La proteína de unión en horquilla de ARN de histona o la proteína de unión de tallo-bucle (SLBP) es una proteína que en los seres humanos está codificada por el gen SLBP . [5] [6] [7]
SLBP | |||||||||||||||||||||||||
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Identificadores | |||||||||||||||||||||||||
Alias | SLBP , HBP, proteína de unión a tallo-asa | ||||||||||||||||||||||||
Identificaciones externas | OMIM : 602422 MGI : 108402 HomoloGene : 31389 GeneCards : SLBP | ||||||||||||||||||||||||
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Ortólogos | |||||||||||||||||||||||||
Especies | Humano | Ratón | |||||||||||||||||||||||
Entrez |
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Ubicación (UCSC) | Crónicas 4: 1,69 - 1,71 Mb | Crónicas 5: 33,63 - 33,65 Mb | |||||||||||||||||||||||
Búsqueda en PubMed | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Wikidata | |||||||||||||||||||||||||
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Distribución de especies
SLBP se ha clonado a partir de humanos, C. elegans , D. melanogaster , X. laevis y erizos de mar . La proteína humana de longitud completa tiene 270 aminoácidos (31 kDa) con un dominio de unión de ARN (RBD) ubicado en el centro. El RBD de 75 aminoácidos está bien conservado en todas las especies, sin embargo, el resto de SLBP es muy divergente en la mayoría de los organismos y no es homólogo a ninguna otra proteína en los genomas eucariotas.
Función
Este gen codifica una proteína que se une a la estructura de tallo-bucle UTR 3 'de la histona en los ARNm de histonas dependientes de la replicación . Los ARNm de histonas no contienen intrones ni señales de poliadenilación y se procesan mediante un único evento de escisión endonucleolítica aguas abajo del tallo-bucle. La estructura de tallo-bucle es esencial para el procesamiento eficiente del pre-ARNm de histonas, pero esta estructura también controla el transporte, la traducción y la estabilidad de los ARNm de histonas. La expresión de SLBP se regula durante la fase S del ciclo celular , aumentando más de 10 veces durante la última parte de G1 .
Todas las proteínas SLBP son capaces de formar un complejo muy estable con ARN de tallo-bucle de histonas. La formación del complejo con el tallo-bucle de ARNm de histona se logra mediante un nuevo pliegue de haz de tres hélices. Las proteínas SLBP también reconocen la estructura tetrabucle de la horquilla de histonas, la base del tallo y la región flanqueante 5 '. La estructura cristalina de SLBP humana en complejo con el ARN de tallo-bucle, así como la exonucleasa Eri1, revela que el residuo Arg181 de SLBP interactúa específicamente con la segunda base de guanina en el tallo de ARN. [8] El resto de la proteína está intrínsecamente desordenada en las moscas de la fruta y en los humanos. Una característica única de SLBP RBD es que está fosforilada en su dominio de unión de ARN en el residuo Thr171. El SLBP RBD también sufre isomerización de prolina alrededor de esta secuencia y es un sustrato para la prolil isomerasa Pin1. El dominio N-terminal de la SLBP humana es necesario para la activación de la traducción de los ARNm de histonas mediante su interacción con SLIP1. SLBP también interactúa con la proteína CTIF asociada a CBP80 para facilitar la rápida degradación de los ARNm de histonas. SLBP es una fosfoproteína y, además de T171, también está fosforilada en Ser7, Ser20, Ser23, Thr60, Thr61 en células de mamíferos. La fosforilación en Thr60 está mediada por CK2 y Thr61 por Cyclin A / Cdk1 . [7]
Referencias
- ^ a b c GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000163950 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000004642 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ Martin F, Schaller A, Eglite S, Schumperli D, Muller B (marzo de 1997). "El gen de la proteína de unión en horquilla de ARN de histona se encuentra en el cromosoma 4 humano y codifica un nuevo tipo de proteína de unión de ARN" . EMBO J . 16 (4): 769–78. doi : 10.1093 / emboj / 16.4.769 . PMC 1169678 . PMID 9049306 .
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- ^ a b "Entrez Gene: proteína de unión de SLBP tallo-bucle (histona)" .
- ^ Dazhi Tan; William F. Marzluff; Zbigniew Dominski; Liang Tong (enero de 2013). "Estructura del vástago de ARNm de histona, proteína de unión de vástago de vástago humano y complejo ternario 3′hExo" . Ciencia . 339 (6117): 318–321. doi : 10.1126 / science.1228705 . PMC 3552377 . PMID 23329046 .
Otras lecturas
- Choe J, Mi Kim K, Park S, Kyung Lee Y, Song OK, Kim MK, Lee BG, Song HK, Kim YK (2013). "La degradación rápida de los ARNm de histonas dependientes de la replicación se produce en gran medida en los ARNm unidos por las proteínas de unión al casquete nuclear 80 y 20" . Investigación de ácidos nucleicos . 41 (2): 1307-1318. doi : 10.1093 / nar / gks1196 . PMC 3553978 . PMID 23234701 .
- Bansal N, Zhang M, Bhaskar A, Itotia P, Lee E, Shlyakhtenko LS, Lam TT, Fritz A, Berezney R, Lyubchenko YL, Stafford WF, Thapar R (enero de 2013). "El ensamblaje del complejo SLIP1-SLBP en ARNm de histona requiere heterodimerización y unión secuencial de SLBP seguida de SLIP1" . Bioquímica . 52 (3): 520–536. doi : 10.1021 / bi301074r . PMC 3580866 . PMID 23286197 .
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