El homólogo 1 de Tribbles es una proteína quinasa que en humanos está codificada por el gen TRIB1 . [5] [6] [7] Los ortólogos de esta proteína pseudoquinasa ( pseudoenzima ) se pueden encontrar de manera casi ubicua en todo el reino animal. [8] Ejerce sus funciones biológicas mediante la unión a proteínas de señalización del nivel MAPKK de la vía MAPK, provocando por tanto un papel regulador en la función de esta vía que media la proliferación, apoptosis y diferenciación en las células. Tribbles-1 está codificado por el gen trib1, que en los seres humanos se puede encontrar en el cromosoma 8 en la posición 24.13 del brazo más largo (q). Estructuras cristalinas recientes muestran que Tribbles 1 tiene una estructura 3D inusual, que contiene una región de hélice C "rota", un sitio de unión para sustratos ubiquitinados como C / EBPalpha y una región de cola C reguladora clave. [9] Al igual que TRIB2 y TRIB3 , TRIB1 se ha considerado recientemente como un posible objetivo farmacológico alostérico. [10]
TRIB1 |
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Estructuras disponibles |
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PDB | Búsqueda de ortólogos: PDBe RCSB |
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Lista de códigos de identificación de PDB |
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5CEM , 5CEK , 5IGO , 5IGQ |
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Identificadores |
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Alias | TRIB1 , C8FW, GIG-2, GIG2, SKIP1, TRB-1, TRB1, tribbles pseudoquinasa 1 |
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Identificaciones externas | OMIM : 609461 MGI : 2443397 HomoloGene : 75216 GeneCards : TRIB1 |
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Ubicación de genes ( humanos ) |
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| Chr. | Cromosoma 8 (humano) [1] |
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| Banda | 8q24.13 | Comienzo | 125,430,358 pb [1] |
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Final | 125 438 403 pb [1] |
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Ubicación de genes ( ratón ) |
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| Chr. | Cromosoma 15 (ratón) [2] |
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| Banda | 15 | 15 D1 | Comienzo | 59.648.350 pb [2] |
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Final | 59.657.099 pb [2] |
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Patrón de expresión de ARN |
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| Más datos de expresión de referencia |
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Ontología de genes |
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Función molecular | • actividad de proteína quinasa • ubiquitina-proteína regulador de la actividad transferasa • actividad del inhibidor de la proteína quinasa • factor de transcripción de unión • GO: proteína de unión 0001948 • proteína activada por mitógeno cinasa cinasa de unión • unión a ATP • ubiquitina proteína ligasa de unión
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Componente celular | • citoplasma • núcleo
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Proceso biológico | • regulación negativa de la proliferación de células del músculo liso • regulación negativa de la actividad de la proteína quinasa • regulación positiva de la diferenciación de macrófagos • regulación negativa de la migración de las células del músculo liso • regulación negativa de la actividad del factor de transcripción de unión al ADN • regulación negativa de la diferenciación de neutrófilos • regulación negativa de lipopolisacáridos vía de señalización mediada • fosforilación de proteínas • cascada de JNK • respuesta al lipopolisacárido • regulación positiva de la diferenciación de eosinófilos • regulación de la actividad de la quinasa MAP • regulación positiva del proceso catabólico de proteínas dependientes de ubiquitina proteasomal
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Fuentes: Amigo / QuickGO |
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Ortólogos |
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Especies | Humano | Ratón |
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Entrez | | |
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Ensembl | | |
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UniProt | | |
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RefSeq (ARNm) | | |
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RefSeq (proteína) | | |
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Ubicación (UCSC) | Crónicas 8: 125,43 - 125,44 Mb | 15 Crónicas: 59,65 - 59,66 Mb |
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Búsqueda en PubMed | [3] | [4] |
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Wikidata |
Ver / editar humano | Ver / Editar mouse |
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Tribbles-1 es uno de los tres miembros de la subfamilia Tribbles, que forma parte de la familia de proteína quinasa CAMK Ser / Thr, de la superfamilia de proteína quinasa. La subfamilia Tribbles es una de las pseudokinasas, lo que significa que aunque expresa regiones de quinasas putativas en su estructura, no es catalítica. La subfamilia Tribbles carece de un bolsillo de unión de ATP funcional y, por lo tanto, no puede fosforilar sus sustratos; en cambio, las proteínas Tribbles funcionan como proteínas de andamio, que se unen a sus sustratos para localizarlos en su función o desde ella [8].
La expresión de Tribbles-1 es muy variable y cambia constantemente con respecto al tiempo y al tipo de célula, [11] lo que sugiere una gran cantidad de regulación que existe en la célula. La estructura primaria de la proteína contiene una región PEST, indicativa de proteínas que son altamente susceptibles a la degradación en la célula; Tribbles-1 juega un papel en la regulación de su propia expresión al unirse a su sustrato, que no solo produce su función en la vía MAPK, sino que también trabaja para protegerlo de la degradación mientras se une. Esto, en parte, crea un ciclo de retroalimentación positiva en la función de Tribbles-1, ya que la función de Tribbles-1 ayuda directamente en el aumento de la cantidad. Como los ciclos de retroalimentación positiva se observan a menudo en toda la biología en circunstancias que requieren el alivio de un estímulo externo, el ciclo de retroalimentación positiva exhibido por Tribbles-1 sugiere que desempeña un papel funcional en la respuesta celular.