5'-3 'La exoribonucleasa 2 (XRN2), también conocida como proteína similar a Dhm1, es una enzima exoribonucleasa que en los seres humanos está codificada por el gen XRN2 . [5]
XRN2 | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Identificadores | |||||||||||||||||||||||||
Alias | XRN2 , entrez : 22803, 5'-3 'exoribonucleasa 2 | ||||||||||||||||||||||||
Identificaciones externas | OMIM : 608851 MGI : 894687 HomoloGene : 6927 GeneCards : XRN2 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Ortólogos | |||||||||||||||||||||||||
Especies | Humano | Ratón | |||||||||||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (ARNm) |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (proteína) |
|
| |||||||||||||||||||||||
Ubicación (UCSC) | 20: 21,3 - 21,39 Mb | Crónicas 2: 147,01 - 147,08 Mb | |||||||||||||||||||||||
Búsqueda en PubMed | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Wikidata | |||||||||||||||||||||||||
|
El gen humano que codifica XRN2 comparte similitud con el Dhm1 de ratón y los genes Dhp1 ( Schizosaccharomyces pombe ) o RAT1 ( Saccharomyces ) de la levadura . El gen de la levadura participa en la recombinación homóloga y el metabolismo del ARN , como la síntesis de ARN y el tráfico y la terminación del ARN. [6] Los estudios de complementación muestran que Dhm1 tiene una función similar en el ratón como Dhp1.
Función
El XRN2 humano está involucrado en el modelo torpedo de terminación de la transcripción. [7]
El homólogo de C. elegans , XRN-2, está involucrado en la degradación de ciertos miARN maduros y su desalojo de miARN miRISC . [8]
En la levadura, se ha demostrado que la proteína Rat1 también participa en el modelo de terminación de la transcripción de torpedos. Cuando se ha detectado un sitio de poliadenilación en el ARN naciente y escindido por la ARN polimerasa II , el factor Rtt103 recluta a Rat1 y lo une al extremo libre. La actividad exonucleasa de Rat1 degrada la cadena de ARN y detiene las transcripciones al alcanzar la polimerasa. [6]
Ver también
- Xrn1
Referencias
- ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000088930 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000027433 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ Zhang M, Yu L, Xin Y, Hu P, Fu Q, Yu C, Zhao S (julio de 1999). "Clonación y mapeo del gen XRN2 al cromosoma humano 20p11.1-p11.2". Genómica . 59 (2): 252–4. doi : 10.1006 / geno.1999.5866 . PMID 10409438 .
- ^ a b David Tollervey (noviembre de 2004). "Terminación por torpedo". Naturaleza . 432 (7016): 456–457. doi : 10.1038 / 432456a . PMID 15565140 . S2CID 6823163 .
- ^ West S, Gromak N, Proudfoot NJ (noviembre de 2004). "La exonucleasa Xrn2 humana 5 '-> 3' promueve la terminación de la transcripción en los sitios de escisión cotranscripcional" . Naturaleza . 432 (7016): 522–5. Código bibliográfico : 2004Natur.432..522W . doi : 10.1038 / nature03035 . PMID 15565158 . S2CID 4365304 .
- ^ Chatterjee S, Grosshans H (septiembre de 2009). "El recambio activo modula la actividad de microARN maduro en Caenorhabditis elegans". Naturaleza . 461 (7263): 546–9. Código bibliográfico : 2009Natur.461..546C . doi : 10.1038 / nature08349 . PMID 19734881 . S2CID 4414841 .
enlaces externos
- Ubicación del genoma humano XRN2 y página de detalles del gen XRN2 en UCSC Genome Browser .
Otras lecturas
- Lehner B, Sanderson CM (2004). "Un marco de interacción de proteínas para la degradación del ARNm humano" . Genome Res . 14 (7): 1315–23. doi : 10.1101 / gr.2122004 . PMC 442147 . PMID 15231747 .
- Deloukas P, Matthews LH, Ashurst J y col. (2001). "La secuencia de ADN y análisis comparativo del cromosoma 20 humano" . Naturaleza . 414 (6866): 865–71. Código Bibliográfico : 2001Natur.414..865D . doi : 10.1038 / 414865a . PMID 11780052 .
- Beausoleil SA, Villén J, Gerber SA, et al. (2006). "Un enfoque basado en la probabilidad para el análisis de fosforilación de proteínas de alto rendimiento y la localización del sitio". Nat. Biotechnol . 24 (10): 1285–92. doi : 10.1038 / nbt1240 . PMID 16964243 . S2CID 14294292 .
- Lu Y, Liu P, James M y col. (2010). "Las variantes genéticas que regulan en cis la expresión de Xrn2 contribuyen al riesgo de tumor pulmonar espontáneo" . Oncogén . 29 (7): 1041–9. doi : 10.1038 / onc.2009.396 . PMC 6019621 . PMID 19915612 .
- Lejeune F, Li X, Maquat LE (2003). "La desintegración de ARNm mediada por sinsentidos en células de mamíferos implica actividades exonucleolíticas, desadenilantes y de desencadenamiento" . Mol. Celular . 12 (3): 675–87. doi : 10.1016 / S1097-2765 (03) 00349-6 . PMID 14527413 .
- Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, et al. (2001). "Hacia un catálogo de genes y proteínas humanos: secuenciación y análisis de 500 nuevas proteínas completas que codifican ADNc humanos" . Genome Res . 11 (3): 422–35. doi : 10.1101 / gr.GR1547R . PMC 311072 . PMID 11230166 .
- Yang XC, Sullivan KD, Marzluff WF, Dominski Z (2009). "Estudios de las actividades de exonucleasa y endonucleasa 5 'de CPSF-73 en el procesamiento de pre-ARNm de histonas" . Mol. Célula. Biol . 29 (1): 31–42. doi : 10.1128 / MCB.00776-08 . PMC 2612496 . PMID 18955505 .
- Olsen JV, Blagoev B, Gnad F y col. (2006). "Dinámica de fosforilación global, in vivo y específica del sitio en redes de señalización" . Celular . 127 (3): 635–48. doi : 10.1016 / j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983 . S2CID 7827573 .
- Scherl A, Couté Y, Déon C, et al. (2002). "Análisis proteómico funcional del nucleolo humano" . Mol. Biol. Celular . 13 (11): 4100–9. doi : 10.1091 / mbc.E02-05-0271 . PMC 133617 . PMID 12429849 .
- Kaneko S, Rozenblatt-Rosen O, Meyerson M, Manley JL (2007). "La proteína multifuncional p54nrb / PSF recluta la exonucleasa XRN2 para facilitar el procesamiento 3 'del pre-ARNm y la terminación de la transcripción" . Genes Dev . 21 (14): 1779–89. doi : 10.1101 / gad.1565207 . PMC 1920172 . PMID 17639083 .
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA y col. (2004). "El estado, la calidad y la expansión del proyecto de ADNc de longitud completa de los NIH: la colección de genes de mamíferos (MGC)" . Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi : 10.1101 / gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
- Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). "Secuenciación completa y caracterización de 21.243 ADNc humanos de longitud completa" . Nat. Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038 / ng1285 . PMID 14702039 .
- Gromak N, West S, Proudfoot Nueva Jersey (2006). "Los sitios de pausa promueven la terminación transcripcional de la ARN polimerasa II de mamíferos" . Mol. Célula. Biol . 26 (10): 3986–96. doi : 10.1128 / MCB.26.10.3986-3996.2006 . PMC 1488997 . PMID 16648491 .
- Andersen JS, Lam YW, Leung AK y col. (2005). "Dinámica del proteoma nucleolar". Naturaleza . 433 (7021): 77–83. Código Bibliográfico : 2005Natur.433 ... 77A . doi : 10.1038 / nature03207 . PMID 15635413 . S2CID 4344740 .
- Li J, Zheng H, Ji C y col. (2005). "Una nueva variante de empalme del gen XRN2 humano se expresa principalmente en leucocitos sanguíneos". DNA Seq . 16 (2): 143–6. doi : 10.1080 / 10425170500066771 . PMID 16147866 . S2CID 35865401 .
- Equipo del programa de recolección de genes de mamíferos; Strausberg, RL; Feingold, EA; Grouse, LH; et al. (2002). "Generación y análisis inicial de más de 15.000 secuencias de ADNc humano y de ratón de longitud completa" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias . 99 (26): 16899-16903. Código Bibliográfico : 2002PNAS ... 9916899M . doi : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
- Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, et al. (2004). "Caracterización a gran escala de fosfoproteínas nucleares de células HeLa" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 101 (33): 12130–5. Código Bibliográfico : 2004PNAS..10112130B . doi : 10.1073 / pnas.0404720101 . PMC 514446 . PMID 15302935 .
enlaces externos
- XRN2 + proteína, + humano en los encabezados de temas médicos (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .