Stephen Chervitz Trutane es mi nombre legal oficial, aunque originalmente era Stephen Allen Chervitz , como se describe aquí . Entonces, es posible que me conozcas con el apellido Trutane o Chervitz , dependiendo de en qué época de mi vida o círculo de amigos me conozcas. Respondo a cualquiera de los dos, así que usa el que quieras. Para simplificar, puedes llamarme simplemente "Steve".
Actualmente estoy en un año sabático de un puesto a largo plazo como ingeniero de software bioinformático en la industria biotecnológica , explorando el mundo de la aptitud física a través de mi trabajo con Athlete Body Shop . Anteriormente, trabajé en Personalis de 2012 a 2023 permitiendo la medicina de precisión para inmunooncología al proporcionar herramientas para procesar datos de secuencia del genoma humano a partir de secuenciación de alto rendimiento , con un enfoque en anotar y ayudar a los científicos a interpretar variaciones en los datos genómicos somáticos y de la línea germinal ( genoma) . , exoma , transcriptoma ) de individuos y sus tumores . Antes de eso, trabajé en software de análisis del genoma en Omicia (ahora Fabric Genomics) (2010-2012) y antes de eso en Affymetrix (ahora Thermo Fisher ) (2000-2010), donde ayudé a anotar conjuntos de sondas de microarrays de ADN para científicos usuarios finales a través de el portal web NetAffx . Me uní a Affymetrix en octubre de 2000 después de la adquisición de Neomorphic , a la que me uní en septiembre de 1998 después de terminar un puesto de posdoctorado en Stanford en el grupo de David Botstein (1996-1998), trabajando en la base de datos del genoma de Saccharomyces . Así que las computadoras y los datos biológicos " ómicos " son mis viejos amigos.
Tengo una licenciatura en biología de Macalester College y un doctorado. del departamento MCDB de CU Boulder , trabajando con el profesor Joseph Falke en el departamento de bioquímica realizando experimentos de biología molecular en laboratorio húmedo con un quimiorreceptor que media la quimiotaxis bacteriana . Hice una gran cantidad de mutagénesis dirigida al sitio y ensayos de transducción de señales in vitro , así como visualización de gráficos moleculares en 3D y análisis de la estructura de proteínas y otras cosas divertidas (como aprender C por mí mismo ).
Después de Boulder, cambié de dirección hacia el mundo de la genómica (o postgenómica ) uniéndome al laboratorio de David Botstein (mientras él estaba en Stanford ) trabajando en la base de datos del genoma de Saccharomyces ( S. cerevisiae, también conocida como levadura de panadería, fue el primer eucariota en tener su genoma está completamente secuenciado , lo que ocurrió en abril de 1996, aproximadamente 3 meses después de que comencé con SGD). Mientras estaba en SGD, desarrollé muchos módulos de Perl para trabajar con datos bioinformáticos y contribuí con la mayor parte de este código al proyecto de código abierto BioPerl , que recién comenzaba en esta época, como se señala en la historia temprana de BioPerl .
Ya no participo activamente en el desarrollo de BioPerl, pero sigo siendo un fanático de la Open Bioinformatics Foundation (y del software de código abierto para la ciencia en general). Otros proyectos en los que he estado involucrado incluyen proyectos BioDAS , GenoViz y HCLS . Estoy en la junta directiva de la Sociedad FGED desde 2002, actuando como su secretario y webmaster entre 2010 y su disolución en 2021.
En mi tiempo libre, salgo con mi familia , entreno u organizo triatlones , promociono la salud y el fitness , twitteo , contribuyo a Wikipedia ( mis estadísticas ) o intento ayudar a la humanidad con la organización que fundé, TeamHuman.org . . Creo que Wikipedia está bien alineada con el objetivo de "promover un entendimiento compartido" de TeamHuman.org.