.is , accedido como usuario
- ^ Meg Tirrell, "La mina de oro genética de Islandia", CNBC , 6 de abril de 2017
- ^ Yekaterina Vaydylevich, "Estudio de Islandia proporciona información sobre la enfermedad, allana el camino para estudios genómicos a gran escala", noticia en línea para el Instituto Nacional de Investigación del Genoma Humano, 1 de mayo de 2015
- ^ A Kong y col. , "Detección de compartir por descendencia, fase de largo alcance e imputación de haplotipos", Nature Genetics , vol. 40, número 9, págs. 1068–1075 (agosto de 2008)
- ^ "Los genomas de los islandeses", Naturaleza , enlace permanente, 25 de marzo de 2015
- ^ DO Arnar y R Palsson, "Genética de enfermedades complejas comunes: una vista desde Islandia", Revista Europea de Medicina Interna , vol. 40, págs. 3-9 (2017)
- ^ T LaFramboise, "Matrices de polimorfismo de un solo nucleótido: una década de avances biológicos, computacionales y tecnológicos", Nucleic Acids Research , vol 37, número 13, pp 4181-93 (2009) doi: 10.1093 / nar / gkp552
- ^ Una descripción general del enfoque y la escala de campo en J Macarthur et al., "El nuevo Catálogo NHGRI-EBI de estudios de asociación de genoma publicados (Catálogo GWAS)", Nucleic Acids Research , vol 45, número D1, pp D896– D901 (enero de 2017)
- ^ Lista de cientos de las principales publicaciones de la empresa en la página de publicaciones de su sitio web.
- ^ Ver, por ejemplo, S Srinivasan et al. , "La variación genética TCF7L2 aumenta la resistencia a la incretina e influye en la respuesta a una sulfonilurea y metformina: el estudio para comprender la genética de la respuesta aguda a la metformina y la glipizida en humanos (SUGAR-MGH)", Diabetes Care , vol 41, número 3, págs. 554-561 (2018); AV Khera y col. , "Las puntuaciones poligénicas de todo el genoma para enfermedades comunes identifican a los individuos con un riesgo equivalente a mutaciones monogénicas", Nature Genetics , vol 50, pp 1219-1224 (2018)
- ^ Tabla 2 en MC Mills y CA Rahal, "Una revisión cienciométrica de estudios de asociación del genoma", Nature Communications Biology , vol 2, número 9 (2019)
- ^ Cuadro 4, Mills y Rahal, op. cit
- ^ Una descripción general temprana y 20 millones de SNP se pusieron en el dominio público en DF Gudbjartsson et al. , "Variantes de secuencia de la secuenciación del genoma completo de un gran grupo de islandeses", Nature Scientific Data , vol 2, art 150011 (marzo de 2015); Decenas de artículos posteriores que utilizan esta escala de datos se encuentran en la página de publicaciones del sitio web de deCODE desde 2015 en adelante.
- ^ Ver publicaciones deCODE desde 2014-presente
- ^ A Helgadottir et al. , "Variantes con grandes efectos sobre los lípidos sanguíneos y el papel del colesterol y los triglicéridos en la enfermedad coronaria", Nature Genetics , vol. 48, págs. 634–639 (mayo de 2016)
- ^ P Nioi y col. , "Variante ASGR1 asociada con un riesgo reducido de enfermedad arterial coronaria", New England Journal of Medicine , vol 374, págs. 2131-2141 (junio de 2016)
- ^ DF Gudbjartsson y col. , "Concentración de lipoproteínas (a) y riesgos de enfermedades cardiovasculares y diabetes", J Am Coll Cardiol. , vol. 74, número 24, págs.2982-2994 (diciembre de 2019)
- ^ La historia narrada por Gina Kolata, "Una mutación rara mata el gen responsable de la diabetes", New York Times , 2 de marzo de 2014
- ^ J Flannick y col. , "Las mutaciones con pérdida de función en SLC30A8 protegen contra la diabetes tipo 2", Nature Genetics (se requiere suscripción), vol 46, págs. 357–363 (2 de marzo de 2014)
- ^ A Kong et al., "Diferencias en la tasa de recombinación a escala fina entre sexos, poblaciones e individuos", Nature , vol 467, pp 1099-1103 (octubre de 2010)
- ^ BV Halldorsson, et al. , "Caracterización de los efectos mutagénicos de la recombinación a través de un mapa genético a nivel de secuencia", Science , vol 363, número 6425, eaau1043 (enero de 2019)
- ^ Roger Highfield, "Cómo evolucionan los seres humanos", blog del Museo de Ciencias del Reino Unido , 24 de enero de 2019
- ^ S Ebenesersdottir et al. , "Los genomas antiguos de Islandia revelan la formación de una población humana" , Science , vol. 360, número 6392, págs.1028-1032 (junio de 2018)
- ^ H Stefansson y col. , "Una inversión común bajo selección en los europeos", Nature Genetics , vol 37, pp 129-137 (16 de enero de 2005)
- ^ A Jagadeesan et al., "Reconstrucción de un genoma haploide africano del siglo XVIII", Nature Genetics , vol 50, pp 199-205 (enero de 2018)
- ^ Breve resumen de las colaboraciones y líneas de negocio de la empresa en su 10K 2005 , págs. 9-10
- ^ "DeCode para adquirir MediChem Life Sciences en un acuerdo de acciones de $ 84 millones", Genomeweb , 8 de enero de 2002
- ^ Comunicado de prensa de la empresa, "deCODE genetics, Inc. proporciona actualización de desarrollo de productos - CEP-1347, DG041, DG031, DG051", republicado en Biospace , 26 de junio de 2006
- ^ H Hakonsarson y col. , "Efectos de un inhibidor de la proteína activadora de la 5-lipoxigenasa sobre los biomarcadores asociados con el riesgo de infarto de miocardio: un ensayo aleatorizado", JAMA , vol 293, número 18, págs. 2245–2256 (mayo de 2005)
- ^ Comunicado de prensa de la empresa , "deCODE lanza deCODE MI ™: una prueba de un factor de riesgo genético importante para un ataque cardíaco de inicio temprano", 11 de octubre de 2007
- ^ Una lista de las pruebas y un ejemplo de cómo se describió su utilidad en el comunicado de prensa de la empresa , "deCODE lanza deCODE BreastCancer ™, una prueba genética para detectar el riesgo de las formas más comunes de cáncer de mama", 8 de octubre de 2008
- ^ Comunicado de prensa de la empresa , "deCODE lanza deCODE T2 ™, una nueva prueba basada en ADN para evaluar el riesgo heredado de diabetes tipo 2", 15 de abril de 2007
- ^ Ejemplo de SNP incluidos en deCODEme en SNPedia
- ^ Nueva variante agregada a deCODE AF en el comunicado de prensa de la empresa , "deCODE descubre el segundo factor de riesgo genético común para la fibrilación auricular y el accidente cerebrovascular", 13 de julio de 2009
- ^ Sobre el escepticismo continuo sobre las pruebas de enfermedades comunes incluso en 2019, consulte Ian Sample, "NHS abandona el plan para permitir que las personas sanas paguen por la secuenciación del ADN", Guardian , 25 de julio de 2019
- ^ AV Khera y col. , "Las puntuaciones poligénicas de todo el genoma para enfermedades comunes identifican individuos con riesgo equivalente a mutaciones monogénicas", Nature Genetics , vol. 50, págs. 1219-1224 (agosto de 2018)
- ^ Comunicado de prensa de la empresa , "deCODE Launches deCODEme ™", 16 de noviembre de 2007
- ^ En el lanzamiento de deCODEme y 23andMe justo detrás, Nicholas Wade, "La empresa ofrece evaluaciones del genoma", New York Times , 16 de noviembre de 2007. Un año más tarde, cuando la revista Time nombró la prueba de ADN minorista como su invención del año, brotó alrededor de 23andMe enlaces con Google pero no mencionó deCODE. "The retail DNA test", Time , 29 de octubre de 2008
- ^ Consulte la versión archivada del sitio web deCODEme de julio de 2012.
- ^ Cartas de cese y desistimiento de California a empresas de pruebas en Andrew Pollack, "Pruebas genéticas cuestionadas por reguladores", New York Times , 26 de junio de 2008
- ^ Carta de la FDA a deCODE , 10 de junio de 2010
- ^ Cartas de la FDA a 23andMe, Navigenics y Knome, en Andrew Pollack, "Empresas de fallos de la FDA en pruebas genéticas no aprobadas", New York Times , 11 de junio de 2010
- ^ Turna Ray, "Con la compra de deCODE, Amgen gana experiencia, los consumidores pierden la opción de prueba de DTC", Genomeweb , 12 de diciembre de 2012
- ^ Comunicado de prensa de la FDA , "La FDA permite la comercialización de las primeras pruebas directas al consumidor que brindan información sobre el riesgo genético para ciertas afecciones", 6 de abril de 2017
- ^ Estadísticas en "Informe del sexto taller clínico de NACG", Alianza nórdica para la genómica clínica , 21 de noviembre de 2018, p.9
- ↑ Matthew Herper, "Choppy IPO for deCODE genetics", Forbes 19 de julio de 2000
- ^ Corie Lok, "Traducir los genes de Islandia en medicina", MIT Technology Review , 1 de septiembre de 2004
- ^ Sobre inversión y desempeño comercial, ver por ejemplo el 10-K de 2006 de deCODE presentado ante la SEC; Comunicado de prensa de la compañía, "deCODE genetics, Inc. anuncia la colocación de $ 65 millones en notas convertibles", reimpreso en Biospace , 14 de noviembre de 2006
- ^ Daniel Macarthur, "deCODE Genetics al borde de la insolvencia", Wired , 8 de noviembre de 2009
- ^ Vermazis, BioIT World , noviembre de 2008
- ^ "DeCODE Genetics on the Ropes", Science , 7 de noviembre de 2008
- ^ Comunicado de prensa de la empresa , "deCODE genetics, Inc. presenta una petición voluntaria del capítulo 11 para facilitar la venta de activos", 17 de noviembre de 2009
- ^ Nicholas Wade, "Fuera de la bancarrota, la empresa de genética abandona los esfuerzos en materia de medicamentos", New York Times , 21 de enero de 2010
- ^ Emily Singer, "deCODE abandona el desarrollo de fármacos", MIT Technology Review , 22 de enero de 2010
- ^ Un buen resumen de los desafíos y el pensamiento para el resurgimiento de deCODE después de la bancarrota, Mary Carmichael, "El fracaso más exitoso del mundo", Newsweek , 11 de febrero de 2010
- ^ Stefansson dijo que seis años antes de Kevin Davies, en BioIT en 2008; Kevin Davies, The $ 1,000 Genome: The Revolution in DNA Sequencing and the New Era of Personalized Medicine (Nueva York: The Free Press, 2010), p. 148
- ^ Stefansson dijo que la compañía se fundó diez años antes de tiempo y le explicó sus razones a Victor McIlhenny en Drawing the Map of Life: Inside the Human Genome Project (Londres: Hachette Reino Unido, 2012)
- ^ "Para Kari Stefansson y deCODE, el diagnóstico parece prometedor", Sciencewatch , septiembre / octubre de 2010
- ^ Comunicado de prensa de la empresa sobre el documento "deCODE Genetics, en colaboración con colegas académicos e Illumina, descubre mutaciones que confieren un alto riesgo de cáncer de ovario", 2 de octubre de 2011
- ^ Matt Herper, "Con DeCode Deal, Amgen tiene como objetivo descubrir drogas como queríamos en 1999", Forbes , 12 de diciembre de 2012
- ^ Citado en Asher Mullard, "Una audiencia con ... Sean Harper", Nature Reviews Drug Discovery (se requiere suscripción), vol 17, pp 10-11 (enero de 2018)
- ^ Uno apunta a la lipoproteína (a), según un descubrimiento de deCODE publicado en 2019 ; otro se dirige al colesterol no HDL basándose en el descubrimiento de variantes en el gen ASGR1 por parte de deCODE en 2016. Ver el pipeline de Amgeny M. Janiszewski et al. , Revista del Colegio Americano de Cardiología , Volumen 73, Número 9, Suplemento 1 (marzo de 2019)
- ^ MJ Daly, "Introducción al premio William Allan 2017", op. cit.
- ^ Sobre el papel de la homogeneidad y los objetivos generales, consulte J Gulcher y K Stefansson, "Genómica de la población: Sentar las bases para el modelado y la focalización de enfermedades genéticas", Química clínica y Medicina de laboratorio , vol 36, Número 8 (1998)
- ^ El científico británico John Bell fue particularmente profético con respecto a la utilidad futura de la genómica en la atención médica. Véase John Bell, "La nueva genética en la práctica clínica", BMJ , vol 316, número 7131 (14 de febrero de 1998).
- ^ Ver J Fears y G Poste, "Creación de recursos de genética de poblaciones utilizando el NHS del Reino Unido " , Science , vol 284, número 5412, págs. 267-8 (abril de 1999)
- ^ Pallab Ghosh, "Will Biobank amortizar?", BBC , 24 de septiembre de 2003
- ^ JM Gaziano y col. , "Million Veteran Program: Un mega-biobanco para estudiar las influencias genéticas en la salud y la enfermedad", Journal of Clinical Epidemiology , vol 70, pp 214-223 (febrero de 2016)
- ^ Z Chen, et al. , "China Kadoorie Biobank de 0,5 millones de personas: métodos de encuesta, características de referencia y seguimiento a largo plazo", International Journal of Epidemiology , vol 40, número 6, págs. 1652–1666 (diciembre de 2011)
- ^ Erika Chek Hayden, "¿Es real el genoma de $ 1,000?", Nature , 15 de enero de 2014
- ^ Catherine Offord, "Aprendiendo del modelo de Islandia para la investigación genética", The Scientist , 31 de mayo de 2017
- ^ Comunicado de prensa , "Regeneron y Geisinger Health System anuncian una importante colaboración en la investigación de genética humana", regeneron.com, 13 de enero de 2014
- ^ Heidi Ledford, "AstraZeneca lanza proyecto para secuenciar 2 millones de genomas", Nature , 22 de abril de 2016
- ^ Véase, por ejemplo, la página de la facultad de Mark Daly como director del Instituto de Medicina Molecular de la Universidad de Helsinki
- ^ ES Hautamäki y J Lilja, "Uso secundario de datos de salud: la nueva ley finlandesa", blog de Insights , Roschier.com, 19 de noviembre de 2019
- ^ Comunicado de prensa , "NextCODE Health lanza operaciones con licencia exclusiva para aprovechar la plataforma de genómica de deCODE genetics para diagnósticos clínicos basados en secuencia y $ 15 millones en financiamiento de riesgo", PRNewswire , 23 de octubre de 2013
- ^ Véase Vivien Marx, "DNA of a Nation", Nature , vol 524, págs. 503–505 (agosto de 2015)
- ^ Comunicado de prensa, "Sidra selecciona WuXi NextCODE para potenciar la genómica de poblaciones y la medicina de precisión en Qatar", PRNewswire , 6 de octubre de 2015
- ^ Allison Proffitt, "WuXi NextCODE elegido para apoyar al piloto de medicina de precisión de Singapur", BioIT World , 5 de enero de 2017
- ^ C Brownstein, et al. , "Si supiera entonces lo que sé ahora: la necesidad de infraestructura para permitir la medicina de precisión", Vector (blog del Boston Children's Hospital), 14 de agosto de 2017
- ^ "ADN de una nación", op. cit. ; "WuXi NextCode, Fudan Children's Hospital Collaborate on Rare Disease Diagnostics", Genomeweb , 16 de septiembre de 2015
- ^ "Intermountain, decodificar la genética para secuenciar genomas de 500K para la investigación", Genomeweb , 12 de junio de 2019
- ^ Jonathan Smith, "Compañía islandesa para secuenciar 225.000 genomas de pacientes del Reino Unido", Labiotech , 13 de septiembre de 2019
- ^ Pruebas por millón por país en la plantilla de la página Wiki : Prueba de COVID-19 por país ; a fines de abril, ocho semanas después de que comenzaran las pruebas, el rastreo y el aislamiento, prácticamente no se detectaban nuevos casos, como se puede ver en https://www.covid.is/data
- ^ La mejor fuente de información sobre la respuesta oficial, desde la cronología histórica hasta los datos más recientes, es el sitio oficial del gobierno, covid.is, disponible en islandés, inglés y muchos otros idiomas. La página de Wikipedia sobre la pandemia de COVID-19 en Islandia se basa en esto con fuentes, enlaces y gráficos adicionales.
- ^ Ver datos y gráficos en la página de datos oficial https://www.covid.is/data
- ^ Elizabeth Kolbert, "Cómo Islandia venció al coronavirus", The New Yorker , 1 de junio de 2020
- ^ Un esquema útil de lo que implican estas pruebas se encuentra en Clive Cookson y Camilla Hodgson, "¿Qué pruebas de coronavirus necesita el mundo para rastrear la pandemia?" Financial Times , 1 de abril de 2020.
- ^ Þórunn Kristjándóttir, "„ Eðlilegt “og„ sjálfsagt “að leggjast á árarnar," Morgunblaðið , 6 de marzo de 2020
- ^ "Tólf þúsund bókað tíma í skimun", Morgunblaðið , 13 de marzo de 2020
- ^ Comunicado de prensa , "Pruebas a gran escala de la población general en Islandia en curso", Ministerio de Relaciones Exteriores de Islandia, 15 de marzo de 2020.
- ^ Las estadísticas completas sobre las pruebas realizadas por las autoridades sanitarias y deCODE por fecha, así como el número de infecciones activas, del 28 de febrero al 14 de junio se pueden encontrar en inglés en https://www.covid.is/data-old
- ^ Comunicado de prensa , "Islandia proporciona una imagen de la propagación temprana de COVID-19 en una población con una respuesta de salud pública cohesiva", deCODE genetics, 14 de abril de 2020
- ^ "Þrisvar sinnum fleiri smit en greindust" , Morgunblaðið , 5 de junio de 2020
- ^ Dagny Hulda Erlendsdóttir, "Mikill minnihluti landsmanna með mótefni við COVID-19", RUV , 28 de mayo de 2020
- ^ "Einkaþotan mætt að sækja blóðkornin", RUV , 6 de junio de 2020
- ^ Burke, Lucy, 'Genética y la escena del crimen: decodificación de sangre contaminada', Journal of Literary & Cultural Disability Studies , 6 (2012), 193-208. doi: 10.3828 / jlcds.2012.16.
- ^ Reikiavik: JPV, 2016.
- ^ Einar Kári Jóhannsson, ' Þjóð (ar) saga Sjóns: Pólitísk ummyndun á sameiginlegum minningum Íslendinga í sögulegum skáldverkum Sjóns ' (tesis de maestría inédita, Universidad de Islandia, 2018), p. 67.
Otras lecturas
- Thráinn Eggertsson. 2011. " La evolución de los derechos de propiedad: el extraño caso de los registros de salud de Islandia ". Revista Internacional de los Comunes Vol. 5, no 1 de febrero de 2011, págs. 50–65
- Sobre deCODE en el contexto de la nueva genómica: Davies, Kevin, The $ 1,000 Genome: The Revolution in DNA Sequencing and the New Era of Personalized Medicine (Nueva York: The Free Press, 2010)
- Ensayos recopilados de un antropólogo islandés sobre Islandia, deCODE y genómica: Palsson, Gisli, Nature, Culture and Society: Anthropological Perspectives on Life (Cambridge: Cambridge University Press, 2016)
- Una pieza de época con una visión crítica de deCODE y la genómica comercial a principios de la década de 2000: Fortun, Michael, Promising Genomics: Iceland y deCODE Genetics in a World of Speculation . Berkeley: Prensa de la Universidad de California, 2008.
- 'Gene Frenzy' Heats Up Iceland, CBS News, 2 de diciembre de 2002.
enlaces externos
- sitio web de deCODE genetics
- Sitio web islandés de deCODE genetics
- Página de Wikipedia de Kári Stefánsson
Coordenadas : 64 ° 08′08 ″ N 21 ° 56′45 ″ W / 64.13556 ° N 21.94583 ° W / 64.13556; -21.94583