El homólogo 1 de la proteína Homer o Homer1 es una proteína neuronal que en los seres humanos está codificada por el gen HOMER1 . [5] [6] [7] Otros nombres son Vesl y PSD-Zip45.
HOMER1 | |||||||||||||||||||||||||
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Identificadores | |||||||||||||||||||||||||
Alias | HOMER1 , HOMER, HOMER1A, HOMER1B, HOMER1C, SYN47, Ves-1, proteína de andamio homer 1, proteína de andamio homer 1 | ||||||||||||||||||||||||
Identificaciones externas | OMIM : 604798 MGI : 1347345 HomoloGene : 3155 GeneCards : HOMER1 | ||||||||||||||||||||||||
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Ortólogos | |||||||||||||||||||||||||
Especies | Humano | Ratón | |||||||||||||||||||||||
Entrez |
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Ensembl |
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Ubicación (UCSC) | Crónicas 5: 79,37 - 79,51 Mb | Crónicas 13: 93,3 - 93,41 Mb | |||||||||||||||||||||||
Búsqueda en PubMed | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Wikidata | |||||||||||||||||||||||||
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Estructura
La proteína Homer1 tiene un dominio EVH1 N-terminal , involucrado en la interacción de proteínas, y un dominio de espiral en espiral C-terminal involucrado en la autoasociación. Consiste en dos variantes de empalme principales , forma corta (Homer1a) y forma larga (Homer1b yc). Homer1a solo tiene dominio EVH1 y es monomérico, mientras que Homer1b y 1c tienen dominios EVH1 y de espiral y son tetraméricos. [8] [9] La bobina enrollada se puede separar aún más en la mitad N-terminal y la mitad C-terminal. Se predice que la mitad N-terminal del dominio de la bobina enrollada es un dímero paralelo, mientras que la mitad C-terminal es un híbrido de bobina en espiral tetramérica dimérica y antiparalela. En conjunto, se predice que Homer largo tiene una estructura similar a una mancuerna donde dos pares de dominios EVH1 están ubicados en dos lados del dominio de bobina enrollada larga (~ 50 nm). [9] Los mamíferos tienen Homer2 y Homer3 , además de Homer1, que tienen una estructura de dominio similar. También tienen formas similares empalmadas alternativamente.
Distribución de tejidos
Homer1 se expresa ampliamente en el sistema nervioso central, así como en el tejido periférico, incluidos el corazón , los riñones , los ovarios , los testículos y el músculo esquelético . Subcelularmente en las neuronas, Homer1 se concentra en estructuras postsinápticas y constituye una parte importante de la densidad postsináptica .
Función
El dominio EVH1 interactúa con el motivo PPXXF. Este motivo de secuencia existe en el receptor de glutamato metabotrófico del grupo 1 (mGluR1 y mGluR5), los receptores IP 3 (IP 3 R), los canales de la familia Shank , el receptor de potencial canónico transitorio (TRPC) , la drebrina , la oligofrenina , la dinamina3 , el CENTG1 y el receptor de rianodina . [5] [7] [10] [11] [12] [13] A través de su estructura tetramérica, se proponen formas largas de Homer (como Homer1b y Homer1c) para entrecruzar diferentes proteínas. Por ejemplo, el mGluR del grupo 1 se cruza enlazado con su receptor IP 3 de señalización aguas abajo . [10] Además, mediante la reticulación de otra proteína multimérica Shank, se propone que comprenda un núcleo de la densidad postsináptica . [9]
En particular, la expresión de Homer1a es inducida por la actividad neuronal, mientras que la de Homer1b y 1c son constitutivas. Por tanto, Homer1a se clasifica como un gen temprano inmediato . Homer1a actúa como una forma negativa dominante natural que bloquea la interacción entre las formas largas y sus proteínas ligando compitiendo con el sitio de unión de EVH1 en las proteínas ligando. De esta manera, la forma corta de Homer desacopla la señalización de mGluR y también encoge la estructura de la columna dendrítica . [6] [14] Por lo tanto, la forma corta de Homer se considera parte de un mecanismo de plasticidad homeostática que amortigua la capacidad de respuesta neuronal cuando la actividad de entrada es demasiado alta. La forma larga Homer1c juega un papel en la plasticidad sináptica y la estabilización de los cambios sinápticos durante la potenciación a largo plazo . [15]
Se informa que el dominio de la bobina en espiral interactúa con la sintaxina13 y la Cdc42 activada . La interacción con Cdc42 inhibe la actividad de Cdc42 para remodelar la estructura de la columna dendrítica.
Ver también
- HOMER2
- HOMER3
Referencias
- ^ a b c GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000152413 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000007617 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ a b Shiraishi-Yamaguchi Y, Furuichi T (2007). "Las proteínas de la familia Homer" . Genome Biol . 8 (2): 206. doi : 10.1186 / gb-2007-8-2-206 . PMC 1852408 . PMID 17316461 .
- ^ a b Tu JC, Xiao B, Yuan JP, Lanahan AA, Leoffert K, Li M, Linden DJ, Worley PF (diciembre de 1998). "Homer une un motivo novedoso rico en prolina y vincula los receptores de glutamato metabotrópicos del grupo 1 con los receptores IP3" . Neurona . 21 (4): 717–26. doi : 10.1016 / S0896-6273 (00) 80589-9 . PMID 9808459 . S2CID 2851554 .
- ^ a b "Entrez Gene: homólogo 1 homer HOMER1 (Drosophila)" .
- ^ Hayashi MK, Ames HM, Hayashi Y (agosto de 2006). "Estructura de cubo tetramérico de homero de proteína de andamio postsináptico" . J. Neurosci . 26 (33): 8492–501. doi : 10.1523 / JNEUROSCI.2731-06.2006 . PMC 6674353 . PMID 16914674 .
- ^ a b c Hayashi MK, Tang C, Verpelli C, Narayanan R, Stearns MH, Xu RM, Li H, Sala C, Hayashi Y (abril de 2009). "Las proteínas de densidad postsinápticas Homer y Shank forman una estructura de red polimérica" . Celular . 137 (1): 159–71. doi : 10.1016 / j.cell.2009.01.050 . PMC 2680917 . PMID 19345194 .
- ^ a b Xiao B, Tu JC, Petralia RS, Yuan JP, Doan A, Breder CD, Ruggiero A, Lanahan AA, Wenthold RJ, Worley PF (diciembre de 1998). "Homer regula la asociación de receptores de glutamato metabotrópicos del grupo 1 con complejos multivalentes de proteínas sinápticas relacionadas con homer" . Neurona . 21 (4): 707-16. doi : 10.1016 / S0896-6273 (00) 80588-7 . PMID 9808458 . S2CID 16431031 .
- ^ Rong R, Ahn JY, Huang H, Nagata E, Kalman D, Kapp JA, Tu J, Worley PF, Snyder SH, Ye K (noviembre de 2003). "Complejo potenciador de PI3 quinasa-Homer acopla mGluRI a PI3 quinasa, previniendo la apoptosis neuronal". Nat. Neurosci . 6 (11): 1153–61. doi : 10.1038 / nn1134 . PMID 14528310 . S2CID 807407 .
- ^ Hwang SY, Wei J, Westhoff JH, Duncan RS, Ozawa F, Volpe P, Inokuchi K, Koulen P (agosto de 2003). "Interacción funcional diferencial de dos isoformas de proteínas Vesl / Homer con el receptor de rianodina tipo 1: un mecanismo novedoso para el control de la señalización del calcio intracelular". Calcio celular . 34 (2): 177–84. doi : 10.1016 / S0143-4160 (03) 00082-4 . PMID 12810060 .
- ^ Feng W, Tu J, Yang T, Vernon PS, Allen PD, Worley PF, Pessah IN (noviembre de 2002). "Homer regula la ganancia del complejo de canales del receptor de rianodina tipo 1" . J. Biol. Chem . 277 (47): 44722-30. doi : 10.1074 / jbc.M207675200 . PMID 12223488 .
- ^ Sala C, Futai K, Yamamoto K, Worley PF, Hayashi Y, Sheng M (julio de 2003). "Inhibición de la morfogénesis de la columna dendrítica y la transmisión sináptica por la proteína de actividad inducible Homer1a" . J Neurosci . 23 (15): 6327–37. doi : 10.1523 / JNEUROSCI.23-15-06327.2003 . PMC 6740555 . PMID 12867517 .
- ^ Meyer D, Bonhoeffer T, Scheuss V (2014). "Equilibrio y estabilidad de las estructuras sinápticas durante la plasticidad sináptica" . Neurona . 82 (2): 430–43. doi : 10.1016 / j.neuron.2014.02.031 . PMID 24742464 .
Otras lecturas
- Xiao B, Tu JC, Worley PF (2000). "Homer: un vínculo entre la actividad neuronal y la función del receptor de glutamato". Curr. Opin. Neurobiol . 10 (3): 370–4. doi : 10.1016 / S0959-4388 (00) 00087-8 . PMID 10851183 . S2CID 8699597 .
- Maruyama K, Sugano S (1994). "Oligo-taponamiento: un método simple para reemplazar la estructura de la tapa de ARNm eucariotas con oligoribonucleótidos". Gene . 138 (1–2): 171–4. doi : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90802-8 . PMID 8125298 .
- Hillier LD, Lennon G, Becker M, Bonaldo MF, Chiapelli B, Chissoe S, Dietrich N, DuBuque T, Favello A, Gish W, Hawkins M, Hultman M, Kucaba T, Lacy M, Le M, Le N, Mardis E , Moore B, Morris M, Parsons J, Prange C, Rifkin L, Rohlfing T, Schellenberg K, Bento Soares M, Tan F, Thierry-Meg J, Trevaskis E, Underwood K, Wohldman P, Waterston R, Wilson R, Marra M (1997). "Generación y análisis de 280.000 etiquetas de secuencias expresadas en humanos" . Genome Res . 6 (9): 807–28. doi : 10.1101 / gr.6.9.807 . PMID 8889549 .
- Brakeman PR, Lanahan AA, O'Brien R, Roche K, Barnes CA, Huganir RL, Worley PF (1997). "Homer: una proteína que se une selectivamente a los receptores de glutamato metabotrópicos". Naturaleza . 386 (6622): 284–8. doi : 10.1038 / 386284a0 . PMID 9069287 . S2CID 4346579 .
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). "Construcción y caracterización de una biblioteca de ADNc enriquecida en longitud completa y enriquecida en el extremo 5 '". Gene . 200 (1–2): 149–56. doi : 10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3 . PMID 9373149 .
- Tu JC, Xiao B, Naisbitt S, Yuan JP, Petralia RS, Brakeman P, Doan A, Aakalu VK, Lanahan AA, Sheng M, Worley PF (1999). "Acoplamiento de complejos mGluR / Homer y PSD-95 por la familia Shank de proteínas de densidad postsináptica" . Neurona . 23 (3): 583–92. doi : 10.1016 / S0896-6273 (00) 80810-7 . PMID 10433269 . S2CID 16429070 .
- Roche KW, Tu JC, Petralia RS, Xiao B, Wenthold RJ, Worley PF (1999). "Homer 1b regula el tráfico de receptores de glutamato metabotrópicos del grupo I" . J. Biol. Chem . 274 (36): 25953–7. doi : 10.1074 / jbc.274.36.25953 . PMID 10464340 .
- Minakami R, Kato A, Sugiyama H (2000). "Interacción de Vesl-1L / Homer 1c con sintaxina 13". Biochem. Biophys. Res. Comun . 272 (2): 466–71. doi : 10.1006 / bbrc.2000.2777 . PMID 10833436 .
- Ango F, Prézeau L, Muller T, Tu JC, Xiao B, Worley PF, Pin JP, Bockaert J, Fagni L (2001). "Activación independiente de agonistas de receptores de glutamato metabotrópicos por la proteína intracelular Homer". Naturaleza . 411 (6840): 962–5. doi : 10.1038 / 35082096 . PMID 11418862 . S2CID 4417727 .
- Wistow G, Bernstein SL, Wyatt MK, Fariss RN, Behal A, Touchman JW, Bouffard G, Smith D, Peterson K (2002). "Análisis de etiquetas de secuencia expresada de RPE / coroides humanos para el Proyecto NEIBank: más de 6000 transcripciones no redundantes, genes novedosos y variantes de empalme". Mol. Vis . 8 : 205-20. PMID 12107410 .
- Feng W, Tu J, Yang T, Vernon PS, Allen PD, Worley PF, Pessah IN (2003). "Homer regula la ganancia del complejo de canales del receptor de rianodina tipo 1" . J. Biol. Chem . 277 (47): 44722-30. doi : 10.1074 / jbc.M207675200 . PMID 12223488 .
- Hwang SY, Wei J, Westhoff JH, Duncan RS, Ozawa F, Volpe P, Inokuchi K, Koulen P (2004). "Interacción funcional diferencial de dos isoformas de proteínas Vesl / Homer con el receptor de rianodina tipo 1: un mecanismo novedoso para el control de la señalización del calcio intracelular". Calcio celular . 34 (2): 177–84. doi : 10.1016 / S0143-4160 (03) 00082-4 . PMID 12810060 .
- Norton N, Williams HJ, Williams NM, Spurlock G, Zammit S, Jones G, Jones S, Owen R, O'Donovan MC, Owen MJ (2004). "Detección de mutaciones de la familia de genes de Homer y análisis de asociación en la esquizofrenia". Soy. J. Med. Gineta. B Neuropsychiatr. Genet . 120 (1): 18-21. doi : 10.1002 / ajmg.b.20032 . PMID 12815733 . S2CID 25053099 .
- Westhoff JH, Hwang SY, Duncan RS, Ozawa F, Volpe P, Inokuchi K, Koulen P (2004). "Las proteínas Vesl / Homer regulan la función del receptor de rianodina tipo 2 y la señalización del calcio intracelular". Calcio celular . 34 (3): 261–9. doi : 10.1016 / S0143-4160 (03) 00112-X . PMID 12887973 .
- Yuan JP, Kiselyov K, Shin DM, Chen J, Shcheynikov N, Kang SH, Dehoff MH, Schwarz MK, Seeburg PH, Muallem S, Worley PF (2003). "Homer se une a los canales de la familia TRPC y es necesario para la activación de TRPC1 por los receptores IP3" . Celular . 114 (6): 777–89. doi : 10.1016 / S0092-8674 (03) 00716-5 . PMID 14505576 . S2CID 10552676 .
- Rong R, Ahn JY, Huang H, Nagata E, Kalman D, Kapp JA, Tu J, Worley PF, Snyder SH, Ye K (2003). "Complejo potenciador de PI3 quinasa-Homer acopla mGluRI a PI3 quinasa, previniendo la apoptosis neuronal". Nat. Neurosci . 6 (11): 1153–61. doi : 10.1038 / nn1134 . PMID 14528310 . S2CID 807407 .