Las proteínas Kelch (y proteínas similares a Kelch ) son un grupo extenso de proteínas que contienen múltiples motivos Kelch . El dominio kelch generalmente ocurre como un conjunto de cinco a siete repeticiones en tándem kelch que forman una estructura terciaria de hélice β . Las hélices β de repetición Kelch generalmente están involucradas en interacciones proteína-proteína, aunque la gran diversidad de arquitecturas de dominio y la identidad de secuencia limitada entre motivos kelch dificultan la caracterización de la superfamilia kelch.
Motivo Kelch | ||||||||||
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Identificadores | ||||||||||
Símbolo | Kelch_1 | |||||||||
Pfam | PF01344 | |||||||||
InterPro | IPR006652 | |||||||||
SCOP2 | 1g de / SCOPe / SUPFAM | |||||||||
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Estructura
El extremo N de varias proteínas Kelch contiene otros dominios proteicos, incluidos los dominios Discoidin , F-box y Broad-complex, Tramtrack, Bric-a-Brac / Poxvirus Zinc finger (BTB / POZ). Las proteínas de Kelch también pueden tener solo una arquitectura de hélice β. El dominio BTB de las proteínas kelch (si está presente) permite la formación de homo o heterodímeros que median las interacciones proteína-proteína .
El extremo C-terminal de las proteínas Kelch contiene repeticiones kelch. Cada repetición de kelch es una secuencia de 44 a 55 aminoácidos de longitud, que suele aparecer en grupos de 4 a 7 repeticiones.
Cada repetición kelch forma una "pala" del pliegue de la hélice β, que consta de una estructura secundaria de hoja β antiparalela de cuatro hebras , dispuesta radialmente alrededor de un eje central, empaquetada en sus repeticiones contiguas mediante contactos hidrófobos.
Las hélices β de repetición Kelch experimentan una variedad de interacciones de unión con otras proteínas, en particular los filamentos de actina de una célula.
Función
Se sabe que las proteínas similares a Kelch actúan como adaptadores de sustrato para las ligasas de ubiquitina Cullin 3 .
Organismos
La primera proteína Kelch (de la que esta familia deriva su nombre) se aisló de Drosophila , en la que las hembras mutantes Kelch ponen huevos estériles en forma de copa; [1] "Kelch" en alemán significa "cáliz" o "copa". Las proteínas Kelch también se han aislado en muchos otros animales, plantas, bacterias, hongos e incluso virus (restringidos a Poxviridae ).
Proteínas humanas que contienen motivos de Kelch
ATRN ; ATRNL1 ; CCIN ; ENC1 ; FBXO42 ; GAN ; HCFC1 ; HCFC2 ; IPP ; IVNS1ABP ; KBTBD10 ; KBTBD11 ; KBTBD2 ; KBTBD3 ; KBTBD4 ; KBTBD5 ; KBTBD6 ; KBTBD7 ; KBTBD8 ; KEAP1 ; KIAA1900 ; KLHDC1 ; KLHDC2 ; KLHDC3 ; KLHDC4 ; KLHDC5 ; KLHDC6 ; KLHDC7A ; KLHDC7B ; KLHDC8A ; KLHDC8B ; KLHDC9 ; KLHDC10 ; KLHL1 ; KLHL10 ; KLHL11 ; KLHL12 ; KLHL13 ; KLHL14 ; KLHL15 ; KLHL17 ; KLHL18 ; KLHL2 ; KLHL20 ; KLHL21 ; KLHL22 ; KLHL23 ; KLHL24 ; KLHL25 ; KLHL26 ; KLHL28 ; KLHL29 ; KLHL3 ; KLHL30 ; KLHL31 ; KLHL32 ; KLHL34 ; KLHL4 ; KLHL40 ; KLHL5 ; KLHL6 ; KLHL7 ; KLHL8 ; KLHL9 ; LZTR1 ; MEGF8 ; MKLN1 ; RABEPK ; SARCOSIN ;
Referencias
- ^ ENTENDIENDO LA FUNCIÓN DE LAS PROTEÍNAS QUE UNEN ACTINA A TRAVÉS DEL ANÁLISIS GENÉTICO DE DROSOPHILA OOGÉNESIS , por Andrew M. Hudson y Lynn Cooley; en la Revisión anual de genética , vol. 36: 455–488 (fecha de publicación del volumen diciembre de 2002); Consultado el 12 de diciembre de 2013.
- Lo SC, Li X, Henzl MT, Beamer LJ, Hannink M (agosto de 2006). "La estructura de la interfaz Keap1: Nrf2 proporciona una visión mecanicista de la señalización Nrf2" . El diario EMBO . 25 (15): 3605-17. doi : 10.1038 / sj.emboj.7601243 . PMC 1538563 . PMID 16888629 .
- Zollman S, Godt D, Privé GG, Couderc JL, Laski FA (octubre de 1994). "El dominio BTB, que se encuentra principalmente en las proteínas con dedos de zinc, define una familia conservada evolutivamente que incluye varios genes regulados por el desarrollo en Drosophila" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 91 (22): 10717–21. Código Bibliográfico : 1994PNAS ... 9110717Z . doi : 10.1073 / pnas.91.22.10717 . PMC 45093 . PMID 7938017 .
- Adams J, Kelso R, Cooley L (enero de 2000). "La superfamilia de proteínas de repetición kelch: propulsores de la función celular". Tendencias en biología celular . 10 (1): 17-24. doi : 10.1016 / S0962-8924 (99) 01673-6 . PMID 10603472 .