GTF2H4

GTF2H4
Estructuras disponibles PDB Búsqueda de ortólogos: PDBe RCSB Lista de códigos de identificación de PDB 5IY9 , 5IVW , 5IY7 , 5IY8 , 5IY6
Identificadores
Alias	GTF2H4 , factor de transcripción general IIH, polipéptido 4, 52 kDa, P52, TFB2, TFIIH, subunidad 4 del factor de transcripción general IIH
Identificaciones externas	OMIM : 601760 MGI : 1338799 HomoloGene : 7090 GeneCards : GTF2H4
Ubicación de genes ( humanos ) Chr. Cromosoma 6 (humano) [1] Banda 6p21.33 Comienzo 30.908.207 pb [1] Fin 30,914,106 pb [1]
Ubicación de genes ( ratón ) Chr. Cromosoma 17 (ratón) [2] Banda 17 | 17 B1 Comienzo 35,667,730 pb [2] Fin 35,673,739 pb [2]
Patrón de expresión de ARN Más datos de expresión de referencia
Ontología de genes Función molecular • Actividad de proteína quinasa • Actividad de ATPasa dependiente de ADN • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Actividad del factor de transcripción de unión al ADN • GO: 0004003 Actividad de ADN helicasa • GO: 0001948 Unión de proteínas • ARN polimerasa II carboxi la actividad del dominio quinasa -terminal • ADN de doble hebra de unión • actividad del activador de ATPasa • GO: 0000983 ARN polimerasa II actividad del factor de iniciación de la transcripción en general Componente celular • nucleoplasma • complejo holo TFIIH • complejo central TFIIH parte del complejo holo TFIIH • GO: 0000441 complejo central TFIIH • núcleo celular • factor de transcripción complejo TFIID • mota nuclear Proceso biológico • terminación de la transcripción de la ARN polimerasa I • regulación de la transcripción, plantilla de ADN • fosforilación del dominio C-terminal de la ARN polimerasa II • iniciación de la transcripción del promotor de la ARN polimerasa I • elongación de la transcripción del promotor de la ARN polimerasa II • Protección del ARNm de 7-metilguanosina • transcripción de Promotor de la ARN polimerasa II • Transcripción, plantilla de ADN • Respuesta celular al estímulo de daño del ADN • Reparación de escisión de nucleótidos del genoma global • Reparación de escisión de nucleótidos acoplada a la transcripción • iniciación de la transcripción de la ARN polimerasa II promotor • reparación de nucleótidos-escisión, incisión ADN • la reparación del ADN • reparación de nucleótidos escisión • reparación de nucleótidos-escisión, antes de la incisión de estabilización complejo • reparación de nucleótidos-escisión, antes de la incisión complejo montaje • reparación de nucleótidos-escisión, incisión ADN, Lesión 5'-a • Desenrollamiento del dúplex de ADN • Regulación positiva de la actividad de ATPasa • Reparación por escisión de nucleótidos, desenrollado del dúplex de ADN • Reparación de escisión de nucleótidos, incisión de ADN, lesión en 3'-to • Elongación de la transcripción del promotor de la ARN polimerasa I Fuentes: Amigo / QuickGO
Ortólogos
Especies	Humano	Ratón
Entrez	2968	14885
Ensembl	ENSG00000234370 ENSG00000236895 ENSG00000233149 ENSG00000221974 ENSG00000213780 ENSG00000226384	ENSMUSG00000001524
UniProt	Q92759	O70422
RefSeq (ARNm)	NM_001517	NM_010364
RefSeq (proteína)	NP_001508	NP_034494
Ubicación (UCSC)	Crónicas 6: 30,91 - 30,91 Mb	Crónicas 17: 35,67 - 35,67 Mb
Búsqueda en PubMed	[3]	[4]
Wikidata
Ver / editar humano Ver / Editar mouse

La subunidad 4 del factor de transcripción general IIH es una proteína que en humanos está codificada por el gen GTF2H4 . ^{[5] [6]}

Interacciones

Se ha demostrado que GTF2H4 interactúa con:

• GTF2F1 , ^[7]
• MED21 , ^[7]
• POLR2A , ^[7]
• Proteína de unión a TATA , ^[7]
• Factor de transcripción II B , ^[7] y
• XPB . ^{[5] [8]}

Ver también

• Factor de transcripción II H

Referencias

1. ENSG00000236895, ENSG00000233149, ENSG00000221974, ENSG00000213780, ENSG00000226384 GRCh38: liberación Ensembl 89: ENSG00000234370, ENSG00000236895, ENSG00000233149, ENSG00000221974, ENSG00000213780, ENSG00000226384 - Ensembl , mayo de 2.017
2. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000001524 - Ensembl , mayo de 2017
3. "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
4. "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
5. Marinoni JC, Roy R, Vermeulen W, Miniou P, Lutz Y, Weeda G, Seroz T, Gomez DM, Hoeijmakers JH, Egly JM (abril de 1997). "Clonación y caracterización de p52, quinta subunidad del núcleo del factor de transcripción / reparación del ADN TFIIH" . EMBO J . 16 (5): 1093-102. doi : 10.1093 / emboj / 16.5.1093 . PMC 1169708 . PMID 9118947 .  
6. "Gen Entrez: factor de transcripción general IIH GTF2H4, polipéptido 4, 52kDa" .
7. Scully R, Anderson SF, Chao DM, Wei W, Ye L, Young RA, Livingston DM, Parvin JD (mayo de 1997). "BRCA1 es un componente de la holoenzima de la ARN polimerasa II" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 94 (11): 5605–10. Código Bibliográfico : 1997PNAS ... 94.5605S . doi : 10.1073 / pnas.94.11.5605 . PMC 20825 . PMID 9159119 .  
8. Giglia-Mari G, Coin F, Ranish JA, Hoogstraten D, Theil A, Wijgers N, Jaspers NG, Raams A, Argentini M, van der Spek PJ, Botta E, Stefanini M, Egly JM, Aebersold R, Hoeijmakers JH, Vermeulen W (julio de 2004). "Una nueva, décima subunidad de TFIIH es responsable del síndrome de reparación del ADN grupo A de tricotiodistrofia" . Nat. Genet . 36 (7): 714–9. doi : 10.1038 / ng1387 . PMID 15220921 . 

Lectura adicional

• Jeang KT (1998). "Tat, quinasa asociada a Tat y transcripción". J. Biomed. Sci . 5 (1): 24–7. doi : 10.1007 / BF02253352 . PMID  9570510 .
• Yankulov K, Bentley D (1998). "Control transcripcional: cofactores Tat y alargamiento transcripcional". Curr. Biol . 8 (13): R447-9. doi : 10.1016 / S0960-9822 (98) 70289-1 . PMID  9651670 . S2CID  15480646 .
• Maruyama K, Sugano S (1994). "Oligo-taponamiento: un método simple para reemplazar la estructura de la tapa de ARNm eucariotas con oligoribonucleótidos". Gene . 138 (1–2): 171–4. doi : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90802-8 . PMID  8125298 .
• Blau J, Xiao H, McCracken S, O'Hare P, Greenblatt J, Bentley D (1996). "Tres clases funcionales de dominio de activación transcripcional" . Mol. Celda. Biol . 16 (5): 2044–55. doi : 10.1128 / MCB.16.5.2044 . PMC  231191 . PMID  8628270 .
• Drapkin R, Le Roy G, Cho H, Akoulitchev S, Reinberg D (1996). "La quinasa activadora de quinasa dependiente de ciclina humana existe en tres complejos distintos" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 93 (13): 6488–93. Código Bibliográfico : 1996PNAS ... 93.6488D . doi : 10.1073 / pnas.93.13.6488 . PMC  39050 . PMID  8692842 .
• Zhou Q, Sharp PA (1996). "Tat-SF1: cofactor para la estimulación del alargamiento transcripcional por Tat del VIH-1". Ciencia . 274 (5287): 605–10. Código Bibliográfico : 1996Sci ... 274..605Z . doi : 10.1126 / science.274.5287.605 . PMID  8849451 . S2CID  13266489 .
• Parada CA, Roeder RG (1996). "Procesividad mejorada de la ARN polimerasa II desencadenada por la fosforilación inducida por Tat de su dominio carboxi-terminal". Naturaleza . 384 (6607): 375–8. Código Bibliográfico : 1996Natur.384..375P . doi : 10.1038 / 384375a0 . PMID  8934526 . S2CID  4278432 .
• García-Martínez LF, Ivanov D, Gaynor RB (1997). "Asociación de Tat con complejos purificados de preiniciación de la transcripción de VIH-1 y VIH-2" . J. Biol. Chem . 272 (11): 6951–8. doi : 10.1074 / jbc.272.11.6951 . PMID  9054383 .
• Cujec TP, Cho H, Maldonado E, Meyer J, Reinberg D, Peterlin BM (1997). "El transactivador Tat del virus de la inmunodeficiencia humana interactúa con la holoenzima de la ARN polimerasa II" . Mol. Celda. Biol . 17 (4): 1817–23. doi : 10.1128 / mcb.17.4.1817 . PMC  232028 . PMID  9121429 .
• Rossignol M, Kolb-Cheynel I, Egly JM (1997). "La especificidad de sustrato de la quinasa de activación de cdk (CAK) se altera tras la asociación con TFIIH" . EMBO J . 16 (7): 1628–37. doi : 10.1093 / emboj / 16.7.1628 . PMC  1169767 . PMID  9130708 .
• Scully R, Anderson SF, Chao DM, Wei W, Ye L, Young RA, Livingston DM, Parvin JD (1997). "BRCA1 es un componente de la holoenzima de la ARN polimerasa II" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 94 (11): 5605–10. Código Bibliográfico : 1997PNAS ... 94.5605S . doi : 10.1073 / pnas.94.11.5605 . PMC  20825 . PMID  9159119 .
• García-Martínez LF, Mavankal G, Neveu JM, Lane WS, Ivanov D, Gaynor RB (1997). "La purificación de una quinasa asociada a Tat revela un complejo TFIIH que modula la transcripción del VIH-1" . EMBO J . 16 (10): 2836–50. doi : 10.1093 / emboj / 16.10.2836 . PMC  1169892 . PMID  9184228 .
• Nekhai S, Shukla RR, Kumar A (1997). "Una quinasa asociada a Tat del virus de inmunodeficiencia humana tipo 1 derivado de linfocitos T humanos primarios fosforila el dominio C-terminal de la ARN polimerasa II e induce la actividad CAK" . J. Virol . 71 (10): 7436–41. doi : 10.1128 / JVI.71.10.7436-7441.1997 . PMC  192089 . PMID  9311822 .
• Cujec TP, Okamoto H, Fujinaga K, Meyer J, Chamberlin H, Morgan DO, Peterlin BM (1997). "El transactivador TAT del VIH se une a la quinasa activadora de CDK y activa la fosforilación del dominio carboxi-terminal de la ARN polimerasa II" . Genes Dev . 11 (20): 2645–57. doi : 10.1101 / gad.11.20.2645 . PMC  316603 . PMID  9334327 .
• Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). "Construcción y caracterización de una biblioteca de ADNc enriquecida en longitud completa y enriquecida en el extremo 5 '". Gene . 200 (1–2): 149–56. doi : 10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3 . PMID  9373149 .
• Li XY, Green MR (1998). "El coactivador celular Tat del VIH-1 Tat-SF1 es un factor de elongación de la transcripción general" . Genes Dev . 12 (19): 2992–6. doi : 10.1101 / gad.12.19.2992 . PMC  317190 . PMID  9765201 .
• Ping YH, Rana TM (1999). "Quinasa asociada a Tat (P-TEFb): un componente de los complejos de preiniciación y elongación de la transcripción" . J. Biol. Chem . 274 (11): 7399–404. doi : 10.1074 / jbc.274.11.7399 . PMID  10066804 .

Enlaces externos

• GTF2H4 + proteína, + humano en los encabezados de temas médicos (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .

Este artículo sobre un gen en el cromosoma 6 humano es un fragmento . Puedes ayudar a Wikipedia expandiéndolo .

• v
• t
• mi