La subunidad 1 del factor de inicio de la transcripción TFIID , también conocida como subunidad del factor de inicio de la transcripción TFIID de 250 kDa (TAFII-250) o factor asociado a TBP de 250 kDa (p250), es una proteína que en los seres humanos está codificada por el gen TAF1 . [5] [6]
TAF1 | |||||||||||||||||||||||||
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Identificadores | |||||||||||||||||||||||||
Alias | TAF1 , BA2R, CCG1, CCGS, DYT3, DYT3 / KAT4, N-NSCL2, OF, P250, TAF (II) 250, TAF2A, TAFII-250, TAFII250, XDP, MRXS33, factor 1 asociado a la proteína de unión a la caja TATA | ||||||||||||||||||||||||
Identificaciones externas | OMIM : 313650 MGI : 1336878 HomoloGene : 37942 GeneCards : TAF1 | ||||||||||||||||||||||||
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Ortólogos | |||||||||||||||||||||||||
Especies | Humano | Ratón | |||||||||||||||||||||||
Entrez |
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Ensembl |
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UniProt |
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RefSeq (ARNm) |
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RefSeq (proteína) |
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Ubicación (UCSC) | Cr X: 71,37 - 71,53 Mb | Chr X: 101,53 - 101,6 Mb | |||||||||||||||||||||||
Búsqueda en PubMed | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Wikidata | |||||||||||||||||||||||||
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Función
El inicio de la transcripción por la ARN polimerasa II requiere las actividades de más de 70 polipéptidos. La proteína que coordina estas actividades es el factor de transcripción basal TFIID , que se une al promotor central para posicionar la polimerasa correctamente, sirve como andamio para el ensamblaje del resto del complejo de transcripción y actúa como canal para las señales reguladoras. TFIID está compuesto por la proteína de unión a TATA ( TBP ) y un grupo de proteínas conservadas evolutivamente conocidas como factores asociados a TBP o TAF. Los TAF pueden participar en la transcripción basal, servir como coactivadores , funcionar en el reconocimiento de promotores o modificar los factores de transcripción generales (GTF) para facilitar el ensamblaje complejo y el inicio de la transcripción. Este gen codifica la subunidad más grande de TFIID. Esta subunidad se une a secuencias promotoras centrales que abarcan el sitio de inicio de la transcripción. También se une a activadores y otros reguladores de la transcripción, y estas interacciones afectan la velocidad de inicio de la transcripción. Esta subunidad contiene dos dominios de proteína quinasa independientes en los terminales N y C, pero también posee actividad acetiltransferasa y puede actuar como una enzima de conjugación / activación de ubiquitina . Se han identificado dos transcripciones que codifican diferentes isoformas para este gen. [5] Las histonas a menudo se acetilan para abrir el ADN para la transcripción. TAF1 contiene dos bromodominios, cada uno de los cuales puede unirse a uno de los dos residuos de acetilsina en la posición 5 y 12 en la cola H4, para estabilizar el complejo de caja TBP-TATA.
Significación clínica
Se identificó una mutación en TAF1 que contribuye a un fenotipo con discapacidad intelectual (DI) severa, un pliegue interglúteo característico y rasgos faciales distintivos, que incluyen una nariz ancha hacia arriba, mejillas caídas, fisuras palpebrales inclinadas hacia abajo, crestas periorbitarias prominentes, ojos fijos, hipertelorismo relativo, labio superior delgado, paladar arqueado alto, orejas prominentes con hélices engrosadas y mentón puntiagudo [7] [8] Este es un cambio no sinónimo en TAF1 que da como resultado una isoleucina (hidrofóbica) para cambio de treonina (polar) en el residuo de aminoácido 1337 en la proteína (NP_001273003.1). Se informaron otras dos mutaciones en TAF1 en dos familias con discapacidad intelectual, aunque no se informaron más detalles clínicos. [9]
Interacciones
Se ha demostrado que TAF1 interactúa con:
- CSNK2A1 , [10]
- CCND1 , [11] [12]
- GTF2F1 , [13] [14] [15] [16]
- RB1 , [12] [13] [17] [18]
- TAF7 , [19]
- TBP , [13] [20] [21] [22] y
- UBTF . [23]
Ver también
- Factor de transcripción II D
Referencias
- ^ a b c GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000147133 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000031314 - Ensembl , mayo de 2017
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Otras lecturas
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enlaces externos
- FactorBook TAF1
- Entrada de GeneReviews / NCBI / NIH / UW sobre Distonía-Parkinsonismo ligado al cromosoma X
- http://biorxiv.org/content/early/2015/01/21/014050
- Descripción general de toda la información estructural disponible en la PDB para UniProt : P21675 (subunidad 1 del factor de iniciación de la transcripción TFIID) en PDBe-KB .
Este artículo incorpora texto de la Biblioteca Nacional de Medicina de los Estados Unidos , que es de dominio público .