La proteína tipo B cortada ( NIPBL ), también conocida como SCC2 o delangina, es una proteína que en los seres humanos está codificada por el gen NIPBL . [5] NIPBL es necesaria para la asociación de cohesina con ADN y es la subunidad principal del complejo de carga de cohesina. [6] Las mutaciones heterocigotas en NIPBL representan aproximadamente el 60% de los casos de síndrome de Cornelia de Lange . [7]
• regulación positiva de la desacetilación de histonas • extremidad anterior morfogénesis • morfogénesis del ojo • regulación del desarrollo embrionario • cognición • útero morfogénesis • respuesta celular a los rayos X • regulación del crecimiento y desarrollo • morfogénesis del corazón • morfogénesis del tracto de salida • regulación positiva de la osificación • regulación negativa de transcripción por ARN polimerasa II • percepción sensorial del sonido • respuesta celular al estímulo de daño del ADN • mantenimiento de la población de células madre • morfogénesis del oído • localización de proteínas celulares • desarrollo del corazón • desarrollo del cerebro • crecimiento del desarrollo • morfogénesis de los genitales externos • regulación del ciclo del cabello • regulación positiva de crecimiento organismo multicelular • embrionario tracto digestivo morfogénesis • vesícula biliar desarrollo • regulación de la expresión génica • embrionario craneal esqueleto morfogénesis • embrionario viscerocráneo morfogénesis • ciclo celular • desarrollo metanefros • regulación negativa de la transcripción, de plantilla de ADN • la diferenciación de células de grasa • mantenimiento de la hermana mitótico cromátida cohesión • embrionario extremidad anterior morfogénesis • cara morfogénesis • regulación positiva de la transcripción por la ARN polimerasa II • regulación de la transcripción por la ARN polimerasa II • regulación positiva de la neurona migración • transcripción, de plantilla de ADN • regulación de la transcripción , Plantilla de ADN • Desarrollo de organismos multicelulares • Cohesión de cromátidas hermanas mitóticas • Reparación de rotura de doble hebra • Condensación de cromosomas mitóticos • Establecimiento de cohesión de cromátidas hermanas mitóticas • Condensación de ADNr • Establecimiento de localización de proteínas en cromatina • Carga de cohesina • Regulación positiva de la carga de cohesina mitótica • Reparación de rotura de doble hebra nacida por replicación a través del intercambio de cromátidas hermanas
Fuentes: Amigo / QuickGO
Ortólogos
Especies
Humano
Ratón
Entrez
25836
71175
Ensembl
ENSG00000164190
ENSMUSG00000022141
UniProt
Q6KC79
Q6KCD5
RefSeq (ARNm)
NM_015384 NM_133433
NM_027707 NM_201232
RefSeq (proteína)
NP_056199 NP_597677
NP_081983 NP_957684
Ubicación (UCSC)
Crónicas 5: 36,88 - 37,07 Mb
Crónicas 15: 8,29 - 8,44 Mb
Búsqueda en PubMed
[3]
[4]
Wikidata
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Estructura e interacciones
Estructura de SCC4 (verde) en complejo con dominio N-terminal de SCC2 (azul) de levadura en gemación (Hinshaw et al., 2015)
NIPBL es una proteína grande en forma de gancho que contiene repeticiones HEAT . [8] NIPBL forma un complejo con MAU2 (Scc4 en la levadura en gemación) conocido como complejo de carga de cohesina. [9] Como sugiere este nombre, NIPBL y MAU2 son necesarios para la asociación inicial de cohesina con ADN.
Se cree que la cohesina media las interacciones potenciador-promotor y genera dominios de asociación topológica (TAD) . Además de mediar la cohesión y regular la arquitectura del ADN, el complejo de cohesina es necesario para la reparación del ADN mediante recombinación homóloga . Dado que se requiere NIPBL para la asociación de la cohesina con el ADN, se cree que NIPBL también se requiere para todos estos procesos. Consistentemente, la inactivación de Nipbl da como resultado la pérdida de los dominios de asociación topológica [10] y la cohesión. [11]
NIPBL se une dinámicamente a la cromatina principalmente a través de una asociación con cohesina . [12] El movimiento de NIPBL dentro de la cromatina es consistente con un mecanismo que involucra saltos entre anillos de cohesina cromosómica . También se ha demostrado para NIPBL una función independiente de la cohesina en la regulación de la expresión génica. [13] [14]
Significación clínica
Las mutaciones en este gen dan como resultado el síndrome de Cornelia de Lange (CdLS), un trastorno caracterizado por rasgos faciales dismórficos, retraso del crecimiento, defectos de reducción de las extremidades y retraso mental. [5] Como estas mutaciones suelen ser heterocigotas , la CdLS se debe a una reducción en la abundancia de Nipbl, no a una pérdida completa. Los experimentos con células de pacientes y ratones indican que la reducción es menos de la mitad. [15] No se sabe por qué una reducción en la expresión de Nipbl da como resultado CdLS.
Referencias
^ a b c GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000164190 - Ensembl , mayo de 2017
^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000022141 - Ensembl , mayo de 2017
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Este artículo incorpora texto de la Biblioteca Nacional de Medicina de los Estados Unidos , que es de dominio público .
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