El factor de transcripción SOX-9 es una proteína que en humanos está codificada por el gen SOX9 . [5] [6]
SOX9 |
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Estructuras disponibles |
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PDB | Búsqueda de ortólogos: PDBe RCSB |
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Lista de códigos de identificación de PDB |
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4EUW |
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Identificadores |
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Alias | SOX9 , CMD1, CMPD1, SRA1, SRXX2, SRXY10, SRY-box 9, factor de transcripción SRY-box 9 |
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Identificaciones externas | OMIM : 608160 MGI : 98371 HomoloGene : 294 GeneCards : SOX9 |
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Ubicación de genes ( humanos ) |
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| Chr. | Cromosoma 17 (humano) [1] |
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| Banda | 17q24.3 | Comienzo | 72.121.020 pb [1] |
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Final | 72,126,416 pb [1] |
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Ubicación de genes ( ratón ) |
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| Chr. | Cromosoma 11 (ratón) [2] |
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| Banda | 11 E2 | 11 77,27 cm | Comienzo | 112,782,224 pb [2] |
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Final | 112,787,760 pb [2] |
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Ontología de genes |
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Función molecular | • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Actividad del factor de transcripción de unión al ADN • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Actividad activadora de la transcripción de unión al ADN, ARN polimerasa II-específico • DNA núcleo promotor de la secuencia específica de unión • actividad de la proteína quinasa • proteína quinasa de unión a una subunidad catalítica • beta-catenina de unión • pre-mRNA intrónica unión • cromatina unión • GO: proteína de unión 0001948 • la unión al ADN • secuencia-específica Unión al ADN • GO: 0000975 transcripción unión a la región reguladora en cis • Unión al factor de transcripción bHLH • GO: 0001158 unión al ADN específico de la secuencia de la región reguladora en cis • actividad de heterodimerización de proteínas • actividad del factor de transcripción, unión específica de secuencia del potenciador distal de ARN polimerasa II • GO : 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Actividad del factor de transcripción de unión al ADN, específico de la ARN polimerasa II • GO: 0000980 Unión al ADN específica de la secuencia de la región reguladora cis de la ARN polimerasa II
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Componente celular | • núcleo • complejo regulador de la transcripción • nucleoplasma • complejo que contiene proteínas
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Proceso biológico | • desarrollo del sistema esquelético • respuesta celular al ácido retinoico • desarrollo del cartílago bronquial • regulación positiva de la fosforilación de proteínas • desarrollo de la válvula cardíaca • formación de yemas de las extremidades • regulación positiva del proceso catabólico de proteínas • regulación de la transcripción por la ARN polimerasa II • morfogénesis del uréter • regulación negativa de proceso del sistema inmunológico • desarrollo de condrocitos • regulación positiva de la proliferación celular involucrada en la morfogénesis del corazón • diferenciación de oligodendrocitos • hipertrofia de condrocitos • desarrollo de la glándula prostática • desarrollo del músculo liso del pulmón • desarrollo de la glándula mamaria • regulación negativa de la osificación • regulación negativa de la diferenciación de las células fotorreceptoras • respuesta celular al estímulo mecánico • desarrollo del conducto biliar intrahepático • regulación de la adhesión celular • regulación negativa de la diferenciación de condrocitos • regulación positiva de la proliferación de células mesenquimales • compromiso del destino de los astrocitos • regulación positiva de los condrocitos e diferenciación • espermatogénesis • glándula prostática morfogénesis • regulación negativa de la proliferación de células epiteliales • células epiteliales de pulmón diferenciación • condrocitos de diferenciación implicado en la morfogénesis de hueso endocondral • regulación negativa de la canónica de Wnt vía de señalización • páncreas endocrino desarrollo • regulación negativa de la proliferación de la población celular • regulación de proceso apoptótico • respuesta celular al estímulo beta del factor de crecimiento transformante • regulación negativa del proceso apoptótico de las células mesenquimales • remodelación de la cromatina • regulación negativa de la diferenciación de mioblastos • regulación positiva de la ramificación implicada en la morfogénesis de yemas ureterales • compromiso del destino celular • regulación de la transcripción, plantilla de ADN • Vía de señalización del receptor del factor de crecimiento epidérmico • Osificación • Regulación de la proliferación celular implicada en la homeostasis tisular • Diferenciación de las células del músculo liso del uréter • Cascada ERK1 y ERK2 • Desarrollo de notocorda • Regulación positiva de migración de células epiteliales • Diferenciación de células de Sertoli • Determinación del sexo masculino • Regulación negativa de la expresión génica • Transcripción, plantilla de ADN • Formación de túbulos de nefrona metanéfricos • Regulación positiva de la transcripción, plantilla de ADN • Desarrollo del corazón • Regulación de la ramificación implicada en la morfogénesis pulmonar • desarrollo del urotelio del uréter • ramificación implicada en la morfogénesis de la yema ureteral • desarrollo del cartílago • Desarrollo de la glándula endurecida • regulación positiva del desarrollo renal • desarrollo del sistema nervioso central • formación de la válvula cardíaca • regulación positiva del desarrollo del cartílago • homeostasis de los tejidos • desarrollo del túbulo metanéfrico • regulación negativa del biomineral desarrollo tisular • morfogénesis ósea endocondral • desarrollo del cartílago de la tráquea • determinación del sexo de la línea germinal masculina • desarrollo de la glándula lagrimal • vía de señalización de la muesca • desarrollo del folículo piloso • diferenciación celular • desarrollo del uréter • regulación del proceso del ciclo celular • gona masculina d desarrollo • regulación positiva de la proliferación de células epiteliales • especificación del destino celular • mantenimiento de la estructura del epitelio intestinal • regulación positiva del ensamblaje de la matriz extracelular • organización de la matriz extracelular • regulación negativa del proceso apoptótico • regulación negativa de la transcripción por la ARN polimerasa II • desarrollo de las células de Sertoli • regulación positiva de la diferenciación de las células madre mesenquimales • desarrollo de la retina en el ojo tipo cámara • respuesta celular a la interleucina -1 • transición epitelial a mesenquimal • homeostasis del número de células dentro de un tejido • regulación negativa de la transcripción, plantilla de ADN • señalización mediada por AMPc • condensación del cartílago • regulación positiva del desarrollo de gónadas masculinas • ensamblaje de nucleosomas • regulación negativa de la mineralización ósea • morfogénesis de un epitelio de ramificación • desarrollo de las células de la cresta neural • señalización de la proteína quinasa B • mantenimiento somática población de células madre • formación de vesícula ótica • desarrollo vesícula ótica • endocardial morfogénesis cojín • respuesta celular al factor de crecimiento epidérmico estímulo • regulación positiva de epitelial di célula diferenciación • inducción de vesículas renales • regulación positiva de la expresión génica • regulación de la proliferación de células epiteliales implicadas en la morfogénesis pulmonar • regulación de la proliferación de la población celular • morfogénesis de la válvula cardíaca • organización del citoesqueleto • morfogénesis de la cóclea • regulación positiva de la proliferación de la población celular • proliferación de células epiteliales implicadas en elongación de la yema prostática • diferenciación de los bastoncillos de la retina • localización de proteínas en el núcleo • regulación de la diferenciación celular • regulación positiva de la señalización de fosfatidilinositol 3-quinasa • respuesta celular a la heparina • regulación negativa de la diferenciación de células epiteliales • ramificación del tubo epitelial implicada en la morfogénesis pulmonar • transducción de señales • Regulación positiva de la transcripción por la ARN polimerasa II • Regulación negativa de la transcripción de pri-miARN por la ARN polimerasa II • Diferenciación de condrocitos • Especificación del destino de las células de la cresta neural • Respuesta celular al estímulo de las BMP • Adhesivos célula-célula ión • iniciación de la transcripción a partir del promotor de la ARN polimerasa II • ensamblaje del complejo que contiene proteínas • desarrollo de la cabeza anterior • morfogénesis de un epitelio • morfogénesis de la válvula aórtica • regulación de la expresión génica
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Fuentes: Amigo / QuickGO |
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Ortólogos |
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Especies | Humano | Ratón |
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Entrez | | |
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Ensembl | | |
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UniProt | | |
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RefSeq (ARNm) | | |
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RefSeq (proteína) | | |
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Ubicación (UCSC) | Crónicas 17: 72,12 - 72,13 Mb | Crónicas 11: 112,78 - 112,79 Mb |
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Búsqueda en PubMed | [3] | [4] |
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Wikidata |
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SOX-9 reconoce la secuencia CCTTGAG junto con otros miembros de las proteínas de unión al ADN de la clase HMG-box . Se expresa mediante condrocitos proliferantes pero no hipertróficos que es esencial para la diferenciación de las células precursoras en condrocitos [7] y, con el factor esteroidogénico 1 , regula la transcripción del gen de la hormona antimülleriana ( AMH ). [6]
SOX-9 también juega un papel fundamental en el desarrollo sexual masculino; Al trabajar con Sf1, SOX-9 puede producir AMH en células de Sertoli para inhibir la creación de un sistema reproductor femenino. [8] También interactúa con algunos otros genes para promover el desarrollo de los órganos sexuales masculinos. El proceso comienza cuando el factor de transcripción Testis determinante (codificado por la región determinante del sexo SRY del cromosoma Y ) activa la actividad de SOX-9 al unirse a una secuencia potenciadora corriente arriba del gen. [9] A continuación, Sox9 activa FGF9 y forma bucles de retroalimentación con FGF9 [10] y PGD2 . [9] Estos bucles son importantes para producir SOX-9; sin estos bucles, SOX-9 se agotaría y casi con certeza se produciría el desarrollo de una mujer. La activación de FGF9 por SOX-9 inicia procesos vitales en el desarrollo masculino, como la creación de cordones testiculares y la multiplicación de células de Sertoli . [10] La asociación de SOX-9 y Dax1 en realidad crea células de Sertoli, otro proceso vital en el desarrollo masculino. [11] En el desarrollo del cerebro, su ortólogo murino Sox-9 induce la expresión de Wwp1 , Wwp2 y miR-140 para regular la entrada de la placa cortical de las células nerviosas recién nacidas y regular la ramificación y la formación de axones en las neuronas corticales. [12]
Las mutaciones conducen al síndrome de malformación esquelética , displasia campomélica , frecuentemente con reversión sexual autosómica [6] y paladar hendido . [13]
SOX9 se encuentra en un desierto genético en 17q24 en humanos. Las deleciones, interrupciones por puntos de corte de translocación y una mutación de un solo punto de elementos no codificantes altamente conservados ubicados> 1 Mb de la unidad de transcripción a ambos lados de SOX9 se han asociado con la secuencia de Pierre Robin , a menudo con paladar hendido . [13] [14]
La proteína Sox9 se ha implicado tanto en el inicio como en la progresión de múltiples tumores sólidos. [15] Su función como regulador maestro de la morfogénesis durante el desarrollo humano lo convierte en un candidato ideal para la perturbación en tejidos malignos. Específicamente, Sox9 parece inducir invasividad y resistencia a la terapia en próstata, [16] colorrectal, [17] mama [18] y otros cánceres, y por lo tanto promueve metástasis letales. [19] Muchos de estos efectos oncogénicos de Sox9 parecen depender de la dosis. [20] [16] [15]
SOX9 se localiza principalmente en el núcleo y es muy móvil. Los estudios en la línea celular de condrocitos han revelado que casi el 50% de SOX9 está unido al ADN y está regulado directamente por factores externos. Su tiempo medio de residencia en el ADN es de ~ 14 segundos. [21]
Las mutaciones en Sox9 o cualquier otro gen asociado pueden causar la reversión del sexo y hermafroditismo (o intersexualidad en humanos). Si Fgf9, que es activado por Sox9, no está presente, un feto con cromosomas X e Y puede desarrollar gónadas femeninas; [9] lo mismo es cierto si Dax1 no está presente. [11] Los fenómenos relacionados con el hermafroditismo pueden ser causados por una actividad inusual del SRY, generalmente cuando se transloca al cromosoma X y su actividad solo se activa en algunas células. [22]
Se ha demostrado que SOX9 interactúa con el factor esteroidogénico 1 , [8] MED12 [23] y MAF . [24]
- SOX9 + proteína, + humano en los encabezados de temas médicos (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- Ubicación del gen humano SOX9 en UCSC Genome Browser .
- Detalles del gen humano SOX9 en UCSC Genome Browser .
- Descripción general de toda la información estructural disponible en el PDB para UniProt : P48436 (factor de transcripción humano SOX-9) en el PDBe-KB .
- Descripción general de toda la información estructural disponible en el PDB para UniProt : Q04887 (factor de transcripción del ratón SOX-9) en el PDBe-KB .
Este artículo incorpora texto de la Biblioteca Nacional de Medicina de los Estados Unidos , que es de dominio público .