La proteína de unión al octámero que no contiene el dominio POU (NonO) es una proteína que en los seres humanos está codificada por el gen NONO . [5] [6] [7]
NO NO | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||||||||||
Identificadores | |||||||||||||||||||||||||
Alias | NONO , NMT55, NRB54, P54, P54NRB, PPP1R114, MRXS34, que no contiene dominio POU, unión de octamer, dominio no POU que contiene unión de octamer | ||||||||||||||||||||||||
Identificaciones externas | OMIM : 300084 MGI : 1855692 HomoloGene : 7212 GeneCards : NONO | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Ortólogos | |||||||||||||||||||||||||
Especies | Humano | Ratón | |||||||||||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (ARNm) |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (proteína) |
|
| |||||||||||||||||||||||
Ubicación (UCSC) | Cr X: 71,25 - 71,3 Mb | Cr X: 101,43 - 101,45 Mb | |||||||||||||||||||||||
Búsqueda en PubMed | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Wikidata | |||||||||||||||||||||||||
|
La proteína NonO pertenece a la familia de proteínas comportamiento / empalme humano de Drosophila (DBHS). [8] Las proteínas de la familia DHBS incluyen SFPQ de mamíferos (factor de empalme, rico en prolina y glutamina; también conocido como PSF), NONO (proteína de unión al octámero que no contiene dominio POU; también conocido como p54nrb) y PSPC1 (componente 1 de paraspeckle; también conocido como PSP1) e invertebrados NONA (Proteína no transitoria A) y Hrp65. [9]
Interacciones
Se ha demostrado que NONO interactúa con SFPQ , [10] SPI1 [11] y el receptor de andrógenos . [12]
Funciones
NONO participa en muchos procesos nucleares y se une tanto al ADN como al ARN . [13]
Como ocurre con todas las proteínas de la familia DBHS, la proteína se describe como una proteína nuclear multifuncional. [14] Se ha demostrado que la proteína NONO está implicada en muchas funciones biológicas, incluido el corte y empalme de pre-ARNm; activación de la transcripción ; terminación de la transcripción; El ADN se desenrolla y se empareja y mantiene la función correcta del reloj circadiano . [13] [15] [16] [17] [18] [19]
Se ha identificado que NONO se une a la proteína Rasd1 , por lo que el dímero Rasd1 resultante puede actuar para modular la función de NONO para regular negativamente la expresión de los genes CREB , NR4A1 y Nr4A2 . [20]
NONO se une a SFPQ para formar un heterodímero que interactúa con la proteína MATR3 . [21] La interacción de estas tres proteínas puede ser parte del proceso en el núcleo que es responsable de la retención de ARN que son defectuosos, que aún no están lo suficientemente maduros para ser exportados o que están diseñados para ser retenidos en el núcleo . [21]
Ubicación del gen
Proteína NONO (humano) es codificada por el NONO gen que se encuentra en la cadena positiva del cromosoma X . [22]
Papel en la enfermedad
Melanoma
Se ha demostrado que NONO se expresa con más fuerza en líneas de células de melanoma y muestras de tejido de melanoma en comparación con las líneas de células humanas normales y el tejido de piel normal. [23] Los estudios han encontrado que la eliminación de la proteína NONO de las líneas celulares de melanoma da como resultado tanto una reducción de las tasas de proliferación de las células cancerosas como una disminución significativa de la migración potencial de las células cancerosas. [23]
Cáncer de mama
Los estudios sobre cánceres de mama han encontrado que la pérdida o alteración de NONO junto con la pérdida del receptor de estrógeno hERα da como resultado cánceres de mama más agresivos que muestran un aumento tanto en el tamaño del tumor como en las metástasis . [24]
Discapacidad intelectual asociada con miocardiopatía no compactada
Los estudios en humanos y ratones han identificado que las mutaciones nulas NONO probablemente conduzcan al desarrollo de una discapacidad intelectual clínicamente reconocible con déficits cognitivos y afectivos. [25] Más tarde se descubrió que estas variantes patogénicas también estaban fuertemente asociadas con la miocardiopatía con no compactación del ventrículo izquierdo y, a veces, con la anomalía de Ebstein . [26] [27]
Estructura
Al igual que con otras proteínas de la familia DBHS, las funciones de la proteína NONO rara vez funcionan solas y principalmente forman homo y heterodímeros con otras proteínas DBHS para realizar sus diversas funciones. [28] Se teoriza que estos dímeros pueden tener diferentes funciones que son específicas del tipo de célula en la que se encuentran. [29]
Se especula que es el estado de fosforilación en NONO el que actúa para dirigir las proteínas en muchas funciones dispares dentro del núcleo. [13]
Especificidad de tejido
NONO se encuentra en el núcleo de la mayoría de las células de mamíferos y se distribuye principalmente dentro del nucleoplasma , también se puede encontrar concentrado dentro de los dominios subnucleares conocidos como paraspeckles . [30]
También se ha observado NONO dentro del cerebro, localizado en el citoplasma de las neuronas del hipocampo que están asociadas con los gránulos de transporte de ARN . [31] También se expresa en gran medida en el tejido cardíaco. [27]
Descubrimiento
La proteína NONO fue descubierta por primera vez en 1993 por investigadores del Laboratorio Cold Springs Harbor . Debido a que la proteína se identificó originalmente como una proteína de unión a ARN, se denominó p54nrb para la proteína de unión a ARN nuclear, 54 kDa. [8]
Referencias
- ^ a b c GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000147140 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000031311 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ Dong B, Horowitz DS, Kobayashi R, Krainer AR (agosto de 1993). "Purificación y clonación de ADNc de la célula HeLa p54nrb, una proteína nuclear con dos motivos de reconocimiento de ARN y una amplia homología con el factor de corte y empalme humano PSF y Drosophila NONA / BJ6" . Investigación de ácidos nucleicos . 21 (17): 4085–92. doi : 10.1093 / nar / 21.17.4085 . PMC 310009 . PMID 8371983 .
- ^ Traish AM, Huang YH, Ashba J, Pronovost M, Pavao M, McAneny DB, Moreland RB (agosto de 1997). "Pérdida de expresión de una proteína nuclear de 55 kDa (nmt55) en cáncer de mama humano con receptor de estrógeno negativo". Patología molecular diagnóstica . 6 (4): 209–21. doi : 10.1097 / 00019606-199708000-00005 . PMID 9360842 .
- ^ "Entrez Gen: NONO que no contiene dominio POU, unión de octámero" .
- ^ a b Dong B, Horowitz DS, Kobayashi R, Krainer AR (agosto de 1993). "Purificación y clonación de ADNc de la célula HeLa p54nrb, una proteína nuclear con dos motivos de reconocimiento de ARN y una amplia homología con el factor de corte y empalme humano PSF y Drosophila NONA / BJ6" . Investigación de ácidos nucleicos . 21 (17): 4085–92. doi : 10.1093 / nar / 21.17.4085 . PMC 310009 . PMID 8371983 .
- ^ Passon DM, Lee M, Rackham O, Stanley WA, Sadowska A, Filipovska A, Fox AH, Bond CS (marzo de 2012). "Estructura del heterodímero de NONO humano y componente 1 de la proteína paraspeckle y análisis de su papel en la formación de cuerpos subnucleares" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 109 (13): 4846–50. doi : 10.1073 / pnas.1120792109 . PMC 3324020 . PMID 22416126 .
- ^ Peng R, Dye BT, Pérez I, Barnard DC, Thompson AB, Patton JG (octubre de 2002). "PSF y p54nrb se unen a un tallo conservado en U5 snRNA" . ARN . 8 (10): 1334–47. doi : 10.1017 / S1355838202022070 . PMC 1370341 . PMID 12403470 .
- ^ Hallier M, Tavitian A, Moreau-Gachelin F (mayo de 1996). "El factor de transcripción Spi-1 / PU.1 se une al ARN e interfiere con la proteína de unión al ARN p54nrb" . La revista de química biológica . 271 (19): 11177–81. doi : 10.1074 / jbc.271.19.11177 . PMID 8626664 .
- ^ Ishitani K, Yoshida T, Kitagawa H, Ohta H, Nozawa S, Kato S (julio de 2003). "p54nrb actúa como un coactivador transcripcional para la función de activación 1 del receptor de andrógenos humanos". Comunicaciones de investigación bioquímica y biofísica . 306 (3): 660–5. doi : 10.1016 / S0006-291X (03) 01021-0 . PMID 12810069 .
- ^ a b c Shav-Tal Y, Zipori D (noviembre de 2002). "PSF y p54nrb / NonO - proteínas nucleares multifuncionales" . FEBS Lett . 531 (2): 109-14. doi : 10.1016 / S0014-5793 (02) 03447-6 . PMID 12417296 .
- ^ Duvignaud JB, Bédard M, Nagata T, Muto Y, Yokoyama S, Gagné SM, Vincent M (mayo de 2016). "Estructura, dinámica e interacción de p54 (nrb) / NonO RRM1 con secuencia de ARN del sitio de empalme 5 '". Bioquímica . 55 (18): 2553–66. doi : 10.1021 / acs.biochem.5b01240 . PMID 27064654 .
- ^ Basu A, Dong B, Krainer AR, Howe CC (febrero de 1997). "La proteína de unión del potenciador proximal de la partícula A intracisternal activa la transcripción y es idéntica a la proteína de unión al ARN y al ADN p54nrb / NonO" . Biología Molecular y Celular . 17 (2): 677–86. doi : 10.1128 / mcb.17.2.677 . PMC 231793 . PMID 9001221 .
- ^ Danckwardt S, Kaufmann I, Gentzel M, Foerstner KU, Gantzert AS, Gehring NH, Neu-Yilik G, Bork P, Keller W, Wilm M, Hentze MW, Kulozik AE (junio de 2007). "Los factores de empalme estimulan la poliadenilación a través de USE en señales de formación del extremo 3 'no canónicas" . El diario EMBO . 26 (11): 2658–69. doi : 10.1038 / sj.emboj.7601699 . PMC 1888663 . PMID 17464285 .
- ^ Hallier M, Lerga A, Barnache S, Tavitian A, Moreau-Gachelin F (febrero de 1998). "El factor de transcripción Spi-1 / PU.1 interactúa con el factor de empalme potencial TLS" . La revista de química biológica . 273 (9): 4838–42. doi : 10.1074 / jbc.273.9.4838 . PMID 9478924 .
- ^ Kameoka S, Duque P, Konarska MM (abril de 2004). "p54 (nrb) se asocia con el sitio de empalme 5 'dentro de grandes complejos de transcripción / empalme" . El diario EMBO . 23 (8): 1782–91. doi : 10.1038 / sj.emboj.7600187 . PMC 394241 . PMID 15057275 .
- ^ Kowalska E, Ripperger JA, Hoegger DC, Bruegger P, Buch T, Birchler T, Mueller A, Albrecht U, Contaldo C, Brown SA (enero de 2013). "NONO acopla el reloj circadiano al ciclo celular" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 110 (5): 1592–9. doi : 10.1073 / pnas.1213317110 . PMC 3562797 . PMID 23267082 .
- ^ Ong SA, Tan JJ, Tew WL, Chen KS (1 de enero de 2011). "Rasd1 modula la función coactivadora de NonO en la vía del AMP cíclico" . PLOS ONE . 6 (9): e24401. doi : 10.1371 / journal.pone.0024401 . PMC 3168489 . PMID 21915321 .
- ^ a b Zhang Z, Carmichael GG (agosto de 2001). "El destino del dsRNA en el núcleo: un complejo que contiene p54 (nrb) media la retención nuclear de los RNA editados promiscuamente A-to-I". Celular . 106 (4): 465–75. doi : 10.1016 / S0092-8674 (01) 00466-4 . PMID 11525732 .
- ^ "NONO - Proteína de unión al octámero que no contiene dominio POU - Homo sapiens (humano) - Gen y proteína NONO" . www.uniprot.org . Consultado el 14 de octubre de 2016 .
- ^ a b Schiffner S, Zimara N, Schmid R, Bosserhoff AK (agosto de 2011). "p54nrb es un nuevo regulador de la progresión del melanoma maligno" . Carcinogénesis . 32 (8): 1176–82. doi : 10.1093 / carcin / bgr103 . PMID 21642354 .
- ^ Pavao M, Huang YH, Hafer LJ, Moreland RB, Traish AM (1 de enero de 2001). "Inmunodetección de isoformas nmt55 / p54nrb en cáncer de mama humano" . BMC Cancer . 1 : 15. doi : 10.1186 / 1471-2407-1-15 . PMC 59838 . PMID 11710964 .
- ^ Mircsof D, Langouët M, Rio M, Moutton S, Siquier-Pernet K, Bole-Feysot C, et al. (Diciembre de 2015). "Las mutaciones en NONO conducen a discapacidad intelectual sindrómica y defectos sinápticos inhibitorios" . Neurociencia de la naturaleza . 18 (12): 1731–6. doi : 10.1038 / nn.4169 . PMC 5392243 . PMID 26571461 .
- ^ Reinstein E, Tzur S, Cohen R, Bormans C, Behar DM (noviembre de 2016). "Discapacidad intelectual y miocardiopatía no compactada con una mutación de novo NONO identificada por secuenciación del exoma" . Revista europea de genética humana . 24 (11): 1635–1638. doi : 10.1038 / ejhg.2016.72 . PMC 5110068 . PMID 27329731 .
- ^ a b Scott DA, Hernandez-Garcia A, Azamian MS, Jordan VK, Kim BJ, Starkovich M, et al. (Enero de 2017). "Defectos cardíacos congénitos y no compactación del ventrículo izquierdo en varones con variantes de pérdida de función en NONO". Revista de Genética Médica . 54 (1): 47–53. doi : 10.1136 / jmedgenet-2016-104039 . PMID 27550220 .
- ^ Fox AH, Bond CS, Lamond AI (noviembre de 2005). "P54nrb forma un heterodímero con PSP1 que se localiza en paraspeckles de una manera dependiente del ARN" . Biología molecular de la célula . 16 (11): 5304-15. doi : 10.1091 / mbc.E05-06-0587 . PMC 1266428 . PMID 16148043 .
- ^ Knott GJ, Bond CS, Fox AH (mayo de 2016). "Las proteínas DBHS SFPQ, NONO y PSPC1: un andamio molecular polivalente" . Investigación de ácidos nucleicos . 44 (9): 3989–4004. doi : 10.1093 / nar / gkw271 . PMC 4872119 . PMID 27084935 .
- ^ Fox AH, Lamond AI (julio de 2010). "Paraspeckles" . Perspectivas de Cold Spring Harbor en biología . 2 (7): a000687. doi : 10.1101 / cshperspect.a000687 . PMC 2890200 . PMID 20573717 .
- ^ Kanai Y, Dohmae N, Hirokawa N (agosto de 2004). "Kinesin transporta ARN: aislamiento y caracterización de un gránulo transportador de ARN". Neurona . 43 (4): 513-25. doi : 10.1016 / j.neuron.2004.07.022 . PMID 15312650 .
Otras lecturas
- Shav-Tal Y, Zipori D (noviembre de 2002). "PSF y p54 (nrb) / NonO - proteínas nucleares multifuncionales" . Cartas FEBS . 531 (2): 109-14. doi : 10.1016 / S0014-5793 (02) 03447-6 . PMID 12417296 .
- Zhang WW, Zhang LX, Busch RK, Farrés J, Busch H (febrero de 1993). "Purificación y caracterización de un heterodímero de unión a ADN de 52 y 100 kDa de células HeLa" . La revista bioquímica . 290 (Parte 1): 267–72. doi : 10.1042 / bj2900267 . PMC 1132410 . PMID 8439294 .
- Hallier M, Tavitian A, Moreau-Gachelin F (mayo de 1996). "El factor de transcripción Spi-1 / PU.1 se une al ARN e interfiere con la proteína de unión al ARN p54nrb" . La revista de química biológica . 271 (19): 11177–81. doi : 10.1074 / jbc.271.19.11177 . PMID 8626664 .
- Peters U, Haberhausen G, Kostrzewa M, Nolte D, Müller U (octubre de 1997). "AFX1 y p54nrb: mapeo fino, estructura genómica y exclusión como genes candidatos del parkinsonismo de distonía ligada a X". Genética humana . 100 (5–6): 569–72. doi : 10.1007 / s004390050553 . PMID 9341872 .
- Clark J, Lu YJ, Sidhar SK, Parker C, Gill S, Smedley D, Hamoudi R, Linehan WM, Shipley J, Cooper CS (octubre de 1997). "Fusión de genes del factor de empalme PSF y NonO (p54nrb) al gen TFE3 en el carcinoma papilar de células renales" . Oncogén . 15 (18): 2233–9. doi : 10.1038 / sj.onc.1201394 . PMID 9393982 .
- Straub T, Grue P, Uhse A, Lisby M, Knudsen BR, Tange TO, Westergaard O, Boege F (octubre de 1998). "El factor de empalme de ARN PSF / p54 controla la actividad de la ADN-topoisomerasa I mediante una interacción directa" . La revista de química biológica . 273 (41): 26261–4. doi : 10.1074 / jbc.273.41.26261 . PMID 9756848 .
- Karhumaa P, Parkkila S, Waheed A, Parkkila AK, Kaunisto K, Tucker PW, Huang CJ, Sly WS, Rajaniemi H (mayo de 2000). "La proteína Nuclear NonO / p54 (nrb) es una anhidrasa carbónica no clásica" . La revista de química biológica . 275 (21): 16044–9. doi : 10.1074 / jbc.275.21.16044 . PMID 10821857 .
- Straub T, Knudsen BR, Boege F (junio de 2000). "PSF / p54 (nrb) estimula el" salto "de la ADN topoisomerasa I entre hélices de ADN separadas". Bioquímica . 39 (25): 7552–8. doi : 10.1021 / bi992898e . PMID 10858305 .
- Mathur M, Tucker PW, Samuels HH (abril de 2001). "PSF es un correpresor novedoso que media su efecto a través de Sin3A y el dominio de unión al ADN de los receptores de hormonas nucleares" . Biología Molecular y Celular . 21 (7): 2298–311. doi : 10.1128 / MCB.21.7.2298-2311.2001 . PMC 86864 . PMID 11259580 .
- Zhang Z, Carmichael GG (agosto de 2001). "El destino del dsRNA en el núcleo: un complejo que contiene p54 (nrb) media la retención nuclear de los RNA editados promiscuamente A-to-I". Celular . 106 (4): 465–75. doi : 10.1016 / S0092-8674 (01) 00466-4 . PMID 11525732 .
- Pavao M, Huang YH, Hafer LJ, Moreland RB, Traish AM (2001). "Inmunodetección de isoformas nmt55 / p54nrb en cáncer de mama humano" . BMC Cancer . 1 : 15. doi : 10.1186 / 1471-2407-1-15 . PMC 59838 . PMID 11710964 .
- Andersen JS, Lyon CE, Fox AH, Leung AK, Lam YW, Steen H, Mann M, Lamond AI (enero de 2002). "Análisis proteómico dirigido del nucleolo humano". Biología actual . 12 (1): 1–11. doi : 10.1016 / S0960-9822 (01) 00650-9 . PMID 11790298 .
- Sewer MB, Nguyen VQ, Huang CJ, Tucker PW, Kagawa N, Waterman MR (abril de 2002). "La activación transcripcional de CYP17 humano en células adrenocorticales H295R depende de la formación de complejos entre p54 (nrb) / NonO, factor de empalme asociado a proteínas y SF-1, un complejo que también participa en la represión de la transcripción" . Endocrinología . 143 (4): 1280–90. doi : 10.1210 / es.143.4.1280 . PMID 11897684 .
- Ohta S, Shiomi Y, Sugimoto K, Obuse C, Tsurimoto T (octubre de 2002). "Un enfoque proteómico para identificar proteínas de unión al antígeno nuclear celular proliferante (PCNA) en lisados de células humanas. Identificación del complejo CHL12 / RFCs2-5 humano como una nueva proteína de unión a PCNA" . La revista de química biológica . 277 (43): 40362–7. doi : 10.1074 / jbc.M206194200 . PMID 12171929 .
- Emili A, Shales M, McCracken S, Xie W, Tucker PW, Kobayashi R, Blencowe BJ, Ingles CJ (septiembre de 2002). "Splicing y proteínas asociadas a la transcripción PSF y p54nrb / nonO se unen a la RNA polimerasa II CTD" . ARN . 8 (9): 1102-11. doi : 10.1017 / S1355838202025037 . PMC 1370324 . PMID 12358429 .
- Peng R, Dye BT, Pérez I, Barnard DC, Thompson AB, Patton JG (octubre de 2002). "PSF y p54nrb se unen a un tallo conservado en U5 snRNA" . ARN . 8 (10): 1334–47. doi : 10.1017 / S1355838202022070 . PMC 1370341 . PMID 12403470 .