NBPF1
La familia del punto de ruptura del neuroblastoma, miembro 1 , o NBPF1 , es una proteína codificada por el gen NBPF1 en humanos. Esta proteína es miembro de la familia de proteínas de punto de ruptura del neuroblastoma , un grupo de proteínas que se cree que están involucradas en el desarrollo del sistema nervioso. [3]
El gen NBPF1 en humanos está ubicado en la hebra negativa de 1p36.3 en humanos y tiene una longitud de 51179 pares de bases, incluidos los exones y los intrones . Se encuentra entre los genes codificadores de proteínas NECAP2 y CROCC . NBPF1 es uno de los 26 miembros conocidos de los genes y pseudogenes de la familia Neuroblastoma Breakpoint. El pseudogén NBPF2 y el gen NBPF3 son los genes más similares ubicados cerca de NBPF1 y residen en la ubicación cromosómica 1p36.12. La mayoría de los miembros de la familia de genes NBPF están ubicados en la ubicación cromosómica 1q21.1-1q23.3 en humanos, y estos genes son más similares entre sí en secuencia que con NBPF1. [4]
La transcripción de NBPF1 en humanos es un ARNm de 6183 pares de bases compuesto por 28 exones. Hay más de 14 formas alternativas de empalme de NBPF1 previstas, pero solo se han observado siete de las formas de empalme. De todas las transcripciones posibles, solo se sabe que dos codifican proteínas. Una de estas transcripciones tiene una longitud de 1139 aminoácidos con 23 exones de codificación, mientras que la otra tiene una longitud de 1095 aminoácidos y 23 exones de codificación. Las transcripciones no codificantes se procesan, pero se desconoce su función. [3] [5] [6]
NBPF1 es una proteína humana de 1214 aminoácidos de longitud que pesa 139 kD y tiene un punto isoeléctrico de alrededor de 5. Una característica de la composición de esta proteína es que es mucho más rica que la mayoría de las otras proteínas en residuos de glutamina y ácido glutámico. Además, contiene repeticiones de aminoácidos que están presentes en humanos, otros primates e incluso armadillos. [7] Otra característica es que la proteína NBPF1 contiene residuos que se prevé que tengan modificaciones postraduccionales , incluida la glucosilación , la glicosilación ligada a N , la unión de O-GlcNAc , la glicosilación ligada a O , la fosforilación y la sumoilación .[8] Los dos tipos de dominio más importantes en la proteína NBPF1 son los dominios enrollados y los dominios DUF1220 . NBPF1 contiene tres dominios de bobina enrollada y nueve dominios DUF1220 en humanos. Los dominios de bobina enrollada tienen una longitud de 60 a 100 aminoácidos, mientras que los dominios DUF1220 tienen una longitud de aproximadamente 65 pares de bases con una gran similitud de secuencia. [9]
Se ha demostrado que el NBPF1 humano interactúa con la ubiquitina C a través de la inmunoprecipitación del complejo proteico [10] y la cromatografía de afinidad . [11] Los ensayos de detección de dos híbridos han demostrado que NBPF1 interactúa con los dominios de bobina enrollada de CBY1 , un represor de la beta-catenina , una proteína que participa en la señalización de Wnt para la proliferación celular . [12] Además, dos pantallas híbridas han demostrado que NBPF1 interactuó con proteínas bacterianas, como una proteína de la familia de hierro/ascorbato oxidorreductasa de la bacteria .Francisella tularensis y una proteína no caracterizada de la bacteria Bacillus anthracis . [13]
Aunque se desconoce la función de la proteína NBPF1, sus propiedades físicas y químicas pueden dar una idea de su función. Al igual que otras proteínas NBPF, el producto proteico NBPF1 contiene un dominio repetido llamado DUF1220 , un dominio de función desconocida que se cree que está relacionado con la complejidad del cerebro humano. [14] En primer lugar, se prevé que NBPF1 sea una proteína nuclear, ya que contiene señales de localización nuclear cargadas positivamente . Estas señales de localización nuclear en NBPF1 y un dominio de unión a ADN conservado similar al factor de transcripción STAT3 /complejo ADN o STAT1 /complejo ADN sugieren que podría actuar como un factor de transcripción [15]
