La ARN polimerasa dirigida por ADN, mitocondrial, es una enzima que en los seres humanos está codificada por el gen POLRMT . [5] [6]
POLRMT | |||||||||||||||||||||||||
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Identificadores | |||||||||||||||||||||||||
Alias | POLRMT , APOLMT, MTRNAP, MTRPOL, h-mtRPOL, polimerasa (ARN) mitocondrial, ARN polimerasa mitocondrial | ||||||||||||||||||||||||
Identificaciones externas | OMIM : 601778 MGI : 1915843 HomoloGene : 37996 GeneCards : POLRMT | ||||||||||||||||||||||||
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Ortólogos | |||||||||||||||||||||||||
Especies | Humano | Ratón | |||||||||||||||||||||||
Entrez |
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Ensembl |
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UniProt |
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RefSeq (ARNm) |
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RefSeq (proteína) |
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Ubicación (UCSC) | Crónicas 19: 0,62 - 0,63 Mb | 10: 79,74 - 79,75 Mb | |||||||||||||||||||||||
Búsqueda en PubMed | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Wikidata | |||||||||||||||||||||||||
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Función
Este gen codifica una ARN polimerasa dirigida por ADN mitocondrial . El producto génico es responsable de la expresión del gen mitocondrial, así como de proporcionar cebadores de ARN para el inicio de la replicación del genoma mitocondrial. Aunque este polipéptido tiene la misma función que las tres ARN polimerasas nucleares dirigidas por ADN, está más estrechamente relacionado con las ARN polimerasas de bacteriófagos (incluida la ARN polimerasa T7 ), las polimerasas mitocondriales de eucariotas inferiores y las RpoT polimerasas cloroplásticas. [6]
Estructura
Se ha resuelto la estructura de la enzima. Presenta una estructura general similar a la del fago RNAP, pero el mecanismo de iniciación es diferente porque requiere factores de iniciación TFAM (solo en mamíferos) y TFB2M . [7] El alargamiento requiere el factor de alargamiento TEFM . [8] El proceso de terminación exacto es menos conocido, pero se cree que MTERF1 juega un papel. [9]
Referencias
- ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000099821 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000020329 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ Tiranti V, Savoia A, Forti F, D'Apolito MF, Centra M, Rocchi M, Zeviani M (julio de 1997). "Identificación del gen que codifica la ARN polimerasa mitocondrial humana (h-mtRPOL) mediante el cribado cibernético de la base de datos de etiquetas de secuencia expresada" . Hum Mol Genet . 6 (4): 615-25. doi : 10.1093 / hmg / 6.4.615 . PMID 9097968 .
- ^ a b "Entrez Gene: POLRMT polimerasa (ARN) mitocondrial (ADN dirigido)" .
- ^ Hillen, HS; Morozov, YI; Sarfallah, A; Temiakov, D; Cramer, P (16 de noviembre de 2017). "Base estructural de la iniciación de la transcripción mitocondrial" . Celular . 171 (5): 1072–1081.e10. doi : 10.1016 / j.cell.2017.10.036 . PMC 6590061 . PMID 29149603 .
- ^ Hillen, Hauke S .; Parshin, Andrey V .; Agaronyan, Karen; Morozov, Yaroslav I .; Graber, James J .; Chernev, Aleksandar; Schwinghammer, Kathrin; Urlaub, Henning; Anikin, Michael; Cramer, Patrick; Temiakov, Dmitry (noviembre de 2017). "Mecanismo de transcripción anti-terminación en mitocondrias humanas" . Celular . 171 (5): 1082–1093.e13. doi : 10.1016 / j.cell.2017.09.035 . PMC 5798601 . PMID 29033127 .
- ^ D'Souza, AR; Minczuk, M (20 de julio de 2018). "Transcripción y traducción mitocondrial: descripción general" . Ensayos de bioquímica . 62 (3): 309–320. doi : 10.1042 / EBC20170102 . PMC 6056719 . PMID 30030363 .
Otras lecturas
- Maruyama K, Sugano S (1994). "Oligo-taponamiento: un método simple para reemplazar la estructura de la tapa de los ARNm eucariotas con oligoribonucleótidos". Gene . 138 (1–2): 171–4. doi : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90802-8 . PMID 8125298 .
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, et al. (1997). "Construcción y caracterización de una biblioteca de ADNc enriquecida en longitud completa y enriquecida en el extremo 5 '". Gene . 200 (1–2): 149–56. doi : 10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3 . PMID 9373149 .
- Falkenberg M , Gaspari M, Rantanen A y col. (2002). "Los factores de transcripción mitocondrial B1 y B2 activan la transcripción del ADNmt humano". Nat. Genet . 31 (3): 289–94. doi : 10.1038 / ng909 . PMID 12068295 . S2CID 11164308 .
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH y col. (2003). "Generación y análisis inicial de más de 15.000 secuencias de ADNc humano y de ratón de longitud completa" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. Código Bibliográfico : 2002PNAS ... 9916899M . doi : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
- McCulloch V, Shadel GS (2003). "El factor de transcripción mitocondrial humano B1 interactúa con la región de activación C-terminal de h-mtTFA y estimula la transcripción independientemente de su actividad de ARN metiltransferasa" . Mol. Célula. Biol . 23 (16): 5816–24. doi : 10.1128 / MCB.23.16.5816-5824.2003 . PMC 166325 . PMID 12897151 .
- Grimwood J, Gordon LA, Olsen A, et al. (2004). "La secuencia del ADN y la biología del cromosoma humano 19" . Naturaleza . 428 (6982): 529–35. Código Bibliográfico : 2004Natur.428..529G . doi : 10.1038 / nature02399 . PMID 15057824 .
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- Gaspari M, Falkenberg M, Larsson NG, Gustafsson CM (2005). "La ARN polimerasa mitocondrial contribuye de manera crítica a la especificidad del promotor en células de mamíferos" . EMBO J . 23 (23): 4606-14. doi : 10.1038 / sj.emboj.7600465 . PMC 533051 . PMID 15526033 .
- Kravchenko JE, Rogozin IB, Koonin EV, Chumakov PM (2005). "Transcripción de ARN mensajeros de mamíferos por una ARN polimerasa nuclear de origen mitocondrial" . Naturaleza . 436 (7051): 735–9. Código bibliográfico : 2005Natur.436..735K . doi : 10.1038 / nature03848 . PMC 1352165 . PMID 16079853 .
- Wang Z, Cotney J, Shadel GS (2007). "La proteína ribosomal mitocondrial humana MRPL12 interactúa directamente con la ARN polimerasa mitocondrial para modular la expresión del gen mitocondrial" . J. Biol. Chem . 282 (17): 12610–8. doi : 10.1074 / jbc.M700461200 . PMC 2606046 . PMID 17337445 .
enlaces externos
- Resumen de toda la información estructural disponible en el PDB para UniProt : O00411 (ARN polimerasa dirigida por ADN humano, mitocondrial (POLRMT)) en el PDBe-KB .