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Enterobacter cloacae es una clínicamente significativa Gram-negativas , facultativamente anaeróbico , en forma de barra bacteria .

Microbiología [ editar ]

En los laboratorios de microbiología, E. cloacae se cultiva frecuentemente a 30 ° C en agar nutritivo oa 35 ° C en caldo de soja tríptico . [1] Es una bacteria gramnegativa con forma de bastón, es facultativamente anaeróbica y tiene flagelos peritricosos . Es oxidasa negativa y catalasa positiva . [2]

Uso industrial [ editar ]

Enterobacter cloacae se ha utilizado en un método basado en biorreactores para la biodegradación de explosivos y en el control biológico de enfermedades de las plantas. [3]

Seguridad [ editar ]

E. cloacae se considera un organismo de nivel 1 de bioseguridad en los Estados Unidos y de nivel 2 en Canadá. [ cita requerida ]

Genómica [ editar ]

Un borrador de la secuencia del genoma de Enterobacter cloacae subsp. cloacae se anunció en 2012. Las bacterias utilizadas en el estudio se aislaron de las heces del panda gigante . [4]

Importancia clínica [ editar ]

Enterobacter cloacae es un miembro de la flora intestinal normal de muchos seres humanos y no suele ser un patógeno primario. [5] Algunas cepas se han asociado con infecciones del tracto urinario y respiratorio en individuos inmunodeprimidos. Se ha informado de tratamiento con cefepima y gentamicina . [6]

Un estudio de 2012 en el que Enterobacter cloacae trasplantado en ratones previamente libres de gérmenes resultó en un aumento de la obesidad en comparación con ratones libres de gérmenes alimentados con una dieta idéntica, lo que sugiere un vínculo entre la obesidad y la presencia de la flora intestinal de Enterobacter. [7]

Especies del complejo E. cloacae [ editar ]

E. cloacae fue descrita por primera vez en 1890 por Jordan [201] [ cita requerida ] como Bacillus cloacae , y luego sufrió numerosos cambios taxonómicos, convirtiéndose en 'Bacterium cloacae' en 1896 (Lehmann y Neumann), Cloaca cloacae en 1919 (Castellani y Chalmers), fue identificado como 'Aerobacter cloacae' en 1923 (Bergey et al.), Aerobacter cloacae en 1958 (Hormaeche y Edwards) y E. cloacae en 1960 (Hormaeche y Edwards), por lo que todavía se conoce hoy. [7] E. cloacaees omnipresente en ambientes terrestres y acuáticos (agua, alcantarillado, suelo y alimentos). Estas cepas ocurren como microflora comensal en el tracto intestinal de humanos y animales [1] y juegan un papel importante como patógenos en plantas e insectos. Esta diversidad de hábitats se refleja en la variedad genética de la especie E. cloacae . [6] La E. cloacae también es un patógeno nosocomial importante responsable de bacteriemia e infecciones del tracto respiratorio inferior, del tracto urinario e intraabdominales, así como de endocarditis. artritis séptica, osteomielitis e infecciones de piel y tejidos blandos. La piel y el tracto gastrointestinal son los sitios más comunes a través de los cuales se puede contraer E. cloacae . [1,29]

E. cloacae tiende a contaminar varios dispositivos médicos, intravenosos y otros dispositivos hospitalarios. Los brotes nosocomiales también se han asociado con la colonización de ciertos equipos quirúrgicos y soluciones de limpieza operativa. Otro reservorio potencial de bacteriemia nosocomial es la solución de heparina que se usa para irrigar ciertos dispositivos intravasculares de forma continua. Este líquido ha sido implicado como reservorio de brotes de bacteriemia asociada al dispositivo en varios casos. [30]

En los últimos años, E. cloacae se ha convertido en uno de los patógenos nosocomiales más comúnmente encontrados en las unidades neonatales, y se han notificado varios brotes de infección. [31] En 1998, van Nierop et al. reportaron un brote en una unidad de cuidados intensivos neonatales con nueve muertes, [32] y en 2003, Kuboyama et al. notificaron tres brotes con 42 infecciones sistémicas y una mortalidad del 34%. [33] Este microorganismo puede transmitirse a los recién nacidos a través de líquidos intravenosos contaminados, soluciones de nutrición parenteral total y equipo médico. Se han descrito muchos brotes de un solo clon, probablemente causados ​​por transmisión cruzada a través de los trabajadores de la salud, lo que sugiere que los pacientes hospitalizados también pueden actuar como reservorio. [31] Las cepas tipo de la especie son E. cloacae ATCC 49162 y 13047. Esta última cepa es la primera secuencia completa del genoma de laE. cloacae especies y la cepa tipo es E. cloacae subsp. cloacae .

La subsp. Completa de E. cloacae . cloacae ATCC 13047 contiene un único cromosoma circular de 5.314.588 pb y dos plásmidos circulares, pECL_A y pECL_B, de 200.370 y 85.650 pb (números de acceso de GenBank CP001918, CP001919 y CP001920, respectivamente). [34]

Los otros genomas de E. cloacae que se han secuenciado se depositan en GenBank con los números de acceso CP002272, CP002886, FP929040 y AGSY00000000.

E. asburiae lleva el nombre de Mary Alyce Fife-Asbury, una bacterióloga estadounidense que hizo muchas contribuciones importantes a la clasificación de Enterobacteriaceae, particularmente en la descripción de nuevos serotipos de Klebsiella y Salmonella , [35-37] nuevos géneros y nuevas especies. [38-42 ] E. asburiae sp. nov. se describió en 1986 sobre la base del grupo entérico 17. [43] Este grupo se definió en 1978 como un grupo de cepas bioquímicamente similares aisladas de diferentes muestras humanas [44] y enviadas a los CDC. Antes de la designación de 'grupo entérico 17', estas cepas se habían informado como cepas de Citrobacter o Enterobacter no identificadas o atípicas. [44] Después de varios estudios, se demostró que estas cepas representan una sola nueva especie en el géneroEnterobacter , que se denominó E. asburiae .

Se han aislado cepas de E. asburiae del suelo e implicadas en la movilización de fosfato para la nutrición vegetal a partir del fosfato de calcio, pero la mayoría de las especies de E. asburiae se han aislado de fuentes humanas. La cepa tipo de la especie E. asburiae es ATCC 35953 y se aisló de los exudados de loquios de una mujer de 22 años en los EE. UU. [43] La única cepa secuenciada de E. asburiae es LF7a, que contiene un ADN circular (4.812.833 pb) y dos plásmidos circulares, pENTAS01 (166.725 pb) y pENTAS02 (32.574 pb), que fueron presentados por Lucas et al. en 2011 al Instituto Conjunto del Genoma del DOE de EE. UU. (CA, EE. UU.; números de acceso de GenBank CP003026.1, CP003027.1 y CP003028.1, respectivamente).

E. hormaechei lleva el nombre de Estenio Hormaeche, un microbiólogo uruguayo que (con PR Edwards) propuso y definió el género Enterobacter . [7] El nombre E. hormaechei antes se llamaba grupo entérico 75, que contenía 11 cepas que fueron enviadas a los CDC. para su identificación entre 1973 y 1984. Se recibieron doce cepas adicionales de 1985 a 1987, tres de las cuales eran aislados de sangre. E. hormaechei se describió por primera vez sobre la base de 23 aislamientos enviados a los CDC para su identificación. En ese momento, no se podían asignar a una especie porque dieron negativo en las pruebas de D-sorbitol y melibiosa y no se ajustaban al perfil bioquímico de ninguna especie de Enterobacter establecida. La especie E. hormaecheise propuso ser negativo para lactosa, D-sorbitol, rafinosa, melibiosa y esculina y 87% positivo para dulcitol. Estas especies fueron definidas originalmente por O'Hara et al. cuando se aisló un gran grupo de hibridación de organismos entéricos y se encontró que estaba asociado con infecciones del torrente sanguíneo. [10]

La cepa tipo de E. hormaechei es ATCC 49162 y se aisló del esputo de un hombre en California en 1977. [10] El proyecto de secuenciación de la escopeta de genoma completo se presentó en 2011 al Centro de secuenciación del genoma humano (TX, EE. UU.; Número de acceso de GenBank AFHR00000000).

E. hormaechei consta de tres subespecies diferentes: E. hormaechei subsp. oharae , E. hormaechei subsp. hormaechei y E. hormaechei subsp. steigerwaltii , que corresponde a los grupos genéticos VI, VII y VIII, respectivamente. [8] La diferenciación de estas subespecies se basa en sus propiedades particulares y pruebas bioquímicas. [11]

E. hormaechei se aísla comúnmente como un patógeno nosocomial de importancia clínica; [45,46] se ha informado en varios brotes de sepsis en unidades de cuidados intensivos neonatales en los EE.UU. [47] y en Brasil, donde el brote se originó por vía parenteral contaminada nutrición. [48]

E. kobei lleva el nombre de la ciudad de Kobe (Japón), donde se aisló la cepa tipo de esta especie. E. kobei fue descrito por primera vez por Kosako et al. basado en una colección de 23 cepas con los rasgos generales de E. cloacae y la diferencia fenotípica común de ser Voges-Proskauer-negativo. [49] El nombre E. kobei se propone para un grupo de organismos denominados grupo 21 de los NIH en los NIH de Tokio. Más tarde se descubrió que el grupo 21 de los NIH también se parecía al grupo entérico 69, [50] de los CDC y a E. kobeise comparó con este último. Sobre la base de la relación del ADN, ambos organismos podrían incluirse en un solo taxón. Sin embargo, el grupo entérico de los CDC 69 se describió como positivo en Voges-Proskauer y pigmentación amarilla, [50] mientras que todas las cepas de E. kobei fueron Voges-Proskauer- y pigmentación negativa. Estos hallazgos sugieren que la relación de ambos organismos es a nivel de subespecies o biogrupos. La cepa tipo de E. kobei es NIH 1485-1479 y se aisló mediante hemocultivo de un paciente diabético.

E. ludwigii , que lleva el nombre de Wolfgang Ludwig, un microbiólogo que trabaja en sistemática bacteriana [51] y que desarrolló las bases de datos del ARB y las hizo públicas [52]. Esta descripción se basa en los análisis filogenéticos de los datos de la secuencia parcial de hsp60 recopilados en un estudio genético de poblaciones [6], así como en ensayos de hibridación ADN-ADN y caracterizaciones fenotípicas.

La cepa tipo EN-119T se aisló de la orina del medio chorro de un paciente masculino de 18 años con una infección nosocomial del tracto urinario mientras estaba hospitalizado en el Hospital Universitario Grosshadern de Múnich, Alemania. El número de acceso de GenBank del rDNA 16S de la cepa EN-119T es AJ853891. [12]

E. nimipressuralis La especie E. nimipressuralis fue definida originalmente por Brenner et al. y antes se llamaba Erwinia nimipressuralis , que se aisló de fuentes no clínicas (por ejemplo, olmos con una enfermedad llamada madera húmeda). [43] Erwinia nimipressuralis se incluyó en las listas aprobadas de nombres bacterianos en 1980. Este microorganismo es bioquímicamente similar a E. cloacae , pero es diferente para la producción de ácido de sacarosa y rafinosa, mientras que E. cloacae es positivo en estas pruebas. La cepa tipo de E. nimipressuralis es ATCC 9912 y está aislada del olmo Ulmus spp. en los Estados Unidos (número de acceso de GenBank AJ567900).

La cepa PR-4 de E. cloacae subespecie cloacae se aisló e identificó mediante la secuencia del gen de rDNA 16S con vista de árbol filogenético desde suelo cargado de explosivos por P Ravikumar (número de acceso de GenBank KP261383). [8]

E. cloacae SG208 identificado como un microorganismo predominante en cultivo mixto aislado de lodos petroquímicos, IOCL, Guwahati es responsable de la degradación del benceno fue informado por Padhi y Gokhale (2016) [137].

Ver también [ editar ]

  • Biohidrógeno

Referencias [ editar ]

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Enlaces externos [ editar ]

  • Tipo de cepa de Enterobacter cloacae en Bac Dive - la base de metadatos de diversidad bacteriana