Proyecto de microbioma humano
El Proyecto del Microbioma Humano ( HMP ) fue una iniciativa de investigación de los Institutos Nacionales de Salud (NIH) de los Estados Unidos para mejorar la comprensión de la microbiota involucrada en la salud y las enfermedades humanas. Lanzada en 2007, [1] la primera fase (HMP1) se centró en identificar y caracterizar la microbiota humana. La segunda fase, conocida como Proyecto Integrativo del Microbioma Humano (iHMP), se lanzó en 2014 con el objetivo de generar recursos para caracterizar el microbioma y dilucidar los roles de los microbios en los estados de salud y enfermedad. El programa recibió $ 170 millones en financiamiento del Fondo Común de los NIH de 2007 a 2016. [2]
Los componentes importantes del HMP fueron los métodos de caracterización de la comunidad microbiana independientes del cultivo , como la metagenómica (que proporciona una perspectiva genética amplia en una sola comunidad microbiana), así como la secuenciación extensa del genoma completo (que proporciona una perspectiva genética "profunda" sobre ciertas aspectos de una comunidad microbiana determinada, es decir , de especies bacterianas individuales). Este último sirvió como secuencias genómicas de referencia (actualmente se planean 3000 secuencias de aislamientos bacterianos individuales ) con fines de comparación durante el análisis metagenómico posterior. El proyecto también financió la secuenciación profunda de secuencias de ARNr 16S bacterianas amplificadas porreacción en cadena de la polimerasa de sujetos humanos. [3]
Antes del lanzamiento de HMP, a menudo se informaba en los medios de comunicación populares y en la literatura científica que hay aproximadamente 10 veces más células microbianas y 100 veces más genes microbianos en el cuerpo humano que células humanas; esta cifra se basó en estimaciones de que el microbioma humano incluye alrededor de 100 billones de células bacterianas y un ser humano adulto tiene típicamente alrededor de 10 billones de células humanas. [4] En 2014, la Academia Estadounidense de Microbiología publicó una pregunta frecuente que enfatizaba que la cantidad de células microbianas y la cantidad de células humanas son estimaciones, y señaló que investigaciones recientes habían llegado a una nueva estimación de la cantidad de células humanas en alrededor de 37 billones de células, lo que significa que la proporción de células microbianas a humanas es probablemente de aproximadamente 3: 1.[4] [5] En 2016, otro grupo publicó una nueva estimación de la proporción de aproximadamente 1: 1 (1,3: 1, con "una incertidumbre del 25% y una variación del 53% sobre la población de machos estándar de 70 kg") . [6] [7]
A pesar de la asombrosa cantidad de microbios dentro y fuera del cuerpo humano, se sabía poco sobre su papel en la salud y las enfermedades humanas. Muchos de los organismos que componen el microbioma no han sido cultivados , identificados o caracterizados de otra manera con éxito . Los organismos que se cree que se encuentran en el microbioma humano, sin embargo, generalmente se pueden clasificar como bacterias , miembros del dominio Archaea , levaduras y eucariotas unicelulares , así como varios parásitos helmintos y virus , estos últimos incluyen virus que infectan los organismos del microbioma celular. (p. ej., bacteriófagos). El HMP se propuso descubrir y caracterizar el microbioma humano, haciendo hincapié en los sitios oral, cutáneo, vaginal, gastrointestinal y respiratorio.
El HMP abordará algunas de las cuestiones científicas más inspiradoras, irritantes y fundamentales de la actualidad. Es importante destacar que también tiene el potencial de romper las barreras artificiales entre la microbiología médica y la microbiología ambiental. Se espera que el HMP no solo identifique nuevas formas de determinar la salud y la predisposición a las enfermedades, sino que también defina los parámetros necesarios para diseñar, implementar y monitorear estrategias para manipular intencionalmente la microbiota humana, para optimizar su desempeño en el contexto de la fisiología de un individuo. . [8]
