Streptomyces albidoflavus es una especie de bacteria del género Streptomyces que se ha aislado del suelo de Polonia . [1] [3] [4] [5] Streptomyces albidoflavus produce ftalato de dibutilo y estreptotricinas . [6] [7]
Streptomyces albidoflavus | |
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clasificación cientifica | |
Reino: | |
Filo: | " Actinobacterias " |
Clase: | |
Pedido: | |
Familia: | |
Género: | |
Especies: | S. albidoflavus |
Nombre binomial | |
Streptomyces albidoflavus Waksman y Henrici 1948 [1] | |
Tipo cepa | |
COMO 4.1291, ATCC 25422, BCRC 13699, CBS 416.34, CBS 920.69, CCRC 13699, CGMCC 4.1291, CIP 105122, DSM 40455, ETH 10209, ICMP 12537, ICSSB 1006, IFO 13010, IMRU 850, IMSNU 20133, IMSNU 21006 , JCM 4446, KCC S-0446, KCC S-0466, KCC S-1072, KCCS-0466, KCTC 9202, Lanoot R-8660, LMG 19300, MTCC 932, NBIMCC 2386, NBRC 13010, NCIB 10043, NCIMB 10043, NRRL B-1271, NRRL B-2663, NRRL BB-2663, NRRL-ISP 5455, RIA 1202, cepa ATCC 25422, VKM Ac-746, VTT E-991429 [2] | |
Sinónimos [3] [4] | |
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ARN no codificante pequeño
Los ARN pequeños bacterianos están involucrados en la regulación postranscripcional. Utilizando secuenciación profunda, se analizó el transcriptoma de S. albidoflavus al final del crecimiento exponencial. Se identificaron 63 ARN pequeños. La expresión de 11 de ellos se confirmó mediante transferencia Northern. Se demostró que los ARNs solo estaban presentes en las especies de Streptomyces . [8]
El sRNA scr4677 ( Streptomyces coelicolor sRNA 4677) se encuentra en la región intergénica entre el gen anti-factor sigma SCO4677 y un supuesto gen de la proteína reguladora SCO4676 . La expresión de scr4677 requiere la actividad de SCO4677 y el propio ARNm de scr4677 parece afectar los niveles de las transcripciones asociadas a SCO4676 . [9]
Se han identificado objetivos de dos de los ARN no codificantes de S. albidoflavus . Se demostró que el ARN no codificante de la glutamina sintetasa I modula la producción de antibióticos. [10] El ARN pequeño scr5239 (ARNs de Streptomyces coelicolor aguas arriba de SCO5239) tiene dos objetivos. Inhibe la expresión de agarasa DagA mediante el apareamiento directo de bases con la región codificante de dagA y reprime la traducción de la metionina sintasa metE (SCO0985) en el extremo 5 'de su marco de lectura abierto. [11] [12]
Uso en biotecnología
Las cepas de S. albidoflavus producen varios antibióticos , incluyendo actinorrodina , metilenomicina , undecilprodigiosina , [13] y perimicina . [14] [15] Ciertas cepas de S. albidoflavus pueden usarse para la expresión de proteínas heterólogas . [dieciséis]
Ver también
Referencias
- ^ a b LPSN bacterio.net
- ^ Straininfo de Streptomyces albidoflavus
- ^ a b UniProt
- ↑ a b Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen [1]
- ↑ Swiontek Brzezinska, M .; Jankiewicz, U .; Burkowska, A. (2013). "Purificación y caracterización de componentes antifúngicos de Streptomyces albidoflavus". Bioquímica y Microbiología Aplicadas . 49 (5): 451. doi : 10.1134 / S0003683813050025 . S2CID 17097515 .
- ^ Roy, RN; Laskar, S .; Sen, SK (2006). "Ftalato de dibutilo, el compuesto bioactivo producido por Streptomyces albidoflavus 321.2". Investigación microbiológica . 161 (2): 121–6. doi : 10.1016 / j.micres.2005.06.007 . PMID 16427514 .
- ^ Stuart Shapiro (1989). Regulación del metabolismo secundario en actinomicetos . Prensa CRC. ISBN 0-8493-6927-4.
- ^ Vockenhuber MP, Sharma CM, Statt MG, Schmidt D, Xu Z, Dietrich S, et al. (Mayo de 2011). "Identificación basada en secuenciación profunda de pequeños ARN no codificantes en Streptomyces coelicolor" . Biología del ARN . 8 (3): 468–77. doi : 10.4161 / rna.8.3.14421 . PMC 3218513 . PMID 21521948 .
- ^ Moody MJ, Jones SE, Elliot MA (1 de enero de 2014). "Dinámica intra-operónica compleja mediada por un pequeño ARN en Streptomyces coelicolor " . PLOS ONE . 9 (1): e85856. Código bibliográfico : 2014PLoSO ... 985856H . doi : 10.1371 / journal.pone.0085856 . PMC 3896431 . PMID 24465751 .
- ^ D'Alia D, Nieselt K, Steigele S, Müller J, Verburg I, Takano E (febrero de 2010). "El ARN no codificante de la glutamina sintetasa I modula la producción de antibióticos en Streptomyces coelicolor A3 (2)" . Revista de bacteriología . 192 (4): 1160–4. doi : 10.1128 / JB.01374-09 . PMC 2812974 . PMID 19966003 .
- ^ Vockenhuber MP, Suess B (febrero de 2012). " Streptomyces coelicolor sRNA scr5239 inhibe la expresión de agarasa por apareamiento directo de bases a la región codificante de dagA ". Microbiología . 158 (Parte 2): 424–435. doi : 10.1099 / mic.0.054205-0 . PMID 22075028 .
- ^ Vockenhuber MP, Heueis N, Suess B (1 de enero de 2015). "Identificación de metE como segundo objetivo del sRNA scr5239 en Streptomyces coelicolor" . PLOS ONE . 10 (3): e0120147. Código bibliográfico : 2015PLoSO..1020147V . doi : 10.1371 / journal.pone.0120147 . PMC 4365011 . PMID 25785836 .
- ^ Brian P, Riggle PJ, Santos RA, Champness WC (junio de 1996). "Regulación global negativa de la síntesis de antibióticos de Streptomyces coelicolor mediada por un sistema de transducción de señales putativo codificado en absA" . Revista de bacteriología . 178 (11): 3221–31. doi : 10.1128 / jb.178.11.3221-3231.1996 . PMC 178074 . PMID 8655502 .
- ^ Liu CM, McDaniel LE, Schaffner CP (marzo de 1972). "Fungimicina, biogénesis de su fracción aromática" . The Journal of Antibiotics . 25 (3): 187–8. doi : 10.7164 / antibióticos.25.187 . PMID 5034814 .
- ^ Lee CH, Schaffner CP (mayo de 1969). "Perimicina. La estructura de algunos productos de degradación". Tetraedro . 25 (10): 2229–32. doi : 10.1016 / S0040-4020 (01) 82770-8 . PMID 5788396 .
- ^ "Streptomyces coelicolor" . Centro John Innes. Archivado desde el original el 19 de octubre de 2005 . Consultado el 25 de enero de 2010 .
Otras lecturas
- Augustine, SK; Bhavsar, SP; Kapadnis, BP (2005). "Un antibiótico antifúngico no poliénico de Streptomyces albidoflavus PU 23". Revista de Biociencias . 30 (2): 201-11. doi : 10.1007 / bf02703700 . PMID 15886456 . S2CID 9722766 .
- Hain, T; Ward-Rainey, N; Kroppenstedt, RM; Stackebrandt, E; Rainey, FA (1997). "Discriminación de cepas de Streptomyces albidoflavus basadas en el tamaño y número de espaciadores intergénicos de ADN ribosómico 16S-23S" . Revista Internacional de Bacteriología Sistemática . 47 (1): 202–6. doi : 10.1099 / 00207713-47-1-202 . PMID 8995823 .
- Cheng, Kun; Rong, Xiaoying; Pinto-Tomás, Adrián A .; Fernández-Villalobos, Marcela; Murillo-Cruz, Catalina; Huang, Ying (2015). "El análisis genético de la población de Streptomyces albidoflavus revela las barreras del hábitat a la recombinación homóloga en la diversificación de Streptomycetes" . Microbiología aplicada y ambiental . 81 (3): 966–75. doi : 10.1128 / AEM.02925-14 . PMC 4292468 . PMID 25416769 .
- Skinner, FA (1953). "Inhibición de Fusarium culmorum por Streptomyces albidoflavus". Naturaleza . 172 (4391): 1191. Código Bibliográfico : 1953Natur.172.1191S . doi : 10.1038 / 1721191a0 . PMID 13111286 . S2CID 4195458 .
- Q. Ashton Acton (2013). Avances en la investigación y aplicación de Streptomycetaceae: 2013 Edición: ScholarlyBrief . ScholarlyEditions. ISBN 978-1-4816-7198-9.
enlaces externos
- Tipo de cepa de Streptomyces albidoflavus en Bac Dive - la base de metadatos de diversidad bacteriana