Thermococcus kodakarensis es una especie de arqueas termófilas . La cepa tipo T. kodakarensis KOD1 es uno de los miembros mejor estudiados del género . [2]
Thermococcus ksis | |
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Especies: | T. kodakarensis |
Nombre binomial | |
Thermococcus kodakarensis Atomi et al, 2004 [1] |
Historia
T. kodakarensis se aisló de una solfatara cerca de la costa de la isla de Kodakara , Kagoshima , Japón. [3] El aislado se llamó originalmente Pyrococcus kodakarensis KOD1, pero se reclasificó como una especie de Thermococcus , según la secuencia de rRNA 16S . [1] Las primeras investigaciones con T. kodakarensis se dirigieron principalmente a sus enzimas termoestables , pero su relativa facilidad de manejo y manipulación genética facilitada por la competencia natural lo ha convertido en un sistema atractivo para el estudio de varios procesos biológicos. [4] [5]
Propiedades
Las células de T. kodakarensis son cocos irregulares de 1 a 2 μm de diámetro, que a menudo se presentan en pares y son muy móviles por medio de archaella lophotrichous . La pared celular consta de una capa de lípidos diéter y tetraéter, y una capa externa de glicoproteína . [1] [3] T. kodakarensis es un anaerobio obligado y un heterótrofo que crece rápidamente en una variedad de sustratos orgánicos en presencia de azufre elemental y produce gas sulfuro de hidrógeno . El tiempo de generación se estima en 40 minutos en condiciones óptimas. [3] El requerimiento de azufre elemental se alivia cuando se usa piruvato o almidón para el crecimiento. En ausencia de azufre, hidrógeno se produce en lugar de sulfuro de hidrógeno. [1] El crecimiento es posible a temperaturas que oscilan entre 60 y 100 ° C, con un óptimo a 85 ° C. [1] Al igual que otros organismos marinos, se requieren altas concentraciones de sal para un crecimiento óptimo y la lisis celular puede ocurrir en soluciones diluidas.
Genoma
En 2005, se secuenció por completo el genoma de T. kodakarensis KOD1. El genoma consta de un único cromosoma circular de 2.088.737 pares de bases, que codifica 2306 proteínas previstas. [6]
Referencias
- ↑ a b c d e Atomi H, Fukui T, Kanai T, Morikawa M, Imanaka T (octubre de 2004). "Descripción de Thermococcus kodakaraensis sp. Nov., Un arqueón hipertermofílico bien estudiado previamente informado como Pyrococcus sp. KOD1" . Archaea (Vancouver, BC) . 1 (4): 263–7. doi : 10.1155 / 2004/204953 . PMC 2685570 . PMID 15810436 .
- ^ Atomi H, Reeve J (noviembre de 2019). "Perfil de microbio: Thermococcus kodakarensis : el modelo de arqueón hipertermófilo" . Microbiología . 165 (11): 1166-1168. doi : 10.1099 / mic.0.000839 . PMC 7137780 . PMID 31436525 .
- ^ a b c Morikawa M, Izawa Y, Rashid N, Hoaki T, Imanaka T (diciembre de 1994). "Purificación y caracterización de una tiol proteasa termoestable de un Pyrococcus sp hipertermófilo recién aislado" . Microbiología aplicada y ambiental . 60 (12): 4559–66. doi : 10.1128 / aem.60.12.4559-4566.1994 . PMC 202019 . PMID 7811092 .
- ^ Sato T, Fukui T, Atomi H, Imanaka T (enero de 2003). "Disrupción de genes dirigida por recombinación homóloga en el archaeon hipertermófilo Thermococcus kodakaraensis KOD1" . Revista de bacteriología . 185 (1): 210–20. doi : 10.1128 / JB.185.1.210-220.2003 . PMC 141832 . PMID 12486058 .
- ^ Sato T, Fukui T, Atomi H, Imanaka T (julio de 2005). "Sistema de transformación mejorado y versátil que permite múltiples manipulaciones genéticas del arqueón hipertermófilo Thermococcus kodakaraensis" . Microbiología aplicada y ambiental . 71 (7): 3889–99. doi : 10.1128 / AEM.71.7.3889-3899.2005 . PMC 1169065 . PMID 16000802 .
- ^ Fukui T, Atomi H, Kanai T, Matsumi R, Fujiwara S, Imanaka T (marzo de 2005). "Secuencia completa del genoma del archaeon hipertermófilo Thermococcus kodakaraensis KOD1 y comparación con los genomas de Pyrococcus" . Investigación del genoma . 15 (3): 352–63. doi : 10.1101 / gr.3003105 . PMC 551561 . PMID 15710748 .
Otras lecturas
- Elshawadfy AM, Keith BJ, Ee Ooi H, Kinsman T, Heslop P, Connolly BA (27 de mayo de 2014). "Híbridos de ADN polimerasa derivados de las enzimas de la familia B de Pyrococcus furiosus y Thermococcus kodakarensis: mejora del rendimiento en la reacción en cadena de la polimerasa" . Fronteras en microbiología . 5 (224): 224. doi : 10.3389 / fmicb.2014.00224 . PMC 4034419 . PMID 24904539 .
- Hwa KY, Subramani B, Shen ST, Lee YM (septiembre de 2014). "Se requiere un enlace disulfuro intermolecular para la termoestabilidad y la termoactividad de la β-glicosidasa de Thermococcus kodakarensis KOD1". Microbiología y Biotecnología Aplicadas . 98 (18): 7825–36. doi : 10.1007 / s00253-014-5731-6 . PMID 24728717 .
- Kishimoto A, Kita A, Ishibashi T, Tomita H, Yokooji Y, Imanaka T, et al. (Septiembre de 2014). "Estructura cristalina de la fosfopantotenato sintetasa de Thermococcus kodakarensis". Las proteínas . 82 (9): 1924–36. doi : 10.1002 / prot.24546 . PMID 24638914 .