Proteína de cadena sencilla de unión a ADN ( SSB ) es una proteína encontrada en Escherichia coli ( E. coli ) bacterias , que se une a regiones de una sola hebra de ácido desoxirribonucleico ( ADN ). [1] El ADN monocatenario se produce durante todos los aspectos del metabolismo del ADN: replicación, recombinación y reparación. Además de estabilizar este ADN monocatenario, las proteínas SSB se unen y modulan la función de numerosas proteínas implicadas en todos estos procesos.
La SSB de E. coli activa se compone de cuatro subunidades idénticas de 19 kDa . La unión de ADN monocatenario al tetrámero puede ocurrir en diferentes "modos", con SSB ocupando diferentes números de bases de ADN dependiendo de varios factores, incluida la concentración de sal. Por ejemplo, el modo de unión (SSB) 65 , en el que aproximadamente 65 nucleótidos de ADN se envuelven alrededor del tetrámero SSB y entran en contacto con sus cuatro subunidades, se favorece a altas concentraciones de sal in vitro . A concentraciones de sal más bajas , tiende a formarse el modo de unión (SSB) 35 , en el que aproximadamente 35 nucleótidos se unen a sólo dos de las subunidades SSB. Se requiere más trabajo para dilucidar las funciones de los diversos modos de unión in vivo .
SSB bacteriano
SSB | ||||||||
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Identificadores | ||||||||
Símbolo | SSB | |||||||
Pfam | PF00436 | |||||||
Clan pfam | CL0021 | |||||||
InterPro | IPR000424 | |||||||
PROSITE | PDOC00602 | |||||||
SCOP2 | 1kaw / SCOPe / SUPFAM | |||||||
TCDB | 3.A.7 | |||||||
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Los dominios de la proteína SSB en bacterias son importantes en su función de mantener el metabolismo del ADN, más específicamente la replicación , reparación y recombinación del ADN. [2] Tiene una estructura de tres cadenas beta a una sola hoja beta de seis cadenas para formar un dímero de proteína . [3]
Ver también
Referencias
- ^ Oakley, AJ (2014). "Modo de unión intramolecular del extremo C de la proteína de unión a ADN monocatenario de Escherichia coli determinado por espectroscopia de resonancia magnética nuclear" . Investigación de ácidos nucleicos . 42 (4): 2750–7. doi : 10.1093 / nar / gkt1238 . PMC 3936761 . PMID 24288378 .
- ^ Meyer RR, Laine PS (diciembre de 1990). "La proteína de unión a ADN monocatenario de Escherichia coli" . Microbiol. Rev . 54 (4): 342–80. doi : 10.1128 / MMBR.54.4.342-380.1990 . PMC 372786 . PMID 2087220 .
- ^ Raghunathan S, Ricard CS, Lohman TM, Waksman G (junio de 1997). "Estructura cristalina del dominio de unión al ADN homo-tetramérico de la proteína de unión al ADN monocatenario de Escherichia coli determinada por difracción de rayos X de longitud de onda múltiple en la proteína selenometionilo a una resolución de 2.9-A" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 94 (13): 6652–7. doi : 10.1073 / pnas.94.13.6652 . PMC 21213 . PMID 9192620 .
enlaces externos
- Monocatenario + ADN + Unión + Proteínas en los encabezados de temas médicos (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- SSB en PFAM