Nitrospirae es un filo de bacterias. Contiene solo una clase, Nitrospira , que a su vez contiene un orden ( Nitrospirales ) y una familia ( Nitrospiraceae ). Incluye múltiples géneros, como Nitrospira , el más grande. El primer miembro de este filo, Nitrospira marina , fue descubierto en 1985. [1] El segundo miembro, Nitrospira moscoviensis , fue descubierto en 1995. [2] [3]
Nitrospirae | |
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clasificación cientifica | |
Dominio: | |
Filo: | Nitrospirae Garrity y Holt 2001 |
Clase y orden | |
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Sinónimos | |
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Las nitrospirae contienen taxones nitrificantes que oxidan el nitrito a nitrato (bacteria oxidante de nitrito, NOB [4] ) y la bacteria commamox Nitrospira inopinata descubierta en 2015 [5] [6] y cultivada en 2017. [7]
Filogenia
Lanzamiento 132 de LTP basado en ARNr 16S por The All-Species Living Tree Project [8] | Annotree v1.2.0 [9] [10] que utiliza GTDB 05-RS95 ( Base de datos de taxonomía del genoma ) [11] [12] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Taxonomía
La taxonomía actualmente aceptada se basa en la Lista de nombres procariotas con posición en la nomenclatura (LSPN) [13] y el Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI). [3]
- Phylum " Nitrospirae " Garrity & Holt 2001
- Corrig del género " Candidatus Troglogloea " . Kostanjsek y col. 2013
- Especie " Ca. T. absolonii " corrig. Kostanjsek y col. 2013
- Clase " Leptospirillia "
- Orden " Leptospirillales "
- Familia " Leptospirillaceae " Cavalier-Smith 2020
- Género Leptospirillum Markosyan 1972 ex Hippe 2000
- Especie " L. ferrodiazotrophum " Tyson et al. 2005
- Especie L. ferriphilum Coram & Rawlings 2002
- Especie L. ferrooxidans Markosyan 1972 ex Hippe 2000
- Especie " L. rubarum " Aliaga Goltsman et al. 2009
- Especie L. thermoferrooxidans Hippe 2000
- Género Leptospirillum Markosyan 1972 ex Hippe 2000
- Familia " Leptospirillaceae " Cavalier-Smith 2020
- Orden " Leptospirillales "
- Clase Nitrospiria Oren et al. 2015
- Género " Candidatus Manganitrophus " Yu & Leadbetter 2020
- Especie " Ca. M. noduliformans " Yu & Leadbetter 2020
- Orden " Nitrospirales " Garrity & Holt 2001
- Familia " Nitrospiraceae " Garrity & Holt 2001
- Género Nitrospira Watson et al. 1986
- Especie " Ca. N. alkalitolerans " Daebeler et al. 2020
- Especie " Ca. N. bockiana " Lebedeva et al. 2008
- Especie " Ca. N. inopinata " Daims et al. 2015
- Especie " Ca. N. kreftii " Sakoula et al. 2021
- Especie " Ca. N. nitrificans " van Kessel et al. 2015
- Especie " Ca. N. nitrosa " van Kessel et al. 2015
- Especie " Ca. N. salsa " Haaijer et al. 2013
- Especie N. calida Lebedeva et al. 2011
- Especie N. defluvii Nowka et al. 2015
- Especie N. japonica Ushiki et al. 2013
- Especie N. lenta Nowka et al. 2015
- Especie N. marina Watson et al. 1986 (tipo sp.)
- Especie N. moscoviensis Ehrich et al. 1995
- Género Nitrospira Watson et al. 1986
- Familia " Nitrospiraceae " Garrity & Holt 2001
- Género " Candidatus Manganitrophus " Yu & Leadbetter 2020
- Clase Thermodesulfovibrionia Umezawa et al. 2021
- Orden " Thermodesulfovibrionales " Umezawa et al. 2021
- Género " Candidatus Sulfobium " Zecchin et al. 2018
- Especie " Ca. S. mesophilum " Zecchin et al. 2018
- Familia " " Dissulfurispiraceae " Umezawa et al. 2021
- Género " Dissulfurispira " Umezawa et al. 2021
- Especie " D. thermophila " Umezawa et al. 2021
- Género " Dissulfurispira " Umezawa et al. 2021
- Familia " Magnetobacteriaceae "
- Género " Candidatus Magnetobacterium " Spring et al. 1993
- Especie " Ca. M. bavaricum " Spring et al. 1993
- Especie " Ca. M. casensis " Lin et al. 2014
- Género " Candidatus Magnetoovum " Lefevre et al. 2011
- Especie " Ca. M. mohavensis " Lefevre et al. 2011
- Especie " Ca. M. chiemensis " Kolinko 2014
- Género " Candidatus Magnetobacterium " Spring et al. 1993
- Familia " Thermodesulfovibrionaceae " Umezawa et al. 2021
- Género Thermodesulfovibrio Henry et al. 1994 enmienda. Sekiguchi y col. 2008
- Especie T. aggregans Sekiguchi et al. 2008
- Especies T. hydrogeniphilus Haouari et al. 2009
- Especie T. islandicus Sonne-Hansen y Ahring 2000
- Especie T. thiophilus Sekiguchi et al. 2008
- Especie T. yellowstonii Henry et al. 1994 (tipo sp.)
- Género Thermodesulfovibrio Henry et al. 1994 enmienda. Sekiguchi y col. 2008
- Género " Candidatus Sulfobium " Zecchin et al. 2018
- Orden " Thermodesulfovibrionales " Umezawa et al. 2021
- Corrig del género " Candidatus Troglogloea " . Kostanjsek y col. 2013
Ver también
- Nitrospira
- Nitrosomonas
- Nitrobacteraceae
- Nitrobacter
- Ciclo del nitrógeno
- Nitrito
- Nitrato
- Lista de órdenes bacterianas
- Comammox
Referencias
- ^ Watson SW, Bock E, Valois FW, Waterbury JB, Schlosser U (1986). "Nitrospira marina gen. Nov. Sp. Nov .: una bacteria oxidante de nitrito quimiolitotrófica". Arch Microbiol . 144 (1): 1–7. doi : 10.1007 / BF00454947 . S2CID 29796511 .
- ^ Ehrich S, Behrens D, Lebedeva E, Ludwig W, Bock E (julio de 1995). "Una nueva bacteria oxidante de nitritos, quimiolitoautotrófica obligada, Nitrospira moscoviensis sp. Nov. Y su relación filogenética". Archivos de Microbiología . 164 (1): 16–23. doi : 10.1007 / BF02568729 . PMID 7646315 . S2CID 2702110 .
- ^ a b Sayers. "Nitrospirae" . Base de datos de taxonomía del Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI) . Consultado el 20 de marzo de 2016 .
- ^ Daims H, Nielsen JL, Nielsen PH, Schleifer KH, Wagner M (noviembre de 2001). "Caracterización in situ de bacterias oxidantes de nitritos similares a Nitrospira activas en plantas de tratamiento de aguas residuales" . Microbiología aplicada y ambiental . 67 (11): 5273–84. doi : 10.1128 / AEM.67.11.5273-5284.2001 . PMC 93301 . PMID 11679356 .
- ^ Daims H, Lebedeva EV, Pjevac P, Han P, Herbold C, Albertsen M, et al. (Diciembre de 2015). "Nitrificación completa por bacterias Nitrospira" . Naturaleza . 528 (7583): 504–9. Código Bibliográfico : 2015Natur.528..504D . doi : 10.1038 / nature16461 . PMC 5152751 . PMID 26610024 .
- ^ van Kessel MA, Speth DR, Albertsen M, Nielsen PH, Op den Camp HJ, Kartal B, et al. (Diciembre de 2015). "Nitrificación completa por un solo microorganismo" . Naturaleza . 528 (7583): 555–9. Código Bib : 2015Natur.528..555V . doi : 10.1038 / nature16459 . PMC 4878690 . PMID 26610025 .
- ^ Kits KD, Sedlacek CJ, Lebedeva EV, Han P, Bulaev A, Pjevac P, et al. (Septiembre de 2017). "El análisis cinético de un nitrificante completo revela un estilo de vida oligotrófico" . Naturaleza . 549 (7671): 269–272. Código bibliográfico : 2017Natur.549..269K . doi : 10.1038 / nature23679 . PMC 5600814 . PMID 28847001 .
- ^ Proyecto de árbol vivo de todas las especies . "Lanzamiento 132 de LTP basado en ARNr 16S" . Base de datos completa de ARN ribosómico de Silva . Consultado el 20 de agosto de 2015 .
- ^ "AnnoTree v1.2.0" . AnnoTree .
- ^ Mendler, K; Chen, H; Parks, DH; Hug, LA; Doxey, AC (2019). "AnnoTree: visualización y exploración de un árbol de la vida microbiano anotado funcionalmente" . Investigación de ácidos nucleicos . 47 (9): 4442–4448. doi : 10.1093 / nar / gkz246 . PMC 6511854 . PMID 31081040 .
- ^ "GTDB release 05-RS95" . Base de datos de taxonomía del genoma .
- ^ Parks, DH; Chuvochina, M; Chaumeil, PA; Rinke, C; Mussig, AJ; Hugenholtz, P (septiembre de 2020). "Una taxonomía completa de dominio a especie para bacterias y arqueas" . Biotecnología de la naturaleza . 38 (9): 1079–1086. bioRxiv 10.1101 / 771964 . doi : 10.1038 / s41587-020-0501-8 . PMID 32341564 . S2CID 216560589 .
- ^ Euzéby JP. " " Nitrospirae " " . Lista de nombres procariotas con posición en nomenclatura (LPSN) . Consultado el 20 de marzo de 2016 .
Otras lecturas
- Lefèvre CT, Frankel RB, Abreu F, Lins U, Bazylinski DA (febrero de 2011). "Caracterización independiente de la cultura de un miembro magnetotáctico novedoso, inculto del filo Nitrospirae" . Microbiología ambiental . 13 (2): 538–49. doi : 10.1111 / j.1462-2920.2010.02361.x . PMID 20977572 .
enlaces externos
- " Leptospirillum sp" .