Esta lista de genomas eubacterianos secuenciados contiene la mayoría de las eubacterias conocidas por tener secuencias genómicas completas disponibles públicamente . La mayoría de estas secuencias se han incluido en la Colaboración Internacional de Base de Datos de Secuencias de Nucleótidos , una base de datos pública que se puede buscar [1] en la web . Es posible que algunos de los genomas enumerados no estén en la base de datos del INSDC , pero sí en otras bases de datos públicas [ verificación necesaria ] .
Los genomas enumerados como "no publicados" están en una base de datos, pero no en la literatura científica revisada por pares .
Para los genomas de arqueas, consulte la lista de genomas de arqueas secuenciados .
Abditibacteriota
Especies | Presion | Tipo | Pares de bases | Genes | Referencia | Identificador de GenBank |
---|---|---|---|---|---|---|
Abditibacterium utsteinense | LMG 29911 | Abditibacteriota | 3.606.330 | 3240 | [2] | NZ_NIGF00000000.1 |
Actinobacterias
Especies | Presion | Tipo | Pares de bases | Genes | Referencia | Identificador de GenBank |
---|---|---|---|---|---|---|
Corynebacterium diphtheriae | C7 (beta) | Actinobacteridae | 2,499,189 | Inédito | CP003210 | |
Corynebacterium diphtheriae | PW8 | Actinobacteridae | 2,530,683 | Inédito | CP003216 | |
Bifidobacterium longum | NCC2705 | Actinobacterias | 2,256,640 | 1,727 | [3] | |
Corynebacterium diphtheriae | NCTC13129 | Actinobacterias | 2,488,635 | 2,320 | [4] | |
Corynebacterium efficiens | YS314 | Actinobacterias | 3,147,090 | 2,942 | [5] | |
Corynebacterium glutamicum | ATCC13032 | Actinobacterias | 3.309.401 | 3,099 | No publicado [1] | |
Corynebacterium jeikeium | K411 | Actinobacterias | 2,462,499 | 2.104 | [6] | |
Especies de Frankia | CcI3 | Actinobacterias | 5.433.628 | 4.499 | No publicado [1] | |
Mycobacterium avium | k10 | Actinobacterias | 4.829.781 | 4.350 | [7] | |
Mycobacterium bovis | AF212297 | Actinobacterias | 4.345.492 | 3.953 | [8] | |
Mycobacterium leprae | Tennesse | Actinobacterias | 3,268,203 | 2720 | [9] | |
Tuberculosis micobacteriana | CDC1551 | Actinobacterias | 4.403.837 | 4.189 | No publicado [1] | |
Tuberculosis micobacteriana | H37Rv | Actinobacterias | 4.411.532 | 3999 | [10] | |
Nocardia farcinica | IFM10152 | Actinobacterias | 6.021.225 | 5.683 | [11] | |
Streptomyces avermitilis | MA4680 | Actinobacterias | 9.025.608 | 7.577 | [12] | |
Streptomyces coelicolor | A3 | Actinobacterias | 8,667,507 | 7.825 | [13] | |
Symbiobacterium thermophilum | Presion | Actinobacterias | 3,566,135 | 3.337 | [14] | |
Thermobifida fusca | YX | Actinobacterias | 3.642.249 | 3,110 | No publicado [1] |
Aquificae
Especies | Presion | Tipo | Pares de bases | Genes | Referencia | Identificador de GenBank |
---|---|---|---|---|---|---|
Aquifex aeolicus | VF5 | Aquificae | 1,551,335 | 1,522 | [15] | Cromosoma NC_000918 Plásmido ece1 NC_001880 |
Armatimonadetes
Grupo Bacteroidetes / Clorobi
Especies | Presion | Tipo | Pares de bases | Genes | Referencia | Identificador de GenBank |
---|---|---|---|---|---|---|
Bacteroides fragilis | NCTC9343 | Bacteroidetes | 5,205,140 | 4.260 | [dieciséis] | Cromosoma CR626927 Plásmido pBF9343 CR626928 |
Bacteroides fragilis | YCH46 | Bacteroidetes | 5.277.274 | 4.578 | [17] | Cromosoma AP006841 Plásmido pBFY46 AP006842 |
Bacteroides thetaiotaomicron | VPI-5482 | Bacteroidetes | 6.260.361 | 4.778 | [18] | Cromosoma AE015928 Plásmido p5482 AY171301 |
Candidatus Amoebophilus asiaticus | 5a2 | Bacteroidetes | 1,884,364 | [19] | CP001102 | |
Clorobaculum parvum | NCIB 8327 | Clorobi | 2,289,249 | Instituto Conjunto del Genoma del DOE | CP001099 | |
Clorobium chlorochromatii | CaD3 | Clorobi | 2.572.079 | 2.002 | Instituto Conjunto del Genoma del DOE | CP000108 |
Ferrooxidanos de cloro | DSM 13031 | Clorobi | Instituto Conjunto del Genoma del DOE | AASE00000000 | ||
Chlorobium limicola | DSM 245 | Clorobi | 2,763,181 | Instituto Conjunto del Genoma del DOE | NC_010803 | |
Chlorobium phaeobacteroides | BS1 | Clorobi | 2,736,403 | Instituto Conjunto del Genoma del DOE | NC_010831 | |
Chlorobium phaeobacteroides | DSM 266 | Clorobi | 3,133,902 | Instituto Conjunto del Genoma del DOE | NC_008639 | |
Chlorobium phaeovibrioides | DSM 265 | Clorobi | 1,966,858 | Instituto Conjunto del Genoma del DOE | NC_009337 | |
Clorobium tepidum | TLS | Clorobi | 2,154,946 | 2.255 | [20] | AE006470 |
Chloroherpeton thalassium | ATCC 35110 | Clorobi | 3,293,456 | Instituto Conjunto del Genoma del DOE | CP001100 | |
Cytophaga hutchinsonii | ATCC 33406 | Clorobi | 4.433.218 | [21] | CP000383 | |
Haliscomenobacter hydrossis | DSM 1100 | Bacteroidetes | 8.371.686 | [22] | Cromosoma CP002691 Plásmido pHALHY01 CP002692 | |
Álbum de Ignavibacterium | JCM 16511 | Clorobi | 3.658.997 | Universidad de Copenhague | CP003418 | |
Pelodictyon luteolum ( Chlorobium luteolum ) | DSM 273 | Clorobi | 2,364,842 | 2.083 | Instituto Conjunto del Genoma del DOE | CP000096 |
Pelodictyon phaeoclathratiforme | BU-1 | Clorobi | 3,018,238 | Instituto Conjunto del Genoma del DOE | CP001110 | |
Porphyromonas gingivalis | ATCC 33277 | Bacteroidetes | 2,354,886 | [23] | NC_010729 | |
Porphyromonas gingivalis | W83 | Bacteroidetes | 2,343,476 | 1.909 | [24] | NC_002950 |
Prosthecochloris aestuarii | DSM 271 | Clorobi | 2,512,923 | Instituto Conjunto del Genoma del DOE | Cromosoma CP001108 Plásmido pPAES01 CP001109 | |
Salinibacter ruber | DSM 13855 | Bacteroidetes | 3,551,823 | 2.801 | [25] | NC_007677 |
Salinibacter ruber | M8 | Bacteroidetes | 3.619.447 | [26] | Cromosoma FP565814 Plásmido pSR11 FP565810 | |
Saprospira grandis | str. Lewin | Bacteroidetes | 4.345.237 | Universidad de Hawaii en Manoa | Cromosoma CP002831 Plásmido CP002832 |
Caldiserica
Grupo de clamidia / verrucomicrobia
Especies | Presion | Tipo | Pares de bases | Genes | Referencia |
---|---|---|---|---|---|
Akkermansia muciniphila | ATCC BAA-835 | Verrucomicrobia | 2,664,102 | 2,176 | [27] |
Akkermansia muciniphila | Urmite | Verrucomicrobia | 2,664,714 | 2,192 | [28] |
Chlamydia muridarum | Negro | Clamidias | 1.072.950 | 904 | [29] |
Chlamydia trachomatis | AHAR13 | Clamidias | 1.044.459 | 911 | [30] |
Chlamydia trachomatis | DUW | Clamidias | 1.042.519 | 894 | [31] |
Chlamydophila abortus | S26-3 | Clamidias | 1,144,377 | 961 | [32] |
Chlamydophila caviae | GPIC | Clamidias | 1,173,390 | 998 | [33] |
Chlamydophila felis | FeC56 | Clamidias | 1,166,239 | 1,005 | [34] |
Chlamydophila pneumoniae | AR39 | Clamidias | 1,229,853 | 1,110 | [29] |
Chlamydophila pneumoniae | CWL029 | Clamidias | 1.230.230 | 1.052 | [35] |
Chlamydophila pneumoniae | J138 | Clamidias | 1,226,565 | 1.069 | [36] |
Chlamydophila pneumoniae | TW183 | Clamidias | 1,225,935 | 1,113 | ALTANA Pharma |
Parachlamy diaspecies | UWE25 | Clamidias | 2,414,465 | 2.031 | [37] |
Cloroflexi
Especies | Presion | Tipo | Pares de bases | Genes | Referencia |
---|---|---|---|---|---|
Dehalococcoides mccartyi | 195 | Dehalococcoidetes | 1,469,720 | 1.580 | [38] |
Dehalococcoides mccartyi | CBDB1 | Dehalococcoidetes | 1.395.502 | 1,458 | [39] |
Dehalococcoides mccartyi | DCMB5 | Dehalococcoidetes | 1.431.902 | 1,526 | [40] |
Dehalococcoides mccartyi | BTF08 | Dehalococcoidetes | 1,452,335 | 1.580 | [40] |
Chrysiogenetes
Cianobacterias
Especies | Presion | Tipo | Pares de bases | Genes | Referencia |
---|---|---|---|---|---|
Anabaena nostoc | PCC7120 | Nostocales | 6.413.771 | 5.368 | [41] |
Anabaena variabilis | ATCC29413 | Nostocales | 6.365.727 | 5,039 | Instituto Conjunto del Genoma del DOE |
Bacteria cianobacteria | YellowstoneA | Chroococcales | 2,932,766 | 2,760 | [42] |
Bacteria cianobacteria | YellowstoneB | Chroococcales | 3,046,682 | 2,862 | [42] |
Gloeobacter violaceus | PCC7421 | Gloeobacterias | 4.659.019 | 4.430 | [43] |
Prochlorococcus marinus | MED4 | Proclorales | 1,657,990 | 1,716 | [44] |
Prochlorococcus marinus | MIT9312 | Proclorales | 1.709.204 | 1.809 | No publicado [1] |
Prochlorococcus marinus | MIT9313 | Proclorales | 2,410,873 | 2.273 | [44] |
Prochlorococcus marinus | NATL2A | Proclorales | 1.842.899 | 1.890 | No publicado [1] |
Prochlorococcus marinus | SS120 | Proclorales | 1,751,080 | 1,882 | [45] |
Synechococcus elongatus | PCC6301 | Chroococcales | 2,696,255 | 2.525 | No publicado [1] |
Synechococcus elongatus | PCC7942 | Chroococcales | 2,695,903 | 2.611 | No publicado [1] |
Especies de Synechococcus | WH8102 | Chroococcales | 2,434,428 | 2.526 | [46] |
Especies de Synechococcus | CC9605 | Chroococcales | 2.510.659 | 2.638 | No publicado [1] |
Especies de Synechococcus | CC9902 | Chroococcales | 2,234,828 | 2.304 | No publicado [1] |
Especies de Synechocystis | PCC6803 | Chroococcales | 3,573,470 | 3,167 | [47] |
Thermosynechococcus elongatus | bp1 | Chroococcales | 2,593,857 | 2,475 | No publicado [1] |
Deferribacteres
Especies | Presion | Tipo | Pares de bases | Genes | Referencia |
---|---|---|---|---|---|
Geovibrio sp. | Deferribacteres | 2,971,658 | 2,415 | Instituto Conjunto del Genoma del DOE | |
Mucispirillum schaedleri | ASF457 | Deferribacteres | 2,319,180 | 2,144 | Instituto amplio |
Denitrovibrio acetiphilus | DSM 12809 | Deferribacteres | 3,222,077 | 3,068 | [48] |
Calditerrivibrio nitroreducens | DSM 19672 | Deferribacteres | 2,157,835 | 2,117 | [49] |
Deferribacter desulfuricans | SSM1 | Deferribacteres | 2,234,389 | 2,184 | [50] |
Flexistipes sinusarabici | DSM 4947 | Deferribacteres | 2,526,590 | 2,397 | [51] |
Deinococcus - Thermus
Especies | Presion | Tipo | Pares de bases | Genes | Referencia | Identificador de GenBank |
---|---|---|---|---|---|---|
Deinococcus deserti | VCD115 | Deinococcales | 2.819.842 | [52] | Cromosoma NC_012526 Plásmido 1 NC_012528 | |
Deinococcus geothermalis | DSM 11300 | Deinococcales | 2,467,205 | 2,335 | Instituto Conjunto del Genoma del DOE | Cromosoma CP000359 Plásmido pDGEO01 CP000358 |
Deinococcus gobiensis | I-0 | Deinococcales | 3,137,147 | [53] | Cromosoma CP002191 Plásmido P1 CP002192 | |
Deinococcus maricopensis | DSM 21211 | Deinococcales | 3.498.530 | Instituto Conjunto del Genoma del DOE de EE. UU. | CP002454 | |
Deinococcus proteolyticus | MRP | Deinococcales | 2,147,060 | Instituto Conjunto del Genoma del DOE de EE. UU. | Cromosoma CP002536 Plásmido pDEIPR01 CP002537 | |
Deinococcus radiodurans | R1 | Deinococcales | Cromosoma 1: 2.648.638 Cromosoma 2: 412,348 | Cromosoma 1: 2579 Cromosoma 2: 357 | [54] | Cromosoma 1 NC_001263 Cromosoma 2 NC_001264 |
Marinithermus hydrothermalis | DSM 14884 | Thermales | 2,269,167 | Instituto Conjunto del Genoma del DOE | CP002630 | |
Meiothermus ruber | DSM 1279 | Thermales | 3,097,457 | Instituto Conjunto del Genoma del DOE | CP001743 | |
Meiothermus silvanus | DSM 9946 | Thermales | 3,249,394 | [55] | Cromosoma CP002042 Plásmido pMESIL01 CP002043 | |
Oceanithermus profundo | DSM 14977 | Thermales | 2.303.940 | Instituto Conjunto del Genoma del DOE | Cromosoma CP002361 Plásmido pOCEPR01 | |
Thermus scotoductus | SA-01 | Thermales | 2,346,803 | [56] | Cromosoma CP001962 Plásmido pTSC8 CP001963 | |
Especies de Thermus | CCB_US3_UF1 | Thermales | 2,243,772 | Universiti Sains Malasia | Cromosoma CP003126 Plásmido pTCCB09 CP003127 | |
Thermus thermophilus | HB27 | Thermales | 1,894,877 | 1,982 | [57] | Cromosoma AE017221 Plásmido pTT27 AE017222 |
Thermus thermophilus | HB8 | Thermales | 1.849.742 | 1.973 | Instituto de Ciencia y Tecnología de Nara | Cromosoma NC_006461 Plásmido pTT27 NC_006462 |
Thermus thermophilus | JL-18 | Thermales | 1.902.595 | Instituto Conjunto del Genoma del DOE | Cromosoma CP003252 Plásmido pTTJL1801 CP003253 | |
Thermus thermophilus | SG0.5JP17-16 | Thermales | 1,863,201 | Instituto Conjunto del Genoma del DOE | Cromosoma CP002777 Plásmido pTHTHE1601 CP002778 | |
Truepera radiovictrix | DSM 17093 | Deinococcales | 3,260,398 | Instituto Conjunto del Genoma del DOE | CP002049 |
Dictyoglomi
Elusimicrobia
Grupo fibrobacterias / acidobacterias
Especies | Presion | Tipo | Pares de bases | Genes | Referencia |
---|---|---|---|---|---|
Bacteria acidobacteria | Ellin345 | Acidobacterias | 5,650,368 | 4.777 | No publicado [1] |
Leifsonia xyli | CTCB07 | Acidobacterias | 2,584,158 | 2.030 | [58] |
Propionibacterium acnes | KPA171202 | Acidobacterias | 2,560,265 | 2,297 | [59] |
Rubrobacter xylanophilus | DSM9941 | Acidobacterias | 3,225,748 | 3,140 | Instituto Conjunto del Genoma del DOE |
Tropheryma whippelii | TW08 / 27 | Acidobacterias | 925,938 | 784 | [60] |
Tropheryma whippelii | Giro | Acidobacterias | 927.303 | 808 | [61] |
Firmicutes
Especies | Presion | Tipo | Pares de bases | Genes | Referencia |
---|---|---|---|---|---|
Bacillus Anthracis | Ames | Bacilos | 5.227.293 | 5.311 | [62] |
Bacillus Anthracis | Sterne | Bacilos | 5.228.663 | 5.287 | No publicado [1] |
Bacillus cereus | ATCC10987 | Bacilos | 5.224.283 | 5.603 | [63] |
Bacillus cereus | ATCC14579 | Bacilos | 5.411.809 | 5.234 | [64] |
Bacillus cereus | ZK | Bacilos | 5.300.915 | 5.134 | No publicado [1] |
Bacilo clausii | KSMK16 | Bacilos | 4.303.871 | 4.108 | [sesenta y cinco] |
Bacilo halodurans | C125 | Bacilos | 4.202.352 | 4.066 | [66] |
Bacillus licheniformis | ATCC14580 | Bacilos | 4.222.334 | 4.152 | [67] |
Bacillus licheniformis | Sin especificar | Bacilos | 4.222.645 | 4.196 | [68] |
Bacillus licheniformis | DSM13 | Bacilos | 4.222.645 | 4.196 | [68] |
Bacillus subtilis | 168 | Bacilos | 4.214.630 | 4.106 | [69] |
bacilo turingiensico | 9727 | Bacilos | 5.237.682 | 5.117 | [70] |
Carboxidotermo hidrogenoformans | Z2901 | Clostridios | 2.401.520 | 2.620 | [71] |
Clostridium acetobutylicum | ATCC824 | Clostridios | 3.940.880 | 3.672 | [72] |
Clostridium difficile | QCD-32g58 | Clostridios | 3.840.681 | No publicado [1] | |
Clostridium perfringens | 13 | Clostridios | 3,031,430 | 2.660 | [73] |
Clostridium tetani | E88 | Clostridios | 2,799,251 | 2,373 | [74] |
Desulfitobacterium hafniense | Y51 | Clostridios | 5.727.534 | 5.060 | [75] |
Enterococcus faecalis | V583 | Bacilos | 3,218,031 | 3,113 | [76] |
Geobacillus kaustophilus | HTA426 | Bacilos | 3,544,776 | 3,498 | [77] |
Lactobacillus acetotolerans | NCFM | Bacilos | |||
Lactobacillus acidophilus | NCFM | Bacilos | 1,993,564 | 1.864 | [78] |
Lactobacillus delbrueckii | bulgaricus | Bacilos | 1.864.998 | 2.096 | No publicado [1] |
Lactobacillus johnsonii | NCC533 | Bacilos | 1,992,676 | 1.821 | [79] |
Lactobacillus plantarum | WCFS1 | Bacilos | 3.308.274 | 3,051 | [79] |
Lactobacillus sakei | 23K | Bacilos | 1,884,661 | 1,885 | No publicado [1] |
Lactobacillus sakei | sakei23K | Bacilos | 1,884,661 | 1,885 | No publicado [1] |
Lactobacillus salivarius | UCC118 | Bacilos | 1.827.111 | 1,717 | No publicado [1] |
Lactococcus lactis | IL1403 | Bacilos | 2,365,589 | 2.266 | [80] |
Listeria innocua | Clip11262 | Bacilos | 3,011,208 | 2,981 | [81] |
Listeria monocytogenes | EGD | Bacilos | 2,944,528 | 2.855 | [81] |
Listeria monocytogenes | 4b | Bacilos | 2.905.187 | 2.821 | [82] |
Moorella termoacética | ATCC39073 | Clostridios | 2,628,784 | 2,465 | No publicado [1] |
Oceanobacillus iheyensis | HTE831 | Bacilos | 3.630.528 | 3,496 | [83] |
Staphylococcus aureus | COLUMNA | Bacilos | 2.809.422 | 2.673 | [84] |
Staphylococcus aureus | MRSA252 | Bacilos | 2.902.619 | 2,744 | [85] |
Staphylococcus aureus | MSSA476 | Bacilos | 2,799,802 | 2.619 | [85] |
Staphylococcus aureus | Mu50 | Bacilos | 2.878.529 | 2.699 | [86] |
Staphylococcus aureus | MW2 | Bacilos | 2.820.462 | 2.632 | [87] |
Staphylococcus aureus | N315 | Bacilos | 2.814.816 | 2.593 | [86] |
Staphylococcus aureus | NCTC8325 | Bacilos | 2.821.361 | 2.892 | No publicado [1] |
Staphylococcus aureus | RF122 | Bacilos | 2,742,531 | 2.589 | No publicado [1] |
Staphylococcus aureus | USA300 | Bacilos | 2.872.769 | 2.560 | [88] |
Staphylococcus epidermidis | ATCC12228 | Bacilos | 2,499,279 | 2,419 | No publicado [1] |
Staphylococcus epidermidis | RP62A | Bacilos | 2.616.530 | 2,494 | [84] |
Staphylococcus haemolyticus | JCSC1435 | Bacilos | 2.685.015 | 2.678 | [89] |
Staphylococcus saprophyticus | saprophyticus | Bacilos | 2.516.575 | 2,446 | [90] |
Streptococcus agalactiae | A909 | Bacilos | 2.127.839 | 1,996 | [91] |
Streptococcus agalactiae | NEM316 | Bacilos | 2,211,485 | 2,134 | [92] |
Streptococcus agalactiae | 2603 V / R | Bacilos | 2,160,267 | 2.124 | [93] |
Streptococcus mutans | UAB159 | Bacilos | 2,030,921 | 1.960 | [94] |
steotococos neumonia | R6 | Bacilos | 2,038,615 | 2.043 | [95] |
steotococos neumonia | TIGR4 | Bacilos | 2,160,842 | 2.125 | [96] |
Streptococcus pyogenes | M5Manfredo | Bacilos | 1.841.271 | No publicado [1] | |
Streptococcus pyogenes | MGAS10270 | Bacilos | 1,928,252 | 1.987 | [97] |
Streptococcus pyogenes | MGAS10394 | Bacilos | 1.899.877 | 1,886 | [98] |
Streptococcus pyogenes | MGAS10750 | Bacilos | 1.937.111 | 1.979 | [97] |
Streptococcus pyogenes | MGAS2096 | Bacilos | 1.860.355 | 1.898 | [97] |
Streptococcus pyogenes | MGAS315 | Bacilos | 1,900,521 | 1.865 | [99] |
Streptococcus pyogenes | MGAS5005 | Bacilos | 1.838.554 | 1.865 | [100] |
Streptococcus pyogenes | MGAS6180 | Bacilos | 1,897,573 | 1,894 | [101] |
Streptococcus pyogenes | MGAS8232 | Bacilos | 1.895.017 | 1.845 | [102] |
Streptococcus pyogenes | MGAS9429 | Bacilos | 1.836.467 | 1.877 | [97] |
Streptococcus pyogenes | SF370 | Bacilos | 1.852.441 | 1,696 | [103] |
Streptococcus pyogenes | SSI1 | Bacilos | 1,894,275 | 1,861 | [104] |
Streptococcus thermophilus | CNRZ1066 | Bacilos | 1,796,226 | 1,915 | [105] |
Streptococcus thermophilus | LMG18311 | Bacilos | 1,796,846 | 1,889 | [105] |
Thermoanaerobacter tengcongensis | MB4T | Clostridios | 2.689.445 | 2.588 | No publicado [1] |
Fusobacterias
Especies | Presion | Tipo | Pares de bases | Genes | Referencia | Identificador de GenBank |
---|---|---|---|---|---|---|
Fusobacterium nucleatum | ATCC25586 | Fusobacterias | 2,174,500 | 2.067 | [106] | |
Fusobacterium sp. | 11_3_2 | Fusobacterias | Inédito | ACUO00000000 | ||
Fusobacterium sp. | 21_1A | Fusobacterias | Inédito | ADEE00000000 |
Gemmatimonadetes
Nitrospirae
Planctomicetos
Especies | Presion | Tipo | Pares de bases | Genes | Referencia |
---|---|---|---|---|---|
Rhodopirellula baltica | cepa1 | Planctomycetes Planctomycetacia | 7.145.576 | 7.325 | No publicado [1] |
Proteobacterias
Alfaproteobacterias
Especies | Presion | Tipo | Pares de bases | Genes | Referencia |
---|---|---|---|---|---|
Agrobacterium tumefaciens | C58 | Alfaproteobacterias | 2.841.581 | 2,722 | [107] |
Anaplasma marginale | StMaries | Alfaproteobacterias | 1,197,687 | 949 | [108] |
Anaplasma phagocytophilum | HZ | Alfaproteobacterias | 1,471,282 | 1,264 | [109] |
Bartonella henselae | Houston-1 | Alfaproteobacterias | 1.931.047 | 1,612 | [110] |
Bartonella quintana | Toulouse | Alfaproteobacterias | 1,581,384 | 1,308 | [110] |
Bradyrhizobium japonicum | USDA 110 | Alfaproteobacterias | 9,105,828 | 8.317 | [111] |
Brucella abortus | 2308 (cromosoma I) | Alfaproteobacterias | 1,156,948 | 1,164 | [112] |
2308 (cromosoma II) | Alfaproteobacterias | 2.121.359 | 2,186 | [112] | |
Brucella abortus | 9-941 (cromosoma I) | Alfaproteobacterias | 2.124.241 | 2.030 | [113] |
9-941 (cromosoma II) | Alfaproteobacterias | 1,162,204 | 1.055 | [113] | |
Brucella melitensis | 16M (cromosoma I) | Alfaproteobacterias | 2,117,144 | 2.059 | [114] |
16M (cromosoma II) | Alfaproteobacterias | 1,177,787 | 1,139 | [114] | |
Brucella suis | 1330 (cromosoma I) | Alfaproteobacterias | 2.107.794 | 2.123 | [115] |
1330 (cromosoma II) | Alfaproteobacterias | 1.207.381 | 1,150 | [115] | |
Caulobacter crescentus | CB15 | Alfaproteobacterias | 4.016.947 | 3.737 | [116] |
Ehrlichia canis | Jake | Alfaproteobacterias | 1.315.030 | 925 | No publicado [1] |
Ehrlichia chaffeensis | Arkansas | Alfaproteobacterias | 1,176,248 | 1.105 | [109] |
Ehrlichia ruminantium | Gardel | Alfaproteobacterias | 1,499,920 | 950 | No publicado [1] |
Ehrlichia ruminantium | Welgevonden | Alfaproteobacterias | 1,512,977 | 958 | No publicado [1] |
Sin especificar | Sin especificar | Alfaproteobacterias | 1,516,355 | 920 | [117] |
Erythrobacter litoralis | HTCC2594 | Alfaproteobacterias | 3,052,398 | 3,011 | No publicado [1] |
Gluconobacter oxydans | 621H | Alfaproteobacterias | 2.702.173 | 2,432 | [118] |
Especies de Jannaschia | CCS1 | Alfaproteobacterias | 4.317.977 | 4.212 | No publicado [1] |
Magnetospirillum magneticum | AMB1 | Alfaproteobacterias | 4.967.148 | 4.559 | [119] |
Mesorhizobium loti | MAFF303099 | Alfaproteobacterias | 7.036.071 | 6.752 | [120] |
Neorickettsia sennetsu | Miyayama | Alfaproteobacterias | 859,006 | 932 | [109] |
Nitrobacter hamburgensis | X14 | Alfaproteobacterias | 4.406.967 | 3.804 | No publicado [1] |
Nitrobacter winogradskyi | Nb255 | Alfaproteobacterias | 3.402.093 | 3.122 | No publicado [1] |
Novosphingobium aromaticivorans | DSM12444 | Alfaproteobacterias | 3,561,584 | 3.324 | No publicado [1] |
Pelagibacter ubique | HTCC1062 | Alfaproteobacterias | 1,308,759 | 1,354 | [121] |
Rhizobium etli | CFN42 | Alfaproteobacterias | 4.381.608 | 4.067 | [122] |
Rhizobium leguminosarum | viciae3841 | Alfaproteobacterias | 7.751.309 | 4.746 | No publicado [1] |
Rhodobacter sphaeroides | 2.4.1 | Alfaproteobacterias | 3,188,609 | 3,022 | No publicado [1] |
Sin especificar | Sin especificar | Alfaproteobacterias | 943,016 | 835 | No publicado [1] |
Rhodopseudomonas palustris | BisB18 | Alfaproteobacterias | 5.513.844 | 4.886 | No publicado [1] |
Rhodopseudomonas palustris | BisB5 | Alfaproteobacterias | 4.892.717 | 4.397 | No publicado [1] |
Rhodopseudomonas palustris | CGA009 | Alfaproteobacterias | 5.459.213 | 4.833 | [123] |
Rhodopseudomonas palustris | HaA2 | Alfaproteobacterias | 5.331.656 | 4.683 | No publicado [1] |
Rhodospirillum rubrum | ATCC11170 | Alfaproteobacterias | 4.352.825 | 3,791 | No publicado [1] |
Rickettsia bellii | RML369-C | Alfaproteobacterias | 1,522,076 | 1.429 | No publicado [1] |
Rickettsia conorii | Malish7 | Alfaproteobacterias | 1.268.755 | 1.374 | [124] |
Rickettsia felis | URRWXCal2 | Alfaproteobacterias | 1,485,148 | 1.400 | [125] |
Rickettsia prowazekii | Madrid-E | Alfaproteobacterias | 1,111,523 | 834 | [126] |
Rickettsia typhi | Wilmington | Alfaproteobacterias | 1,111,496 | 838 | [127] |
Silicibacter pomeroyi | DSS3 | Alfaproteobacterias | 4.109.442 | 3.810 | [128] |
Especies de silicibacter | TM1040 | Alfaproteobacterias | 3,200,938 | 3,030 | No publicado [1] |
Sinorhizobium medicae | WSM419 | Alfaproteobacterias | 3,781,904 | 3.635 | [129] |
Sinorhizobium meliloti | Rm1021 | Alfaproteobacterias | 3.654.135 | 3.341 | [130] |
Sphingopyxis alaskensis | RB2256 | Alfaproteobacterias | 3,345,170 | 3,165 | No publicado [1] |
Wolbachia endosymbiont | TRS | Alfaproteobacterias | 1.080.084 | 805 | [131] |
Wolbachia pipientis | wMel | Alfaproteobacterias | 1.267.782 | 1,195 | [132] |
Zymomonas mobilis | ZM4 | Alfaproteobacterias | 2,056,416 | 1,998 | [133] |
Betaproteobacterias
Especies | Presion | Tipo | Pares de bases | Genes | Referencia |
---|---|---|---|---|---|
Azoarcus sp. | EbN1 | Betaproteobacterias | 4.296.230 | 4.128 | 2002 [134] |
Bordetella bronchiseptica | RB50 | Betaproteobacterias | 5.339.179 | 5,006 | No publicado [1] |
Bordetella parapertussis | 12822 | Betaproteobacterias | 4.773.551 | 4.402 | No publicado [1] |
Bordetella pertussis | TohamaI | Betaproteobacterias | 4.086.189 | 3.806 | No publicado [1] |
Burkholderia cenocepacia | AU1054 | Betaproteobacterias | 3,294,563 | 2,965 | No publicado [1] |
Sin especificar | Sin especificar | Betaproteobacterias | 2,788,459 | 2,472 | No publicado [1] |
Sin especificar | Sin especificar | Betaproteobacterias | 1,196,094 | 1.040 | No publicado [1] |
Burkholderia mallei | ATCC23344 | Betaproteobacterias | 3,510,148 | 2,996 | No publicado [1] |
Sin especificar | Sin especificar | Betaproteobacterias | 2,325,379 | 2.029 | 2004 [135] |
Burkholderia pseudomallei | 1710b | Betaproteobacterias | 4.126.292 | 3.736 | No publicado [1] |
Sin especificar | Sin especificar | Betaproteobacterias | 3,181,762 | 2.611 | No publicado [1] |
Burkholderia pseudomallei | K96243 | Betaproteobacterias | 4.074.542 (cromosoma I) 3.173.005 (cromosoma II) | 3.460 (cromosoma I) 2.395 (cromosoma II) | 2004 [85] |
Especies de Burkholderia | 383 | Betaproteobacterias | 3.694.126 | 3.334 | No publicado [1] |
Sin especificar | Sin especificar | Betaproteobacterias | 3,587,082 | 3,174 | No publicado [1] |
Sin especificar | Sin especificar | Betaproteobacterias | 1.395.069 | 1.209 | No publicado [1] |
Burkholderia thailandensis | E264 | Betaproteobacterias | 3.809.201 | 3,276 | 2005 [136] |
Sin especificar | Sin especificar | Betaproteobacterias | 2,914,771 | 2,358 | 2005 [136] |
Burkholderia xenovorans | LB400 | Betaproteobacterias | 4.895.836 | 4.430 | No publicado [1] |
Sin especificar | Sin especificar | Betaproteobacterias | 3,363,523 | 2,960 | No publicado [1] |
Sin especificar | Sin especificar | Betaproteobacterias | 1,471,779 | 1.312 | No publicado [1] |
Chromobacterium violaceum | ATCC12472 | Betaproteobacterias | 4.751.080 | 4.407 | 2003 [137] |
Dechloromonas aromatica | RCB | Betaproteobacterias | 4.501.104 | 4.171 | No publicado [1] |
Methylobacillus flagellatus | KT | Betaproteobacterias | 2,971,517 | 2,753 | No publicado [1] |
Neisseria gonorrhoeae | FA1090 | Betaproteobacterias | 2,153,922 | 2.002 | No publicado [1] |
Neisseria meningitidis | serogrupo A cepa Z2491 | Betaproteobacterias | 2,184,406 | 2.121 | 2000 [138] |
Neisseria meningitidis | cepa MC58 del serogrupo B | Betaproteobacterias | 2,272,360 | 2.063 | 2000 [139] |
Nitrosomonas europaea | Schmidt | Betaproteobacterias | 2.812.094 | 2.574 | 2003 [140] |
Nitrosospira multiformis | ATCC25196 | Betaproteobacterias | 3,184,243 | 2,757 | No publicado [1] |
Especies de Polaromonas | JS666 | Betaproteobacterias | 5.200.264 | 4.817 | No publicado [1] |
Ralstonia eutropha | JMP134 | Betaproteobacterias | 3.806.533 | 3.439 | No publicado [1] |
Sin especificar | Sin especificar | Betaproteobacterias | 2,726,152 | 2.407 | No publicado [1] |
Metaliduranos de Ralstonia | CH34 | Betaproteobacterias | 3.928.089 | 3.601 | No publicado [1] |
Sin especificar | Sin especificar | Betaproteobacterias | 2.580.084 | 2,313 | No publicado [1] |
Ralstonia solanacearum | GMI1000 | Betaproteobacterias | 3.716.413 | 3,441 | 2002 [141] |
Sin especificar | Sin especificar | Betaproteobacterias | 2,094,509 | 1,679 | [141] |
Rhodoferax ferrireducens | DSM15236 | Betaproteobacterias | 4.712.337 | 4.170 | No publicado [1] |
Thiobacillus denitrificans | ATCC25259 | Betaproteobacterias | 2.909.809 | 2.827 | No publicado [1] |
Gammaproteobacteria
Especies | Presion | Tipo | Pares de bases | Genes | Referencia |
---|---|---|---|---|---|
Acinetobacter sp. | ADP1 | Gammaproteobacteria | 3,598,621 | 3.325 | 2004 [142] |
Baumannia cicadellinicola | Hc | Gammaproteobacteria | 686,194 | 595 | No publicado [1] |
Blochmannia floridanus | Presion | Gammaproteobacteria | 705,557 | 589 | 2003 [143] |
Blochmannia pennsylvanicus | bpEN | Gammaproteobacteria | 791.654 | 610 | 2005 [144] |
Buchnera aphidicola | APS | Gammaproteobacteria | 640.681 | 564 | 2000 [145] |
Buchnera aphidicola | B | Gammaproteobacteria | 615,980 | 504 | 2003 [146] |
Buchnera aphidicola | Sg | Gammaproteobacteria | 641,454 | 545 | 2002 [147] |
Carsonella ruddii | PV | Gammaproteobacteria | 159.662 | 182 | 2006 [148] |
Chromohalobacter salexigens | DSM3043 | Gammaproteobacteria | 3.696.649 | 3,298 | No publicado [1] |
Colwellia psychrerythraea | 34H | Gammaproteobacteria | 5.373.180 | 4.910 | No publicado [1] |
Coxiella burnetii | RSA493 | Gammaproteobacteria | 1,995,281 | 2.016 | 2003 [149] |
Erwinia carotovora | SCRI1043 | Gammaproteobacteria | 5,064,019 | 4.492 | No publicado [1] |
Escherichia coli | 536 | Gammaproteobacteria | 4.938.920 | 4.685 | No publicado [1] |
Escherichia coli | CFT073 | Gammaproteobacteria | 5.231.428 | 5.379 | 2002 [150] |
Escherichia coli | K-12 | Gammaproteobacteria | 4.639.675 (4.646.332) | 4.331 (4.337) | 1997, [151] 2005 [152] |
Escherichia coli | O157: H7 | Gammaproteobacteria | 5.528.445 (5.498.450) | 5.349 (5.361) | 2001, [153] 1999 [154] |
Escherichia coli | UTI89 | Gammaproteobacteria | 5,065,741 | 5.066 | No publicado [1] |
Francisella tularensis | LVS | Gammaproteobacteria | 1.895.994 | 1.967 | No publicado [1] |
Francisella tularensis | SCHUS4 | Gammaproteobacteria | 1.892.819 | 1.804 | 2005 [155] |
Haemophilus ducreyi | 3500HP | Gammaproteobacteria | 1,698,955 | 1,717 | No publicado [1] |
Haemophilus influenzae | 86-028NP | Gammaproteobacteria | 1,913,428 | 1,792 | 2005 [156] |
Haemophilus influenzae | Rd | Gammaproteobacteria | 1.830.138 | 1.709 | 1995 [157] |
Hahella chejuensis | KCTC2396 | Gammaproteobacteria | 7.215.267 | 6.782 | 2005 [158] |
Idiomarina loihiensis | L2TR | Gammaproteobacteria | 2.839.318 | 2.628 | 2004 [159] |
Legionella pneumophila | Lente | Gammaproteobacteria | 3,345,687 | 2,947 | 2004 [160] |
Legionella pneumophila | París | Gammaproteobacteria | 3,503,610 | 3,082 | 2004 [160] |
Legionella pneumophila | Filadelfia1 | Gammaproteobacteria | 3.397.754 | 2,942 | No publicado [1] |
Mannheimia succiniciproducens | MBEL55E | Gammaproteobacteria | 2,314,078 | 2,384 | No publicado [1] |
Methylococcus capsulatus | Baño | Gammaproteobacteria | 3.304.561 | 2,960 | 2004 [161] |
Nitrosococcus oceani | ATCC19707 | Gammaproteobacteria | 3.481.691 | 2,976 | No publicado [1] |
Pasteurella multocida | Pm70 | Gammaproteobacteria | 2,257,487 | 2,014 | 2001 [162] |
Photobacterium profundum | SS9 | Gammaproteobacteria | 4.085.304 | 3.416 | No publicado [1] |
Sin especificar | Sin especificar | Gammaproteobacteria | 2,237,943 | 1,997 | No publicado [1] |
Photorhabdus luminescens | laumondiiTTO1 | Gammaproteobacteria | 5,688,987 | 4,905 | No publicado [1] |
Pseudoalteromonas haloplanktis | TAC125 | Gammaproteobacteria | 3,214,944 | 2,941 | 2005 [163] |
Sin especificar | Sin especificar | Gammaproteobacteria | 635,328 | 546 | [163] |
Pseudomonas aeruginosa | VRFPA04 | Gammaproteobacteria | 6.818.030 | 5.939 | 2016 [164] |
Pseudomonas entomophila | L48 | Gammaproteobacteria | 5.888.780 | 5.168 | No publicado [1] |
Pseudomonas fluorescens | Pf-5 | Gammaproteobacteria | 7.074.893 | 6.137 | 2005 [165] |
Pseudomonas fluorescens | PfO-1 | Gammaproteobacteria | 6.438.405 | 5.736 | No publicado [1] |
Pseudomonas putida | KT2440 | Gammaproteobacteria | 6.181.863 | 5.350 | 2002 [166] |
Pseudomonas syringae | B728a | Gammaproteobacteria | 6.093.698 | 5.136 | 2005 [167] |
Pseudomonas syringae | DC3000 | Gammaproteobacteria | 6.397.126 | 5.470 | 2003 [168] |
Pseudomonas syringae | Phaseolicola1448A | Gammaproteobacteria | 5.928.787 | 4.983 | No publicado [1] |
Psychrobacter arcticum | 273-4 | Gammaproteobacteria | 2.650.701 | 2,147 | No publicado [1] |
Psychrobacter cryohalolentis | K5 | Gammaproteobacteria | ~ 3,1 Mb | 2.575 | [169] |
Sin especificar | Sin especificar | Gammaproteobacteria | 3,059,876 | 2,467 | No publicado [1] |
Saccharophagus degradans | Febrero-40 | Gammaproteobacteria | 5,057,531 | 4,008 | No publicado [1] |
Salmonella enterica | ATCC9150 | Gammaproteobacteria | 4,585,229 | 4.093 | 2004 [170] |
Salmonella enterica | SCB67 | Gammaproteobacteria | 4.755.700 | 4.445 | 2005 [171] |
Salmonella enterica | Ty2 | Gammaproteobacteria | 4.791.961 | 4.323 | 2003 [172] |
Salmonella enterica | typhiCT18 | Gammaproteobacteria | 4.809.037 | 4.600 | 2001 [173] |
Salmonella typhimurium | LT2 | Gammaproteobacteria | 4.857.432 | 4.452 | 2001 [174] |
Shewanella denitrificans | OS217 | Gammaproteobacteria | 4.545.906 | 3,754 | No publicado [1] |
Shewanella oneidensis | MR1 | Gammaproteobacteria | 4.969.803 | 4.630 | 2002 [175] |
Shigella boydii | Sb227 | Gammaproteobacteria | 4.519.823 | 4.142 | 2005 [176] |
Shigella dysenteriae | Sd197 | Gammaproteobacteria | 4.369.232 | 4.277 | 2005 [176] |
Shigella flexneri | 2457T | Gammaproteobacteria | 4,599,354 | 4.073 | 2003 [177] |
Shigella flexneri | 2a301 | Gammaproteobacteria | 4.607.203 | 4.436 | 2002 [178] |
Shigella sonnei | Ss046 | Gammaproteobacteria | 4.825.265 | 4.224 | 2005 [176] |
Sodalis glossinidius | morsitans | Gammaproteobacteria | 4.171.146 | 2,432 | 2006 [179] |
Thiomicrospira crunogena | XCL2 | Gammaproteobacteria | 2,427,734 | 2,192 | No publicado [1] |
Vibrio cholerae | N16961 | Gammaproteobacteria | 2,961,149 (cromosoma I) 1,072,315 (cromosoma II) | 2.736 (cromosoma I) 1.092 (cromosoma II) | 2000 [180] |
Vibrio fischeri | ES114 | Gammaproteobacteria | 2.906.179 (cromosoma I) 1.332.022 (cromosoma II) | 2.575 (cromosoma I) 1.172 (cromosoma II) | 2005 [181] |
Vibrio parahaemolyticus | RIMD2210633 | Gammaproteobacteria | 3,288,558 (cromosoma I) 1,877,212 (cromosoma II) | 3.080 (cromosoma I) 1.752 (cromosoma II) | 2000 [182] |
Vibrio vulnificus | CMCP6 | Gammaproteobacteria | 3,281,944 (cromosoma I) 1,844,853 (cromosoma II) | 2,973 (cromosoma I) 1,565 (cromosoma II) | 2003 [183] |
Vibrio vulnificus | YJ016 | Gammaproteobacteria | 3.354.505 (cromosoma I) 1.857.073 (cromosoma II) | 3262 (cromosoma I) 1697 (cromosoma II) | 2003 [184] |
Wigglesworthia glossinidia | Presion | Gammaproteobacteria | 697,724 | 611 | 2002 [185] |
Xanthomonas axonopodis | citri306 | Gammaproteobacteria | 5,175,554 | 4.312 | 2002 [186] |
Xanthomonas campestris | 8004 | Gammaproteobacteria | 5.148.708 | 4.273 | 2005 [187] |
Xanthomonas campestris | 8510 | Gammaproteobacteria | 5,178,466 | 4.487 | 2005 [188] |
Xanthomonas campestris | ATCC33913 | Gammaproteobacteria | 5,076,188 | 4.181 | 2002 [186] |
Xanthomonas oryzae | KACC10331 | Gammaproteobacteria | 4.941.439 | 4.637 | 2005 [189] |
Xanthomonas oryzae | MAFF311018 | Gammaproteobacteria | 4.940.217 | 4.372 | No publicado [1] |
Xylella fastidiosa | 9a5c | Gammaproteobacteria | 2.679.306 | 2,766 | 2000 [190] |
Xylella fastidiosa | Temecula1 | Gammaproteobacteria | 2.519.802 | 2.034 | 2003 [191] |
Yersinia pestis | Antiqua | Gammaproteobacteria | 4.702.289 | 4.167 | 2006 [192] |
Yersinia pestis | CO-92 Biovar Orientalis | Gammaproteobacteria | 4.653.728 | 4,008 | 2001 [193] |
Yersinia pestis | KIM | Gammaproteobacteria | 4.600.755 | 4.090 | 2002 [194] |
Yersinia pestis | Mediaevalis | Gammaproteobacteria | 4.595.065 | 3.895 | 2004 [195] |
Yersinia pseudotuberculosis | IP32953 | Gammaproteobacteria | 4.744.671 | 3.974 | 2004 [196] |
Subdivisiones delta / épsilon
Especies | Presion | Tipo | Pares de bases | Genes | Referencia |
---|---|---|---|---|---|
Anaeromyxobacter dehalogenans | 2CP-C | delta-épsilon | 5,013,479 | 4.346 | No publicado [1] |
Bdellovibrio bacteriovorus | HD100 | delta-épsilon | 3,782,950 | 3,583 | 2004 [197] |
Campylobacter jejuni | NCTC11168 | delta-épsilon | 1,641,481 | 1,643 | 2000 [198] |
Campylobacter jejuni | RM1221 | delta-épsilon | 1,777,831 | 1.838 | 2005 [199] |
Desulfotalea psychrophila | LSv54 | delta-épsilon | 3,523,383 | 3,118 | No publicado [1] |
Desulfovibrio desulfuricans | G20 | delta-épsilon | 3.730.232 | 3.775 | No publicado [1] |
Desulfovibrio vulgaris | Hildenborough | delta-épsilon | 3,570,858 | 3.379 | 2004 [200] |
Geobacter metalireducens | GS15 | delta-épsilon | 3.997.420 | 3,519 | No publicado [1] |
Geobacter sulfurreducens | PCA | delta-épsilon | 3.814.139 | 3,447 | 2003 [201] |
Helicobacter hepaticus | ATCC51449 | delta-épsilon | 1,799,146 | 1.875 | 2003 [202] |
Helicobacter pylori | 26695 | delta-épsilon | 1,667,867 | 1,566 | 1997 [203] |
Helicobacter pylori | HPAG1 | delta-épsilon | 1,596,366 | 1,536 | No publicado [1] |
Helicobacter pylori | J99 | delta-épsilon | 1,643,831 | 1,491 | 1999 [204] |
Lawsonia intracellularis | PHEMN1-00 | delta-épsilon | 1,719,014 | 1.344 | No publicado [1] |
Lawsonia intracellularis | PHE / MN1-00 | delta-épsilon | 1,457,619 (cromosoma) 27,048 (plásmido A) 39,794 (plásmido B) 194,553 (plásmido C) | 1,187 29 (plásmido A) 24 (plásmido B) 104 (plásmido C) | 2013 [205] |
Myxococcus xanthus | DK1622 | delta-épsilon | 9.139.763 | 7.331 | No publicado [1] |
Pelobacter carbinolicus | DSM2380 | delta-épsilon | 3.665.893 | 3,119 | No publicado [1] |
Sorangium cellulosum | Entonces ce56 | delta-épsilon | 13,033,779 | 9.367 | 2007 [206] |
Sulfurimonas denitrificans | DSM1251 | delta-épsilon | 2.201.561 | 2.104 | 2007 [207] |
Syntrophus aciditrophicus | SB | delta-épsilon | 3,179,300 | 3,168 | No publicado [1] |
Thiomicrospira denitrificans | ATCC33889 | delta-épsilon | 2.201.561 | 2.097 | No publicado [1] |
Wolinella succino | DSMZ1740 | delta-épsilon | 2,110,355 | 2.044 | 2003 [208] |
Zetaproteobacteria
Espiroquetas
Especies | Presion | Tipo | Pares de bases | Genes | Referencia |
---|---|---|---|---|---|
Borrelia burgdorferi | B31 | Espiroquetas | 910,724 | 850 | [209] |
Borrelia garinii | PBi | Espiroquetas | 904,246 | 832 | [210] |
Leptospira interrogans | 56601 | Espiroquetas | 4.332.241 | 4.358 | [211] |
Sin especificar | Sin especificar | Espiroquetas | 358,943 | 367 | [211] |
Leptospira interrogans | FiocruzL1130 | Espiroquetas | 4.277.185 | 3.394 | [212] |
Sin especificar | Sin especificar | Espiroquetas | 350,181 | 264 | [212] |
Treponema denticola | ATCC35405 | Espiroquetas | 2.843.201 | 2,767 | [213] |
Treponema pallidum | Nichols | Espiroquetas | 1,138,011 | 1.031 | [214] |
Sinergistetes
Especies | Presion | Tipo | Pares de bases | Genes | Referencia | Identificador de GenBank |
---|---|---|---|---|---|---|
Thermovirga lienii | Cas60314, DSM 17291 | Sinergistia | 1,967,774 | Instituto Conjunto del Genoma del DOE | CP003096 |
Tenericutes
Especies | Presion | Tipo | Pares de bases | Genes | Referencia | Identificador de GenBank |
---|---|---|---|---|---|---|
Mesoplasma florum | L1 | Mollicutes | 793,224 | 683 | No publicado [1] | |
Mycoplasma anatis | 1340, ATCC 25524 | Mollicutes | [215] | AFVJ00000000 | ||
Mycoplasma capricolum | ATCC273 | Mollicutes | 1.010.023 | 812 | No publicado [1] | |
Mycoplasma gallisepticum | R | Mollicutes | 996,422 | 726 | [216] | |
Mycoplasma genitalium | G37 | Mollicutes | 580,076 | 476 | [217] | |
Mycoplasma haemocanis | Illinois | Mollicutes | 919.992 | Inédito | CP003199 | |
Mycoplasma hyopneumoniae | 232 | Mollicutes | 892,758 | 691 | [218] | |
Mycoplasma hyopneumoniae | 7448 | Mollicutes | 920,079 | 663 | [219] | |
Mycoplasma hyopneumoniae | J | Mollicutes | 897,405 | 665 | [219] | |
Mycoplasma hyorhinis | GDL-1 | Mollicutes | 837,480 | Inédito | CP003231 | |
Mycoplasma leachii | 99/014/6 | Mollicutes | 1.017.232 | Inédito | FR668087 | |
Mycoplasma móvil | 163K | Mollicutes | 777,079 | 635 | [220] | |
Mycoplasma mycoides | CAROLINA DEL SUR | Mollicutes | 1.211.703 | 1.016 | [221] | |
Mycoplasma penetrans | HF2 | Mollicutes | 1,358,633 | 1.037 | [222] | |
Mycoplasma pneumoniae | M129 | Mollicutes | 816,394 | 688 | [223] | |
Mycoplasma pulmonis | UAB | Mollicutes | 963,879 | 782 | [224] | |
Mycoplasma sinoviae | 53 | Mollicutes | 799,476 | 672 | [219] | |
Phytoplas maasteris | AYWB | Mollicutes | 706,569 | 671 | No publicado [1] | |
Phytoplas maasteris | OY | Mollicutes | 860,631 | 754 | [225] | |
Ureaplasma urealyticum | serovar3 | Mollicutes | 751,719 | 611 | [226] |
Termodesulfobacterias
Especies | Presion | Tipo | Pares de bases | Genes | Referencia |
---|---|---|---|---|---|
Thermodesulfatator indicus | CIR29812 (T) | Termodesulfobacterias | 2,322,224 | 2,291 | 2012 [227] |
Thermodesulfobacterium geofontis | OPF15 (T) | Termodesulfobacterias | 1,634,377 | 1,635 | 2013 [228] |
Termotogas
Especies | Presion | Tipo | Pares de bases | Genes | Referencia |
---|---|---|---|---|---|
Fervidobacterium nodosum | Rt17-B1 | Termotogas | 1.950.000 | 1.750 | 2009 [229] |
Kosmotoga olearia | TBF 19.5.1 | Termotogas | 2.302.126 | 2,118 | 2011 [230] |
Mesotoga prima | MesG1.Ag.4.2 | Termotogas | 2.974.229 cromosoma 1.724 plásmido | 2,736 | 2012 [231] |
Thermosipho africanus | TCF52B | Termotogas | 2,016,657 | 2.000 | 2009 [232] |
Thermosipho melanesiensis | BI429 | Termotogas | 1,920,000 | 1.879 | 2009 [229] |
Thermotoga lettingae | TMO | Termotogas | 2,140,000 | 2.040 | 2009 [229] |
Thermotoga maritima | MSB8 | Termotogas | 1.860.725 | 1.846 | 1999, [233] 2013 [234] |
Thermotoga petrophila | RKU-1 | Termotogas | 1.820.000 | 1,785 | 2009 [229] |
Ver también
- Proyecto genoma
- Proyecto de microbioma humano
- Lista de genomas eucariotas secuenciados
- Lista de genomas de arqueas secuenciados
- Lista de plastomas secuenciados
Referencias
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- Análisis in silico de genomas bacterianos completos: PCR, AFLP-PCR y restricción de endonucleasas
- Combinando diversas evidencias para el reconocimiento de genes en genomas bacterianos completamente secuenciados
- Heterogeneidad intragenómica entre múltiples operones de ARN ribosómico 16S en genomas bacterianos secuenciados
enlaces externos
- BacMap : un atlas electrónico actualizado de genomas bacterianos anotados
- Base de datos de genómica comparativa SUPERFAMILY Incluye genomas de procariotas completamente secuenciados y herramientas sofisticadas de minería de datos y visualización para análisis