La tetraspanina-4 es una proteína que en humanos está codificada por el gen TSPAN4 . [5] [6]
TSPAN4 | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Identificadores | |||||||||||||||||||||||||
Alias | TSPAN4 , NAG-2, NAG2, TETRASPAN, TM4SF7, TSPAN-4, tetraspanina 4 | ||||||||||||||||||||||||
Identificaciones externas | OMIM : 602644 MGI : 1928097 HomoloGene : 2453 GeneCards : TSPAN4 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Ortólogos | |||||||||||||||||||||||||
Especies | Humano | Ratón | |||||||||||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (ARNm) |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (proteína) |
|
| |||||||||||||||||||||||
Ubicación (UCSC) | Crónicas 11: 0,84 - 0,87 Mb | Crónicas 7: 141,48 - 141,49 Mb | |||||||||||||||||||||||
Búsqueda en PubMed | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Wikidata | |||||||||||||||||||||||||
|
La proteína codificada por este gen es miembro de la superfamilia de la transmembrana 4, también conocida como familia de las tetraspaninas. La mayoría de estos miembros son proteínas de la superficie celular que se caracterizan por la presencia de cuatro dominios hidrófobos. Las proteínas median eventos de transducción de señales que juegan un papel en la regulación del desarrollo, activación, crecimiento y motilidad celular. Esta proteína codificada es una glicoproteína de la superficie celular y es similar en secuencia a su antígeno CD53 miembro de la familia. Se sabe que forma complejos con integrinas y otras proteínas de la superfamilia transmembrana 4. Alternativamente, se han identificado variantes de transcripciones empalmadas que codifican diferentes isoformas. [6]
Interacciones
Se ha demostrado que TSPAN4 interactúa con CD9 , [5] ITGA6 , [5] CD29 , [5] CD49c [5] y CD81 . [5]
Referencias
- ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000214063 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000025511 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ a b c d e f Tachibana I, Bodorova J, Berditchevski F, Zutter MM, Hemler ME (diciembre de 1997). "NAG-2, una nueva proteína de la superfamilia transmembrana-4 (TM4SF) que forma complejos con integrinas y otras proteínas TM4SF" . J Biol Chem . 272 (46): 29181–9. doi : 10.1074 / jbc.272.46.29181 . PMID 9360996 .
- ^ a b "Entrez Gene: TSPAN4 tetraspanin 4" .
Otras lecturas
- Berditchevski F (2002). "Complejos de tetraspaninas con integrinas: más de lo que parece". J. Cell Sci . 114 (Pt 23): 4143–51. PMID 11739647 .
- Todd SC, Doctor VS, Levy S (1998). "Secuencias y expresión de seis nuevos miembros de la familia tetraspanin / TM4SF". Biochim. Biophys. Acta . 1399 (1): 101–4. doi : 10.1016 / s0167-4781 (98) 00087-6 . PMID 9714763 .
- Serru V, Le Naour F, Billard M, et al. (1999). "Complejos selectivos tetraspan-integrina (CD81 / alpha4beta1, CD151 / alpha3beta1, CD151 / alpha6beta1) en condiciones que interrumpen las interacciones tetraspan" . Biochem. J . 340 (1): 103-11. doi : 10.1042 / 0264-6021: 3400103 . PMC 1220227 . PMID 10229664 .
- Yauch RL, Kazarov AR, Desai B y col. (2000). "Contacto extracelular directo entre la integrina alfa (3) beta (1) y la proteína TM4SF CD151" . J. Biol. Chem . 275 (13): 9230–8. doi : 10.1074 / jbc.275.13.9230 . PMID 10734060 .
- Lozahic S, Christiansen D, Manié S, et al. (2000). "CD46 (proteína cofactor de membrana) se asocia con múltiples integrinas beta1 y tetraspans" . EUR. J. Immunol . 30 (3): 900–7. doi : 10.1002 / 1521-4141 (200003) 30: 3 <900 :: AID-IMMU900> 3.0.CO; 2-X . PMID 10741407 .
- Suzuki H, Fukunishi Y, Kagawa I y col. (2001). "Panel de interacción proteína-proteína utilizando ADNc de longitud completa de ratón" . Genome Res . 11 (10): 1758–65. doi : 10.1101 / gr.180101 . PMC 311163 . PMID 11591653 .
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH y col. (2003). "Generación y análisis inicial de más de 15.000 secuencias de ADNc humano y de ratón de longitud completa" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. doi : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
- Clark AG, Glanowski S, Nielsen R, et al. (2003). "Inferir evolución no neutral de tríos de genes ortólogos humanos-chimpancé-ratón". Ciencia . 302 (5652): 1960–3. doi : 10.1126 / science.1088821 . PMID 14671302 . S2CID 6682593 .
- Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). "Secuenciación completa y caracterización de 21.243 ADNc humanos de longitud completa" . Nat. Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038 / ng1285 . PMID 14702039 .
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA y col. (2004). "El estado, la calidad y la expansión del proyecto de ADNc de longitud completa de los NIH: la colección de genes de mamíferos (MGC)" . Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi : 10.1101 / gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
- Rual JF, Venkatesan K, Hao T, et al. (2005). "Hacia un mapa a escala de proteoma de la red de interacción proteína-proteína humana". Naturaleza . 437 (7062): 1173–8. doi : 10.1038 / nature04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .
- Oh JH, Yang JO, Hahn Y, et al. (2006). "Análisis del transcriptoma del cáncer gástrico humano". Mamm. Genoma . 16 (12): 942–54. doi : 10.1007 / s00335-005-0075-2 . PMID 16341674 . S2CID 69278 .