El regulador de transcripciones sin sentido 3A es una proteína que en humanos está codificada por el gen UPF3A . [4] [5] [6]
UPF3A | |||||||||||||||||||||||||
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Identificadores | |||||||||||||||||||||||||
Alias | UPF3A , HRENT3A, UPF3, UPF3 regulador de transcripciones sin sentido homólogo A (levadura), regulador de la desintegración del ARNm mediada sin sentido | ||||||||||||||||||||||||
Identificaciones externas | OMIM : 605530 MGI : 1914281 HomoloGene : 23395 GeneCards : UPF3A | ||||||||||||||||||||||||
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Ortólogos | |||||||||||||||||||||||||
Especies | Humano | Ratón | |||||||||||||||||||||||
Entrez |
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Ensembl |
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UniProt |
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RefSeq (ARNm) |
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RefSeq (proteína) |
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Ubicación (UCSC) | n / A | Crónicas 8: 13,79 - 13,8 Mb | |||||||||||||||||||||||
Búsqueda en PubMed | [2] | [3] | |||||||||||||||||||||||
Wikidata | |||||||||||||||||||||||||
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Este gen codifica una proteína que forma parte de un complejo multiproteico post-empalme involucrado tanto en la exportación nuclear de ARNm como en la vigilancia de ARNm. La proteína codificada es uno de los dos homólogos funcionales de la levadura Upf3p. La vigilancia del ARNm detecta los ARNm exportados con marcos de lectura abiertos truncados e inicia la desintegración del ARNm mediada sin sentido (NMD). Cuando la traducción termina corriente arriba de la última unión exón-exón, esto hace que la NMD degrade los ARNm que contienen codones de parada prematuros. Esta proteína se une al ARNm y permanece unida después de la exportación nuclear, actuando como una proteína de transporte nucleocitoplasmático. Forma con Y14 un complejo que se une específicamente 20 nt corriente arriba de las uniones exón-exón. Este gen se encuentra en el brazo largo del cromosoma 13. Se han encontrado dos variantes de corte y empalme que codifican diferentes isoformas para este gen. [6]
Interacciones
Se ha demostrado que la UPF3A interactúa con RBM8A , [7] UPF2 [5] [8] y UPF1 . [5] [9] [10]
Referencias
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000038398 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
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- ^ Yamashita, A; Ohnishi T; Kashima I; Taya Y; Ohno S (septiembre de 2001). "Human SMG-1, una nueva proteína quinasa relacionada con la fosfatidilinositol 3-quinasa, se asocia con componentes del complejo de vigilancia del ARNm y participa en la regulación de la descomposición del ARNm mediada sin sentido" . Genes Dev . 15 (17): 2215-28. doi : 10.1101 / gad.913001 . ISSN 0890-9369 . PMC 312771 . PMID 11544179 .
Otras lecturas
- Yamashita A, Ohnishi T, Kashima I y col. (2001). "Human SMG-1, una nueva proteína quinasa relacionada con la fosfatidilinositol 3-quinasa, se asocia con componentes del complejo de vigilancia del ARNm y participa en la regulación de la descomposición del ARNm mediada sin sentido" . Genes Dev . 15 (17): 2215-28. doi : 10.1101 / gad.913001 . PMC 312771 . PMID 11544179 .
- Kim VN, Kataoka N, Dreyfuss G (2001). "Papel del factor de desintegración mediada sin sentido hUpf3 en el complejo de unión exón-exón dependiente de empalme". Ciencia . 293 (5536): 1832–6. Código Bibliográfico : 2001Sci ... 293.1832K . doi : 10.1126 / science.1062829 . PMID 11546873 . S2CID 12018200 .
- Lykke-Andersen J, Shu MD, Steitz JA (2001). "Comunicación de la posición de las uniones exón-exón a la maquinaria de vigilancia del ARNm por la proteína RNPS1". Ciencia . 293 (5536): 1836–9. Código Bibliográfico : 2001Sci ... 293.1836L . doi : 10.1126 / science.1062786 . PMID 11546874 . S2CID 389385 .
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