La proteína que interactúa con SLX4 es una proteína que en los seres humanos está codificada por el gen SLX4IP . [5]
SLX4IP | |||||||||||||||||||||||||
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Identificadores | |||||||||||||||||||||||||
Alias | SLX4IP , C20orf94, bA204H22.1, bA254M13.1, dJ1099D15.3, proteína de interacción SLX4 | ||||||||||||||||||||||||
Identificaciones externas | OMIM : 615958 MGI : 1921493 HomoloGene : 49913 GeneCards : SLX4IP | ||||||||||||||||||||||||
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Ortólogos | |||||||||||||||||||||||||
Especies | Humano | Ratón | |||||||||||||||||||||||
Entrez | |||||||||||||||||||||||||
Ensembl | |||||||||||||||||||||||||
UniProt | |||||||||||||||||||||||||
RefSeq (ARNm) |
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RefSeq (proteína) |
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Ubicación (UCSC) | 20 de Cr: 10,44 - 10,64 Mb | Crónicas 2: 136,89 - 137,07 Mb | |||||||||||||||||||||||
Búsqueda en PubMed | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Wikidata | |||||||||||||||||||||||||
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Función
La proteína de interacción SLX4 (SLX4IP) existe en forma monomérica e interactúa con el complejo multiproteico SLX4 - XPF - ERCC1 , que es responsable del ensamblaje de una resolvasa de unión de Holliday en la función de reparación y mantenimiento del ADN. [6]
Se ha demostrado que SLX4IP interactúa directamente con el extremo N-terminal de la proteína SLX4 , que desempeña un papel en la coordinación de múltiples endonucleasas específicas de estructura de ADN diferentes. [7]
También se ha demostrado que SLX4IP participa en el control del alargamiento alternativo de los telómeros , a través de su acumulación e interacciones con las proteínas SLX4 , BLM y XPF . [8]
Ubicación y expresión
El gen SLX4IP se encuentra en el brazo corto (p) del cromosoma 20 en la posición 12.2 (20p12.2). [9] El gen SLX4IP humano contiene 14 exones , con el ADNc de 204.000 pares de bases orientados en la hebra positiva. [9] Esto codifica una proteína de 408 aminoácidos con una masa molecular de 45,552 Daltons . [10]
Los homólogos se han encontrado en el gen SLX4IP ser conservadas en varias especies no humanos, incluyendo ratones, ratas, ranas, pollos, perros, monos rhesus y chimpancés. [11] También se han identificado ortólogos para el gen SLX4IP humano en otros 283 organismos. [11]
La proteína SLX4IP se expresa en su nivel más alto en la piel y los testículos, además de expresarse en otros 26 tejidos. [12]
Significación clínica
Cáncer
Leucemia linfoblástica aguda
Se demostró que las deleciones somáticas y monoalélicas de la región 5 'de SLX4IP ocurren en el 30% de los pacientes con leucemia linfoblástica aguda (LLA) infantil y en los casos de leucemia linfoblástica aguda reordenada con ETV6 / RUNX1 , se encontraron deleciones en más del 60% de casos. [13] Al analizar los puntos de corte de SLX4IP, se reveló la recombinación ilegítima mediada por V (D) J característica . [13] Se encontró que estas supresiones estaban significativamente sesgadas hacia el género masculino. [13]
Alargamiento alternativo de telómeros
Para que las células cancerosas conserven su capacidad de proliferar sin limitaciones, pueden regular los telómeros de sus cromosomas mediante recombinación mediante un proceso conocido como alargamiento alternativo de telómeros (ALT). [14] Se ha demostrado que esta recombinación requiere la acumulación de SLX4IP en los telómeros ALT debido a su antagonización de la actividad BLM promiscua . [8] BLM es responsable de la extensión de los telómeros, ya que es una helicasa RecQ vital para la recombinación homóloga y la replicación del ADN. [15]
Reparación de enlaces cruzados Interstrand
En el ADN, es necesario reparar los enlaces cruzados Interstrand (ICL) debido a su alta toxicidad, lo que a menudo conduce a enfermedades como la anemia de Fanconi . [16] SLX4IP juega un papel en la funcionalidad de reparación de ICL del complejo SLX4-XPF-ERCC1, debido a su unión simultánea de SLX4 y XPF-ERCC1, que mantiene la estabilidad del complejo y promueve la interacción entre SLX4 y XPF -Regiones ERCC1. [6] [17] Cuando SLX4IP se agotó de las células tratadas, se encontró que se acumulaban en la fase G2 / M del ciclo celular donde la resolución de las uniones de vacaciones durante la reparación de ICL ocurre regularmente. [17] [18]
VIH-1
La proteína auxiliar Vpr del VIH-1 detiene de manera potente la progresión de las células huésped a través de su ciclo natural en la etapa de transición G2 / M. [19] Se descubrió que esta detención se debe a la activación prematura del complejo de endonucleasa de estructura específica de SLX4 , con el que SLX4IP interactúa directamente. [20] A través de esta investigación, también se descubrió que el complejo SLX4 está involucrado en la regulación de la inmunidad innata, debido a su regulación negativa de la producción de interferón tipo 1 , tanto cuando se induce espontáneamente como cuando está mediada por el VIH-1. [20]
Referencias
- ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000149346 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000027281 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ "Entrez Gene: proteína de interacción SLX4" .
- ^ a b Svendsen JM, Smogorzewska A, Sowa ME, O'Connell BC, Gygi SP, Elledge SJ, Harper JW (julio de 2009). "Mammalian BTBD12 / SLX4 ensambla una resolvasa de unión de Holliday y es necesaria para la reparación del ADN" . Celular . 138 (1): 63–77. doi : 10.1016 / j.cell.2009.06.030 . PMC 2720686 . PMID 19596235 .
- ^ Fekairi S, Scaglione S, Chahwan C, Taylor ER, Tissier A, Coulon S, et al. (Julio de 2009). "Human SLX4 es una subunidad de resolvasa de unión de Holliday que se une a múltiples endonucleasas de recombinación / reparación de ADN" . Celular . 138 (1): 78–89. doi : 10.1016 / j.cell.2009.06.029 . PMC 2861413 . PMID 19596236 .
- ^ a b Panier S, Maric M, Hewitt G, Mason-Osann E, Gali H, Dai A, et al. (Octubre de 2019). "SLX4IP antagoniza la actividad BLM promiscua durante el mantenimiento de ALT" . Célula molecular . 76 (1): 27–43.e11. doi : 10.1016 / j.molcel.2019.07.010 . PMC 6863466 . PMID 31447390 .
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- ^ "SLX4IP - Proteína SLX4IP - Homo sapiens (humano) - Gen y proteína SLX4IP" . www.uniprot.org . Consultado el 31 de octubre de 2019 .
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Otras lecturas
- Svendsen JM, Smogorzewska A, Sowa ME, O'Connell BC, Gygi SP, Elledge SJ, Harper JW (julio de 2009). "Mammalian BTBD12 / SLX4 ensambla una resolvasa de unión de Holliday y es necesaria para la reparación del ADN" . Celular . 138 (1): 63–77. doi : 10.1016 / j.cell.2009.06.030 . PMC 2720686 . PMID 19596235 .
- Ghosal G, Leung JW, Nair BC, Fong KW, Chen J (octubre de 2012). "La proteína de unión al antígeno nuclear celular proliferante (PCNA) C1orf124 es un regulador de la síntesis de translesión" . La revista de química biológica . 287 (41): 34225–33. doi : 10.1074 / jbc.M112.400135 . PMC 3464530 . PMID 22902628 .
- Warnatz HJ, Schmidt D, Manke T, Piccini I, Sultan M, Borodina T, et al. (Julio de 2011). "Los genes diana de homología 1 (BACH1) de BTB y CNC están implicados en la respuesta al estrés oxidativo y en el control del ciclo celular" . La revista de química biológica . 286 (26): 23521–32. doi : 10.1074 / jbc.M111.220178 . PMC 3123115 . PMID 21555518 .