La liprina-alfa-1 es una proteína que en humanos está codificada por el gen PPFIA1 . [5] [6] [7]
PPFIA1 | |||||||||||||||||||||||||
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Identificadores | |||||||||||||||||||||||||
Alias | PPFIA1 , LIP.1, LIP1, LIPRIN, proteína alfa 1 que interactúa con PTPRF | ||||||||||||||||||||||||
Identificaciones externas | OMIM : 611054 MGI : 1924750 HomoloGene : 20802 GeneCards : PPFIA1 | ||||||||||||||||||||||||
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Ortólogos | |||||||||||||||||||||||||
Especies | Humano | Ratón | |||||||||||||||||||||||
Entrez |
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Ensembl |
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UniProt |
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RefSeq (ARNm) |
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RefSeq (proteína) |
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Ubicación (UCSC) | Crónicas 11: 70,27 - 70,39 Mb | Crónicas 7: 144,48 - 144,55 Mb | |||||||||||||||||||||||
Búsqueda en PubMed | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Wikidata | |||||||||||||||||||||||||
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Función
La proteína codificada por este gen es un miembro de la familia de la proteína LAR que interactúa con la tirosina fosfatasa (liprina). Las liprinas interactúan con miembros de la familia LAR de proteínas tirosina fosfatasas transmembrana, que se sabe que son importantes para la guía de axones y el desarrollo de la glándula mamaria. Esta proteína se une al dominio de fosfatasa distal de la membrana intracelular de la tirosina fosfatasa LAR, y parece localizar LAR en las adherencias focales celulares. Esta interacción puede regular el desmontaje de la adhesión focal y así ayudar a orquestar las interacciones célula-matriz. Alternativamente, se han descrito variantes de transcripciones empalmadas que codifican distintas isoformas. [7]
Interacciones
Se ha demostrado que la proteína tirosina fosfatasa, tipo de receptor, polipéptido f (PTPRF), proteína de interacción (liprina), alfa 1 interactúa con:
- ERC2 , [8]
- GIT1 , [8] [9]
- GRIP2 , [8] [9]
- PPFIBP1 , [6]
- PPP2R5D , [10]
- PTPRD , [11]
- PTPRF , [5] [6] [11] y
- PTPRS . [6] [11]
Referencias
- ^ a b c ENSG00000288198 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000131626, ENSG00000288198 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000037519 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ a b Serra-Pagès C, Kedersha NL, Fazikas L, Medley Q, Debant A, Streuli M (agosto de 1995). "La proteína transmembrana LAR tirosina fosfatasa y una proteína que interactúa con LAR en espiral co-localizan en adherencias focales" . EMBO J . 14 (12): 2827–2838. doi : 10.1002 / j.1460-2075.1995.tb07282.x . PMC 398401 . PMID 7796809 .
- ^ a b c d Serra-Pagès C, Medley QG, Tang M, Hart A, Streuli M (julio de 1998). "Liprins, una familia de proteínas que interactúan con la proteína transmembrana LAR-tirosina fosfatasa" . J Biol Chem . 273 (25): 15611-15620. doi : 10.1074 / jbc.273.25.15611 . PMID 9624153 .
- ^ a b "Entrez Gen: PPFIA1 proteína tirosina fosfatasa, tipo de receptor, polipéptido f (PTPRF), proteína de interacción (liprina), alfa 1" .
- ^ a b c Ko J, Na M, Kim S, Lee JR, Kim E (octubre de 2003). "Interacción de la familia ERC de proteínas de unión a RIM con la familia liprina-alfa de proteínas multidominio" . J. Biol. Chem . 278 (43): 42377–85. doi : 10.1074 / jbc.M307561200 . PMID 12923177 .
- ^ a b Ko J, Kim S, Valtschanoff JG, Shin H, Lee JR, Sheng M, Premont RT, Weinberg RJ, Kim E (marzo de 2003). "La interacción entre liprina-alfa y GIT1 es necesaria para la orientación del receptor AMPA" . J. Neurosci . 23 (5): 1667–77. doi : 10.1523 / JNEUROSCI.23-05-01667.2003 . PMC 6741975 . PMID 12629171 .
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- ^ a b c Pulido R, Serra-Pagès C, Tang M, Streuli M (diciembre de 1995). "La subfamilia LAR / PTP delta / PTP sigma de proteína transmembrana-tirosina-fosfatasas: múltiples isoformas humanas LAR, PTP delta y PTP sigma se expresan de una manera específica de tejido y se asocian con la proteína LIP.1 que interactúa con LAR" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 92 (25): 11686–90. doi : 10.1073 / pnas.92.25.11686 . PMC 40467 . PMID 8524829 .
Otras lecturas
- Pulido R, Serra-Pagès C, Tang M, Streuli M (1996). "La subfamilia LAR / PTP delta / PTP sigma de proteína transmembrana-tirosina-fosfatasas: múltiples isoformas humanas LAR, PTP delta y PTP sigma se expresan de una manera específica de tejido y se asocian con la proteína LIP.1 que interactúa con LAR" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 92 (25): 11686-11690. doi : 10.1073 / pnas.92.25.11686 . PMC 40467 . PMID 8524829 .
- Wyszynski M, Kim E, Dunah AW, Passafaro M, Valtschanoff JG, Serra-Pagès C, Streuli M, Weinberg RJ, Sheng M (2002). "La interacción entre GRIP y liprina-alfa / SYD2 es necesaria para el direccionamiento del receptor AMPA" . Neurona . 34 (1): 39–52. doi : 10.1016 / S0896-6273 (02) 00640-2 . PMID 11931740 .
- Ko J, Kim S, Valtschanoff JG, Shin H, Lee JR, Sheng M, Premont RT, Weinberg RJ, Kim E (2003). "La interacción entre liprina-alfa y GIT1 es necesaria para la orientación del receptor AMPA" . J. Neurosci . 23 (5): 1667–1677. doi : 10.1523 / JNEUROSCI.23-05-01667.2003 . PMID 12629171 .
- Ko J, Na M, Kim S, Lee JR, Kim E (2004). "Interacción de la familia ERC de proteínas de unión a RIM con la familia liprina-alfa de proteínas multidominio" . J. Biol. Chem . 278 (43): 42377–42385. doi : 10.1074 / jbc.M307561200 . PMID 12923177 .
- Jin J, Smith FD, Stark C, Wells CD, Fawcett JP, Kulkarni S, Metalnikov P, O'Donnell P, Taylor P, Taylor L, Zougman A, Woodgett JR, Langeberg LK, Scott JD, Pawson T (2004). "Análisis proteómico, funcional y basado en dominios de proteínas de unión 14-3-3 in vivo implicadas en la regulación citoesquelética y la organización celular" . Curr. Biol . 14 (16): 1436-1450. doi : 10.1016 / j.cub.2004.07.051 . PMID 15324660 .
- Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (2005). "Hacia un mapa a escala de proteoma de la red de interacción proteína-proteína humana". Naturaleza . 437 (7062): 1173–1178. doi : 10.1038 / nature04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .
- Serra-Pagès C, Streuli M, Medley QG (2006). "La fosforilación de liprina regula la unión a LAR: evidencia de autofosforilación de liprina" . Bioquímica . 44 (48): 15715-15724. doi : 10.1021 / bi051434f . PMC 2529169 . PMID 16313174 .
- Lim J, Hao T, Shaw C, Patel AJ, Szabó G, Rual JF, Fisk CJ, Li N, Smolyar A, Hill DE, Barabási AL, Vidal M, Zoghbi HY (2006). "Una red de interacción proteína-proteína para ataxias hereditarias humanas y trastornos de la degeneración celular de Purkinje" . Celular . 125 (4): 801–814. doi : 10.1016 / j.cell.2006.03.032 . PMID 16713569 .
- Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (2006). "Dinámica de fosforilación global, in vivo y específica del sitio en redes de señalización" . Celular . 127 (3): 635–648. doi : 10.1016 / j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983 .
- Hoogenraad CC, Feliu-Mojer MI, Spangler SA, Milstein AD, Dunah AW, Hung AY, Sheng M (2007). "La degradación de liprinalpha1 por la proteína quinasa II dependiente de calcio / calmodulina regula la distribución de la tirosina fosfatasa del receptor LAR y el desarrollo de las dendríticas" . Dev. Celular . 12 (4): 587–602. doi : 10.1016 / j.devcel.2007.02.006 . PMID 17419996 .
enlaces externos
- Descripción general de toda la información estructural disponible en el PDB para UniProt : Q13136 (Liprin-alpha-1) en el PDBe-KB .