El factor 1 relacionado con la diferenciación endotelial es una proteína que en humanos está codificada por el gen EDF1 . [5] [6] [7]
EDF1 |
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Estructuras disponibles |
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PDB | Búsqueda de ortólogos: PDBe RCSB |
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Lista de códigos de identificación de PDB |
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1X57 |
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Identificadores |
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Alias | EDF1 , EDF-1, MBF1, CFAP280, factor 1 relacionado con la diferenciación endotelial |
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Identificaciones externas | OMIM : 605107 MGI : 1891227 HomoloGene : 2809 GeneCards : EDF1 |
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Ubicación de genes ( humanos ) |
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| Chr. | Cromosoma 9 (humano) [1] |
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| Banda | 9q34.3 | Comienzo | 136,862,119 pb [1] |
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Final | 136,866,308 pb [1] |
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Ubicación de genes ( ratón ) |
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| Chr. | Cromosoma 2 (ratón) [2] |
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| Banda | 2 | 2 A3 | Comienzo | 25,557,847 pb [2] |
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Final | 25.562.082 pb [2] |
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Ontología de genes |
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Función molecular | • Actividad de metiltransferasa • Unión de ADN de secuencia específica • Unión de ADN • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Actividad del factor de transcripción de unión al ADN • GO: 0001105 Actividad de coactivador de la transcripción • Unión de calmodulina • Actividad de histona acetiltransferasa • GO : 0001948 proteína de unión • unirse a la ARN • factor de transcripción de clase TFIID complejo de unión
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Componente celular | • citoplasma • complejo de factor de transcripción TFIID • estructura anatómica intracelular • nucleolo • exosoma extracelular • núcleo • citosol
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Proceso biológico | • diferenciación celular • regulación de la transcripción, plantilla de ADN • transcripción, plantilla de ADN • desarrollo de organismos multicelulares • regulación positiva de la transcripción, plantilla de ADN • regulación del proceso metabólico de lípidos • diferenciación de células endoteliales • regulación positiva de la unión al ADN
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Fuentes: Amigo / QuickGO |
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Ortólogos |
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Especies | Humano | Ratón |
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Entrez | | |
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Ensembl | | |
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UniProt | | |
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RefSeq (ARNm) | |
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NM_153200 NM_001281297 NM_001281298 NM_001281299 NM_003792 |
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RefSeq (proteína) | |
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NP_001268226 NP_001268227 NP_001268228 NP_003783 NP_694880 |
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Ubicación (UCSC) | Crónicas 9: 136,86 - 136,87 Mb | Crónicas 2: 25,56 - 25,56 Mb |
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Búsqueda en PubMed | [3] | [4] |
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Wikidata |
Ver / editar humano | Ver / Editar mouse |
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Este gen codifica una proteína que puede regular la diferenciación de las células endoteliales. Se ha postulado que la proteína funciona como una molécula puente que interconecta las proteínas reguladoras y la maquinaria transcripcional basal, modulando así la transcripción de genes implicados en la diferenciación endotelial. También se ha descubierto que esta proteína actúa como un coactivador transcripcional al interconectar la proteína de unión al elemento TATA (TBP) del factor de transcripción general y activadores específicos de genes. Se han encontrado dos transcripciones empalmadas alternativamente que codifican proteínas distintas para este gen. [7]
Se ha demostrado que EDF1 interactúa con:
- Receptor alfa X del hígado , [8]
- Receptor gamma activado por proliferador de peroxisoma , [8] y
- Proteína de unión a TATA . [8] [9] [10]