Marc R. Wilkins es un científico australiano a quien se le atribuye la definición del concepto de proteoma . [1] Wilkins es profesor en la Escuela de Biotecnología y Ciencias Biomoleculares de la Universidad de Nueva Gales del Sur , Sydney.
Marc R. Wilkins | |
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Nacionalidad | Australia |
alma mater | Universidad Macquarie |
Conocido por | proteoma |
Carrera científica | |
Instituciones | Universidad de Nueva Gales del Sur |
Asesor de doctorado | Keith Williams |
Influencias | Denis Hochstrasser, Amos Bairoch |
Wilkins acuñó el término proteoma en 1994 mientras desarrollaba el concepto como estudiante de doctorado en la Universidad Macquarie , Sydney, Australia, y lo describió como el "complemento de PROTEína expresado por un genoma". [2] El término es una generalización del concepto de genoma para abarcar el conjunto de todas las proteínas que se pueden producir a través del genoma mediante el empalme alternativo y la modificación postranscripcional del ARN mensajero . [3]
Carrera profesional
Wilkins obtuvo una beca postdoctoral de 1995 a 1997 en la Universidad de Ginebra , Suiza , en la que trabajó con el profesor Denis Hochstrasser y el Dr. Amos Bairoch . Co-desarrolló muchas de las herramientas de análisis de proteínas disponibles en el servidor web ExPASy . Posteriormente se desempeñó como becario postdoctoral senior en el Centro de Análisis de Proteomas de Australia, que fue establecido por el Gobierno de Australia en 1995 como el primer centro de investigación de proteomas dedicado del mundo. [4]
En 1997 coeditó el primer libro sobre proteómica , 'Proteome Research: New Frontiers in Functional Genomics' (Wilkins et al. (Eds), Springer Verlag ), que vendió más de 4.000 copias. [5]
Fue cofundador de la empresa de proteómica Proteome Systems Ltd. Se estableció en enero de 1999 y cotizó en la Bolsa de Valores de Australia en 2004. El Dr. Wilkins trabajó en Proteome Systems a tiempo completo durante 6 años como líder de su investigación bioinformática y Luego, el equipo de desarrollo como Jefe de Proteómica. Fue galardonado con el "Premio al Novato del Año" de IBM para empresas de la región de Asia y el Pacífico, en 2003. Proteome Systems pasó a llamarse Tyrian Diagnostics [6] y finalmente se deshizo de su propiedad intelectual. En 2007, Wilkins cofundó la empresa de medicina regenerativa Regeneus. [7] Esta empresa ha desarrollado tratamientos para la osteoartritis utilizando células madre adultas, que ahora se encuentran en ensayos clínicos.
Wilkins es actualmente profesor de Biología de Sistemas en la Universidad de Nueva Gales del Sur , [8] y es el director de la Iniciativa de Biología de Sistemas [9] y el Centro Ramaciotti de Genómica. [10] Ha publicado más de 200 artículos de investigación y capítulos de libros. [11] Su investigación actual se refiere al papel de la metilación de proteínas en la célula eucariota, el uso de espectrometría de masas de reticulación (XL-MS) para el análisis a escala de proteomas de las redes de interacción de proteínas (el interactoma ) y el análisis bioinformático de la secuenciación de próxima generación. datos. Como parte del consorcio del genoma del koala, su equipo realizó toda la secuenciación de lectura larga de PacBio y luego el ensamblaje basado en Falcon para generar el genoma marsupial más completo y contiguo hasta la fecha. [12]
En 2012, Wilkins recibió el premio Beckman Coulter Discovery Science de la Sociedad Australiana de Bioquímica y Biología Molecular. [13] Este premio se otorga a un miembro por sus contribuciones distinguidas en el campo de la bioquímica y la biología molecular. La Universidad de Nueva Gales del Sur otorgó a Wilkins un Doctorado en Ciencias (D. Sc.) En 2018.
Referencias
- ^ Wilkins, Marc R .; Sánchez, Jean-Charles; Gooley, Andrew A .; Appel, Ron D .; Humphery-Smith, Ian; Hochstrasser, Denis F .; Williams, Keith L. (1996). "Progreso con proyectos de proteomas: por qué todas las proteínas expresadas por un genoma deben identificarse y cómo hacerlo" . Reseñas de Biotecnología e Ingeniería Genética . 13 (1): 19–50. doi : 10.1080 / 02648725.1996.10647923 .
- ^ Wilkins, Marc R .; Pasquali, cristiano; Appel, Ron D .; Ou, Keli; Golaz, Olivier; Sánchez, Jean-Charles; Yan, Jun X .; Gooley, Andrew. A.; Hughes, Graham; Humphery-Smith, Ian; Williams, Keith L .; Hochstrasser, Denis F. (1 de enero de 1996). "De proteínas a proteomas: identificación de proteínas a gran escala por electroforesis bidimensional y análisis de ácidos arnino". Biotecnología de la naturaleza . 14 (1): 61–65. doi : 10.1038 / nbt0196-61 . PMID 9636313 .
- ^ Wasinger y col. Progreso con el mapeo de productos génicos de Mollicutes: Mycoplasma genitalium
- ^ APAF - Centro de investigación australiano del proteoma
- ^ Wilkins et al (Eds.) Investigación del proteoma: nuevas fronteras en genómica funcional
- ^ " Tyrian Diagnostics Pty Ltd "
- ^ Regeneus Pty Ltd
- ^ Marc Wilkins - perfil de investigador de UNSW
- ^ Iniciativa de biología de sistemas
- ^ Centro Ramaciotti de Genómica
- ^ Marc Wilkins - Lista de publicaciones de UNSW
- ^ Johnson, RN; O'Meally, D; Chen, Z; Etherington, GJ; Ho, SYW; Nash, WJ; Grueber, CE; Cheng, Y; Whittington, CM; Dennison, S; Pelar, E; Haerty, W; O'Neill, RJ; Colgan, D; Russell, TL; Alquezar-Planas, DE; Attenbrow, V; Bragg, JG; Brandies, PA; Chong, AY; Deakin, JE; Di Palma, F; Duda, Z; Eldridge, MDB; Ewart, KM; Hogg, CJ; Frankham, GJ; Georges, A; Gillett, AK; Govendir, M; Greenwood, AD; Hayakawa, T; Helgen, KM; Hobbs, M; Holleley, CE; Heider, TN; Jones, EA; Rey, A; Madden, D; Graves, JAM; Morris, KM; Neaves, LE; Patel, HR; Polkinghorne, A; Renfree, MB; Robin, C; Salinas, R; Tsangaras, K; Waters, PD; Waters, SA; Wright, B; Wilkins, MR; Timms, P; Belov, K (2018). "Perspectivas de adaptación y conservación del genoma del koala" . Nat Genet . 50 (8): 1102-1111. doi : 10.1038 / s41588-018-0153-5 . PMC 6197426 . PMID 29967444 .
- ^ Premios ASBMB
enlaces externos
- Biografía de Marc Wilkins - Universidad de Nueva Gales del Sur
- Escuela de Biotecnología y Ciencias Biomoleculares Universidad de Nueva Gales del Sur
- Carol Ezzell, " Proteins Rule ", Scientific American (abril de 2002).
- La instalación australiana de análisis de proteomas (APAF Ltd)
- Tyrian Diagnostics (anteriormente Proteome Systems Ltd, hasta el 6 de noviembre de 2008)
- Iniciativa de biología de sistemas
- Descripciones de los premios ASBMB