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FANCE
Proteína FANCE PDB 2ilr.png
Estructuras disponibles
PDBBúsqueda humana UniProt: PDBe RCSB
Lista de códigos de identificación de PDB

2ILR

Identificadores
AliasFANCE , FACE, FAE, grupo de complementación de anemia de Fanconi E, grupo de complementación de FA E
Identificaciones externasOMIM : 613976 MGI : 1920025 HomoloGene : 11066 GeneCards : FANCE
Ubicación de genes ( humanos )
Cromosoma 6 (humano)
Chr.Cromosoma 6 (humano) [1]
Cromosoma 6 (humano)
Ubicación genómica para FANCE
Ubicación genómica para FANCE
Banda6p21.31Comienzo35.452.338 pb [1]
Final35,467,102 pb [1]
Ubicación de genes ( ratón )
Cromosoma 17 (ratón)
Chr.Cromosoma 17 (ratón) [2]
Cromosoma 17 (ratón)
Ubicación genómica para FANCE
Ubicación genómica para FANCE
Banda17 | 17 A3.3Comienzo28,313,519 pb [2]
Final28,326,572 pb [2]
Patrón de expresión de ARN
PBB GE FANCE 220255 en fs.png
Más datos de expresión de referencia
Ontología de genes
Función molecular• función molecular
• GO: 0001948 unión a proteínas
Componente celular• Complejo nuclear de anemia de Fanconi
• núcleo
• nucleoplasma
Proceso biológico• Reparación de enlaces cruzados entre cadenas
• Respuesta celular al estímulo de daño del ADN
• Reparación del ADN
Fuentes: Amigo / QuickGO
Ortólogos
EspeciesHumanoRatón
Entrez

2178

72775

Ensembl

ENSG00000112039

ENSMUSG00000007570

UniProt

Q9HB96

n / A

RefSeq (ARNm)

NM_021922

NM_001163819
NM_001163820
NM_028348

RefSeq (proteína)

NP_068741

n / A

Ubicación (UCSC)Crónicas 6: 35,45 - 35,47 MbCrónicas 17: 28,31 - 28,33 Mb
Búsqueda en PubMed[3][4]
Wikidata
Ver / editar humanoVer / Editar mouse

La anemia de Fanconi, la proteína del grupo de complementación E es una proteína que en los humanos está codificada por el gen FANCE . [5] [6] [7] El grupo de complementación de la anemia de Fanconi (FANC) actualmente incluye FANCA , FANCB , FANCC , FANCD1 (también llamado BRCA2), FANCD2 , FANCE , FANCF , FANCG y FANCL. La anemia de Fanconi es un trastorno recesivo genéticamente heterogéneo caracterizado por inestabilidad citogenética, hipersensibilidad a los agentes de entrecruzamiento del ADN, aumento de la rotura cromosómica y reparación defectuosa del ADN. Los miembros del grupo de complementación de la anemia de Fanconi no comparten similitud de secuencia; están relacionados por su ensamblaje en un complejo proteico nuclear común. Este gen codifica la proteína para la complementación groufcrp E. [7]

Un complejo nuclear que contiene proteína FANCE (así como FANCC , FANCF y FANCG ) es esencial para la activación de la proteína FANCD2 a la isoforma mono-ubiquitinada . [8] En células normales, no mutantes, FANCD2 es mono-ubiquinated en respuesta al daño del ADN. FANCE junto con FANCC actúa como el adaptador de sustrato para esta reacción [9] La proteína FANCD2 activada co-localiza con BRCA1 (proteína de susceptibilidad al cáncer de mama) en focos inducidos por radiación ionizante y en complejos sinaptonémicos de meióticoscromosomas. La proteína FANCD2 activada puede funcionar antes del inicio de la recombinación meiótica , quizás para preparar cromosomas para sinapsis o para regular eventos de recombinación posteriores. [8]

Expresión genética [ editar ]

Se afirma que FANCE se ha expresado en 151 órganos con el nivel más alto en gónadas femeninas. [10]

Ubicación cromosómica [ editar ]

La ubicación del gen está en 6p21.31, donde p es el brazo corto del cromosoma 6 en la posición 21.31 [11]

La ubicación a nivel molecular está en pares de bases 35,452,339 a 35,467,106 en el cromosoma 6 (Homo sapiens Annotation Release 109, GRCh38.p12) [11]

Características de las proteínas [ editar ]

El complejo principal de FA contiene un complejo nuclear de múltiples subunidades de, en particular, 8 proteínas FA. [12] Esto agrega una sola cadena ubicua al FANCD2 luego de daño en el ADN o presión duplicada. [13]

Para la colección de FANCC, FANCE es importante en el núcleo y la reunión del complejo central. Algunas características de FANCE es que puede establecerse con FANCD2, BRCA2 ubiquitinados y focos nucleares construidos. Además, ya que es el único miembro que muestra una unión directa con FANCD2 y proporciona los vínculos necesarios entre el complejo principal de FA y FANCD2. [14]

La estructura de FANCE tiene un epítopo en su superficie que se considera importante para su unión con FANCD2. La existencia de un motivo helicoidal recurrente no estaba clara cuando se realizó el análisis de aminoácidos.

Estructura de la proteína [ editar ]

Consiste en 13 hélices α, 1 3 10 hélices y ninguna hebra β. Forma alargada, no globular y tamaño de 70 Å n. Ancho de 30 Å y espesor de 20 Å. La proteína se pliega continuamente de manera diestra desde el terminal N al C terminal. Identificarlo es fácil debido a sus hélices al final de C-end. [14]

Función [ editar ]

Restaura los enlaces cruzados del ADN y es necesario para la acumulación nuclear de FANCC, proporcionando un puente crítico entre el complejo FA y FANCD2. [15]

Aplicaciones [ editar ]

  • FANCE tiene su aplicación en Western Blot e IHC-P (inmunohistoquímica) donde el peso molecular predicho fue de 58 kDa en Western blot y la recuperación de antígeno con tampón citrato pH6 se realizó antes del inicio de IHC-P. [15]
  • FANCE también se usa en Gene Mapping , aquí mapeo de homocigosidad , donde se fusiona con 3 células de ADN que ayudarán a calcular la sensibilidad a los compuestos de Mitomicina C, un agente de entrecruzamiento del ADN (Sigma). Luego también examina el uso de marcadores de microsatélites D6S422 y D6S1610, [16] para la vinculación. A partir de esto, se localiza una región cromosómica en el cromosoma 6p para FANCE. [17]
  • La inmunotransferencia mostró que los mutantes FANCE-L348M y FANCE-E263K mostraban una división en la membrana nuclear de FA-E EUFA409 LCL, lo que indica que, independientemente de que FANCE tenga señales de localización nuclear putativas, [18] limita principalmente al núcleo. [19]

Interacciones [ editar ]

Se ha demostrado que FANCE interactúa con:

  • FANCA , [20] [21] [22] [23]
  • FANCD2 , [22] [24] [25]
  • FANCF [22] [26]
  • FANCG , [20] [21] [22] y
  • FANCC . [20] [21] [22] [24] [26]

Referencias [ editar ]

  1. ^ a b c GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000112039 - Ensembl , mayo de 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000007570 - Ensembl , mayo de 2017
  3. ^ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ^ "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  5. ^ Joenje H, Lo ten Foe JR, Oostra AB, van Berkel CG, Rooimans MA, Schroeder-Kurth T, Wegner RD, Gille JJ, Buchwald M, Arwert F (septiembre de 1995). "Clasificación de pacientes con anemia de Fanconi por análisis de complementación: evidencia de un quinto subtipo genético" . Sangre . 86 (6): 2156–60. doi : 10.1182 / blood.V86.6.2156.bloodjournal8662156 . PMID 7662964 . 
  6. ^ de Winter JP, Léveillé F, van Berkel CG, Rooimans MA, van Der Weel L, Steltenpool J, Demuth I, Morgan NV, Alon N, Bosnoyan-Collins L, Lightfoot J, Leegwater PA, Waisfisz Q, Komatsu K, Arwert F, Pronk JC, Mathew CG, Digweed M, Buchwald M, Joenje H (noviembre de 2000). "Aislamiento de un ADNc que representa el gen del grupo E de complementación de la anemia de Fanconi" . Revista Estadounidense de Genética Humana . 67 (5): 1306–8. doi : 10.1016 / S0002-9297 (07) 62959-0 . PMC 1288571 . PMID 11001585 .  
  7. ^ a b "Entrez Gene: anemia de FANCE Fanconi, grupo de complementación E" .
  8. ^ a b García-Higuera I, Taniguchi T, Ganesan S, Meyn MS, Timmers C, Hejna J, Grompe M, D'Andrea AD (febrero de 2001). "Interacción de las proteínas de la anemia de Fanconi y BRCA1 en una vía común" . Célula molecular . 7 (2): 249–62. doi : 10.1016 / s1097-2765 (01) 00173-3 . PMID 11239454 . 
  9. ^ van Twest S, Murphy VJ, Hodson C, Tan W, Swuec P, O'Rourke JJ, Heierhorst J, Crismani W, Deans AJ (enero de 2017). "Mecanismo de ubiquitinación y desubiquitinación en la vía de la anemia de Fanconi" . Célula molecular . 65 (2): 247–259. doi : 10.1016 / j.molcel.2016.11.005 . PMID 27986371 . 
  10. ^ "FANCE - proteína del grupo E de la anemia de Fanconi - Homo sapiens (humano) - proteína y gen FANCE" . www.uniprot.org . Consultado el 9 de noviembre de 2018 .
  11. ^ a b "Grupo de complementación FANCE FA E [Homo sapiens (humano)] - Gene - NCBI" . www.ncbi.nlm.nih.gov . Consultado el 9 de noviembre de 2018 .
  12. ^ Medhurst AL, Huber PA, Waisfisz Q, de Winter JP, Mathew CG (febrero de 2001). "Las interacciones directas de las cinco proteínas conocidas de la anemia de Fanconi sugieren una vía funcional común" . Genética molecular humana . 10 (4): 423–9. doi : 10.1093 / hmg / 10.4.423 . PMID 11157805 . 
  13. ^ García-Higuera I, Taniguchi T, Ganesan S, Meyn MS, Timmers C, Hejna J, Grompe M, D'Andrea AD (febrero de 2001). "Interacción de las proteínas de la anemia de Fanconi y BRCA1 en una vía común" . Célula molecular . 7 (2): 249–62. doi : 10.1016 / S1097-2765 (01) 00173-3 . PMID 11239454 . 
  14. ↑ a b Nookala RK, Hussain S, Pellegrini L (2007). "Información sobre la anemia de Fanconi de la estructura de FANCE humano" . Investigación de ácidos nucleicos . 35 (5): 1638–48. doi : 10.1093 / nar / gkm033 . PMC 1865054 . PMID 17308347 .  
  15. ^ a b "Anticuerpo anti-FANCE (ab126177) | Abcam" . www.abcam.com . Consultado el 9 de noviembre de 2018 .
  16. ^ Waisfisz Q, Saar K, Morgan NV, Altay C, Leegwater PA, de Winter JP, Komatsu K, Evans GR, Wegner RD, Reis A, Joenje H, Arwert F, Mathew CG, Pronk JC, Digweed M (mayo de 1999) . "El gen del grupo E de la anemia de Fanconi, FANCE, se asigna al cromosoma 6p" . Revista Estadounidense de Genética Humana . 64 (5): 1400-5. doi : 10.1086 / 302385 . PMC 1377877 . PMID 10205272 .  
  17. ^ Waisfisz Q, Saar K, Morgan NV, Altay C, Leegwater PA, de Winter JP, Komatsu K, Evans GR, Wegner RD, Reis A, Joenje H, Arwert F, Mathew CG, Pronk JC, Digweed M (mayo de 1999) . "El gen del grupo E de la anemia de Fanconi, FANCE, se asigna al cromosoma 6p" . Revista Estadounidense de Genética Humana . 64 (5): 1400-5. doi : 10.1086 / 302385 . PMC 1377877 . PMID 10205272 .  
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  20. ↑ a b c Taniguchi T, D'Andrea AD (octubre de 2002). "La proteína de la anemia de Fanconi, FANCE, promueve la acumulación nuclear de FANCC" . Sangre . 100 (7): 2457–62. doi : 10.1182 / sangre-2002-03-0860 . PMID 12239156 . 
  21. ↑ a b c Medhurst AL, Huber PA, Waisfisz Q, de Winter JP, Mathew CG (febrero de 2001). "Las interacciones directas de las cinco proteínas conocidas de la anemia de Fanconi sugieren una vía funcional común" . Genética molecular humana . 10 (4): 423–9. doi : 10.1093 / hmg / 10.4.423 . PMID 11157805 . 
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Lectura adicional [ editar ]

  • Wegner RD, Henrichs I, Joenje H, Schroeder-Kurth T (diciembre de 1996). "Grupo de complementación de la anemia de Fanconi E: datos clínicos y citogenéticos del primer paciente". Genética clínica . 50 (6): 479–82. doi : 10.1111 / j.1399-0004.1996.tb02716.x . PMID  9147877 . S2CID  23242981 .
  • Joenje H, Oostra AB, Wijker M, di Summa FM, van Berkel CG, Rooimans MA, Ebell W, van Weel M, Pronk JC, Buchwald M, Arwert F (octubre de 1997). "Evidencia de al menos ocho genes de anemia de Fanconi" . Revista Estadounidense de Genética Humana . 61 (4): 940–4. doi : 10.1086 / 514881 . PMC  1715980 . PMID  9382107 .
  • Waisfisz Q, Saar K, Morgan NV, Altay C, Leegwater PA, de Winter JP, Komatsu K, Evans GR, Wegner RD, Reis A, Joenje H, Arwert F, Mathew CG, Pronk JC, Digweed M (mayo de 1999). "El gen del grupo E de la anemia de Fanconi, FANCE, se asigna al cromosoma 6p" . Revista Estadounidense de Genética Humana . 64 (5): 1400-5. doi : 10.1086 / 302385 . PMC  1377877 . PMID  10205272 .
  • Medhurst AL, Huber PA, Waisfisz Q, de Winter JP, Mathew CG (febrero de 2001). "Las interacciones directas de las cinco proteínas conocidas de la anemia de Fanconi sugieren una vía funcional común" . Genética molecular humana . 10 (4): 423–9. doi : 10.1093 / hmg / 10.4.423 . PMID  11157805 .
  • Pace P, Johnson M, Tan WM, Mosedale G, Sng C, Hoatlin M, de Winter J, Joenje H, Gergely F, Patel KJ (julio de 2002). "FANCE: el vínculo entre el ensamblaje y la actividad del complejo de anemia de Fanconi" . El diario EMBO . 21 (13): 3414-23. doi : 10.1093 / emboj / cdf355 . PMC  125396 . PMID  12093742 .
  • Taniguchi T, D'Andrea AD (octubre de 2002). "La proteína de la anemia de Fanconi, FANCE, promueve la acumulación nuclear de FANCC" . Sangre . 100 (7): 2457–62. doi : 10.1182 / sangre-2002-03-0860 . PMID  12239156 .
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  • Meetei AR, Levitus M, Xue Y, Medhurst AL, Zwaan M, Ling C, Rooimans MA, Bier P, Hoatlin M, Pals G, de Winter JP, Wang W, Joenje H (noviembre de 2004). "Herencia ligada al cromosoma X del grupo B de complementación de la anemia de Fanconi" . Genética de la naturaleza . 36 (11): 1219–24. doi : 10.1038 / ng1458 . PMID  15502827 .
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  • Gordon SM, Alon N, Buchwald M (octubre de 2005). "FANCC, FANCE y FANCD2 forman un complejo ternario esencial para la integridad de la vía de respuesta al daño del ADN de la anemia de Fanconi" . La Revista de Química Biológica . 280 (43): 36118-25. doi : 10.1074 / jbc.M507758200 . PMID  16127171 .

Enlaces externos [ editar ]

  • Resumen de toda la información estructural disponible en el PDB para UniProt : Q9HB96 (proteína del grupo E de la anemia de Fanconi) en el PDBe-KB .
  • v
  • t
  • mi