El elemento de inserción (también conocido como IS , un elemento de secuencia de inserción o un elemento IS ) es una secuencia de ADN corta que actúa como un elemento transponible simple . Las secuencias de inserción tienen dos características principales: son pequeñas en relación con otros elementos transponibles (generalmente alrededor de 700 a 2500 pb de longitud) y solo codifican proteínas implicadas en la actividad de transposición (por lo tanto, son diferentes de otros transposones , que también portan genes accesorios como como genes de resistencia a antibióticos ). Estas proteínas suelen ser la transposasa.que cataliza la reacción enzimática permitiendo que el IS se mueva, y también una proteína reguladora que estimula o inhibe la actividad de transposición. La región codificante de una secuencia de inserción suele estar flanqueada por repeticiones invertidas . Por ejemplo, el conocido IS 911 (1250 pb) está flanqueado por dos extremidades repetidas invertidas de 36 pb y la región codificante tiene dos genes que se superponen parcialmente orfA y orfAB , que codifican la transposasa (OrfAB) y una proteína reguladora (OrfA). Una secuencia de inserción particular se puede nombrar de acuerdo con la forma IS n , donde n es un número (por ejemplo, IS 1 , IS 2 , IS 3 , IS 10 , IS 50 , IS 911 , IS 26, etc.); Sin embargo, este no es el único esquema de nomenclatura utilizado. Aunque las secuencias de inserción se analizan habitualmente en el contexto de genomas procarióticos , determinadas secuencias de ADN eucariótico que pertenecen a la familia de elementos transponibles Tc1 / mariner pueden considerarse secuencias de inserción. [1]
Además de ocurrir de forma autónoma, las secuencias de inserción también pueden ocurrir como partes de transposones compuestos ; en un transposón compuesto, dos secuencias de inserción flanquean uno o más genes accesorios, como un gen de resistencia a antibióticos (por ejemplo , Tn10 , Tn 5 ). Sin embargo, existe otro tipo de transposones, llamados transposones unitarios, que no llevan secuencias de inserción en sus extremos (por ejemplo, Tn 7 ).
Un transposón complejo no depende de secuencias de inserción flanqueantes para resolvasa. La resolvasa es parte del genoma tns y corta en repeticiones invertidas flanqueantes.
La frecuencia de transposición de los elementos IS depende de múltiples parámetros, incluida la fase de crecimiento del cultivo, la composición del medio, la tensión de oxígeno, la escala de crecimiento y la conformación estructural de los sitios diana (p. Ej., Curvatura, presencia de ciertos motivos, composición del ADN). [2]
Ver también
Referencias
- ↑ Mahillon, Jacques; Chandler, Michael (1 de septiembre de 1998). "Secuencias de inserción" . Revisiones de Microbiología y Biología Molecular . 62 (3): 725–774. doi : 10.1128 / MMBR.62.3.725-774.1998 . ISSN 1092-2172 . PMC 98933 . PMID 9729608 .
- ^ Goncalves GA, Oliveira PH, Gomes AG, Prather KL, Lewis LA, Parzeres DM, Monteiro GA (2014). "La evidencia de que los eventos de inserción de la transposición de IS2 están sesgados hacia cambios de composición abruptos en el ADN diana y están modulados por un conjunto diverso de parámetros de cultivo" (PDF) . Appl Microbiol Biotechnol . 98 (15): 6609–6619. doi : 10.1007 / s00253-014-5695-6 . hdl : 1721,1 / 104375 . PMID 24769900 .
- Campbell, Neil A. y Reece, Jane B. (2002). Biology (6ª ed.), Págs. 345–346. San Francisco: Benjamin Cummings. ISBN 0-8053-6624-5 .
- Mahillon Jacques, Chandler Michael (1998). "Secuencias de inserción" . Revisiones de Microbiología y Biología Molecular . 62 (3): 725–774. doi : 10.1128 / MMBR.62.3.725-774.1998 .
- Prescott, Lansing M .; Harley, John P .; y Klein, Donald A. (2002). Microbiology (5ª ed.), Págs. 298-299. Nueva York: McGraw-Hill. ISBN 0-07-232041-9 .
- Shuler, Michael L. y Kargi, Fikret (2002). Ingeniería de bioprocesos: conceptos básicos (2ª ed.), P. 220. Upper Saddle River, Nueva Jersey: Prentice Hall PTR. ISBN 0-13-081908-5 .