La protoporfirinógeno oxidasa o protox es una enzima que en los seres humanos está codificada por el gen PPOX . [5] [6] [7]
PPOX | |||||||||||||||||||||||||
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Identificadores | |||||||||||||||||||||||||
Alias | PPOX , PPO, V290M, VP, protoporfirinógeno oxidasa | ||||||||||||||||||||||||
Identificaciones externas | OMIM : 600923 MGI : 104968 HomoloGene : 262 GeneCards : PPOX | ||||||||||||||||||||||||
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Ortólogos | |||||||||||||||||||||||||
Especies | Humano | Ratón | |||||||||||||||||||||||
Entrez |
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Ensembl |
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UniProt |
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Ubicación (UCSC) | Crónicas 1: 161,17 - 161,18 Mb | Crónicas 1: 171,28 - 171,28 Mb | |||||||||||||||||||||||
Búsqueda en PubMed | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Wikidata | |||||||||||||||||||||||||
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protoporfirinógeno oxidasa | ||||||||
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Identificadores | ||||||||
CE no. | 1.3.3.4 | |||||||
No CAS. | 53986-32-6 | |||||||
Bases de datos | ||||||||
IntEnz | Vista IntEnz | |||||||
BRENDA | Entrada BRENDA | |||||||
FÁCIL | NiceZyme vista | |||||||
KEGG | Entrada KEGG | |||||||
MetaCyc | camino metabólico | |||||||
PRIAM | perfil | |||||||
Estructuras PDB | RCSB PDB PDBe PDBsum | |||||||
Ontología de genes | AmiGO / QuickGO | |||||||
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La protoporfirinógeno oxidasa es responsable del séptimo paso en la biosíntesis de protoporfirina IX . Esta porfirina es la precursora de la hemoglobina , el portador de oxígeno en los animales, y la clorofila, el tinte en las plantas. La enzima cataliza la deshidrogenación (eliminación de átomos de hidrógeno ) del protoporfirinógeno IX (el producto del sexto paso en la producción de hemo) para formar protoporfirina IX. Una enzima adicional debe modificar la protoporfirina IX antes de que se convierta en hemo. La inhibición de esta enzima es una estrategia utilizada en ciertos herbicidas .
Gene
El gen PPOX está ubicado en el brazo largo (q) del cromosoma 1 en la posición 22, desde el par de bases 157,949,266 al par de bases 157,954,082.
Función
Este gen codifica la penúltima enzima de la biosíntesis del hemo, que cataliza la oxidación de 6 electrones del protoporfirinógeno IX para formar protoporfirina IX . Esta proteína es una flavoproteína asociada con la superficie externa de la membrana mitocondrial interna . [7]
Vía biosintética del hemo
Los siguientes genes codifican enzimas que catalizan los distintos pasos de la vía biosintética del hemo :
- ALAD : aminolevulinato, delta-, deshidratasa
- ALAS1 : aminolevulinato, delta-, sintasa 1
- ALAS2 : aminolevulinato, delta-, sintasa 2 (anemia sideroblástica / hipocrómica)
- CPOX : coproporfirinógeno oxidasa
- FECH : ferroquelatasa (protoporfiria)
- HMBS : hidroximetilbilano sintasa
- PPOX : protoporfirinógeno oxidasa
- UROD : uroporfirinógeno descarboxilasa
- UROS : uroporfirinógeno III sintasa (porfiria eritropoyética congénita)
Significación clínica
La porfiria variegada es causada por mutaciones en el gen PPOX. Se han identificado más de 100 mutaciones que pueden causar porfiria variegada en el gen PPOX. Una mutación, una sustitución del aminoácido triptófano por arginina en la posición 59 (también escrita como Arg59Trp o R59W), se encuentra en aproximadamente el 95 por ciento de las familias sudafricanas con porfiria variegada. Las mutaciones en el gen PPOX reducen la actividad de la enzima producida por el gen, lo que permite que los subproductos de la producción de hemo se acumulen en el cuerpo. Esta acumulación, en combinación con factores no genéticos (como ciertas drogas, alcohol y dietas), causa este tipo de porfiria.
Inhibidores como herbicidas
La inhibición de la protoporfirinógeno oxidasa es un mecanismo de acción de varios herbicidas comerciales, incluidos los éteres de nitrofenilo acifluorfeno y fomesafeno y las pirimidindionas butafenacilo y saflufenacilo . Los síntomas visibles del tratamiento son clorosis y desecación . El daño es causado por una acumulación de protoporfirina IX en las células vegetales. Este es un potente fotosensibilizador que activa el oxígeno, lo que conduce a la peroxidación de lípidos . Se requiere luz y oxígeno para que este proceso mate la planta. [8] [9] [10]
Ver también
- Porfirina
Referencias
- ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000143224 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000062729 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ Taketani S, Inazawa J, Abe T, Furukawa T, Kohno H, Tokunaga R, et al. (Octubre de 1995). "El gen de la protoporfirinógeno oxidasa humana (PPOX): organización y ubicación del cromosoma 1". Genómica . 29 (3): 698–703. doi : 10.1006 / geno.1995.9949 . PMID 8575762 .
- ^ Frank J, McGrath JA, Poh-Fitzpatrick MB, Hawk JL, Christiano AM (julio de 1999). "Las mutaciones en el codón de iniciación de la traducción del gen de la protoporfirinógeno oxidasa subyacen a la porfiria variegada". Dermatología clínica y experimental . 24 (4): 296-301. doi : 10.1046 / j.1365-2230.1999.00484.x . PMID 10457135 . S2CID 40509390 .
- ^ a b "Entrez Gene: PPOX protoporfirinógeno oxidasa" .
- ^ Dayan FE, Reddy KN, Duke SO (1999). "Relaciones estructura-actividad de difenil éteres y otros inhibidores de protoporfirinógeno oxidasa con puentes de oxígeno". Herbicidas peroxidantes . págs. 141-161. doi : 10.1007 / 978-3-642-58633-0_5 . ISBN 978-3-642-63674-5.
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- ^ Dayan, Franck E .; Duke, Stephen O. (2010). "Herbicidas inhibidores de protoporfirinógeno oxidasa". Manual de toxicología de plaguicidas de Hayes . págs. 1733-1751. doi : 10.1016 / B978-0-12-374367-1.00081-1 . ISBN 9780123743671.
Otras lecturas
- Elder GH (1998). "Defectos genéticos en las porfirias: tipos y significado". Clínicas en Dermatología . 16 (2): 225–33. doi : 10.1016 / S0738-081X (97) 00202-2 . PMID 9554235 .
- Maneli MH, Corrigall AV, Klump HH, Davids LM, Kirsch RE, Meissner PN (agosto de 2003). "Caracterización cinética y física de protoporfirinógeno oxidasas humanas mutantes y de tipo salvaje recombinante". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Proteínas y proteómica . 1650 (1–2): 10–21. doi : 10.1016 / s1570-9639 (03) 00186-9 . PMID 12922165 .
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enlaces externos
- PDBe-KB proporciona una descripción general de toda la información de estructura disponible en el PDB para la protoporfirinógeno oxidasa humana