La subunidad 8 del factor de iniciación de la transcripción TFIID es una proteína que en humanos está codificada por el gen TAF8 . [5]
TAF8 | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||||||||||
Identificadores | |||||||||||||||||||||||||
Alias | TAF8 , 43, II, TAF, TAFII-43, TAFII43, TBN, factor 8 asociado a la proteína de unión a la caja TATA, TAF (II) 43 | ||||||||||||||||||||||||
Identificaciones externas | OMIM : 609514 MGI : 1926879 HomoloGene : 11094 GeneCards : TAF8 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Ortólogos | |||||||||||||||||||||||||
Especies | Humano | Ratón | |||||||||||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (ARNm) |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (proteína) |
|
| |||||||||||||||||||||||
Ubicación (UCSC) | Crónicas 6: 42,05 - 42,09 Mb | Crónicas 17: 47,48 - 47,5 Mb | |||||||||||||||||||||||
Búsqueda en PubMed | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Wikidata | |||||||||||||||||||||||||
|
Este gen codifica uno de varios factores asociados a la proteína de unión a TATA (TBP) (TAF), que son subunidades integrales del complejo de factores de transcripción general TFIID. TFIID reconoce el promotor central de muchos genes y nuclea el ensamblaje de un complejo de preiniciación de la transcripción que contiene ARN polimerasa II y otros factores de iniciación. La proteína codificada por este gen contiene un dominio de pliegue de histona similar a H4 e interactúa con varias subunidades de TFIID, incluida la TBP y la proteína de pliegue de histona TAF10. Se han descrito variantes de transcripciones empalmadas alternativamente, pero no se ha determinado su validez biológica. [5]
Referencias
- ^ a b c GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000137413 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000023980 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ a b "Entrez Gene: homólogo de TBN taube nuss (ratón)" .
Otras lecturas
- Zhou Q, Sharp PA (1995). "Nuevo mecanismo y factor de regulación por VIH-1 Tat" . EMBO J . 14 (2): 321–8. doi : 10.1002 / j.1460-2075.1995.tb07006.x . PMC 398086 . PMID 7835343 .
- Parada CA, Yoon JB, Roeder RG (1995). "Una nueva restricción mediada por LBP-1 de la transcripción del VIH-1 en el nivel de elongación in vitro" . J. Biol. Chem . 270 (5): 2274–83. doi : 10.1074 / jbc.270.5.2274 . PMID 7836461 .
- Ou SH, García-Martínez LF, Paulssen EJ, Gaynor RB (1994). "Papel de los motivos flanqueantes de la caja E en la función del elemento TATA de tipo 1 del virus de inmunodeficiencia humana" . J. Virol . 68 (11): 7188–99. doi : 10.1128 / JVI.68.11.7188-7199.1994 . PMC 237158 . PMID 7933101 .
- Kashanchi F, Piras G, Radonovich MF y col. (1994). "Interacción directa de TFIID humano con el tat transactivador de VIH-1". Naturaleza . 367 (6460): 295–9. doi : 10.1038 / 367295a0 . PMID 8121496 . S2CID 4362048 .
- Wang Z, Morris GF, Rice AP y col. (1996). "Los mutantes de tipo salvaje y defectuosos de transactivación de la proteína Tat del virus de inmunodeficiencia humana tipo 1 se unen a la proteína de unión a TATA humana in vitro". J. Adquirir. Inmunodeficiencia. Syndr. Tararear. Retrovirol . 12 (2): 128–38. doi : 10.1097 / 00042560-199606010-00005 . PMID 8680883 .
- Pendergrast PS, Morrison D, Tansey WP, Hernandez N (1996). "Las mutaciones en el dominio carboxi-terminal de TBP afectan la síntesis de transcripciones cortas y completas del virus de inmunodeficiencia humana tipo 1 de manera similar" . J. Virol . 70 (8): 5025–34. doi : 10.1128 / JVI.70.8.5025-5034.1996 . PMC 190456 . PMID 8764009 .
- Kashanchi F, Khleif SN, Duvall JF y col. (1996). "La interacción de Tat del virus de inmunodeficiencia humana tipo 1 con un sitio único de TFIID inhibe el cofactor negativo Dr1 y estabiliza el complejo TFIID-TFIIA" . J. Virol . 70 (8): 5503–10. doi : 10.1128 / JVI.70.8.5503-5510.1996 . PMC 190508 . PMID 8764062 .
- Zhou Q, Sharp PA (1996). "Tat-SF1: cofactor para la estimulación del alargamiento transcripcional por Tat del VIH-1". Ciencia . 274 (5287): 605–10. Código Bibliográfico : 1996Sci ... 274..605Z . doi : 10.1126 / science.274.5287.605 . PMID 8849451 . S2CID 13266489 .
- García-Martínez LF, Ivanov D, Gaynor RB (1997). "Asociación de Tat con complejos purificados de preiniciación de la transcripción de VIH-1 y VIH-2" . J. Biol. Chem . 272 (11): 6951–8. doi : 10.1074 / jbc.272.11.6951 . PMID 9054383 .
- Purrello M, Di Pietro C, Viola A, et al. (1998). "Análisis de genómica y transcripción de TFIID humano" . Oncogén . 16 (12): 1633–8. doi : 10.1038 / sj.onc.1201673 . PMID 9569032 .
- Guermah M, Tao Y, Roeder RG (2001). "Funciones TAFII positivas y negativas que sugieren una estructura dinámica de TFIID y provocan sinergia con TRAP en la transcripción inducida por activadores" . Mol. Célula. Biol . 21 (20): 6882–94. doi : 10.1128 / MCB.21.20.6882-6894.2001 . PMC 99865 . PMID 11564872 .
- Tora L (2002). "Una nomenclatura unificada para los factores asociados a la proteína de unión a la caja TATA (TBP) (TAF) implicados en la transcripción de la ARN polimerasa II" . Genes Dev . 16 (6): 673–5. doi : 10.1101 / gad.976402 . PMID 11963920 .
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH y col. (2003). "Generación y análisis inicial de más de 15.000 secuencias de ADNc humano y de ratón de longitud completa" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. Código Bibliográfico : 2002PNAS ... 9916899M . doi : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
- Guermah M, Ge K, Chiang CM, Roeder RG (2003). "La proteína TBN, que es esencial para el desarrollo embrionario temprano del ratón, es un TAFII inducible implicado en la adipogénesis". Mol. Celular . 12 (4): 991–1001. doi : 10.1016 / S1097-2765 (03) 00396-4 . PMID 14580349 .
- Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). "Secuenciación completa y caracterización de 21.243 ADNc humanos de longitud completa" . Nat. Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038 / ng1285 . PMID 14702039 .
- Soutoglou E, Demény MA, Scheer E, et al. (2005). "La importación nuclear de TAF10 está regulada por uno de sus tres socios de interacción que contienen dominio de pliegues de histonas" . Mol. Célula. Biol . 25 (10): 4092-104. doi : 10.1128 / MCB.25.10.4092-4104.2005 . PMC 1087738 . PMID 15870280 .