El panel de líneas celulares cancerosas NCI-60 es un grupo de 60 líneas celulares cancerosas humanas utilizadas por el Instituto Nacional del Cáncer (NCI) para el cribado de compuestos para detectar una posible actividad anticancerígena. [1]
Propósito
El procedimiento de detección se denomina Detección de líneas celulares tumorales humanas NCI-60 y es uno de los Servicios de descubrimiento y desarrollo del Programa de Terapéutica del Desarrollo (DTP) del NCI . [2] [3] [4] Las tasas de detección para cada línea celular el impacto citostático y citotóxico de las sustancias analizadas. [2]
Debido a la diversidad de las líneas celulares, es posible comparar los compuestos probados por sus patrones de efecto, correspondiendo potencialmente una alta correlación a mecanismos de efecto similares. [2] Una comparación automatizada con una base de datos de más de 88.000 compuestos puros y más de 34.000 extractos crudos (al 6 de enero de 2017[actualizar]) es proporcionada por la herramienta COMPARE , que muestra una lista de sustancias clasificadas por los coeficientes de correlación de Pearson para una sustancia de prueba determinada. [5]
El mismo panel se utiliza en el Programa de Dianas Moleculares para la caracterización de dianas moleculares. Las mediciones incluyen niveles de proteínas, mediciones de ARN, estado de mutación y niveles de actividad enzimática . [6]
Líneas celulares
El panel contiene líneas celulares que representan leucemia , melanoma , carcinoma de pulmón de células no pequeñas y cánceres de cerebro , ovario , mama , colon , riñón y próstata . [1] [2]
Se evalúan 13 líneas celulares adicionales para su uso en el programa de cribado, entre ellas dos líneas derivadas de carcinoma de pulmón microcítico no representado hasta ahora . [1]
Todas las líneas celulares excepto una (al 6 de enero de 2017[actualizar]) están disponibles para otros laboratorios, incluidas las líneas celulares adicionales. [1]
Identificación errónea y clasificación errónea
A partir del cambio de milenio, se descubrió que varias líneas celulares estaban mal identificadas o mal clasificadas en el momento de la investigación o antes: [7] [8] [9]
MDA-MB-435 , originalmente clasificada como línea celular de cáncer de mama, se identificó como una línea celular de melanoma. [7] Cuando se investigó más a fondo, el MDA-MB-435 actual parecía derivar del mismo individuo que la línea celular M14 . [7] Un examen de los clones dejó en claro que la confusión con M14 ocurrió muy temprano en la historia de MDA-MB-435, antes de su establecimiento en el Programa de Terapéutica del Desarrollo. [7]
NCI / ADR-RES , originalmente clasificada como línea celular de cáncer de mama, se identificó como una línea celular de tumor de ovario. [8] NCI / ADR-RES parece haberse derivado en algún momento de la línea celular OVCAR-8 . [8] Originalmente, la línea celular se llamaba MCF-7 / ADR-RES ; se le cambió el nombre junto con el cambio de clasificación. [8]
Se descubrió que dos líneas celulares de cáncer de cerebro, SNB-19 y U251 , provienen de la misma persona. [9] Esto hace probable una confusión.
Se ha confirmado que una 61ª línea celular, MDA-N , se deriva de la línea celular MDA-MB-435 clasificada erróneamente. [7] Por lo tanto, también está mal clasificado, en realidad es una línea celular de melanoma, pero a partir del 6 de enero de 2018[actualizar]el sitio web oficial todavía lo enumera como línea celular de cáncer de mama. [1] Esta línea celular no está disponible a partir del 6 de enero de 2018.[actualizar]. [1]
El Comité Internacional de Autenticación de Líneas Celulares mantiene una lista de líneas celulares contaminadas . [10] Incluye las líneas celulares informadas anteriormente, aunque generalmente con fechas de informes y artículos considerablemente posteriores a las primeras fechas y artículos que generan una preocupación específica con respecto a la línea celular respectiva. [10] [7] [8] [9]
Uso continuado de clasificación incorrecta
A partir de 2014[actualizar]Cientos de estudios de investigación todavía usan MDA-MB-435 como modelo de cáncer de mama, incluso después de que se declarara oficialmente como una línea celular de melanoma en 2007, e incluso en revistas internacionales revisadas por pares de mayor calificación. [11] Lo mismo ocurre con otras líneas celulares mal identificadas. [11]
Lista de líneas celulares NCI-60
Línea celular | Clasificación de tumores | (Potencialmente) mal identificado | Clasificación original | Indisponible | Tiempo de duplicación (horas) | Densidad de inoculación | Identificador y enlace de Cellosaurus |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CCRF-CEM | Leucemia | 26,7 | 40000 | CCRF-CEM (RRID: CVCL_0207) | |||
HL-60 (TB) | Leucemia | 28,6 | 40000 | HL-60 (TB) (RRID: CVCL_A794) | |||
K-562 | Leucemia | 19,6 | 5000 | K-562 (RRID: CVCL_0004) | |||
MOLT-4 | Leucemia | 27,9 | 30000 | MOLT-4 (RRID: CVCL_0013) | |||
RPMI-8226 | Leucemia | 33,5 | 20000 | RPMI-8226 (RRID: CVCL_0014) | |||
SR | Leucemia | 28,7 | 20000 | SR (RRID: CVCL_1711) | |||
A549 / ATCC | Pulmón de células no pequeñas | 22,9 | 7500 | A-549 (RRID: CVCL_0023) | |||
EKVX | Pulmón de células no pequeñas | 43,6 | 20000 | EKVX (RRID: CVCL_1195) | |||
HOP-62 | Pulmón de células no pequeñas | 39 | 10000 | HOP-62 (RRID: CVCL_1285) | |||
HOP-92 | Pulmón de células no pequeñas | 79,5 | 20000 | HOP-92 (RRID: CVCL_1286) | |||
NCI-H226 | Pulmón de células no pequeñas | 61 | 20000 | NCI-H226 (RRID: CVCL_1544) | |||
NCI-H23 | Pulmón de células no pequeñas | 33,4 | 20000 | NCI-H23 (RRID: CVCL_1547) | |||
NCI-H322M | Pulmón de células no pequeñas | 35,3 | 20000 | NCI-H322M (RRID: CVCL_1557) | |||
NCI-H460 | Pulmón de células no pequeñas | 17,8 | 7500 | NCI-H460 (RRID: CVCL_0459) | |||
NCI-H522 | Pulmón de células no pequeñas | 38,2 | 20000 | NCI-H522 (RRID: CVCL_1567) | |||
COLO 205 | Colon | 23,8 | 15000 | COLO 205 (RRID: CVCL_0218) | |||
HCC-2998 | Colon | 31,5 | 15000 | HCC2998 (RRID: CVCL_1266) | |||
HCT116 | Colon | 17,4 | 5000 | HCT 116 (RRID: CVCL_0291) | |||
HCT-15 | Colon | 20,6 | 10000 | HCT 15 (RRID: CVCL_0292) | |||
HT-29 | Colon | 19,5 | 5000 | HT-29 (RRID: CVCL_0320) | |||
KM12 | Colon | 23,7 | 15000 | KM12 (RRID: CVCL_1331) | |||
SW-620 | Colon | 20,4 | 10000 | SW620 (RRID: CVCL_0547) | |||
SF-268 | SNC | 33,1 | 15000 | SF268 (RRID: CVCL_1689) | |||
SF-295 | SNC | 29,5 | 10000 | SF295 (RRID: CVCL_1690) | |||
SF-539 | SNC | 35,4 | 15000 | SF539 (RRID: CVCL_1691) | |||
SNB-19 | SNC | sí | SNC | 34,6 | 15000 | SNB-19 (RRID: CVCL_0535) | |
SNB-75 | SNC | 62,8 | 20000 | SNB-75 (RRID: CVCL_1706) | |||
U251 | SNC | sí | SNC | 23,8 | 7500 | U-251MG (RRID: CVCL_0021) | |
LOX IMVI | Melanoma | 20,5 | 7500 | LOX-IMVI (RRID: CVCL_1381) | |||
MALME-3M | Melanoma | 46,2 | 20000 | Malme-3M (RRID: CVCL_1438) | |||
M14 | Melanoma | 26,3 | 15000 | M14 (RRID: CVCL_1395) | |||
MDA-MB-435 | Melanoma | sí | Seno | 25,8 | 15000 | MDA-MB-435 (RRID: CVCL_0417) | |
SK-MEL-2 | Melanoma | 45,5 | 20000 | SK-MEL-2 (RRID: CVCL_0069) | |||
SK-MEL-28 | Melanoma | 35,1 | 10000 | SK-MEL-28 (RRID: CVCL_0526) | |||
SK-MEL-5 | Melanoma | 25,2 | 10000 | SK-MEL-5 (RRID: CVCL_0527) | |||
UACC-257 | Melanoma | 38,5 | 20000 | UACC-257 (RRID: CVCL_1779) | |||
UACC-62 | Melanoma | 31,3 | 10000 | UACC-62 (RRID: CVCL_1780) | |||
IGR-OV1 | Ovárico | 31 | 10000 | IGROV-1 (RRID: CVCL_1304) | |||
OVCAR-3 | Ovárico | 34,7 | 10000 | OVCAR-3 (RRID: CVCL_0465) | |||
OVCAR-4 | Ovárico | 41,4 | 15000 | OVCAR-4 (RRID: CVCL_1627) | |||
OVCAR-5 | Ovárico | 48,8 | 20000 | OVCAR-5 (RRID: CVCL_1628) | |||
OVCAR-8 | Ovárico | 26,1 | 10000 | OVCAR-8 (RRID: CVCL_1629) | |||
NCI / ADR-RES (originalmente MCF-7 / ADR-RES) | Ovárico | sí | Seno | 34 | 15000 | NCI-ADR-RES (RRID: CVCL_1452) | |
SK-OV-3 | Ovárico | 48,7 | 20000 | SK-OV-3 (RRID: CVCL_0532) | |||
786-O | Renal | 22,4 | 10000 | 786-O (RRID: CVCL_1051) | |||
A498 | Renal | 66,8 | 25000 | A-498 (RRID: CVCL_1056) | |||
ACHN | Renal | 27,5 | 10000 | ACHN (RRID: CVCL_1067) | |||
CAKI-1 | Renal | 39 | 10000 | Caki-1 (RRID: CVCL_0234) | |||
RXF 393 | Renal | 62,9 | 15000 | RXF 393L (RRID: CVCL_1673) | |||
SN12C | Renal | 29,5 | 15000 | SN12C (RRID: CVCL_1705) | |||
TK-10 | Renal | 51,3 | 15000 | TK-10 (RRID: CVCL_1773) | |||
UO-31 | Renal | 41,7 | 15000 | UO-31 (RRID: CVCL_1911) | |||
PC-3 | Próstata | 27,1 | 7500 | PC-3 (RRID: CVCL_0035) | |||
DU-145 | Próstata | 32,3 | 10000 | DU145 (RRID: CVCL_0105) | |||
MCF7 | Seno | 25,4 | 10000 | MCF-7 (RRID: CVCL_0031) | |||
MDA-MB-231 / ATCC | Seno | 41,9 | 20000 | MDA-MB-231 (RRID: CVCL_0062) | |||
MDA-MB-468 | Seno | 62 | 2000 | MDA-MB-468 (RRID: CVCL_0419) | |||
HS 578T | Seno | 53,8 | 20000 | Hs 578T (RRID: CVCL_0332) | |||
MDA-N | Melanoma | sí | Seno | indisponible | 22,5 | 15000 | MDA-N (RRID: CVCL_1910) |
BT-549 | Seno | 53,9 | 20000 | BT-549 (RRID: CVCL_1092) | |||
T-47D | Seno | 45,5 | 20000 | T-47D (RRID: CVCL_0553) |
Lista de líneas celulares adicionales
Línea celular | Clasificación de tumores | Especies | Densidad de inoculación | Identificador y enlace de Cellosaurus |
---|---|---|---|---|
LXFL 529 | Pulmón de células no pequeñas | humano | 10000 | LXFL 529L (RRID: CVCL_D085) |
DMS 114 | Pulmón de células pequeñas | humano | 20000 | DMS 114 (RRID: CVCL_1174) |
SHP-77 | Pulmón de células pequeñas | humano | 40000 | SHP-77 (RRID: CVCL_1693) |
DLD-1 | Colon | humano | 50000 | DLD-1 (RRID: CVCL_0248) |
KM20L2 | Colon | humano | 10000 | KM20L2 (RRID: CVCL_D889) |
SNB-78 | SNC | humano | 20000 | SNB-78 (RRID: CVCL_B321) |
XF 498 | SNC | humano | 20000 | XF 498 (RRID: CVCL_8928) |
RPMI-7951 | Melanoma | humano | 20000 | RPMI-7951 (RRID: CVCL_1666) |
M19-MEL | Melanoma | humano | 10000 | M19-MEL (RRID: CVCL_B415) |
RXF-631 | Renal | humano | 10000 | RXF 631L (RRID: CVCL_A780) |
SN12K1 | Renal | humano | 10000 | SN12K1 (RRID: CVCL_D106) |
P388 | Leucemia | ratón | 50000 | P388 (RRID: CVCL_7222) |
P388 / ADR | Leucemia | ratón | 50000 | P388 / ADR (RRID: CVCL_IZ75) |
Referencias
- ^ a b c d e f g h "Líneas celulares en la pantalla In Vitro" . Programa de Terapéutica del Desarrollo . Instituto Nacional del Cáncer . 8 de mayo de 2015 . Consultado el 6 de enero de 2018 .
- ^ a b c d "Pantalla de líneas de células tumorales humanas NCI-60" . Programa de Terapéutica del Desarrollo . Instituto Nacional del Cáncer . 26 de agosto de 2015 . Consultado el 6 de enero de 2018 .
- ^ "Servicios de descubrimiento y desarrollo" . Programa de Terapéutica del Desarrollo . Instituto Nacional del Cáncer . 26 de agosto de 2015 . Consultado el 6 de enero de 2018 .
- ^ "Bienvenidos al Programa de Terapéutica del Desarrollo" . Programa de Terapéutica del Desarrollo . Instituto Nacional del Cáncer . Consultado el 6 de enero de 2018 .
- ^ "COMPARAR Análisis" . Programa de Terapéutica del Desarrollo . Instituto Nacional del Cáncer . 11 de agosto de 2015 . Consultado el 6 de enero de 2018 .
- ^ "Objetivos moleculares" . Programa de Terapéutica del Desarrollo . Instituto Nacional del Cáncer. 12 de mayo de 2015 . Consultado el 7 de enero de 2018 .
- ^ a b c d e f "MDA-MB-435, y su derivación MDA-N, son líneas celulares de melanoma, no líneas celulares de cáncer de mama" . Programa de Terapéutica del Desarrollo . Instituto Nacional del Cáncer . 8 de mayo de 2015 . Consultado el 6 de enero de 2018 .
- ^ a b c d e "La línea celular NCI / ADR-RES es una línea celular de tumor ovárico, no una línea de mama" . Programa de Terapéutica del Desarrollo . Instituto Nacional del Cáncer . 8 de mayo de 2015 . Consultado el 6 de enero de 2018 .
- ^ a b c "Las líneas celulares del SNC SNB-19 y U251 se derivan del mismo individuo" . Programa de Terapéutica del Desarrollo . Instituto Nacional del Cáncer . 8 de mayo de 2015 . Consultado el 6 de enero de 2018 .
- ^ a b Base de datos de líneas celulares contaminadas o mal identificadas (PDF) , 8.0, Comité Internacional de Autenticación de Líneas Celulares (ICLAC), 1 de diciembre de 2016 , consultado el 6 de enero de 2018
- ^ a b Prasad, Vidudala VTS; Gopalan, Ramprasad OG (2 de junio de 2015). "Uso continuado de MDA-MB-435, una línea celular de melanoma, como modelo para el cáncer de mama humano, incluso en el año 2014" . NPJ Breast Cancer . 1 : 15002–. doi : 10.1038 / npjbcancer.2015.2 . PMC 5515196 . PMID 28721362 .
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- ^ "Cellosaurus - un recurso de conocimiento sobre líneas celulares" . Cellosaurus . Instituto Suizo de Bioinformática . Consultado el 17 de enero de 2018 .La referencia incluye las páginas encontradas al buscar con los nombres de las líneas celulares respectivas como se indica en la Lista de líneas celulares adicionales .